Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02632 LG1 39420693 39425748 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase 9
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, abscisic acid-activated signaling pathway, abscisic acid-activated signaling pathway, abscisic acid-activated signaling pathway, intracellular signal transduction, protein phosphorylation, signal transduction, protein phosphorylation, protein phosphorylation, abscisic acid-activated signaling pathway, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   nucleus, cytoplasm
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, mitochondrion, nucleus, nucleus, cytosol, nucleus
Molecular Function   enables   MAP kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, ATP binding, protein kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, MAP kinase activity, protein kinase activity, ATP binding, MAP kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, MAP kinase activity, protein kinase activity, MAP kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 39420826 5_prime_UTR_variant
A/C 39420842 5_prime_UTR_variant
G/A 39420997 5_prime_UTR_variant
G/C 39421006 5_prime_UTR_variant
G/A 39421007 5_prime_UTR_variant
G/C 39421173 missense_variant p.Leu14Phe
G/A 39421439 upstream_gene_variant
T/A 39421622 upstream_gene_variant
T/G 39421643 5_prime_UTR_variant
A/T 39421655 5_prime_UTR_variant
G/A 39421676 5_prime_UTR_variant
T/A 39421713 5_prime_UTR_variant
A/T 39421878 5_prime_UTR_variant
T/G 39422014 5_prime_UTR_variant
C/A 39422257 synonymous_variant p.Arg152Arg
C/G 39422263 missense_variant p.Leu154Val
T/A 39422310 synonymous_variant p.Pro169Pro
G/A 39422439 synonymous_variant p.Arg212Arg
G/C 39422523 upstream_gene_variant
T/G 39422528 upstream_gene_variant
T/C 39422873 synonymous_variant p.Ser281Ser
G/T 39422929 downstream_gene_variant
A/G 39422977 downstream_gene_variant
A/T 39423141 synonymous_variant p.Ala331Ala
G/A 39423188 downstream_gene_variant
T/A 39423409 synonymous_variant p.Pro376Pro
C/T 39423416 missense_variant p.Arg379Cys
G/T 39423899 downstream_gene_variant
A/C 39424359 downstream_gene_variant
C/A 39424629 missense_variant p.Pro508Gln
G/C 39424648 missense_variant p.Gln514His
C/T 39424690 synonymous_variant p.Thr528Thr
T/A 39424718 missense_variant p.Leu538Met
