Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04387 LG1 60666858 60670801 "PREDICTED: phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial isoform X1 "
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   cardiolipin biosynthetic process, cellular localization, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, cardiolipin biosynthetic process, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, cardiolipin biosynthetic process, cardiolipin biosynthetic process, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, cardiolipin biosynthetic process, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, cardiolipin biosynthetic process, CDP-diacylglycerol biosynthetic process, cardiolipin biosynthetic process, cardiolipin biosynthetic process
Cellular Component   is active in   mitochondrion
Cellular Component   located in   chloroplast, chloroplast, mitochondrion, mitochondrion, chloroplast, chloroplast
Molecular Function   enables   phosphatidate cytidylyltransferase activity, phosphatidate cytidylyltransferase activity
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03029 Mitochondrial biogenesis [BR:ko03029]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 60666980 splice_region_variant&intron_variant
T/C 60666985 splice_region_variant&intron_variant
C/A 60666999 intron_variant
G/T 60667001 intron_variant
C/T 60667203 intron_variant
C/T 60667246 intron_variant
C/T 60667326 synonymous_variant p.Tyr68Tyr
G/T 60667415 intron_variant
T/A 60667418 intron_variant
G/T 60667420 intron_variant
C/T 60667435 intron_variant
A/T 60667482 synonymous_variant p.Gly83Gly
T/C 60667508 missense_variant p.Val92Ala
A/G 60667511 missense_variant p.His93Arg
G/A 60667579 intron_variant
A/G 60667660 intron_variant
A/C 60667702 intron_variant
T/C 60667725 intron_variant
G/T 60667976 downstream_gene_variant
T/G 60668056 downstream_gene_variant
C/G 60668100 downstream_gene_variant
A/T 60668377 downstream_gene_variant
G/T 60668417 downstream_gene_variant
G/A 60668443 downstream_gene_variant
A/T 60668604 downstream_gene_variant
A/G 60668633 missense_variant p.His136Arg
C/T 60668762 downstream_gene_variant
C/G 60668767 downstream_gene_variant
T/C 60668817 synonymous_variant p.Tyr173Tyr
T/A 60668931 downstream_gene_variant
G/A 60669035 downstream_gene_variant
T/A 60669317 downstream_gene_variant
G/A 60669334 downstream_gene_variant
A/G 60669363 downstream_gene_variant
G/C 60669366 downstream_gene_variant
G/A 60669369 downstream_gene_variant
T/C 60669411 missense_variant p.Phe201Ser
A/C 60669437 missense_variant p.Met210Leu
T/A 60669746 downstream_gene_variant
