Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00933 LG1 12556763 12562661 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase 20-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, signal transduction, intracellular signal transduction
Cellular Component   is active in   nucleus, cytoplasm
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein binding, MAP kinase activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, protein binding, MAP kinase activity, protein binding, protein binding, MAP kinase activity, protein binding, MAP kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 12557367 downstream_gene_variant
A/T 12559212 intron_variant
A/T 12559286 missense_variant p.Thr192Ser
T/C 12559341 splice_region_variant&intron_variant
T/A 12559547 intron_variant
T/G 12559566 intron_variant
T/A 12559703 missense_variant p.Val236Asp
T/A 12559909 missense_variant p.Met270Lys
T/C 12560259 synonymous_variant p.Leu319Leu
G/A 12560262 synonymous_variant p.Ala320Ala
G/A 12560266 missense_variant p.Val322Ile
G/A 12560277 synonymous_variant p.Glu325Glu
A/G 12560280 synonymous_variant p.Pro326Pro
A/G 12560283 synonymous_variant p.Ser327Ser
T/C 12560292 synonymous_variant p.Pro330Pro
A/C 12560299 missense_variant p.Lys333Gln
A/T 12560301 missense_variant p.Lys333Asn
A/T 12560302 missense_variant p.Met334Leu
A/G 12560320 missense_variant p.Arg340Gly
G/A 12560321 missense_variant p.Arg340Lys
G/A 12560324 missense_variant p.Arg341Lys
C/A 12560331 synonymous_variant p.Val343Val
A/G 12560339 missense_variant p.Glu346Gly
A/T 12560349 synonymous_variant p.Gly349Gly
G/T 12560350 stop_gained p.Glu350*
C/A 12560792 intron_variant
T/G 12560800 intron_variant
G/T 12560809 intron_variant
A/T 12560810 intron_variant
A/G 12560817 intron_variant
A/G 12560821 intron_variant
T/A 12560922 intron_variant
T/C 12560995 intron_variant
A/T 12562637 3_prime_UTR_variant
G/A 12562657 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00933.1
MQQDHRKKGSMEMEFFSDYGDANRYKIQEVIGKGSYGVVCSAIDTHTGEKVAIKKIHDIFEHVSDTARILREIKLLRLLRHPDIVEIKHVMLPPSRRDFKDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTKEHYQFFLYQLLRALKYIHTANVYHRDLKPKNILANANCKLKICDFGLARVAFSDTPTTVFWTDYVATRWYRAPELCGSFYSRYTPAIDIWSIGCIFAEVLIGKPLFPGKNVVHQLDLMTDLLGTPSLDTISRVRNDKARRYLTSMRKKQPIPFAQKFPNADPLALRLLEKLLAFDPKDRPTAEEALADPYFKGLAKVEREPSCQPITKMEFEFERRRVTKEEIGELIFREILEYHPQLLKDYMNGTERTNFLYPSAVDQFKKQFTHLEETGGKSSPVLPPERKHVSLPRSTIIHSNTVPTKEQSNIASSKIRQTTEEYSNNSRDTENPVPRSIQGLQKFSHAKPGKVVGPVIPYEYASVVKGSYEPRTFMRGSVPPSQPTPPTNHYQRLTSGKQERSATEAEKCVSLQSKLAQQCCVNGQIAPEIAINIDSNPFFMTRAGVNKIEQDDRIAIDTKLLQTKAHQYGGISTTAHRKVGPVQYGITRLF*


CDS Sequence:
>Vu_00933.1
ATGCAGCAAGATCACAGAAAAAAGGGTTCAATGGAGATGGAATTTTTCTCCGATTATGGCGATGCCAACAGGTACAAAATTCAAGAAGTCATTGGGAAAGGCAGTTATGGTGTTGTTTGTTCAGCTATAGACACTCATACTGGCGAGAAAGTAGCAATTAAAAAGATACATGATATCTTCGAGCATGTATCTGATACTGCACGTATTCTCCGTGAGATAAAGTTGCTTAGACTTCTTCGACATCCTGATATTGTTGAAATTAAGCATGTTATGTTGCCACCTTCGAGGAGGGACTTTAAGGATATTTATGTCGTTTTTGAGCTAATGGAGTCTGATCTGCATCAAGTCATTAAAGCCAATGATGACTTAACAAAAGAGCACTATCAATTTTTTCTGTACCAGTTACTTCGAGCACTGAAGTATATTCACACTGCAAATGTCTATCATCGAGACTTGAAGCCAAAGAATATATTAGCCAATGCAAACTGTAAACTTAAAATATGTGATTTTGGGTTAGCTAGAGTTGCTTTTAGTGACACGCCAACAACTGTATTTTGGACGGATTATGTTGCTACAAGGTGGTATAGAGCACCGGAGCTCTGTGGATCCTTTTACTCACGGTATACTCCAGCAATTGATATTTGGAGTATAGGTTGCATCTTTGCTGAAGTATTGATAGGAAAGCCTCTTTTTCCTGGAAAAAATGTTGTGCATCAGTTGGATCTAATGACAGATCTGCTTGGTACGCCATCGCTTGATACAATATCTCGGGTACGCAATGATAAGGCACGGAGATACCTGACTAGTATGAGGAAAAAACAGCCTATACCATTTGCACAAAAGTTTCCTAATGCAGATCCTTTAGCCCTACGACTACTTGAAAAGTTACTCGCCTTTGATCCAAAAGACCGGCCAACTGCTGAAGAGGCATTAGCTGATCCTTACTTCAAGGGACTTGCGAAAGTTGAGAGGGAGCCATCATGCCAGCCTATTACAAAAATGGAGTTTGAATTCGAAAGGAGAAGAGTCACAAAGGAAGAAATTGGAGAGTTAATCTTTCGTGAGATTCTAGAGTATCATCCTCAACTATTGAAAGACTACATGAATGGAACAGAGAGAACTAATTTTCTTTACCCAAGTGCTGTTGATCAATTCAAGAAGCAATTTACTCATCTTGAGGAAACTGGTGGCAAAAGTAGTCCAGTTCTGCCACCTGAAAGAAAGCATGTATCACTTCCCAGGTCAACAATTATACATTCAAATACAGTACCCACAAAAGAGCAATCAAATATTGCTTCCAGCAAAATCAGGCAAACAACTGAGGAATACAGCAATAATTCCAGGGATACAGAAAATCCTGTGCCAAGGTCCATTCAGGGTCTGCAAAAATTTTCACATGCGAAACCTGGTAAAGTTGTTGGGCCGGTTATTCCATACGAGTATGCAAGTGTTGTCAAGGGTTCATACGAGCCGAGGACATTTATGAGAGGTTCTGTTCCTCCTTCTCAACCTACTCCCCCAACGAATCATTATCAAAGATTAACCTCTGGGAAACAAGAAAGGTCAGCAACAGAAGCTGAGAAGTGTGTATCTTTACAATCAAAACTTGCACAGCAATGTTGTGTGAATGGCCAAATAGCACCAGAAATAGCAATAAATATTGATTCCAACCCCTTTTTCATGACACGAGCAGGAGTGAACAAGATAGAGCAGGATGACCGAATAGCCATTGATACAAAGTTGCTGCAAACAAAAGCTCATCAATATGGTGGGATTAGTACAACTGCTCATAGAAAGGTTGGACCAGTACAGTATGGTATTACAAGGTTGTTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_00933::LG1:12554763-12556763(+)