T/A 39424721 missense_variant p.Leu539Ile
T/G 39424729 missense_variant p.Ser541Arg
C/A 39424731 missense_variant p.Ala542Glu
A/T 39424769 missense_variant p.Asn555Tyr
G/A 39424809 downstream_gene_variant
G/A 39424975 downstream_gene_variant
T/A 39424998 downstream_gene_variant
A/G 39425734 3_prime_UTR_variant
T/A 39425739 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02632.1
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>Vu_02632.3
MGGGGTLVEGIRRLFQRRASSSAENQNNANNSRVYVRDLRAQLASIPNHDHLVDPDFDFSTLKPIKVPAQIPFRPSSMDHHKKGAPESEFFTEYGEASQYQIQEVVGKGSYGVVGSAVDTHTGERVAIKKISDVFEHVSDATRILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSRREFRDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTPEHHQFFLYQLLRGLKYIHTANVFHRDLKPKNILANADCKLKICDFGLARVSFNDAPSAIFWTYTPAIDIWSIGCIFAEMLTGKPLFPGKNVVHQLDLMTDLLGTPPPESIARIRNEKAKRYLNSMRKKQPIPLSHKFPNADPLALRLLERLLAFDPKDRPSAEEALADPYFIGLANIDREPCTLPISKLEFEFERRKLTKDDVRELIYREILEYHPQMLQEHIRGGDQTSFMYPSGVDRFKRQFAHLEEHYGNGERSTPLQRQHASLPRERVCAPKDESKQHNDIENPSETNLQSPPGSDATGSQNGTSRSNYSARSLLKSASISASKCVVVKQNKDPEQEAIKEINDETMDDVRDVAALHA*

>Vu_02632.2
MVINQGAPESEFFTEYGEASQYQIQEVVGKGSYGVVGSAVDTHTGERVAIKKISDVFEHVSDATRILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSRREFRDIYVVFELMESDLHQVIKANDDLTPEHHQFFLYQLLRGLKYIHTANVFHRDLKPKNILANADCKLKICDFGLARVSFNDAPSAIFWTDYVATRWYRAPELCGSFFSKYTPAIDIWSIGCIFAEMLTGKPLFPGKNVVHQLDLMTDLLGTPPPESIARIRNEKAKRYLNSMRKKQPIPLSHKFPNADPLALRLLERLLAFDPKDRPSAEEALADPYFIGLANIDREPCTLPISKLEFEFERRKLTKDDVRELIYREILEYHPQMLQEHIRGGDQTSFMYPSGVDRFKRQFAHLEEHYGNGERSTPLQRQHASLPRERVCAPKDESKQHNDIENPSETNLQSPPGSDATGSQNGTSRSNYSARSLLKSASISASKCVVVKQNKDPEQEAIKEINDETMDDVRDVAALHA*


CDS Sequence:
>Vu_02632.1
ATGGGTGGTGGAGGAACGCTCGTGGAAGGGATTCGAAGATTGTTTCAACGACGCGCTTCTAGCTCTGCTGAAAATCAAAACAATGCCAACAATAGCCGCGTCTACGTGAGAGATTTGCGCGCGCAGTTGGCTTCCATTCCCAACCACGACCACCTTGTTGACCCTGATTTCGATTTCTCTACCTTGAAGCCCATCAAAGTTCCCGCACAAATCCCCTTCAGACCCTCTTCTATGGATCATCACAAAAAGGGTGCTCCAGAGTCAGAGTTTTTTACTGAGTATGGAGAGGCGAGTCAATACCAGATCCAAGAGGTTGTTGGAAAAGGAAGTTATGGTGTTGTGGGTTCTGCCGTTGATACTCACACGGGTGAAAGGGTTGCAATCAAGAAAATTAGTGATGTTTTTGAGCATGTATCCGATGCCACACGGATCCTTAGAGAAATTAAGCTCTTGCGGTTGCTTAGACATCCTGATATTGTGGAAATTAAGCATATTATGCTTCCTCCTTCCCGGAGAGAGTTCAGGGATATCTATGTAGTGTTTGAGTTGATGGAATCTGATCTTCATCAAGTAATCAAGGCCAATGATGATCTTACCCCCGAGCACCATCAATTTTTCTTGTACCAACTTCTAAGGGGCCTGAAATATATTCATACAGCAAACGTGTTTCATCGTGATCTGAAGCCAAAAAATATTCTTGCTAACGCTGACTGCAAACTAAAAATATGCGATTTTGGGCTTGCTCGAGTTTCATTCAATGATGCTCCATCAGCTATATTCTGGACTGATTATGTTGCAACTCGGTGGTACCGTGCACCGGAATTATGTGGTTCTTTTTTTTCTAAGTACACTCCTGCAATTGATATATGGAGCATTGGATGCATATTTGCAGAAATGCTCACTGGGAAGCCATTGTTTCCTGGAAAAAATGTTGTGCACCAATTGGATCTCATGACTGATTTGCTTGGCACTCCTCCTCCAGAGTCCATTGCAAGGATTCGAAATGAAAAGGCCAAAAGGTATCTCAACAGCATGAGAAAAAAGCAACCAATTCCACTATCCCACAAATTTCCAAATGCAGATCCATTGGCTCTCCGGTTACTGGAACGGCTACTTGCATTTGATCCTAAAGACCGTCCATCAGCTGAAGAGGCACTAGCTGATCCTTACTTCATTGGTTTGGCGAACATAGACCGTGAACCATGCACTCTACCCATTTCAAAACTTGAGTTTGAATTTGAGAGAAGGAAATTGACCAAAGATGATGTCAGAGAGTTGATTTATCGAGAGATTTTGGAGTACCATCCCCAAATGCTGCAAGAGCATATTCGTGGTGGAGATCAAACTAGCTTCATGTATCCAAGTGGGGTTGATCGGTTCAAGAGACAGTTTGCACATCTTGAGGAGCATTATGGGAATGGTGAACGAAGCACTCCATTGCAGAGACAGCATGCCTCCTTACCTAGAGAGAGAGTTTGTGCTCCCAAGGATGAAAGTAAACAACACAACGATATTGAAAATCCAAGTGAAACAAATCTACAGAGTCCTCCAGGGTCTGATGCGACAGGTTCTCAAAATGGAACCTCCAGATCAAACTACAGTGCGCGTAGCTTGTTAAAAAGTGCGAGTATTAGTGCTTCTAAGTGTGTAGTTGTGAAACAAAATAAAGATCCAGAGCAAGAGGCAATTAAGGAGATAAATGATGAGACGATGGATGATGTGAGAGATGTTGCTGCCCTCCATGCTTGA

>Vu_02632.3
ATGGGTGGTGGAGGAACGCTCGTGGAAGGGATTCGAAGATTGTTTCAACGACGCGCTTCTAGCTCTGCTGAAAATCAAAACAATGCCAACAATAGCCGCGTCTACGTGAGAGATTTGCGCGCGCAGTTGGCTTCCATTCCCAACCACGACCACCTTGTTGACCCTGATTTCGATTTCTCTACCTTGAAGCCCATCAAAGTTCCCGCACAAATCCCCTTCAGACCCTCTTCTATGGATCATCACAAAAAGGGTGCTCCAGAGTCAGAGTTTTTTACTGAGTATGGAGAGGCGAGTCAATACCAGATCCAAGAGGTTGTTGGAAAAGGAAGTTATGGTGTTGTGGGTTCTGCCGTTGATACTCACACGGGTGAAAGGGTTGCAATCAAGAAAATTAGTGATGTTTTTGAGCATGTATCCGATGCCACACGGATCCTTAGAGAAATTAAGCTCTTGCGGTTGCTTAGACATCCTGATATTGTGGAAATTAAGCATATTATGCTTCCTCCTTCCCGGAGAGAGTTCAGGGATATCTATGTAGTGTTTGAGTTGATGGAATCTGATCTTCATCAAGTAATCAAGGCCAATGATGATCTTACCCCCGAGCACCATCAATTTTTCTTGTACCAACTTCTAAGGGGCCTGAAATATATTCATACAGCAAACGTGTTTCATCGTGATCTGAAGCCAAAAAATATTCTTGCTAACGCTGACTGCAAACTAAAAATATGCGATTTTGGGCTTGCTCGAGTTTCATTCAATGATGCTCCATCAGCTATATTCTGGACTTACACTCCTGCAATTGATATATGGAGCATTGGATGCATATTTGCAGAAATGCTCACTGGGAAGCCATTGTTTCCTGGAAAAAATGTTGTGCACCAATTGGATCTCATGACTGATTTGCTTGGCACTCCTCCTCCAGAGTCCATTGCAAGGATTCGAAATGAAAAGGCCAAAAGGTATCTCAACAGCATGAGAAAAAAGCAACCAATTCCACTATCCCACAAATTTCCAAATGCAGATCCATTGGCTCTCCGGTTACTGGAACGGCTACTTGCATTTGATCCTAAAGACCGTCCATCAGCTGAAGAGGCACTAGCTGATCCTTACTTCATTGGTTTGGCGAACATAGACCGTGAACCATGCACTCTACCCATTTCAAAACTTGAGTTTGAATTTGAGAGAAGGAAATTGACCAAAGATGATGTCAGAGAGTTGATTTATCGAGAGATTTTGGAGTACCATCCCCAAATGCTGCAAGAGCATATTCGTGGTGGAGATCAAACTAGCTTCATGTATCCAAGTGGGGTTGATCGGTTCAAGAGACAGTTTGCACATCTTGAGGAGCATTATGGGAATGGTGAACGAAGCACTCCATTGCAGAGACAGCATGCCTCCTTACCTAGAGAGAGAGTTTGTGCTCCCAAGGATGAAAGTAAACAACACAACGATATTGAAAATCCAAGTGAAACAAATCTACAGAGTCCTCCAGGGTCTGATGCGACAGGTTCTCAAAATGGAACCTCCAGATCAAACTACAGTGCGCGTAGCTTGTTAAAAAGTGCGAGTATTAGTGCTTCTAAGTGTGTAGTTGTGAAACAAAATAAAGATCCAGAGCAAGAGGCAATTAAGGAGATAAATGATGAGACGATGGATGATGTGAGAGATGTTGCTGCCCTCCATGCTTGA

>Vu_02632.2
ATGGTTATCAATCAGGGTGCTCCAGAGTCAGAGTTTTTTACTGAGTATGGAGAGGCGAGTCAATACCAGATCCAAGAGGTTGTTGGAAAAGGAAGTTATGGTGTTGTGGGTTCTGCCGTTGATACTCACACGGGTGAAAGGGTTGCAATCAAGAAAATTAGTGATGTTTTTGAGCATGTATCCGATGCCACACGGATCCTTAGAGAAATTAAGCTCTTGCGGTTGCTTAGACATCCTGATATTGTGGAAATTAAGCATATTATGCTTCCTCCTTCCCGGAGAGAGTTCAGGGATATCTATGTAGTGTTTGAGTTGATGGAATCTGATCTTCATCAAGTAATCAAGGCCAATGATGATCTTACCCCCGAGCACCATCAATTTTTCTTGTACCAACTTCTAAGGGGCCTGAAATATATTCATACAGCAAACGTGTTTCATCGTGATCTGAAGCCAAAAAATATTCTTGCTAACGCTGACTGCAAACTAAAAATATGCGATTTTGGGCTTGCTCGAGTTTCATTCAATGATGCTCCATCAGCTATATTCTGGACTGATTATGTTGCAACTCGGTGGTACCGTGCACCGGAATTATGTGGTTCTTTTTTTTCTAAGTACACTCCTGCAATTGATATATGGAGCATTGGATGCATATTTGCAGAAATGCTCACTGGGAAGCCATTGTTTCCTGGAAAAAATGTTGTGCACCAATTGGATCTCATGACTGATTTGCTTGGCACTCCTCCTCCAGAGTCCATTGCAAGGATTCGAAATGAAAAGGCCAAAAGGTATCTCAACAGCATGAGAAAAAAGCAACCAATTCCACTATCCCACAAATTTCCAAATGCAGATCCATTGGCTCTCCGGTTACTGGAACGGCTACTTGCATTTGATCCTAAAGACCGTCCATCAGCTGAAGAGGCACTAGCTGATCCTTACTTCATTGGTTTGGCGAACATAGACCGTGAACCATGCACTCTACCCATTTCAAAACTTGAGTTTGAATTTGAGAGAAGGAAATTGACCAAAGATGATGTCAGAGAGTTGATTTATCGAGAGATTTTGGAGTACCATCCCCAAATGCTGCAAGAGCATATTCGTGGTGGAGATCAAACTAGCTTCATGTATCCAAGTGGGGTTGATCGGTTCAAGAGACAGTTTGCACATCTTGAGGAGCATTATGGGAATGGTGAACGAAGCACTCCATTGCAGAGACAGCATGCCTCCTTACCTAGAGAGAGAGTTTGTGCTCCCAAGGATGAAAGTAAACAACACAACGATATTGAAAATCCAAGTGAAACAAATCTACAGAGTCCTCCAGGGTCTGATGCGACAGGTTCTCAAAATGGAACCTCCAGATCAAACTACAGTGCGCGTAGCTTGTTAAAAAGTGCGAGTATTAGTGCTTCTAAGTGTGTAGTTGTGAAACAAAATAAAGATCCAGAGCAAGAGGCAATTAAGGAGATAAATGATGAGACGATGGATGATGTGAGAGATGTTGCTGCCCTCCATGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_02632::LG1:39418693-39420693(+)
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Gene Sequence:
>Vu_02632(+)
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TAATTATTCGTGAAATTCTGTGATAAATAAATAGTAAAATTAGTCATTGACCAATT