Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00620 LG1 9413375 9417066 PREDICTED: probable inactive receptor-like protein kinase At3g56050
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   root hair cell differentiation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, root hair cell differentiation, root hair cell differentiation, protein phosphorylation, root hair cell differentiation
Cellular Component   located in   endomembrane system, pollen tube, chloroplast
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 9413453 3_prime_UTR_variant
T/G 9413698 synonymous_variant p.Ala583Ala
T/G 9413959 synonymous_variant p.Ser496Ser
G/C 9414010 missense_variant p.Asn479Lys
C/G 9414019 synonymous_variant p.Ala476Ala
T/A 9414415 upstream_gene_variant
C/T 9414592 missense_variant p.Ser370Asn
A/G 9414738 upstream_gene_variant
G/C 9414781 upstream_gene_variant
A/G 9414793 upstream_gene_variant
T/G 9414813 upstream_gene_variant
C/T 9414831 upstream_gene_variant
C/A 9415303 missense_variant p.Ala275Ser
C/G 9415306 missense_variant p.Gly274Arg
A/T 9415331 synonymous_variant p.Ser265Ser
A/G,T 9415333 missense_variant p.Ser265Pro
A/C 9415337 missense_variant p.Asn263Lys
G/T 9415468 missense_variant p.Gln220Lys
G/T 9415481 synonymous_variant p.Gly215Gly
T/C 9415489 missense_variant p.Thr213Ala
G/A 9415541 intron_variant
G/A 9415576 intron_variant
T/A 9415685 missense_variant p.Arg200Ser
T/A 9415804 missense_variant p.Asn161Tyr
T/C 9415855 intron_variant
T/C 9415896 intron_variant
A/T 9415898 intron_variant
G/T 9415948 missense_variant p.Leu144Ile
C/G 9416010 missense_variant p.Gly123Ala
C/T 9416014 missense_variant p.Glu122Lys
A/C 9416092 intron_variant
C/T 9416253 intron_variant
A/T 9416271 intron_variant
C/G 9416280 intron_variant
A/G 9416407 intron_variant
A/G 9416418 intron_variant
C/T 9416428 intron_variant
A/T 9416457 intron_variant
G/T 9416465 intron_variant
C/T 9416790 missense_variant p.Val22Ile
C/T 9416803 synonymous_variant p.Ser17Ser
G/A,C 9416827 synonymous_variant p.Arg9Arg
G/A 9416830 synonymous_variant p.Ser8Ser
G/C 9416835 missense_variant p.Leu7Val
A/C 9416863 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T 9416871 5_prime_UTR_variant
