Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03139 LG1 44144671 44148806 PREDICTED: protein BASIC PENTACYSTEINE4-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   response to ethylene, response to ethylene, regulation of developmental process, response to ethylene, response to ethylene
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   sequence-specific DNA binding, protein homodimerization activity, DNA binding, protein binding, DNA-binding transcription factor activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 44144813 intron_variant
C/G 44144939 intron_variant
G/C 44145658 intron_variant
G/A 44145775 intron_variant
G/A 44146585 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03139.1
MEDGRQNENDRHKMDYYRGPHSMWNTGSQHQVKEPNALVMNKKIRSILAERQAAILELELEAAISEKNEALAARDEAIRQRDEALVQRDNAILERDNALAALQSRNSSVTFPFGSGIQCGSKRIHHSSNHLCIMSEAAYKTKDASPITVIPSEVVKSHQAKRTKENKVIGSKASNPPYKVKKMGEDLNRKASFEGTKIRSEWHRQDVGLNLVKFDETTMPVPVCTCTGIPRQCYKWGNGGWQSSCCTTTLSMHPLPQLPNKRHARIGGRKMSGSVFTRLLSRLVLEGHDLSIPLDLKEYWARHGTNRYITIK*


CDS Sequence:
>Vu_03139.1
ATGGAGGATGGCCGTCAAAATGAAAATGACAGACATAAGATGGACTACTACAGAGGACCACATTCCATGTGGAATACTGGTTCCCAGCATCAAGTGAAAGAGCCAAATGCACTGGTTATGAATAAGAAGATTAGGTCCATTTTGGCTGAAAGGCAGGCTGCTATTCTAGAGCTTGAACTGGAGGCTGCAATATCTGAAAAGAATGAAGCCTTGGCTGCTCGAGATGAAGCCATTCGACAGAGGGATGAAGCACTTGTTCAAAGAGATAATGCTATTTTGGAACGGGATAATGCCCTTGCAGCTCTTCAGAGTCGGAACAGTTCTGTTACCTTCCCTTTTGGCAGTGGAATTCAATGTGGATCAAAACGAATTCATCATTCTTCAAACCATCTGTGTATCATGTCTGAAGCTGCGTACAAAACAAAGGATGCCTCCCCAATTACAGTTATACCTTCTGAAGTTGTCAAATCTCATCAAGCAAAGAGAACAAAGGAGAACAAGGTCATTGGTTCTAAGGCATCAAACCCACCCTACAAAGTAAAGAAAATGGGCGAGGATTTAAACAGGAAGGCTTCTTTTGAAGGTACAAAAATCCGATCTGAATGGCATAGGCAAGATGTTGGCCTGAATTTGGTTAAATTTGATGAAACTACCATGCCAGTTCCAGTTTGCACATGTACTGGCATACCACGACAGTGCTACAAATGGGGGAATGGTGGATGGCAGTCATCTTGTTGTACCACAACATTGTCTATGCATCCATTACCACAACTTCCAAACAAACGCCATGCTCGCATTGGAGGACGAAAGATGAGTGGAAGTGTTTTTACCAGACTTCTCAGCAGGTTGGTGTTAGAAGGCCATGATTTATCAATACCACTAGATCTTAAGGAGTATTGGGCCAGACATGGAACCAATCGCTACATCACCATCAAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_03139::LG1:44142671-44144671(+)
