Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00797 LG1 11315898 11320612 hypothetical protein PRUPE_1G186900
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   response to virus, leaf development, phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain, protein phosphorylation, positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter, protein phosphorylation, leaf development, response to virus, phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain, positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter, protein phosphorylation, phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain, positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter, positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter, phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain, phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain
Cellular Component   is active in   cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex, nucleus
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity, protein binding, RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity, cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity, RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity, cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity, protein binding, cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity, protein binding, kinase activity
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 11316175 stop_gained p.Gly337*
G/A 11316283 stop_gained p.Gln301*
C/T 11317193 stop_gained p.Trp212*
G/A 11320293 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00797.1
MAIAAPGQLNVNESPTCGSRSVDCFEKLEQIGEGTYGQVYMAKEIKTGEIVALKKIRMDNEREGFPITAIREIKILKKLHHENVIKLKEIVTSPGPEKDEQGRPDGNKYRGGIYMVFEYMDHDLTGLADRPGMRFTVPQIKCYMRQLLTGLHYCHVNQVLHRDIKGSNLLIDNEGNLKLADFGLARSFSNDQNANLTNRVITLWYSFDHHALELLEKMLTLDPAQRITAKDALDAEYFWTDPLPCDPKSLPKYESSHEFQTKKKRQQQRQNEEMAKRQKMQHPQQHSRLPPIQQPGQHGQMRSGPNQQIHGSQPPVAAGPTHHYGKPRGPSGGPGRYPPNGNQGGGYNHPNRGGQGGGYGTGPYPPQGRGAPYGSNNMPGGGPRGGGGGGSGYGVGAPNYPQQGGPYGGSAAGRGSNMMGGNRNQQQYGWQQ*


CDS Sequence:
>Vu_00797.1
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Promoter Sequence:
>Vu_00797::LG1:11320612-11322612(-)
