Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04736 LG1 67758729 67765692 serine/threonine-protein kinase STY8
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   brassinosteroid mediated signaling pathway, auxin-activated signaling pathway, protein phosphorylation, brassinosteroid mediated signaling pathway, auxin-activated signaling pathway, brassinosteroid mediated signaling pathway, brassinosteroid mediated signaling pathway, protein phosphorylation, auxin-activated signaling pathway, auxin-activated signaling pathway, leaf vascular tissue pattern formation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   extracellular region, nucleus
Molecular Function   enables   protein kinase activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 67759322 splice_donor_variant&intron_variant
T/C 67759323 splice_donor_variant&intron_variant
G/T 67759324 splice_region_variant&intron_variant
T/A 67759813 intron_variant
T/C 67759815 intron_variant
C/T 67760720 missense_variant p.Leu214Phe
A/G 67760868 missense_variant p.Lys231Arg
G/T 67760877 missense_variant p.Gly234Val
T/A 67761185 intron_variant
C/A 67761433 intron_variant
G/A 67761435 intron_variant
G/C 67761740 intron_variant
A/T 67761956 intron_variant
A/C 67762554 intron_variant
A/T 67762558 intron_variant
G/T 67762562 intron_variant
A/G 67762575 intron_variant
C/G 67762585 intron_variant
A/C 67762735 intron_variant
C/A 67762796 intron_variant
G/T 67762797 intron_variant
T/A 67763043 intron_variant
A/T 67763216 intron_variant
A/T 67763761 missense_variant&splice_region_variant p.Asn271Ile
G/A 67763914 intron_variant
G/A 67764200 missense_variant p.Gly362Ser
G/C 67764201 missense_variant p.Gly362Ala
A/G 67764205 synonymous_variant p.Gln363Gln
G/T 67765425 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04736.1
MSSGSHSDKEKDKQRVSRTSLILWHAHQNDAAAVRKLLQEDPSLVTARDYDNRTPLHVASLHGWIDVAKCLIEFGADVNAQDRWKNTPLADAEGAKKTDVIELLQSHGGSSYGQTGSHFEPKPVPPPLPNKCDWEIEPTELDFSTSTRIGKGSFGEILKAQWRGTPVAVKRILPSLSEDRLVIQDFRHEVNLLVKLRHPNIVQFLGAVTDRKPLMLITEYLKGGDLHQYLKDKGALSPATAINFSMDIVRGMAYLHNEPNVIIHRDLKPRNVLLVNTSADHLKVGDFGLSKLITVQSSHDVYKMTGETGSYRYMAPEVFKHRRYDKKVDVYSFAMILYEMLEGEPPFANLEPYDGAKRAAEGQRPSFRSKGYINELQELTEQCWAHDVNQRPPFIEILKRLEKIKENLHSDHHWHLFAS*


CDS Sequence:
>Vu_04736.1