ACGTGTCATGTAAGCATGCTCATGTTGTTCCCCACTTTAATATTGCTAAAATTTACACTAAATTAAAGTAAGGGAAAACACTAATGTATTCAATTCCATCACTAAATTTACTTCTTATAGCAAAGTGGAAAACTATTGAATGTTTTATTTTTTTATAACTAAGATTATACATGTTATGTAAAATGCTAAGTCCTTTATAGCATAGTGTAACCAATAATTTTTAAAAGGATAACAATTTACATATATAAATGGTATATATTTTCAGCATGTATTTTAAATATAGAATGTGATCCTTTGGGATATTAAAGACAAGTTTTAATATATCTTACATAGAACAAAACTAAATATATATTTTTCAATTCTAAGACAACTAAGAATAGATATAAAACTTACTTCCCAAAGTATTTGTTAAATTATGTTAAATCGAAAAATTCATTTTCAAAGATATTACACTAACGAGATCTCGAAGATGATATCGATACACACTGATGAAAATTAAGAAGAATTTGATTTATTGAATAGTAAATGTCTGAATTTGCAGTGGATATATCATTGTTTTGATTTTGAAAACGATTTACTCTGTCTCTGTTGGATGTGTTGCTAAATCCTGTGGTTAATTAGAATGTCTGGTATTGTTGTGGAAGTAAAGTAAGTGTAAAGTAAAAGAAAGGTTAAAGTTTATACGAATATATTAATTAATTGCTAAATGTGCACTATTTGTGATGCACAGCTTTAATAGAAAAAAGGTTAAAGTTAATTAATGTATAAGACAACATTTTTGATGTGATCTTTTATTATGTTCGATGAATGTCTTGGGATCTGTCTAAAGCAAGTCTCATCCATATTTCACATGATTTATTTAGAGGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCTTTTGAATAAAAGAAAATTAACTTTAATTTTTTTAATTGAATAACTAATTAATCTTATAAGACCTAATTCACATCTATTTGGAATGGATTAATAGAGTTGAATTTTAATTATACATTTTTGTGAGATTATTAATGTCGTGGGTATTATTAACTATTTGGGGTCACTTTTAATATTATTATTGTGATCATTAGTTTGACGTTTGTAGCTAATAATAGCATGATAGTATATGGCTAGACAAATGTTTGTAATTTTGTTCTTATGGAAATAAATGATAAATATAACATTAAACTAACATGCTAAATGAATGAGACACTTTCCCTAATTCTAAACAATATCACTATATTTGTTATGGATGATTATTTCTTAATATTTTTATTATGTGTTCTTTTACTTTTAACATCATATCATTTTTAATCTTGGTTTAAGAATTTACACCAATAAATTAGTAAAGTGGTAAACTTGAATCTTAAAATTGTACACAAATTTTAATAAATTAAAATAAAGTCTCTAAAAATAATTTTAATTATTTATACTTGTCCCTTATTTCAGATAGATTCTTACACGTTGTCACTAAAATGAAATTTAGTTTATATACATTATTATTAAAATGCAATTCAGTTCATATATTTAAGAATTACATTATATTTTAATAGTAATAATAATAAGTATAATATGTTTAAAATGAAAGATAAATGTAGAAGAAAAAATTATTTTGAAGACGTTTTATTTATTTATAAATATTTAAGGGTTATTTGGAAAAAAGACATTTTGAATTGTAAGTTGTGAAAAATATCAAAAAAATAAAACCATGTAAATAAATAAAAATATTATATCTTTGAAAATGAAAATTGTGAGATTAATATTTTGGAAGGTGACACGTGTTTGGCACATTCCCTATGCCATGTAAGTTGGAGAGGAGACAGACAGGTAATTCCAGAACAGTATCTGCCATCTTACTTCGTAACCAGGTTTTAGGAACCTGAATTTACGAAAACACCCTCCATATTCTCTCTAAATATCAAATACGCCACTTGGGTATAATAAGAATCATACCATATCCGTATCTCACA


Gene Sequence:
>Vu_00933(+)
AAGCGAATGCGAAGCAGAGAGAGAGAAGAGCCACCCTCTCATACAACTCAACAAACAACTCATTCCAACAACGAAGCCTTTCAAAATTTTCACTCTTTCTCCTTGTGTCGGTGTACTCCTCTTCCGGGCCACTCGTTTTAGCTTCCTCAAACGCGCTTTTGGTTGAAGAAGCTCCTCTGGGATCTGAGTGTGGGGTGAGAGAGAGATGGGTGAGTTTTGTCTCTGAGTTAGATCTACGTCGCTTCATGTGCCAGTTTGGTGTTGGGATTGGAGGTGGGGTTGTATTTGGATTCTGTGTGGGTTGAAGGAGCTGGGGTAGGGGGGGTAAATGTGCTTGGCTTTTGTTTTATGTCAAAATTGAACCTTACCTTTCTATGTCTTTCCTATTGGTGGCTTAATTTGTAGTGGCTCTTGTCTCAGAATGCAGCAAGATCACAGAAAAAAGGTGGATTTGTTGTTTGTTTTCTTCATTATGCTTTACTCTTATTAGTTGCTTCACTAAAAGTATTGCTTTTTTCAAGTCTTTCTCTGTCCCTGAATGAATGATGAGGGTGCCCTTTTTGTATCTAAGCAGAGTAATGAATGATAAAACTAAAATTTTGTCTCCTTCTGTGTTGGTGGGTTACTTCTCAGAATTTTAGATTACTTAAGTCTAGGCGAGGTAGCGAGGCTCTGCCATGTTTCTTCCATGGGGCCTTCTTATGATGTTAGTTAGCTCTCTTATATTTAGTCCACCAGTGACATAATTTCTCTCCCCCACGTGACGTTTGGTTGACAGGGTCTTTATTTTTTTTCACCATTTCTGCAGTACTCTAATATGTTCATGAATTTTGCGTGGTTCTTCTTTTTACTTGCTAGATTGCATTCCTGGGGTTGATCTTCCATCTCAATCAACCCACCCTTTTGCTTTTCTTTGTTTCTACGTCTTCTGAGATGTGTTTCGCACGCGTTAGGTGCATTGTACGAGATTGACTCTCCCAAATAAACGTCGGTGAATGACAACAAATGGTTAATTGGGGAAGAGAAAAGTTATAGTCTAAGAATTGTGATGTGTTTATGGTTTTAAGCGCTATATTTTCTCCTTTTGGCTGGAACAAGCTGGGGACGGGGAGTGACGCTGTTTATGGTGACAATGTGTTTTTTTGTTTATTGTTTGTTATTTTGCTTGTGTTAGTCCAATCTACGTTGCTGACATGACCAAATTACTGAAAATATAGTTTCCAATCTGAGTCTATGATTCTTCAATACCGAGTTAGTTCCATAATGTAAATTATATGGCACACGCAATTTTGTTTGTTTAATGTGTATTGAACTTATGGATGGATCATGGATTCTGAGATATAGCAAAGAATGTTTATTTATTATTTTAATTTCAATTTATCTACTTTGAAAACTTATTTCCAATTTGTTGCTTTAGCTTGATTTATTAACGTTTGTAGATGACCAAATTTGGGCATGCCTGATTTTCCTATGTGGATTACTTTTATATCTTTGCAACAGGGTTCAATGGAGATGGAATTTTTCTCCGATTATGGCGATGCCAACAGGTACAAAATTCAAGAAGTCATTGGGAAAGGCAGTTATGGTGTTGTTTGTTCAGCTATAGACACTCATACTGGCGAGAAAGTAGCAATTAAAAAGATACATGATATCTTCGAGCATGTATCTGATACTGCACGTATTCTCCGTGAGATAAAGTTGCTTAGACTTCTTCGACATCCTGATATTGTTGAAATTAAGCATGTTATGTTGCCACCTTCGAGGAGGGACTTTAAGGATATTTATGTCGTTTTTGAGCTAATGGAGTCTGATCTGCATCAAGTCATTAAAGCCAATGATGACTTAACAAAAGAGCACTATCAATTTTTTCTGTACCAGTTACTTCGAGCACTGAAGTATATTCACACTGGTATTTTTCAATATCTGATACTTACTTGTTTATCAATATCTTATTAGAATGCACATTGTGTTGCTAATAATAGCTATACCTTGTTTTCAGCACTTGAATGGAATGTGACTGAAATTGCATCATTCCTTTGCATTTCTCTTTACGCAGATGTCAGCATTATGTATATCAGTTTTTTTTTTCTAACTGTTGCTGTTGACTTTGTTTTTACCTCGTGGCTGGATTTCCTTAAACTTATGTGGTTTGACCAAAATGTTTTACTTATTCATTTTCCTTTTTTTATATATTTTACTGTGTATTAATCAACTTAATTTTGCTGACTTCAATGCCAGTATTAATGCTGATCTAATATTTATCAACACATTGCAGCAAATGTCTATCATCGAGACTTGAAGCCAAAGAATATATTAGCCAATGCAAACTGTAAACTTAAAATATGTGATTTTGGGTTAGCTAGAGTTGCTTTTAGTGACACGCCAACAACTGTATTTTGGACGGTATTCCATCATAAAATTTCCTCTGTTTGTTTCACACCCATTTTACAGCTTTGCTAGATAACAGATGGCTGATGTTTTTCTTGCTTACTTAATATATTATTTCTATAGGATTATGTTGCTACAAGGTGGTATAGAGCACCGGAGCTCTGTGGATCCTTTTACTCACGGGTATGACTTTTTCAAGATTCTTTTGTATAGTCTTGAATATAAAAGAAGAGAACCAAATTCTGCATAGTCTTGAATCTCCATACCCTAATTCATGCTCAATAGTTTTGTGTAGAAATTTCATATCAACACATGATACATGCTTTCTGTTATGTTCTTTCCCCTCAATAGCTAAAAGTAAGACCCAAGACCAATCTGTTATTTATTATTAATTATTAATCCACTGGTTTCTAGTTTCTGTTAGTTTTGTGTCTTCTGGTGGGTTAACGCTAAGGTATTTAATGCAGTATACTCCAGCAATTGATATTTGGAGTATAGGTTGCATCTTTGCTGAAGTATTGATAGGAAAGCCTCTTTTTCCTGGAAAAAATGTTGTGCATCAGTTGGATCTAATGACAGATCTGCTTGGTACGCCATCGCTTGATACAATATCTCGGGTAATTATTTTTCTCTGTAGAGGGAAACTGTCAGCATTTGCTTAAATTCAATTTTCCAACATCATTCTTTTGGCGACAATTTTGAATCTTTGTGTTGGATGCAGGTACGCAATGATAAGGCACGGAGATACCTGACTAGTATGAGGAAAAAACAGCCTATACCATTTGCACAAAAGTTTCCTAATGCAGATCCTTTAGCCCTACGACTACTTGAAAAGTTACTCGCCTTTGATCCAAAAGACCGGCCAACTGCTGAAGAGGTTTGTTATATTGTTCTCTATGCTTTGTTTGTGTGAGTTGAAAAATTATTCTAGTTACATTAGTAACTGTTTCTAGAACTTACGCTTTTTCTTTTGGAGTTTGGACAAATAGAAATGTGTAATCAATCACACAGCAGTTTCATTGTGTGCAATAATTTGTGATTTTCTTGCTCAAGAATTTTGAAGGATTTGGCATTTTCAGGCATTAGCTGATCCTTACTTCAAGGGACTTGCGAAAGTTGAGAGGGAGCCATCATGCCAGCCTATTACAAAAATGGAGTTTGAATTCGAAAGGAGAAGAGTCACAAAGGAAGAAATTGGAGAGTTAATCTTTCGTGAGATTCTAGAGTATCATCCTCAACTATTGAAAGACTACATGAATGGAACAGAGAGAACTAATTTTCTTTACCCAAGGTTTTTATTATTTGTTTTCGGTTCATTCTTCAACTGGTTATCTTATTTTCCTTAATATATATATATATATATTTCACGTTCTACCCTATTATTCTTCTCCTTATCGTAATTGGTGCTTATTCTTCACAGTGCTGTTGATCAATTCAAGAAGCAATTTACTCATCTTGAGGAAACTGGTGGCAAAAGTAGTCCAGTTCTGCCACCTGAAAGAAAGCATGTATCACTTCCCAGGTAATTCGTTAATGTAGTAACTCATTGGATTTTAATTGTCATTTATTATTATCATGCGTTGTTGGAAAAAAGTTCTCTTGATTACACAGGATTGAATATTCTATGATGATTGTTGAATACACTAATGTCTATATGAGATGCTTAAGAAAATTATGCTATGTGCAAATAGGAACTGACACATACAGACAACTGGTTTTGACGCGATACCTGTTCTAATTTCATCTTCCATGTGCATAGATGCTATCACTGTTTAAAACTTGACTGGTCAAGCTATTAAATAATAATATAATAAATGCATAAAATATATTGAAGAAACATGATATCTTAATTTTATAAGGCTAAAAGCTAAAGTTGAAACGGCATTTTATAAAAAAAGTCCAAATCAAATATATCATTATACTTGTGTCTAAATTTCAACATTAAACAGCAATGTCTATTAACAACAGTATCAATTTGACATTTATAATTAAAAAATGATGATTAATATTTGAACCTTTTTTTTTTCATTTTTCTTAGAAGTAAAAAAGGTGTCTGTTAAGTATTTTTTATAGGTTCACTGGGAACTGTTTTTTGGCTTTTTCTCATTGATTTTCTTGCTCATTGACTGATTTGTCTTATGTCTGATTTAGTGGTATATTTGGACTGGACGCAAGACGGATTTACTGATTTTTCAATTAAATCGGTGAATTTGGTGTTGGTTTTAGATCATAGGGAATTACTATACATTTTTCTAAGATGCATTAATGTAAGATGTTGTTGACTATATCGTCGATGAAGTGACGTGCACGAGTTGCAAATGCACTCAATTATTTCAAACCTGTTATTGATATTTATCTGAGCCATAATTTAGTGTTATTAATGGGGAACTTAATTAGATTACATCACACTAAATTTTTCTTGTTTGATTTCCTTATTTTCCTTTTGGAATTATCGACAGGTCAACAATTATACATTCAAATACAGTACCCACAAAAGAGCAATCAAATATTGCTTCCAGCAAAATCAGGCAAACAACTGAGGAATACAGCAATAATTCCAGGGATACAGAAAATCCTGTGCCAAGGTCCATTCAGGGTCTGCAAAAATTTTC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