T/A 60669759 downstream_gene_variant
C/T 60669775 downstream_gene_variant
G/C 60669830 downstream_gene_variant
A/G 60669932 downstream_gene_variant
A/C 60670004 downstream_gene_variant
T/C 60670039 downstream_gene_variant
T/A 60670046 downstream_gene_variant
G/T 60670534 downstream_gene_variant
A/G 60670786 missense_variant p.Met334Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04387.1
MFVAIDIMDNAAYRSFLQVLPPVEFACVYGSSLHPSNCDKTTMTDYIIGVADPKQWHSENLKLNKHHYASWMVHLGGERLITGVADEIGVGVHFNPFVSWNGKLFKYGVVRMHDLLQDVHYWEKFYLCGRLQKPVHIVVDNLDVNSTNSVNLRAAVSAALLLLPSEFTEADLYAKVCSLSYMGDVRMLFAEDKNKVKKIVFGQFDLFHSMYKPFLEEYEAKKLLRLSSIANNQIHISQDCDLSVDYSLVSALPPSIRNQIIMKEGVKEKLRETGRAINDTRSRVREEAANCLQRILRRRVMVSSARQAVSGLLAVGAVNASRYLARKVTKAWKSWSQA*


CDS Sequence:
>Vu_04387.1
ATGTTTGTAGCCATAGACATTATGGACAATGCAGCATATCGCAGTTTTCTTCAGGTTCTCCCCCCTGTTGAGTTTGCTTGCGTCTATGGATCATCTCTTCATCCATCCAACTGCGATAAGACTACCATGACAGATTATATTATTGGTGTGGCTGATCCCAAACAGTGGCATTCTGAGAATCTTAAATTGAACAAGCATCACTACGCGTCCTGGATGGTGCACCTTGGTGGGGAGAGACTGATTACGGGAGTTGCTGATGAAATTGGTGTGGGAGTACATTTCAACCCTTTTGTTAGCTGGAATGGAAAGCTGTTCAAGTATGGTGTTGTTCGAATGCATGACTTACTTCAAGATGTACACTATTGGGAGAAATTCTACTTGTGCGGTCGTTTACAGAAACCGGTTCATATTGTTGTTGATAATTTAGATGTTAACAGCACCAATTCTGTTAACTTGAGAGCTGCAGTGTCAGCTGCTCTTCTCCTGCTTCCATCGGAATTCACAGAGGCAGATCTGTATGCCAAAGTATGTAGTCTCTCGTACATGGGGGATGTACGCATGTTATTTGCCGAGGATAAAAACAAGGTGAAGAAGATCGTTTTTGGGCAGTTTGATCTATTCCACTCAATGTATAAGCCATTTCTTGAAGAATATGAGGCTAAAAAGTTATTGAGACTTTCATCAATTGCCAACAATCAAATACATATCTCTCAGGATTGTGACTTATCAGTTGATTATTCTCTAGTTTCTGCACTTCCTCCGTCAATCAGAAACCAAATCATAATGAAGGAAGGAGTGAAAGAAAAATTACGGGAAACTGGAAGGGCCATAAATGATACTCGAAGCAGAGTAAGAGAGGAAGCTGCTAATTGCTTACAGAGAATTCTGAGGCGTAGAGTAATGGTTTCAAGTGCAAGGCAGGCTGTATCTGGTCTTCTGGCTGTTGGTGCAGTAAATGCAAGCAGGTACCTTGCTAGAAAGGTTACCAAAGCCTGGAAATCATGGAGCCAGGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_04387::LG1:60664858-60666858(+)
ATTGTGGTGTTTTATGCCATGTAACCTTTGAGTGGGACAAAGTGGTGGTTTTGAATGGGTTGCGATGTTTATGCGATGAACCATTGTGTGGTGTTGGTTGTGTGTAATTGTTGATACTTTGTTTCTTACGTACTCATTGATGGCGAGCTCGAGAAAGTTCTGCTTTGGTAAGTAGGCTCTGTTTTGGTGAACAAGAAAGTCTTGCTTTGGTGAGTATGTGCTATTTTGGTAAATAGGAAAGTCCTGCTTTATTATGTCAGATTGTAGATTTATGTTTATTCTGTCAGCTCATCTTTATTTGTTTGTGTTTGTGCAATGATCGTATAATTCTTATTATACAGAAGTAAACGATTCTACAGATGTTCCGGTTGATGAATAAAACGACGAGTATATCAGAGTATTGGAAACATTTTTGGATTTATTTAATGTTTTTGCTTAATTAATAATGTAAAATTTTATTTCGTAACAATTATTTGTAAGGATTAAATTTTGGATTTTAGTTTAGTCTATTTTAATGATTGGCAATTTTAATAGGTGTGAATGGTGTTGAAATTTAAAAATAGAAAGTTTTACGCTTTTGTTTTTTGTATAATAGATCTCTCAGATGTATAAGATGTTGGGATATGTGTGTATATTTGATGTTATAATTATATGTCTGATAATTCTAATAGTCTTATATACATTTTCTTTTGGAACTATCTATTCTTTTAAATGTTTATGCATAAATTGTATATTATTAAAATAAGATTTTACAAAAACAACATTTACTTAAAAAAAAATAATAAACAAAACCTATTACACACCTCTACACACTTCTTAATGGCACCAACAAGATATAATAACGTTGGATAAGTTATTCTTTTACTTGTAAATATCACTTTGAGTTTTCTATTTGAGCTGAAATAGTCAAAGTCACAAAAGTTAATTTCAAAATTAGACTAATCATAAAGAATTTTCGATATTTATTTAATCCAATTAAAATTATAGTAAAATAGGTAATAATACTTCAAAATGGCGAGATGGGTAAAACAAATCGGGCCAGATTAACTTTTGGGCTATTCAGTTACCCGTTTTCCTTGCTGTTTTTGTCTTCTCTGTTTTTGACTCCGATGCACTTAAACTGTTCAAAATCACTGATCCTTCACTTTTCCAAACACTTGAGTTTTAAGTCTTTCGTCTTTGTCAAGCTACTATCACCAAACTTTTGACGACAACGCTTTAAAAATGCTATTTCACATGTATTTTTTTTTTTAAAATAACATCTAGAATTCAAATTTTCAATAAAATAATTAAGTAAAATAGTTAAAATTCACGTAATTATATTTCAATAGAATAATTAAAACAATTATATTTCATAAATTCATCGATTAAGTAAAATAATTTAAGTTCACACAATTCAAATATCTGTTTTCATGATTTTTCTTTTTATTTATACTTCTACTCTTAGTATATAAAGACACACTTGCATTGTTCTTAATTGAATTCGATGCATTCCCTAACCTACTTCAAATTGATTCCTGATTTCAATTTTCAATTATGCAAATTAAAAACATATTATATAGTTATTAAGTAATTAAAAATAATTTCTAATTCCTAACCATAAAAGTTAATAAAAAATATAATATAATTGTTTTTTTGCAATGGTGTAGACCATAAATGAAATAAGTGCAATGGAGAGCAATTAAAATACCACTTACGAAGCAGTGCAGGGGAGCAGTGGTTTGTGACTCGACGGCTAGCGGTTCAGAAGAAGGTATGAACCAGTGCGGGGCAGTAGAAGAATGAAATCCTGATCCCCTAATAAGTGAGTTTTCTTCACTTTCGCATGCCAAACCACTGTCGGATTTTTAAAATTTTTCTCTTCGAACTCTCCAACTCGGTTGCAAAATGGCGACTTTCGCCCAGTTCACCGATTCTATCCCGATTTTACCGAGTTTACATCAAAATCGAACTTGCTTCCGAGTCCGAAGCTATCGTCTAAGTTAACGAGTTGATAACCA


Gene Sequence:
>Vu_04387(+)
ATGTTTGTAGCCATAGACATTATGGACAATGCAGCATATCGCAGTTTTCTTCAGGTTCTCCCCCCTGTTGAGTTTGCTTGCGTCTATGGATCATCTCTTCATCCATCCAACTGCGATAAGGTCGTCTTTTGTTAAACCCATCGGTTTTTTTTGCTTGCTGGTCCTCTTCTTTATTATGGGCCTCTTTTTTTTTTTTTTACTCTCCTTTAATTGTTGTTTTAATATTTGTTCTCTGTTCTGTGCTTTTGTGTTTCTAGACTACCATGACAGATTATATTATTGGTGTGGCTGATCCCAAACAGTGGCATTCTGAGGTACTGATATGTGATTATGACTAATGATGTGCTATTTATTTATGTTATGAGTTGCTTGATATTGTTTGATTGCCCCACTGATATCTTTTGTTTTTCCTTTTATTGTTCATACAATGGCATCAATCAAGAATCTTAAATTGAACAAGCATCACTACGCGTCCTGGATGGTGCACCTTGGTGGGGAGAGACTGGTACTTGCTCAAATTTAGTTTCATTTTCATTGTTTGTGGCCTCTCGTATCTGGCTTGGGTTTTATTGGATGGCGATCTTATCTCATACTTTATCGTGATGTGACATATAAGATTACGGGAGTTGCTGATGAAATTGGTGTGGGAGTACATTTCAACCCTTTTGTTAGCTGGAATGGAAAGGTATCGATAACCTCTTATCATGACTTAGGGGTGTGTGGTATGTGATTGAGACCTTTAGTTTAGTTCCTGCAAACTCACCTTCCAGAGAAATTATTTCAGAATGCTGGGATATTTTTAATTTTCTATTAACATATGTTTTTTGGCTTAATTGTTAAATCAAGATTACATTTTTCACGAATTCCTTGTCTCTACAAGAAAATTTATGCAGCTGTTCAAGTATGGTGTTGTTCGAATGCATGACTTACTTCAAGATGTACACTATTGGGAGAAATTCTACTTGTGCGGTCGTTTACAGAAACCGGTATGCTATACGCTTTTTATCCTCTTCATGTCTTGAGTCGTTTGATTCTTGATATTCCTTGTGCTCTAAGCTTATTTTTTACAAGATTCTTAATTTTCTTATATGAAACATTCTCTAACTATGAGAACTATAGATATTTTATATATGGCATTTATGATGATTTATATTTTCTCATGTTTAATTAGAGAGATTTAAAGTAGAATAACTAGTATTTGTAAGCTTTATAATGTACATCTTATTTGCAGACTACTATCGTCAGTGTAGGTAGATCTAAAAACACAGAACTCTAGTGACAGAGAGGGGAAAAAAAGAGACGTTGGCATTGCAAAGAAGGGGAGGGAGAGGAAGGTGGCTGTGGTAAAAAATAAGAAAAGGTTGAAGAAAAATAACCTTTAGTTCTCATAATCTCATTATCATTCAGATAGGAAAAATAATAAATAAAAGAAATTACGGGCTCTGCTAGTTTTCTAAAATTAGCAAAAGAGACTATGGAATTATTGGATGTTTATACGTGGTGATAAAATTCCAGATGAATATGGATTTTAAATACTAAACCTACTAAGTCTATGCCCTGTATCCCATATCAAGAAAAGTCCTGTGTTGTATACTTGTATTGTATGCATATCATATGACGTAACGAGATATAGAAAAATTCCTGTAACAGTGCTCTAGTGCTAGTTTCAGATATCTATCTCATAGTTTGCCTGTCCTCTATTTACCTGATAAATTGAATCCATGACTGAGGCGTATTTTGGTCCCTATGTTTTTGGATGTGTTTCACTCAGGTTCATATTGTTGTTGATAATTTAGATGTTAACAGCACCAATTCTGTTAACTTGAGAGCTGCAGTGTCAGCTGCTCTTCTCCTGCTTCCATCGGAATTCACAGAGGTATACTTTTTTCTTATTAAATTATTTACTTTGCGAGTTGGACAACTGATTTGATTTAACTATCCCTTGCAGGCAGATCTGTATGCCAAAGTATGTAGTCTCTCGTACATGGGGGATGTACGCATGTTATTTGCCGAGGATAAAAACAAGGTATTCCTTGGTTGTTACTAGAGTAGGATGTGGTATGGAAATTTTAATATCTTTAAAATTCAGTTATATTTAAATTCCCATGATTACTTGGTACCATCCCATGTAGGAACTTGTGTCTACAGAGGTTATATCTCAATTTGGTCACAAATTCGGGCTCATGCTTTAGAAATTGCTGCTTTTCTGAATTATAAGTTATCTGTTTGTTGTTTCTTATAGTGAAGATGTGAAACATTGGATAGTTGTCCTTTCACTGATATGTCTGCCCATCCTTGACAGTCAGGTTGGATTTTCATCAATATGATTAGCACTATGTACTGAAATTATGAATATTGTTTTGCTGAATCTGCCCATATTCTTTCCTTCCTCGTATTTCTTTTGTTCTCTTAGGGACTGACAGATCCTTGTTTGAAAACTGCTTGCATTTGTGGAATATTCTTTGTGAAGGAATTGGGCAAATATGGATCCGGTTGCCATGTTTTACTGAGGTTCCTTTTGTTCACAATCTGTCCAGGTGAAGAAGATCGTTTTTGGGCAGTTTGATCTATTCCACTCAATGTATAAGCCATTTCTTGAAGAATATGAGGCTAAAAAGTTATTGAGACTTTCATCAATTGCCAACAATCAAATACATATCTCTCAGGTCTTTATTATTTGGTATTGATATTTGAAGTGTTAAAATTTTCCAATTTCGGACAATGGATTAAACACTATTAAAAACACTAAAAAATATCTGATAAGCCATTTTTATGGTTCATTTGTCGTTAATTGGAATTATATAATTATTAACTATGTATCCTGAATGGTAGTTCTCCCATTGCCTTTCCATGAATTTGAAGGAATTTAGCTTTGTTGTGCCATAAACTCTATGCTAAAGTTTTACCTCTTGAAAATCATATTTTACTAGCAAACTTGTATTGATAATTGACTATTTTACTACCTTGAACCCGGAATCGGTTCACTTCCCTTGAAATTTTTATTACAAAAAATTCAAGGCATGTATCCCATAATGCATGGACATGTGATTGGTTCTGTTTATGTCCATCTTGTTATTTGGTGCTACTTGATGTTGGCCTGAGAATGCATTTTTCTTTCTGTAGTTTCTGTGAAGAAGAAATATAAAAAATGTTTTACTGTTATTTTGTACCTTTCATCTTTTTCTACATGCTCTAATTTTAACCTTTGGGTGCTATTTAATTGTTGAAGACATTCTTGAGGTTTATATCTTGTAGCTTTTCTTGCTGCTTTAGAAATTATTTCTTTATATATATTTCATCACATTTATTGATAAGGTAAGACACTCGTGGTCGTTTACTAAATGGAAAAGCTTCTTCCCAATGTTTTAGTGCATAGAAAATTTGTTAGTCAAAATACCTTGCAAAAGCAGGCAAGTTGTATAAAACGAATATTCAAAGTTTAAATAAAGTAAAGAAACTTCCTTACTCTCCAAAACAGGATTGTGACTTATCAGTTGATTATTCTCTAGTTTCTGCACTTCCTCCGTCAATCAGAAACCAAATCATAATGAAGGAAGGAGTGAAAGAAAAATTACGGGAAACTGGTATGCTTTTGATATTATTAGACGTATTTCTGAATTATTGCTTTAGTTCCTAACTGCTAATATTGTTAAGGTCCAAATCACAGAAAAGGAAGGGGGATTTTGCAAGATAACCACTTAATAGTGATTTGTGTCAAATTATAAAAATAGGGTATTATGATTTCAGGAAGGGCCATAAATGATACTCGAAGCAGAGTAAGAGAGGAAGCTGCTAATTGCTTACAGAGAATTCTGAGGCGTAGAGTAATGGTTTCAAGTGCAAGGCAGGCTGTATCTGGTCTTCTGGCTGTTGGTGCAGTAAATGCAAGCAGGTACCTTGCTAGAAAGGTTACCAAAGCCTGGAAATCATGGAGCCAGGCTTAA