AGAGAGTAGTGAGTGTTTTCTGAGAGAAGATGTAGAGGAGGTAGAGAAAAGGAGGAGAAAAAGGGGATTCTTCAGAATTCTGGAAAGAGGGTGCATGCAGAGAGTGGAGTAGATTTTTCTGAAAATTCAAGTTTTGCTCCACATTCGAGAACAAACGTCCCCTCTTCAGCCGACACCTGTTTTCTACTAACTGGTTTCCGACTCCCCTCATCATGACACCTGGCGTCCGTTGTTGAAGTGTCGCGCTCTCAGAGTGACACGCAAACTGCACTGCGCTCCTCACTCCAGACTCCATGCAGCGTGACACCTGGCGTCCGTTGGTGAAGTGTCTCGCTCTGCGGTCGCCACGTACGTTGTTGAGGTGTCTCGTTCTCCAGCTACCACGCGTACTCCAGCGTACGTTATTTTCCAGGGTCTTACATTAGTTGTTCTTGGAAAATTTATTCATGAATCTAATCTCAAATATTTCACGTTTTTACCATACAACATGAAATTAACCTTTTAAATACTAAAATATATATTCAGTCTTCATGTTAACTTTATATTGATGAATTTAGTTAATATAATAACTGAAATTAAAGATAAAGTATAATTTAACATCAATACAAATAGCTCCAAACTAAAAAAAGATCCAAATTTTTATTTGGTGGATCAAATTAGATATGAAATTTAAAATGTAGCACCTAGAGGATCTCGAGAGTTCAATATTAATTTTATATATGAAATATAACAATGGTCTGTACAGTATTTGTATTTTCGTATTCTTTATTAATAAACTATCAATAAAAGCATAAGCACTTGATTTTAATATTTGATCATTTTTAGTGTCTATGACCAATCGTAAGAGTGAATTAAACTCTTATTTAAATAAATGGTAAAAATACAGTAGTAAAATAATGATATATTGTCCTCTTTTTAAAACATGAAATAAGAAGGTATAATATTTTGAAGTTCAGTTTTACTATCAAGACTTTTAATCTTCTAAAGGTCATCAATTAATTGCCATTATTTAAAAATTTATTAAAAATAAAATAAAATAAAAGATATAAAGCATAAAAAGACAACACTACACTTCTAAAATATAATCACACTATCTTCTAAACATGATAATATACGTTGTTTGTTATTCTATCTTTTCAAAATATTTTCCTTGCTTTAATAAAATAATTGTAAATAATTCAGTGAAATATTTTTTTTATATAAAAAAAACAATTTTAGGACTGAAAAATAACCTCTTATTTTGGAAAATTGAAAATAGTAGGTTTTCTTAAATGACTTTTAAATTATCACATTAAAGAGTTTATAAATTATTTTTAGAAATAAAAAGATTTTTATATTATCATTTAATTGTTTTTTTTCCACAATTAGTTTTTTTTTCTTTAGTACCTATTTTAAAAAATGTAGTGGTCTCATTATAATTTGCACCAATCGAGTTAACTCGGTGATGTGGTAATACCTTCTTCTTCTTCTTATTATTATTTTATAATTAAAAGAACAAAGATTAATTTACAAATACAAAATATTTTTATAATAAAATGTTATACTACTTTGATAAATATGTATAATAGATCACTAAACAGTATTGATTTTTTTTAAATCAAATCTCACATAACGTGAGATTGATATTGATATAAATAGAGTAAAATACATAAAAAGATATGTATCAAATATTACAATTGTAATTTTTCTAGTCTAAAAACTTATATATATTATAATCAAACTAATAATACTTACAGTTAAGTCATACTAATATATATTATTTGATTCTTTTATTAAATGGAAAATAGACTTGAACAATAAAATCAAAATTAAAGATATATTCTTCTGAAAATTACTTATATCTTTACAACTCCTATATCAGAATTTTATCTTTACAGGCTTTATTATTTGATTTGTGGGTAATTTTCGGGAAATTTCGCGCGCGAGAAACCCTAAGCGGAACCCTGATTCATTCGATTCGCTGTTGAATCCGAATTTGGAACTTGGAAGATTAGGGAGCA


Gene Sequence:
>Vu_00797(-)