AGAAAACTGAGAAACCGAGAGATGAGAGGGAAAAGTAGAGCGAGATGCTCTGCTAGGGTTTTCACCCTTCTTCTGCAAGCACCAAACACCACCACCACACGCCGGAGTTCACACCAGAATCAGCCTAGCAACCAGAGTCAGAAAACAACAAGCAAAGGAAGAACACACAAAATAGGTACTGAATAATATTCTCTCTGTTATTTCATTAACCGCAAACATAATGTAGGAATACAACTTTATACAAGATAATAAACTGAAAGTAACTGAAAAATGTTTTGTTTATCCTAACATTCTGGAGATGAAGAGAAAGAAATAAAAATTATTGTATGTGTTTACAAATAGAAACTATAACATAAATTATTTTTTCTTAAGTATTGATATTTTAATGTGCTCCTCAACAAATTAAAATATTATTTATAATTTTTATACAATAATTCTTTCATAACAATATGTCCTTAACTATAATTTAATTAATTAGATCATTTTAATAAATTGACTAGTAATATAATGATCTTAACATATTTTATATTATATATATAATAATTTTTTTAAATCTATAATATATACATCAAGTTTTTTAATTTTAACCTAACATTATGAAAAAAAAATTAATATTCCACTTAGGTTTATGCCTGTTATAGTTTATCATTAACTATTTAAACATGGTTAATAATTTTGATTTATTTGTTACACATTTAAAAAATTAATAACCTAATTAAGATCAATCTATGATGACTTAATTAAGATTTTCTAACAAAATCTTAACACTAAGCGAATATTTTTCGTCATTTGCAATTTTGTCAAATATGTTTTACACAATATGTCAAACTTTTGAGGAACTTATTAGAGTTTGAAATGATTTTTAAATTTGTTGCTTATTTTGTATAAAAACCGAACATGATTGCTATTAGAAAATTCAGATCCTATACCAATTTCACCAGGTTTATGGTTATGAAAGGATTTGGATTGAATTTCAATTTCAATTTCAATCTAATTATTTATTATTTAATTATTTATATTTATATTTACATTTAATTTATTATTTTTTCATTTAAATTTCATTTTTACTTAACTCTTGCCACACGAGTACTAACTAGTCTATTAAACACAAACATTTTGGTTTAGAATGCACCAGCCACTTCATTTAAAAATGACACATATTAGTGACACATCTTTCTTTTAAAAGACAAATTAACCTTTTCAGTATTGGTAAAAAATGAATATAGGATTAATTTAGTTAATTTTTTAAAAATCAAAACAACCTTTTTAGACAACAATAGTTTTTATCTTCTCTGTATATTCAACCCTTTTTTAGAAACTTATTTCAAAATATGAAACTCCAAAAGAATAACCATTTGAGATGAGAGGTAATATGAACAATAATTTAGTAGGTACAGTCAAATCAAATCTTATTAATCTTATTAAAATAAGTCGTGAAAATACTTTTTCCTTGTTTATAAATTAGTCTTTCTAATTTGATAAACGAAAATGTAATTTTTATTGAGAGATATCTATATTTAAACTGCACTGTGTTTTGAATTAATTTTTCTTTAAAGAAAATATCTTGAAAAACAAAGCAAGATTTTAAATTCGCATGAGTATTTCAGAATTCATGTTAATAAGATGTTTTAATTGTTTTGTTCAACTCGTTTTCAGGTATATATTTAAAACTTAAAAAGAAAATAAAACAAAATATACGTGTTTAATACTTCTTTTAACTAAATACCATATAATATATATATTTTTTTATCATGATCGTATATTATTATCTATAAATCTATAACAATATATTAATATCATTGTTTTGTTTTAGCACACACAACTTACTTCCAAATACAGCTCTTAATATGCATGTTAATATATAAAATAATAAAAATTAAATTTTAGTTTAATAAAATAAAATATGCTGTATGAAATAAATAATATGAAAAGACATCTTAAAAACTTAATCTGAAAAAAAGAAAAACAAATAAAGTTTATATTTTGGGATGAAATTGATG


Gene Sequence:
>Vu_03139(+)
GATGATGAAAGGAAAACATGAGATGAAAGGTGAAGAAAGGAAAGAGTGAAACACTACTTTCTCTGCAGAGAAGTGTCCAAGAACAACAGTGTCATTGTAGCCTTGCAGGTATCTTCTTCTTCTCTCTCTAATTTCTCTCCCTTTTCCTTCGATTCCTTTTCACTACTTGTAGGTTTTCTCTCTCATTTCACATTTTATTGTCTCTTCCTGCCTAATTACTGCTTAAAGCTCTGTAATCTCCCTAACCTTTTTACTCAAACTTTTCACTCTTTTCAATGCCCATTTTTTTTTTGCATTCTCAAATTCTCTGCGGGATTCATTTCACACTGCAATTTTGATGATTTTCGCTTAATTTCCCGCTTTCGATCTCTGTATTTGCATTGCATGCATGCTTTTAGTTCCTATTTACGGGTTATTGAATTGGGAGATTGGGAAAAAATGTTTTCTGTTTGTTTCTTTTTGCAATGTGTTTGTGGATTGAGTGTTGCGAACAGTACTGGTCAAATGGGAGAGGGTTTTAGAGATTGACTTGAGGTTTTAGCACAATGATGTGATCACATTCTTGTGAAAAGGAAACAGAAAAAGGTTACTTAATGTGCTTTTCTTGTATACTTTTGAGGAAAGTGTAGAGTGGTGAGTGCGACTCATTTATTTTCTTTTTGTTACCATTTAAATATCCAGTTTGCTGTGTATGATCTCAGCAATGAGTTATGACTTGCATGTCTTTTTAGTTCTTCTTGGACTGCTGTGTTTACACTTAGATAACTATGGTAATCTGGATCGAATAATCTCTTTTGGTTGTTTCTTCTGCTTTCATACTTTATTGGTTGCTTATCTCTCTTTCTCCCTCTCTGTATTTGGGCACTGTCCCAGGGATCTTGCTCTTGAGTTAAGGATTTTTTATGAGCTATTAAACTATAAAAGTCCCTTCTTTGCCATATGAGGTTCAAACAATATTTCATAATTCAGATCTATGTAGTATTTGCTGTGCTCCCTGAAACTATCTATAATTTTGATAACTTAAAATAGACAATTAGCTAAGATTTGGCCACACTGAATTGATTGGGACTCTGTTTACTTCCTTTCAGTATGATTCATGGTAACGAAATATTGGGAGTGATTTGTCAATGACAGTGAAACAACTATTGCTTCCTAAGTTGTTTAGGGATTAATGTTTAGTGATGTCCCTGTTAAGTATTTGTAGCATGTTATTTATCCTTGTACAGTTAATATCTTGTATAATTGTAAACCATGTAAGATGGTGTTTCTAAGGTGCCTATAATATTAATTATTAACCTGCATATTCTGCGAGTAATTGATACATGCGAGAAATTGAGAACAATGTGTTTAGGATATGATTACTCAAGTTTGGTGGATTAGGTCATGCATTAGCTTTATTACAACTGTACCTTGATGTAAGGTTGGCCATTTTATGACCTGTTTGTTTCTGTCATTTGCAGTGAGAAAATGACAATTTTTCCATTGCAAGATTGTGAAACAATTAGTCTATGCTTACATGCTTTTGGCTTTCTTTTCCCAAGCAACTTATAAGTTGTCTTTGCTCTTGATTATACCTTTAGTGGAAATTTACTTCACTCCTATCATAAAGCAGTAATACTTGCTGAGTGCTTATAAATATTTTCTTTCCCCACTATTCAGCTTGAGGTTATGTGAAGTTCTAAAAATGTTATCATAAATGAATATTGTAAAACTGCAAACTCTCATTTTTGCAATCTGTGTCCAACATGTTCCCAAACTACAATAACCACTAAAATGCAATTCAGTATGTTGAGCACAGTGAAACTTTAGTGATAAGAAAAAATGAACACCTACCAGTATGCAATAAGGGTGTCCCATCTGGCTACTCTTTGGAAATATGGTTAATTTTTTAAAATATGTCCTGTATTTATGTTTGATATATTAGTCATGCTACTTTTAATTGTTATCAGTAACTTTCTTAGTGGAATTCTTGTTTATATTATAATGTTTTTAAGTGCATAACACATGAGTCTGTTGGAAGTTTTAAAGTCTGAAAGTTCTAAATGTTTGGGCATTGCCTTTTTCCTTGTGCTAGAATAAAGGATTGTGGTTAGGTATGGATTTGACTAAGTTATTTCTGTTCAAGCTTTGATGGTCCTTTTAAATGCCAAACATTTAAATGAAGAGTTTATATCTAGTTAATTACTTTTTTTTTTATTAATGTCTATTTCTCAACGTTGCATCATATCTGCTTTATAATGTACATTGGTGTTTGTGGTATGTAAAAAATTGTCATTTTGGTTAAATGAATTTTATCTACAAGCAACAGAAATTAAGTTTTTCACTGTCTACTTTCCACCATATAAATCTATAGTTGATAAAATTGAAACAGGGAAGGTTGAGTGCAGTTCTTGTTGGAGACTGGTGGAATCTCCACTTCACGCCTGAGTTTTTGTTCAATAAATGGTTTCTTTGTATCTACTTCTGTCTGTAGTGTGCAAGATAAAATAAAGAACTATTTAGCAGTCAAAGTTTGCTAAATTCTTTTCAGATTGTATTAGAACAATGTTTGGGAACGTTGATGTCTATTTTCTTTGCTTATTGACCTAATGCTACACTTTTTCTTTTCTCATTGTTAACAGGAGTTTCCTTTCACCTGAAGATTGTTGATTAATTAAATCCATGATTTCTTGACTTCAACTATCACATCTGTTGCAAAATCCTCTGGATGAAAAATGGAGGATGGCCGTCAAAATGAAAATGACAGACATAAGATGGACTACTACAGAGGACCACATTCCATGGTAAATAGAATACATGAATTTGTGATCTTTCTTTTTTTCAGCTTTGCACTACTGGTCACTTTATTCATTAGTTGAATTGGATTTTGCATTTGCAGTGGAATACTGGTTCCCAGCATCAAGTGAAAGAGCCAAATGCACTGGTTATGAATAAGAAGATTAGGTCCATTTTGGCTGAAAGGCAGGCTGCTATTCTAGAGCTTGAACTGGAGGCTGCAATATCTGAAAAGAATGAAGCCTTGGCTGCTCGAGATGAAGCCATTCGACAGAGGGATGAAGCACTTGTTCAAAGAGATAATGCTATTTTGGAACGGGATAATGCCCTTGCAGCTCTTCAGAGTCGGAACAGTTCTGTTACCTTCCCTTTTGGCAGTGGAATTCAATGTGGATCAAAACGAATTCATCATTCTTCAAACCATCTGTGTATCATGTCTGAAGCTGCGTACAAAACAAAGGATGCCTCCCCAATTACAGTTATACCTTCTGAAGTTGTCAAATCTCATCAAGCAAAGAGAACAAAGGAGAACAAGGTCATTGGTTCTAAGGCATCAAACCCACCCTACAAAGTAAAGAAAATGGGCGAGGATTTAAACAGGAAGGCTTCTTTTGAAGGTACAAAAATCCGATCTGAATGGCATAGGCAAGATGTTGGCCTGAATTTGGTTAAATTTGATGAAACTACCATGCCAGTTCCAGTTTGCACATGTACTGGCATACCACGACAGTGCTACAAATGGGGGAATGGTGGATGGCAGTCATCTTGTTGTACCACAACATTGTCTATGCATCCATTACCACAACTTCCAAACAAACGCCATGCTCGCATTGGAGGACGAAAGATGAGTGGAAGTGTTTTTACCAGACTTCTCAGCAGGTTGGTGTTAGAAGGCCATGATTTATCAATACCACTAGATCTTAAGGAGTATTGGGCCAGACATGGAACCAATCGCTACATCACCATCAAGTAGCCTCCTGAAATTTGTCAGTATTGAGTAGGTTTCATTTTGAACCTCTTGCAACAGTTTCATTTTGAACCTCTTGCAACAACTGACCTCTAGTTGAAATCATGCCTTGACTGGTATGCTTGACTCTTGGGAACATGATATGACTTTTCAGTAGAAGGTACCCCATACGTAGTCACTGATTTGGCTAGACTCAACTTTGATCCTTATTATAAATGAGATACCTGTAAAGTATCATGTATACATGTGACTTTCTAAGTAACTAGGGGTAGACCCTTTTGGTTCCCACCATGTTTTCTGCTTTGTCTGTCCACTGTGAATACGGTGTACGAAACTTTCTCCATCTTTTGTTTTTTAATCCTTTTATCAATCGTCATTTACAAAATTCCATGAT