T/C,A 9416880 5_prime_UTR_variant
C/A 9416882 5_prime_UTR_variant
G/A 9416893 5_prime_UTR_variant
A/T 9416904 5_prime_UTR_variant
G/A 9416911 5_prime_UTR_variant
C/A 9416927 5_prime_UTR_variant
T/C 9416935 5_prime_UTR_variant
A/G 9416942 5_prime_UTR_variant
A/T 9416945 5_prime_UTR_variant
A/T 9416951 5_prime_UTR_variant
G/A 9416969 5_prime_UTR_variant
G/A 9416975 5_prime_UTR_variant
C/A 9417007 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00620.1
MEKNRKLSRLQDLCIASRLVAVFFLFQSLGLCCSLNEEGNALLKFRQRIVSDPFGALSNWVDDDSSFDPCNWFGVECSDGRVVALNLKDLCLEGTLAPELAKLIHINSIILRNNSFSGTIPEGFVELKELEVLDLGYNNFSGHLPADLGSNISLAILLLDNNEFLVGFSPEINELRLLSECQVGENQLTNAAKMPACIERATTWHIGQGKGITRGLLQLQKPFHRTHEDPRNRAANPPQEKPSLPSPPSPVPKLSPPEKSASNSSTPHSTPGSGALPKTEKSTSPKVHILVGVIGGAVFLLFSTIGLYICKTKVVNVRPWATGLSGQLEKAFVTGAQKLRRLNLEVACEDFSNVIGTSPIGTVYKGTLSSGVEIAVTSVPVTSSKNWSKTLEVQFRNKIDTLSKVNHKNFVNLIGYCEEEEPFTRMLVFEYAPNGTLFEHLHIKEAEHLDWVTRLRVATGMAYCLQHMHQLDPPMALINLNSQTVYLTDDYAAKLSDFSFSYEITSAETKAIDMPKASLETNVYSFGALLFEMVTGRLPYSVEQRDSLENWASHYLQGDQPLKDMVDPILESYQEDQLEQVAALIKSCVHPDPKQRPIMKDVSEKLREITKITPESAVPKLSPLWWAELEIASTEVR*


CDS Sequence:
>Vu_00620.1
ATGGAAAAGAACAGGAAACTCAGCCGCTTGCAGGATCTTTGTATAGCTTCGCGCCTTGTGGCGGTTTTTTTCTTGTTTCAGAGTTTGGGTTTGTGTTGTTCTTTGAATGAAGAAGGTAATGCTCTTTTGAAGTTCAGGCAGAGAATAGTGAGTGACCCTTTTGGTGCTTTGTCAAATTGGGTGGATGATGATTCATCTTTTGACCCTTGTAATTGGTTTGGAGTTGAGTGCTCAGATGGAAGAGTTGTCGCCTTGAATTTGAAGGATCTCTGCCTTGAAGGAACTCTGGCACCTGAGCTTGCGAAACTTATCCACATAAATTCCATTATTTTACGGAACAACTCTTTCTCTGGGACCATCCCCGAAGGATTTGTGGAGTTAAAAGAATTGGAGGTTTTGGATTTGGGATACAACAACTTCAGTGGACATCTACCTGCTGATCTTGGGAGCAATATCTCACTAGCAATCCTCTTGTTGGATAACAATGAATTTCTTGTTGGTTTCTCACCGGAAATTAATGAACTGAGGCTGCTTTCTGAGTGCCAAGTGGGTGAAAATCAGCTAACTAATGCTGCTAAAATGCCAGCGTGTATAGAAAGAGCCACCACATGGCATATTGGTCAAGGTAAAGGTATTACTCGTGGCCTACTGCAACTTCAAAAACCATTTCATCGTACTCATGAAGATCCTCGTAATCGTGCGGCTAATCCACCACAAGAGAAGCCTTCACTTCCTTCTCCTCCTTCACCAGTGCCAAAGCTATCTCCCCCTGAGAAAAGTGCTTCTAATTCTTCTACTCCACATTCTACACCAGGTTCTGGAGCACTACCTAAAACTGAAAAAAGCACTTCACCAAAGGTTCATATTTTGGTTGGAGTTATAGGTGGTGCAGTGTTTCTTCTTTTTTCAACCATTGGCTTATATATTTGTAAAACAAAGGTGGTTAATGTCAGACCTTGGGCCACGGGACTAAGTGGACAGCTGGAGAAGGCATTTGTAACTGGTGCTCAAAAGCTAAGGAGATTGAATCTTGAAGTAGCATGTGAAGATTTTAGTAATGTAATCGGTACTTCACCTATTGGCACAGTGTACAAAGGAACTTTGTCTAGTGGCGTTGAAATTGCTGTAACTTCTGTTCCGGTGACATCATCCAAGAATTGGTCAAAGACTTTAGAAGTTCAATTTAGAAACAAGATAGATACATTATCGAAAGTGAACCACAAGAATTTTGTAAATCTTATTGGATACTGTGAAGAGGAGGAGCCTTTCACCAGAATGTTGGTTTTTGAATATGCCCCAAATGGAACACTATTTGAGCATTTACACATAAAAGAGGCTGAGCACTTGGATTGGGTAACAAGGCTTAGAGTTGCAACGGGTATGGCTTATTGCTTGCAGCATATGCACCAATTGGACCCTCCTATGGCGCTTATCAACCTGAATTCTCAAACTGTTTACTTGACTGATGATTATGCTGCCAAACTCTCAGATTTTAGTTTCTCCTATGAAATAACCTCAGCTGAGACAAAAGCCATTGACATGCCAAAAGCAAGTCTAGAAACTAACGTTTATAGCTTTGGTGCTTTGTTATTTGAGATGGTTACTGGTCGTCTCCCTTATTCAGTGGAACAAAGGGACTCCCTTGAAAACTGGGCATCACACTATTTACAAGGAGACCAACCTCTCAAGGATATGGTGGATCCAATTCTTGAATCTTACCAAGAGGATCAGCTTGAACAAGTTGCTGCATTGATCAAATCTTGTGTGCATCCAGATCCAAAGCAGAGACCAATAATGAAAGATGTCAGTGAGAAGCTAAGAGAGATAACAAAGATAACACCCGAATCAGCAGTTCCAAAACTTTCTCCACTTTGGTGGGCAGAGCTTGAGATTGCTTCTACAGAAGTGCGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_00620::LG1:9417066-9419066(-)
ATTATTTATTTTTCTCTTTCGTTGGCTCTTAAGACTTGACTAAGACTTGTGTTTGACTATATACATGTAAACAAATATATGCATGAGTCATTAAACCTAGATTTAAACAACTTTTATTTCTATGTAAATATAATTTTATCTAACTTTGTTTTTTTTAAGAAATGTTTTTATATCTTGACCTTTTTAGAAGTTTCTACCATTAATTGGTTTAACATTAAAATAGAAATTTTAGGTACAATAATTAAGATGATAAAAAATATTTCAAATTAAAATAGTTATATTATTTTTATGTATATAATTCCATTAAATAATATATTTATTGTTTTTTTTATAAATAATATACTTACACGCATTTTTTTAATACATTTTAGTAAGAGATATTATATGAATTTTGTTCTTTTATATTACTTGTATTATATAATCATTATTTCTTAATAAATATAATTTAAAGAAGGTAGTTACGTATACTTCTTATTTTATATTACATAATATGTGTTTATAACTTTCCACGTAAAAAAAAATATTAGTAAAAGAATATACCATAAACATAATTACTTTTTATATTATTTTTTAATAGCATAAAGATAAAAAAGGGAATACCCATATTCAAATATGTTTAATTTTAAGGGATTTATTCTATTATAAAACAAAACTACTGAAGATTTTTAAAATTGTTGATAAATGTTAAGATTTAAAGCAGACATATATAGCATTATTCAATCAACTCAATCCAACTTATTTAAATTAAAAAATATTTGAATCTAATCCGTGAGTTAAATCAGTTAATTTACTTGCTTACTTAATTACAATTTTTTTACTATTAAAAAATAATATATATTTTAATTTAAATTTAACCAAAGTGAAGTTTAAATTAGATTTATGATAATATTTGATTCATGTATTAACAAATTTTCTCAACAAATATTTTGAATAACTTCATAAATATTCAAATTTGTTTATACAATATTTGTGGATAATTATTTTTATATAAATAATTTCATTCTAGCTTCTATCTCAATATTTTATAAAATGATTAATTTAACAAAAAATACTTATTAAAAAATTAGGTGAATTGTGAGTCAATCCGACTGCGAGTTCAACATGAATGTACCTGTTTGTAAGTGAACCAAATTCAAAATTAGACTATATTAAAATTTCAAAATTTTTTCATCCGGATTATCAATTTTTTTTTAAAAAAGTCAGTAAAATTCGGTTGTTTAACATTTCACACCTTATTTATTTTTATCGTAATGTTATTTTTTTCATTATTCATTTTCTTTGTTCTCCCACTGATCGTACTAGAGGAAAAGGAAACATTGGTTTACATTTAAAAAAAACACAACAAAGTAAACTCCACGGAAAATACTGAAAGTTGAATGTTGACATAATAAGAGTTTTACAAACCCTCTGAATTACTCAAGCTTTTACAAACTGCGGTGAGTTTCGCTTTTTCAGAAATTATCAAATATTCCGTTAATATGTTAGCGTGGACCGACTCTATAATAAAAATAATAAACCGCGGATAACACATTTAACAATATCAAAAACCAACAGAAATATTAAATATAATTCCATTAAAATTAACATTTTTGTAATGACTATATTTATATTAAATTATTAATAAAAACTAAAATCAAACAGAATCATATTTATAGAGTGTGGAAAAAACAGCCTGATATTTTATATTTTGTGGTGGAAATGTGGAGTTTCGTCCTAAAGTAAGAATTTTAAAATATACAATCAGACAATAAAAATATTTAAAAAAGAATTGAATTATTAAAATGTTGAAAGAGTTAATAGCATCACAAGATTTTCTTTATATATTTCCGTGAAATTAATAATAACGTATTACAAAAGGTTATATGAACATGTTCTGTCCTTCGCTCACTCCTTGCACCGTTACTACTATTATGACTTGTTAGCTCAGTGACAGCGAACGCGCTTTCAAGTCTCTTGGGTCCATTCACTGATAAAAACACAGACACACACCAATCCCAACT


Gene Sequence:
>Vu_00620(-)
GAAGCTGTCATTACATGTTACCTTAGAATTTATTAGAACTTTGGAACCAGTCAGTCCATGCTTTACTTTACTTTCACCCTTTTGCTTCTTCCTTCTACATCTTCTTCAACTACATTTTTTTTATTTTCTTAATACGTTTGCTCTTTCCAAATTTGCTTCCTTTGGATATTAACCTTAAATTCTTGCAAGAAACACGCTTTTCTTGCAGCAAGAATGGAAAAGAACAGGAAACTCAGCCGCTTGCAGGATCTTTGTATAGCTTCGCGCCTTGTGGCGGTTTTTTTCTTGTTTCAGAGTTTGGGTTTGTGTTGTTCTTTGAATGAAGAAGGTACCTCACTAGTGGTGGGATTTTTGGGTTTGAGGAATCTGGTGGCTGCTTGGATGATGCTGAAACGTGGTTTCTGTGTGCAGGTAATGCTCTTTTGAAGTTCAGGCAGAGAATAGTGAGTGACCCTTTTGGTGCTTTGTCAAATTGGGTGGATGATGATTCATCTTTTGACCCTTGTAATTGGTTTGGAGTTGAGTGCTCAGATGGAAGAGTTGTCGCCTTGTAAGTGCTTATTTTTTTAACCCTTTTTCTCAGAAACTGCTTATTTGTAGCCAATGCTGTGGTATAATTCATGGCCACACAAGAAAAAGAGAGGAATATTTATGTTTTTTTTAACAATTTTTCTTCATTAGTCTCTCATGTTAAAAGTATTCCCCAGTGTTCATAGTGTTAAGCATGAAAGATTTGTTTGGTCAGGAATTTGAAAAGTCCACAGAAACAGGCTGTTATCACAACAGGTTTTGAACTATAGTTTCCTCTGTTTTGAAATTGACTTGAGTGATTTTGTGCTCAGGAATTTGAAGGATCTCTGCCTTGAAGGAACTCTGGCACCTGAGCTTGCGAAACTTATCCACATAAATTCCATGTAATTTTTCTTACCTGGTTTCATTTCCTATCTCGGTTCCTTTCCTTCATTAATTCTATTTTGGCCTTTGATCGAATAATTGGAGGGTGAATATGCTGCAGTATTTTACGGAACAACTCTTTCTCTGGGACCATCCCCGAAGGATTTGTGGAGTTAAAAGAATTGGAGGTTTTGGATTTGGGATACAACAACTTCAGTGGACATCTACCTGCTGATCTTGGGAGCAATATCTCACTAGCAATCCTGTAGGGTGATGACCCTCTTTGAATAGTTCAATTTCACTTTTTCTTTTAAGAAACTTTTTGCACATATGCTCACTCGGTTTCTTCTAATTGTAGCTTGTTGGATAACAATGAATTTCTTGTTGGTTTCTCACCGGAAATTAATGAACTGAGGCTGCTTTCTGAGTGCCAAGTGGGTGAAAATCAGCTAACTAATGCTGCTAAAATGCCAGCGTGTATAGAAAGAGCCACCACATGGTATGTTACTAATTAATTGAAATGTGGTCCATCTCTGGAATTATGTACTTGTATTTTGTATTCTTAGTCGTGTCCAATGTATATATATTTTATTATACGATAGGGTCATCCTATTTCTTTTTTCTAAAAAACCAAGTTCACACAATTTTCTTTTTAAAGGCATATTGGTCAAGGTAAAGGTATTACTCGTGGCCTACTGCAACTTCAAAAACCATTTCATCGTACTCATGAAGATCCTCGTAATCGTGCGGCTAATCCACCACAAGAGAAGCCTTCACTTCCTTCTCCTCCTTCACCAGTGCCAAAGCTATCTCCCCCTGAGAAAAGTGCTTCTAATTCTTCTACTCCACATTCTACACCAGGTTCTGGAGCACTACCTAAAACTGAAAAAAGCACTTCACCAAAGGTTCATATTTTGGTTGGAGTTATAGGTGGTGCAGTGTTTCTTCTTTTTTCAACCATTGGCTTATATATTTGTAAAACAAAGGTGGTTAATGTCAGACCTTGGGCCACGGGACTAAGTGGACAGCTGGAGAAGGCATTTGTAACTGGTAAATCTAAGCAGCACACAATTTTTATCATGATAAAGCTTATATACAATTTTTAAGTGTTTTAATGTTCTTCTCAAATCAAATTTGAAGTTTTACTTGATATTACATGATCTCAAGTGAATTTGACTTCAAATCTAAAAATAGAATATCACAAAAGTCCCCGAGGAATTGCCTTTAAATTTTGTCTATCATGCTAGGACCTACATTATTAGGCACAAGATCTACTGCTTATAATAAAAAAAAATGTTTTTCTGTTTCCAAGAAGGATCGTGTCTTTTTAATAAAAAAATAGAAGGTCTAAATCCCATAATGCATAGCAACTCAGGATTTCTGAAACGCGACAAAGAACAGGAACTTAACTTATTTTCAGGGTTCTTCGGTCATTTAATGATCTTGCTTTGAATGACAGAGTTCTACATTTTCAGGTGCTCAAAAGCTAAGGAGATTGAATCTTGAAGTAGCATGTGAAGATTTTAGTAATGTAATCGGTACTTCACCTATTGGCACAGTGTACAAAGGAACTTTGTCTAGTGGCGTTGAAATTGCTGTAACTTCTGTTCCGGTGACATCATCCAAGAATTGGTCAAAGACTTTAGAAGTTCAATTTAGAAACAAGGTATCAATTATCATAACAGAAGAAGACCAAACAAACTTAACACTAGAATTGCAATCTAACCATTGTAATTATAACTAACTTTTTAACCGTTATGGTTTCAGATAGATACATTATCGAAAGTGAACCACAAGAATTTTGTAAATCTTATTGGATACTGTGAAGAGGAGGAGCCTTTCACCAGAATGTTGGTTTTTGAATATGCCCCAAATGGAACACTATTTGAGCATTTACACAGTAAGTGTTTTACCATTTTTAGAGTAATTAGCACACCAAGTATAGCAACATGCATTCTTTAACACGTTCTAAATTATTGGTTAAACTTGTTGAAAACCATAAAACTAGTTATTGTTGTGTTTGAGTTGGTAAATTTGTTCTTTTGAGTGCCAGTAAAAGAGGCTGAGCACTTGGATTGGGTAACAAGGCTTAGAGTTGCAACGGGTATGGCTTATTGCTTGCAGCATATGCACCAATTGGACCCTCCTATGGCGCTTATCAACCTGAATTCTCAAACTGTTTACTTGACTGATGATTATGCTGCCAAACTCTCAGATTTTAGTTTCTCCTATGAAATAACCTCAGCTGAGACAAAAGCCATTGACATGCCAAAAGCAAGTCTAGAAACTAACGTTTATAGCTTTGGTGCTTTGTTATTTGAGATGGTTACTGGTCGTCTCCCTTATTCAGTGGAACAAAGGGACTCCCTTGAAAACTGGGCATCACACTATTTACAAGGAGACCAACCTCTCAAGGATATGGTGGATCCAATTCTTGAATCTTACCAAGAGGATCAGCTTGAACAAGTTGCTGCATTGATCAAATCTTGTGTGCATCCAGATCCAAAGCAGAGACCAATAATGAAAGATGTCAGTGAGAAGCTAAGAGAGATAACAAAGATAACACCCGAATCAGCAGTTCCAAAACTTTCTCCACTTTGGTGGGCAGAGCTTGAGATTGCTTCTACAGAAGTGCGTTGAAACCAGTGAAGCAGATTGTAGTTAAGTTCCAAAGGCTTTTAACGTTGTGATCCTTTTTCCATAAAGAGTTGTTAAAAAGAATCTATTTTTATGTTGTAGAACATGGTCGCAAATGACTTATGGGAGACCAAAAATGTGCAGTGATTTTCTTTCGGTGC