ATGGCTATTGCAGCTCCAGGGCAATTGAACGTTAATGAATCGCCCACTTGTGGATCCAGAAGTGTCGATTGCTTCGAGAAACTGGAGCAAATTGGCGAAGGCACATATGGGTTAGTTTTCAATTTCTGTACTGCTTAAGCTTTACATTATTTTTGGGTTGTCTTTTTTAATATGGAAGTTGAAAATGTATGTTCTCAATTATAACAAAGCGTGTTTACTATGCAACACTCTATTGGAACAATCCCATATATTTTGTTAAGCTAGGCTGAAATTCAAAGCAACTTAAACCTGAACATTTAGGGGTCTTGATCTTGAGCACCTATCTCTTATCAATCAGAGCATTTTAGAGTGAAGAAATCGTTATAGTTATTTATTGGTGGGTGCTTTGGGGTTTAATTGTTATATATCCTTTTTTTTTAAATTTATTTATTGGTTCCATGTTTTAAAATTGTGATCACCGTTTCAGTTTTGTTGGCAATCCTTGATGTTGTGTGAAATTGTGAAAAAATGTGGCTGATGGGACCGCATTTCAGTTGCAATGTGGTTGCAAGGACCCTATAACCGTGATGTTTGTGGCTACGATCACGGTTACAGAAGCTTTTGTTAAAACCTCGATCTATTTTCTATGGTTTAGTTGGCTATTACTCTTGTGCAATTTGTTTTCTTATGTTCCCTTGCTCTCTTTCTCTGTGCAGTAGATTTTTTCGCCGCATTAATTTCTTCTATGGAGATAGCTTCCAACTTCATCACGCATAAAATGTCATCTAGTTGTAGCATTGTTCACATCAATGTCATCCGCTTCCTTTCTGATGCATTCTGAAGTGAATTGATATACCTTCATACATTTATGCTTGCAGTCAGGTTTACATGGCTAAAGAGATCAAAACTGGTGAAATTGTTGCTCTGAAGAAAATACGTATGGACAATGAGAGAGAGGGGGTATATCTTTGATTAAAAAAATTCATAATTTATCACATTCCATTCAGTGGACCTAAATCAGAAGTTACAGCACGTTCTGTTGGTACAAATTTTCCTCTGAACTGTGTTGTTAATTTTGCCATTGCAGTTTCCTATAACTGCTATACGAGAAATCAAAATTCTTAAGAAACTACATCATGAAAATGTGATCAAGCTGAAAGAAATTGTGACTTCTCCAGGTACCCTTTTTCAAGATCTAAATTAGCTTCACTATCAAATTTAGACGACTTAGGATTTAAAAGTTTGTTTTATTTATACATCTAGAATGTTATTTTTTTTCTTTCAGGTCCTGAGAAAGATGAACAGGGGAGGCCAGGCAAGTCATTCATTCTTGTATGAGCCCGACTGCTGGGCAGTATCATTACTATGCTTTGTAGTTCTAGTGTGTGAATATTTCCATCAATTTGCTTTGGGGTTAGCATACTAACCCTAGTTTGTCCGCTTTTTATTCTTGTTTTTGGGATTGCAGATGGTAACAAATATAGAGGTGGCATCTATATGGTCTTTGAATACATGGACCATGATTTAACAGGCCTTGCTGACCGACCTGGGATGAGATTTACAGTTCCCCAAATTAAGGTATTACTGTTAATACCAAGTTTTATTTCATATATTAATAGTTGCTTGTTTTATTGTTATCTGAATGGTGTTTCACTTCCTTTCGTAAGTGTTACATGAGACAACTGTTGACGGGGCTTCACTATTGTCATGTAAATCAAGTACTCCATCGTGATATCAAAGGTCTGTATATTGAAAAGATTGTTTTAGTTTAGGATGTAAAATTTTATTATTCTTATTTTATGTATTTTTTTTCTGTTGCAGGCTCAAATCTTCTTATAGACAACGAGGGAAACCTTAAGCTTGCAGATTTTGGACTAGCACGATCGTTTTCTAATGACCAAAATGCTAATCTTACAAATCGTGTCATTACATTATGGTACAGGTAATTACCAAAATGCTGATAAAAACGTTATGGTATAGGTAATTAATGTCATCTTTTGTCATGAGTTATGATTGGACGAGGGATATTTTGAGTGTTTTTTTATATATGTAGACCTCCTGAGTTGCTGCTTGGGACAACAAAGTATGGGCCTGCTGTAGATATGTGGTCAGTTGGGTGCATTTTTGCTGAGCTTCTTCAAGGGAAGCCTATCTTTCCTGGAAAAGATGAGGTTAGTAATATTCTATATATGATAAGTTGAGAGAAATTAGAAGCTAAATTGATGACTGATTGATGTGATATTGAGTGCAACGGACTAGTTATGGTTTTGTCTTGTATTATTATCAGCGAGCTTATGCATAAATGGTATCAAGAAGAGATTCTTTACATTGTAGCTCATCATATTCAGTGTCTTGATACTTGCCACAAGCATAAACTACCTTTCTGTTTCATTAAAATAAATTTTTATTTATTTTGTTTGATTTTAAATATAAGCATTTCTCTGAAAGTTAATTTTAGGTTAAATTAAAAATAAAAAATTTAGTCCTCACCTGTGACTCCAGTTTTTTTTGTAGTCCCGTAATTAAAAAGTTAGTCTTCACTTGTGACACCAGTTTTCGTTGTAGTCCCTGCATGTAAAAACTCGACATATTGTTCTACATTCCATACAGTAATTGGTCTCTGCAGTTTGCTAAAGTTAGTACAAGTGTTAGATATATTTTTTTTTTATTGAGGGACAACAACAGAAAAATTTCGTGTGTCAGGTGTAGATATCAATATTTAGAATTTTTTTTCTCATGTAGGGATGAAAACAAAGTGTATTTTTTGTATAAGAATTAAAACTAAATAAAGTATCTAATATAGATTACAAATTTACTACCAATTAAATATCAGGGTTTCATTTGTAAATATTTTTCATGTAGGGACTCAAATGTAGAGTGTTTCCCTGCAGAAACTGAAATGGACAAGTGTTAGGACTTGAGTCTAAATTTTTATTTTAAAGGTGATTTATATTTTTATCATCAAGAAAAGATGAAATGCTAATGATGATGTTTGTGTACATTGCTGGATCTCTAACCTGCCCAATACTTTGGAAATTTAGTCATTACGTTGCATTACACTCCTGATCTTTTTTTTTTAAATACATGACATTACTGTATATCCTCGTGATAAATTTTTTCCAGCTTAAATGTAATGCCGGCTTTGTTTGTAACCATTGTAGCCAGAACAATTAAATAAAATATATGAGCTGTGTGGAGCACCAACTGAAATCAACTGGCCTGGGGTTTCTAAGATACCTTATTATAATAAATTTATGCCAACAAGGCCAATGAAAAGACGTTTGAGGGAAGTTTTCCGGCAGTAAGTATCAAAATATACATGCTTTTCTATCCACCAGAAAAGCTAACCTGTATTTCATTTCCTGGGATTTTTTTTTATATATTTAAATAGCTTGTTTCCCTATGACTTACAGTTTTGATCATCATGCTCTGGAGTTGTTGGAGAAGATGTTGACACTTGATCCAGCACAGGTATCATTTCTTCACTTATAAGTCTGATTTATTAATTGTTAAATAATCTTGAATTTTTATTTTACAGGGTTCAAATGCCTGTTTTTCGTAGTTTTATTTTTTATCGCTCCATCTATTTTATTATGACATGGTTAACTGTATCTACAATAGCTGGCTTGTTTTATTATATCATGGATGTTGACAAAAATCTCAGTAAACTTAAGAGAAAAGTGCTATGCGTCTGGTTTTTCCTTTGTGAAAAACGGAAAAACATCAATGGCAGTGCTTGCTGGTTCAGACGAATTCTGTAAAGTAATTATATATGTGCTGTAATTGATAAATATGAAGTTGTGTTGGCGTAACCTGAAAATTTTTTGTAACCAAAAAATCTAAGCGAAGTAATTATTTTCCACTTGTTTACGTGATTTTATGACGATTAATTATTTTGTGTTTGTCGATTTGATTTCTTCAGAGAATTACTGCGAAAGATGCACTTGATGCTGAGTATTTCTGGACAGATCCATTACCATGTGACCCCAAGAGGTAAGAACTTCCATGTATTTTAGTTACTTATTTTCAGAATGCCACTTTTTGCGTGAAAATATGTCTTCTTAATAGGAATAAATATCTTCTCATTCACTCCTTTTCCTTTCCTTTTTACTTTATTGTTTCTACTCGACTAATCGTTTTCTGGTCGATACTTTTCAACTTCCTACTCTTATGTACGGCTTAGTTTGCCCAAGTACGAGTCATCGCATGAGTTTCAGACAAAGAAAAAGCGCCAACAGCAACGGCAAAATGAAGAAATGGCTAAGCGTCAGAAAATGCAGCACCCACAGCAGCACAGTCGTCTTCCCCCCATTCAGCAGCCCGGACAACATGGTCAAATGCGGTCAGGACCAAACCAACAGATTCATGGCTCTCAACCCCCAGTTGCTGCAGGACCCACTCATCATTATGGGAAACCTAGAGGTCCATCTGGTGGACCAGGAAGATATCCTCCCAATGGGAACCAAGGCGGAGGATACAATCACCCAAATCGAGGAGGTCAAGGTGGTGGTTATGGCACTGGACCTTATCCTCCTCAAGGGCGGGGGGCACCTTATGGGTCCAATAACATGCCTGGTGGCGGTCCTCGCGGTGGCGGTGGTGGTGGCAGTGGGTATGGAGTTGGAGCTCCAAATTATCCCCAACAAGGTGGTCCATATGGGGGTTCAGCAGCTGGTCGTGGCTCGAACATGATGGGTGGAAACCGCAATCAACAACAGTATGGTTGGCAGCAGTAA