Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00702 LG1 10170141 10173905 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 3 isoform X1
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category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   cellular catabolic process, cellular catabolic process, plant-type cell wall organization or biogenesis, cell wall biogenesis, response to water deprivation, hormone-mediated signaling pathway, negative regulation of signal transduction, response to water deprivation, hormone-mediated signaling pathway, response to ethylene, signal transduction, small molecule metabolic process, response to water deprivation, response to ethylene, hormone-mediated signaling pathway, hormone-mediated signaling pathway, cell differentiation, response to abscisic acid, cellular catabolic process, negative regulation of signal transduction, macromolecule catabolic process, macromolecule catabolic process, response to abscisic acid, negative regulation of signal transduction
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   mRNA binding, mRNA binding, mRNA binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00702.1
MPENRQVLRNADSTPSGDNIEGGADFSEAIRRLKINDNWDRDAAAQSTQYPDRPGEPDCLYYLRTGMCGYGSNCRYHHPAHISIGSHYGEELPQRTGQPDCEYFLKTGTCKYGSTCKYHHPKDRRGAAPVSFNTLGLPMRQEEKSCPYYMRTGSCKFGVACKFHHPQHASIGAYPLAGSPTSTIIPTSGLPYAGGFPAWSAVPRMSYLSGQGVQSYVPPFLSSSQGIIPVQSWNNYMGSMNPTMPTGYLGSNLVYDFMNLGESLFGGQAINSALPNRPDQPECRYFMSTGTCKYGSDCKFHHPKERVSQSLINPLGLPVRPGQAVCSYYRIYGMCKFGPTCKFDHPVLTIPQNYGLTSPALALDAPLISNQRGLSSVQPPETSPSKLSSDNKLQHSDAKAATEDSSKQADTTPNSFPASSEPLHD*


CDS Sequence:
>Vu_00702.1
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Promoter Sequence:
>Vu_00702::LG1:10173905-10175905(-)
CATGTTTCAAAGTTATATTACATGTTAAAATACAATTATTAATAGCTTTTAACTATGTATAAGTAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATATATATATATATATATACGAGTTGTCAAAATGATAATAAATAATTTTTTATCGTTTTATTTAACACTCTCTCACTTTGTTATAATGCAAATTTCATCTTATCTTTTTACCAGTAACTAATTTTTTATTATAATAATAAATCTGAATATCATAAAATCTGATATTCACAAATCATTTTAAAATCCTTCGTGTATGAGTGTGGGATACAAACCATTCTACCAGTTAATTAAAAAATGTATATAATTGTGTATAGTGGATCTACGTATAGCTCAACGAAACGTTTCAAACCAACGGTTAACAACAAAGTTCAATGTTGATAATAAAAGCTAATATTAATTAATTTAATAAATTGAATAGATTCTAATATAATTTCGAATATTATTGTTTACGGACAACAAAAATGCAATAAAAAAATTGCAATTAGAAATCTAACGTTACATAACATTACTGAAAAGCAATCGAACGATGGTTGATAGAAAACGATGGTTTTTCATAATGTCAAATCTCCAAAGTAATTAGATTTTAAATAGTGTTGCACCATTATTTTCACCACCAACGGCACACTTACTATAAACTATTCATGAATTTTATTTTTCTAATAGAATAGAATGCTTGAAGAAATTCAAAAAAAAAAAAAAACTATATCAATTTCAAAGTTAAAAACAGGACTAGGCTCATCTAAAAACAAATCATTATTTATATGATATTTAATAATAACATTTTCAATGCATACTTATTTTTGGGTAGTATTAAATGCATAATTCTATCTAAAAAAGGTATGGTACAAATTTATAATATTGGATGTTTGGTTCTCCGTGTCTCAAAAGGTCATACTTTGTGGCTCCGTCCTATTAAAAAAAGAGTTCAATGGAAAGTAACGGTAAAAAGTTGTATACGAAAACTAAGCAGAAATTGTAATAAATACAGATTTTGGATAATTAAATTTTAAAAATTATCGTACATTTTAATCAGATAATAATACTAAAAAGAAATATATATATTGTTTTACAATAATAGCATTGTGGTGCAAAGAATGGGAGAAGAAAGTTTTGAGGCCATGAAATTAAAAATAGGCAAATTAAGATATGAAAATTATGATATAAAAGTGGTATATATAGGGTTATCTGTTGAAAAAAGATGATGAATGGTTGAATATGAAGCTAAAAATGGAGAGGTCTATTTATGAAAAGAATTAAAGTGGTTAATTGAGGAGATTTGAGATAATATTAAGAGTTGGTAAAAACTTGAGAATTCCAAAATTGGCATCTACTTTTTCAGGCTAATTAAATTTTGTTAAGAATCCAAATTTGTAGTAGTGGTTGAAGAGCACGCGCCAAGTGAAGGAAATAAATATTGGTTCACGTAAACGTGTTGTGGAGGTGCCACGTGGAGGGCAATATGGTACAGAGAATTAAATGTTCGTACACGCGCGCAAGAACCTTACTTTAGTATTACTGTATTAACATTATTATTATTAACTTGTCGGGTTTCACATTCAAAGATCCAAAATGTTCCGTAGATTGCAGAACCACAGCCAGGAACTCTAATCTAATTTGACGCCAACTTTCATCCAATTGGAATATTACTAAATCTCTTTTCACGATTTCACATTTGATTCTTCTCAATTTTACCTCCGATTCTCTCTTTGCACCTTTGTTTTTGTGTTGGTTTTAATAATTTTCTTTTCCGGGCAAAGTTTTGTTTATTTTATTGTTTTCAGTCTTTGGTCAATTTTCACTCTCTCCTGATGATCATTTTACCATGTGGGGTGAGTTAATTTGAGAGTGTTGTGCGCTGATTTCTTCTTAAAGGCTCAAAAAGGGTCTTCTGGGTTTGATCGAACAACCAAAAGAGTCTCTTGTTATCATTTCAACGCTACCAG


Gene Sequence:
>Vu_00702(-)
ATGCCAGAAAACAGGCAGGTTCTCAGGAATGCTGATTCTACACCTTCTGGTGACAACATTGAAGGTGGTGCAGATTTTTCTGGTGATTCATTTTCCTCTGTTTTTCTGTCATGATTCCTGCTTTAAATGGTCCTGATCATCGCTTAATCATGTTGCCTTTCTTTTGTTTCGCTAGGGAATGTTAGGTATTAGATTGTCTTCACAGAACCATTTTCTTTCGTTTATGATATCGTGGCTTTCTTTTTTTGGTACGACGATTTTGATTTTGAGAATTCTGGTGATTCACACAATGTATTGCGAGAGACCTTTGGGGATTTTTTAAAACATGTTTTAGTTTTTTCTTTTCAAAGTTTACTTTTCTAAGCTGAGCTTTTATGCTTGATCACCCGTGGGTTTACATAGTTGATGAACCTCTTTTAACGATGCAACGAAGGATCGCCTACATGTTTTGATCTTAAAATCTTTTAGGGAACACTATTGTGCTTTTTGAGGTGAAAATGTTAGCTATTGGTTTAATTTGCTCAAATGAGAGCTTGAATAGACTTTGCCTGATTCCTGACTGATCTGTTTCGTAGAAGCGATTCGTCGTTTGAAAATCAATGATAATTGGGACAGAGATGCTGCAGCTCAATCTACCCAATATCCAGATCGACCCGGTGAACCCGATTGCTTGTATTATTTGAGGACTGGAATGTGTGGTTATGGGAGTAACTGTCGCTACCATCACCCTGCCCATATTTCAATTGTAAGAGCTCTTTCTTTTGTTTCCTTTTCATTCCTTGTCTTCTGAATATATATTAAGCAACCCCTTTGGCCAAACACTGGATTAGTTTGTATAATTGTAATCTCTTGGTTCCTATTGAAATTCTTAAATCTGCTTCTCAGTTTTATCATATGCAAACAAAGGGAAGTTTCTAATACTTAATTAGATGTTCAGGGTTCTCATTATGGTGAAGAACTCCCCCAGAGGACCGGGCAACCTGATTGTGAGGTATGTTTATTTTGGTGATCAAAATGTAAATGTTTTGCAACTTTTCCCTCTGTTGAATTTGTTAGGAGTGTAATTTAGAACCGTTCTTGTGTCTCTGCCTAGCAACTTAAGCTTAGTCATAACAGATTATTCTTTATGAAACTGATTGTGGATGCGTTTTTATATTAGAACTCTACAGTGAAATCAAACGAAGTTTGAGGTTTGTTTTGTTATTAATAATAAATAAAATACCTTGCGTCTGTAGAAAACTCCATAAGAAGTTCCAAAGTTATGCGTTTCATATTTTGCAATGTCCCTCTGGCAGAAACTTTACCTGGTCTTTTGCATTTATGTTTGTCCTTTTTGTGGTCCCTTTCAATAATAGATCTGATCTGTTTGAAATGTTTAGCTTACTGATTACTGGTGCACTGATAACAAACCATTAAATGATGGAAAAGAAAATGTCAAACTGAAGTAGCGATACCTAATGAACTGGACAAAAGTAGAGTAGTTATGCTGTCAGTGTAACGTCAACCATTTTGTTTTCTATTGATGATTTGTTTGATTTTTACTGGTCATTTTATGCGGTTTTTGTCTTATAGATCTTAATCATAAGATTTCATATGATGGCAAAATTTTATTGATGCCAGCTATGGCATGCTTGAACTAGGAAAGGAATAAAATATATGAACTTGAGGTACACATCTATCATACTATAAATATCGGGTTACGGAACCCAAGTGTAATCTGAAGAATTTTGTATGCTACACAGTCCATTTCAATGGAAGATTTATTGTTCTATTCCGGTGCTTTTCAATTTGATTAACTTGTTTGAGATGTGCATTGCAGTATTTTCTTAAGACAGGGACATGCAAATATGGATCCACATGTAAATACCATCATCCAAAGGACAGGCGTGGTGCTGCTCCTGTGTCATTCAATACTTTAGGTCTTCCAATGCGTCAGGTTTGCGCATCCCTTTGCACCTTCAGCATTTTTATAATTGATTGCTGATCATTTTGTTTTTGTTGATAAAAGAAACCGTTGCAATCTTTCAACATTCTTTGATTGTTGTTGCATTTAGGAAGAAAAATCATGTCCCTATTACATGAGAACCGGGTCTTGTAAGTTTGGTGTTGCATGCAAGTTTCATCATCCACAGCATGCTTCCATTGGAGCATATCCCTTGGCTGGATCTCCTACCTCAACAATTATCCCTACATCAGGTTTACCATATGCCGGAGGGTTTCCTGCATGGTCAGCAGTGCCAAGAATGTCATATTTATCTGGGCAAGGTGTTCAATCTTATGTGCCACCTTTTCTCTCTTCTTCACAAGGCATTATACCCGTGCAGAGCTGGAACAACTACATGGTTAGTTAAGGATGTTGAATGTCCTGTTCATCTATATATTTGCTCTGGCCTTACTCAGTGTTATTCTGTCGTTGAATTCGACCTGTGTGGCCAGTATTTCTCTTCATGAATGATTGCAAGGGTTATTTACGTTTGCTAATTGTTACAGAAAAAAAGATGGAAGTGGATATTATTATATCTATTCTCTCTTACTGAAATTTTACTCTCACTCATAATGTTTTGGATGGCTGAATGAAGCATTAAGCAATAGTTATTTTTTACTTGGTGGCATCTAAAATTTTGTCGTCTGATTGATGTATAAATGCAAGGGGATTATAGTCCATCGTTACCATGTTTTAATTCCAAGTGTCTGACTGACATGTCTAGATACATATACCTATAGTTATTCATCATACTTTCCATCTATTTTATTATGGTGATGGCGAAGCACATTTGGAATCCATATCCCTGTTAATATCTGAAACGAAAAAGTGTCTTGTTCTTAAGGAAATCTTTGGAGCATCTGGCCTTTTAATGATAATTAATGATGTTGGGTTTTGGTTACTAAATTAAAAAGGAGCATACAGTTAACAGCAGTTTCTGCAAATTGAGTTAAAATCTTTTGTTTTGACTGTGACTTTGTTTCTCAAAATAGGGAAGTATGAATCCAACAATGCCTACTGGTTATCTTGGATCTAATCTTGTTTATGACTTCATGAATCTGGGGGAGTCACTTTTCGGCGGGCAGGCGATAAATTCAGCTCTCCCAAATCGACCTGATCAACCAGAATGTAGATACTTTATGAGCACTGGGACCTGCAAATATGGATCCGATTGCAAGTTCCACCATCCAAAGGAAAGAGTATCTCAATCATTAATAAATCCACTTGGCCTTCCTGTGAGACCTGTAAGTTCAGCTTCTCCAAAAATAATTTGTGATATCACTTTTAAAGTAATTCTTATGAAAGTTCACAAACTGTCGTAACAGAGTGTGACTGCATGATAGTAGGAAAAATCAGAGTATTTATTGCTCCTAATATACTGACAAGTTATTTTGACAATCCATATTGCTACCAAATATGGCTCTTTAGTGTTTAGATTCCTGATTTCAAACTTGGCTTATCTGCAGGGGCAAGCTGTATGCTCTTACTACAGAATCTATGGAATGTGCAAATTTGGTCCAACATGCAAATTTGATCATCCAGTGTTGACTATCCCTCAGAACTATGGCTTGACCTCACCTGCTCTAGCACTTGATGCTCCTCTTATTAGTAACCAAAGAGGGTTGTCAAGTGTACAACCACCTGAGACATCTCCTTCTAAATTATCAAGTGACAACAAGCTTCAGCACTCTGATGCAAAAGCTGCCACAGAAGATTCATCCAAACAAGCTGATACTACACCAAATTCCTTCCCAGCCTCCTCAGAGCCTTTACATGACTAA