ATGAGTTCGGGAAGCCATAGTGATAAGGAGAAGGACAAGCAGAGGGTGAGCCGCACGTCGTTGATACTGTGGCATGCTCACCAAAACGACGCCGCAGCGGTGCGGAAGCTCCTGCAGGAGGATCCTTCGCTGGTGACGGCAAGGGATTACGACAACCGCACCCCGCTCCACGTCGCATCCCTCCACGGCTGGATCGACGTCGCTAAGTGTTTGATCGAGTTCGGCGCCGATGTCAACGCGCAAGATCGTTGGAAAAACACCCCTCTGGCGGATGCGGAAGGAGCTAAGAAGACTGATGTGATCGAGCTTTTGCAATCTCATGGAGGCTCTTCTTATGGGCAAACTGGTAGCCATTTTGAACCGAAGCCTGTTCCGCCGCCGTTGCCGAATAAGTGTGACTGGGAAATCGAACCTACCGAGCTTGACTTCTCCACCTCCACGAGAATTGGAAAGGGGTCTTTTGGTGAGATTTTAAAAGCCCAGTGGCGTGGAACACCAGTTGCTGTTAAACGTATTCTTCCATCTCTTTCAGAAGATAGATTGGTGATTCAGGACTTCAGGCATGAGGTCAATTTGTTAGTGAAACTTCGACACCCCAATATAGTTCAGTTTCTTGGAGCTGTCACTGACAGGAAGCCCCTTATGTTAATTACTGAGTATCTGAAAGGGGGTGATCTTCATCAGTACCTCAAGGATAAAGGTGCACTTAGTCCAGCAACAGCTATCAACTTTTCCATGGATATTGTGAGAGGAATGGCCTATCTTCATAACGAACCAAATGTTATAATTCATCGGGACCTAAAGCCAAGGAATGTTCTTTTAGTCAATACTAGTGCCGACCATTTAAAAGTTGGAGATTTTGGATTGAGTAAGCTTATCACTGTCCAGAGTTCTCATGATGTATACAAGATGACCGGTGAAACTGGGAGCTACCGCTATATGGCTCCTGAAGTGTTCAAACATCGGAGATATGATAAGAAGGTTGATGTGTACTCCTTTGCAATGATTTTGTATGAGATGCTTGAAGGTGAACCACCTTTTGCAAATCTCGAGCCTTATGATGGAGCAAAACGTGCTGCTGAGGGTCAAAGGCCTTCATTTCGGTCAAAGGGTTATATCAATGAATTGCAAGAATTAACGGAACAGTGTTGGGCTCATGACGTGAATCAGAGACCACCCTTCATAGAGATCCTTAAACGTCTTGAAAAGATCAAGGAGAATTTACATTCAGATCATCACTGGCATTTGTTTGCATCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_04736::LG1:67756729-67758729(+)
AAAGTTAAAAGATTGATTAAAGTTATGTTGAGTTGGTTTGATTATGTGATACATGGAAGGAATCTTGTCGTTCATGACTTTTGCCCGCCATGATCCGATCATTTCAATTCATATAAGGATGATGACTTGATAATTCTAATGAATGGTGCGCACTTAAAATTTAGTTTAGATCTTCAAGTCATCATATGAACCAAGTGGGAGAATGTTAAATTATATTAATATTTAAGATTGGTTCATGTAATTTAAAGTATAACTTTGATGTACAGATTCTAATGTGATGATTATTAGAATATAATGTATTAAAGTTATAGGGATTATTTTAGAGTTATTAAAATTAATCCCTCTCTTCTCACTTTAATAAAGGGCATTTTGGTATTTTATTAAAGTTAATTAAATATCATAAAAGAGGGAAAAGATGAGACTACGGTTGACAGATTAAGTTTCTGAAAAGAGAGAAAGAAAGGTTACGTTCTCTAAAAAGAAAGAAACTGTGACATCCCTCAGAATTTTCTATATCATCAAGAAAGCATTAAAGAGGAGTAAGAGAAGGGAGAACATTGACAGAAAGAAACTATACAATGGATCCAGGTAAGTTCTTTTCTACTGTGTATAAGAGAATAGTAAGTATCATGAAAATTCAAGATCCTGTGTGTGTGTTTTTCATTTAATTGAAAATAAAAGAATTGCTTACAGGTGATCTTAGGCTCTAGCTGCCAAGAATGGACATAGAGTTACACTTAAGTGAACTCTCAAGACTTGATCATCTAAAACTTCATGTTTTGGATGTAGATCTAATGCAAAAGAGTGAAAATATGTGAAGTTGAGCTTCAAAACGATTTAACCATTTAAAAGTCACTCATTTAGTAACGAAAACTGATTTCTAATTTATTTTACAATATTTTCACCCATACAAACGGGTTTTCTACACATCAATTGTTTTACAAAATATCAAAATAATTAAAACATTATGTTTTCTTCCAAACTCATGTGAATAGGACACTTATTTACTACAATAACCCACTATACTTATTGGTATATTTCAGGTTGCAAACTACAAACAAACAATATTTTAGGGCACCTGTCGTGGTAGAGTCGCTTTTTGATTAGGAATCGGTAAACTACACCCAGCTCTAATTATAAATTACTACAAAATTGTTAAATTTTGAAATAAAATTTCTAAAATTAAAATTTAATAAAATTTTAATTAATTGATGATATAAAAATCCACTCTATCAAAATGAAAATCTTTAAAAAATTTATTTGTTCTGAAGGAGTTTTTAATCTCGTGATTTATGATAAAAAAAAATTGAAGATTAAAATACTAAAGAAAAATTTAAACTCTCCCTTCAAACATCATTCTATTACAAATGAATCTATTTCTTATACTGAAGGAAAGGATTGAAAAATAATTTCGATATTACGAAAAATTGTGTACTTTTATTTTAATAACATATTAAAAAATAGTAACGATATATTTAAATAAATTGTTGTATAAAGATTTTAAGAAAATAAAAAGTAAAAAACTAAATTTACTTTTTTATAAATTACAATAAGTAAAACATAAAAATTCTTTATATTTTTTGCTTATAACACATATAGCACGTATTAAAATTAGGTTTGATTTGCTTGAATACATTTTGAATAATACAAATTCCTGTTTCCTAGTCCATATTTTATATAAACGTGATAGCCATTTCTCACCTAACAAAAGAACGCAATTGATAGCCATTATAACGTGAATTTGAAGCATGGAAATGTGGAATATCCACTTTTATATGTGAGGTGAAGACTTTGTTTCTATTATAATTATTGAATAAAAATTAGCCACAAAAGTTATATTTTGCACAAAACGAGTCTGAAAATAGAGCATGAGAATTCCATTTTCACTTGTAATAATTAAAAAAAATTATATAATAATTGATTGGTTGAAGTAGTATAATTATGTATGGAAGGTATTCAGTTGAAGCGGTTAAATGGTAATTACGATGAAAAGTAAGGCC


Gene Sequence:
>Vu_04736(+)
CACGCGGATTGGAAGAGGGTGTGAGTTGACATTGAAAACATGGTTGAGTAAGGGAGCAACCAAACCAAAGGAAACGCAAAAGAGAGGAAGTAGAAGAAGATAATATAATTAGGCGAGTGTTGAAGAAAGGGTTAAGTTTGAAGCGATGAGTTCGGGAAGCCATAGTGATAAGGAGAAGGACAAGCAGAGGGTGAGCCGCACGTCGTTGATACTGTGGCATGCTCACCAAAACGACGCCGCAGCGGTGCGGAAGCTCCTGCAGGAGGATCCTTCGCTGGTGACGGCAAGGGATTACGACAACCGCACCCCGCTCCACGTCGCATCCCTCCACGGCTGGATCGACGTCGCTAAGTGTTTGATCGAGTTCGGCGCCGATGTCAACGCGCAAGATCGTTGGAAAAACACCGTAATACTATTATATAATAATCACGATTATTACTCTCAGCATTGTTATTTTACTGTATGCATGATTGTGAAATGGTGAATGAACTTTAGGTTTTGGTTGTTGTTGTGAACAGCCTCTGGCGGATGCGGAAGGAGCTAAGAAGACTGATGTGATCGAGCTTTTGCAATCTCATGGAGGCTCTTCTTATGTGAGGTTTTTTTAAGTATTGTGTGTAATTCTGTGTTTGTGTTGTGAATGATGAGGGAAGTTGAGGTTTGATTTTGAACGGTGATGGTCGTTGCAGGGGCAAACTGGTAGCCATTTTGAACCGAAGCCTGTTCCGCCGCCGTTGCCGAATAAGTGTGACTGGGAAATCGAACCTACCGAGCTTGACTTCTCCACCTCCACGAGAATTGGAAAGGTAGGTTTCGCTTCTGCTCGTTTTCTTGGTTTGACTTTGGTCAACGAATTTCAAAGCCTGCTCTTTACTTTGGTCAAACTCGTTGTTTCACTACATTTCTGCGACTGTTATATAACACTGACATAGATTTGTGCTATGCTTTAGTCCCTAGAGTGGCAAGTTTGAAGTATTTGCTGCGTAATCTCATTGAAGGACGGTTGTCGCGTTTCAAGTCTTTTTATCGATGATTCTGGGAAGAAAGGAAAAAATTTCTGTTCAGTTTCATTCCGCAGACGATTTTTTGTGTGTGTTAAAAGCTGTTTTCTAAAACAATTTTACATTAAAGATCAATCGGTTTTTAATCTGAAATGAATGAAGTACTTTTTCTTTCTTTTCTTTTTCAAATCAGGTGTTTAAAAATCCCAATAACAGAAACAACTGAAAAGTGTTTTTTCCATTGTCTTTCTTTTGTTTTCTTTTTAAGGGCTCTGTTTATGTGTTCAGTCTGAGGATAAAGTCCCTAATAATCTTACCTGGATTGAACAAGATTTTATTTGGTGAAGGATATATATGATCTATGTCAAAACTAGCAAAGACCTCTTTTTCCAATGGTTTAATATGTTTTCGTGTATGTTTTTATGTTTCATGAAGGGGTCTTTTGGTGAGATTTTAAAAGCCCAGTGGCGTGGAACACCAGTTGCTGTTAAACGTATTCTTCCATCTCTTTCAGAAGATAGATTGGTGATGTGAGATTCTTTCTTTAGCCTCTAGCATTTGTTTCAATTTGGTTGCTTGCTAGTTGGTCGTTGTTTGCGAGGCGAATGCCTTTAGATTGCTTGTGACTGGTGTCGTTGCTAAAACGAAGGTCTAGTAGCTTACTTTTACCTGTTATCTGTCAGAACTAGGAAAGATTTCGACAATTTATTTAAGTGTTTTACTGAATGTACTCATGATTTATTCTAAACCTATTGGATATTGGATGCATAGTCATCTATGTTTATGATAAATGATAAAAAATTAAAGGAATTGGGGAGGGGGGAGGGGTGTTGCAGCATATAAATCGTATGTCACAGGCTTTTTGGATATCTCATTTTGTGTGTTAATTTTTAATACAGTCAGGACTTCAGGCATGAGGTCAATTTGTTAGTGAAACTTCGACACCCCAATATAGTTCAGTTTCTTGGAGCTGTCACTGACAGGAAGCCCCTTATGTTAATTACTGAGTATCTGAAAGGGGTATGTGAATAAAATATAACTCCTTCAGATTGAGTGAACTTAGTTTTTGATTTAGCGAACTTCTTTAAATTGAACTTCTGTTTCGTTCATAAATAGGGTGATCTTCATCAGTACCTCAAGGATAAAGGTGCACTTAGTCCAGCAACAGCTATCAACTTTTCCATGGATATTGTGAGGTATGGTATCTTTCATATTTTCTTTTACTATTTTTGTTTTATAAGAAAAATATTAAGAATAAAAATTAAATACATTAGAGAAGGAGGATTGAAGGAAATTACCATTGAAAAATTAAACCACGTCAAAAGAAATTACCAAAATGATCTCCAGTTATTCTTACATCTGTTATATAACACCCGTCGATCTTCTGACCGGCGTCATTGTGCTCCAGCCACAGCAGCTCCTCGTCTCTCTTCAACCCTTTCTTGGCCCGAAACCTCAACTCACTCTTATTATCATTCAAAGTCCTCTCAGTAATCCGGATATTAGCTAACTTGTTACCACCCATCATTATCTATCCTAATTTCATTTTGAGCTTGCGATTTGCTTACTTTGCCTTTTCAGTCATTCCTTTATTTCTTCTAACACGGTATTCATGTGCTCTAATCGTAGATGCATAGCTTTCAAGATCAAATAATCATCTTCTTATTCCTCTTTGTATCTTGAATTAAAAGTTATGATAAAATCTGTTAGTGAACAAAATAGAAAGTCTCACAATAATATTCTCCCATGTATGCGCTCAAATAAGGATCATACACACTCGTATTTGTTAGCTCGATTTGACTTCTAGCCTCTAATAATAGCATACTCCTTTGACTTCCACCGGTCAATTCTTTCAGTGGAGAGCTTAAATATCACTAAATAAGATCGAGAGTAATATCCCAGTTGCTAGCTGGCAGATACAAAGGGGCTTAGGACCATTCCAAACACTTTTGTGGGCAAAGATAAAAACAGAAGAATTTTTTAAAGTACAAAGTCCTTTTTTAGCTTTTGGTTCTTTTTCTTTTCTTTCTTTTTTAGCATATGCTCTTCTTTTTTCTATTCTGTTTCCTTTTTTAGAATGCTTATGTAAAAGTGAAAACAATTCAGGGTTATAGAAAGATTAAGGGAAAATACTTGGTTGATTGAATGTGTGGGCAAATCTAGAATATCTAAGATGGATAATTGACAAGAGATGAATGCGACAACTTTATGGTTACAAATTAACAAATAATAAGAAAAAAGTATGGATGAAAAAGAAGGGTTGATGATGATTCCAGTAATGGTGACCAAGAGAATTCATAAAAACTGATAATTTACCAATAAGGATATGAAAGAAATAGAAATAACTCAGACAAACTGTCAACAAACAAAAAAGGATGTAGAAATGAGAAAAATAATTGAGGAATATAAGGAATAAAGTTCAAAATGCACAAGTGGTTTTTTTAGTACTCGTTTTTAAATATGAAACTACCAAAAGAATAATATTTAGCCCACAATCAAGAACCTCTGATATCAAACTAACGCAGAAAACAAGATGGATAAGAGGTATGTGGACAACACAAAAGCAAGTCTTCAATTGAAATTCCTAAATCCCACAATAATGTTCACCAGCTAACCAGAAATGGTAAACTTTGACCCATGAGAATTTTTGCAGTCTGTGAGGAACTTACCACATGAATCATCTCGATTCTTGGTGCTAGTAGTATTTTACAACCCCTAAGGAGAAAAGAAACTCTAATGGATATTTGGAACTTCTTATTCAAATTAATGTTCAACTCCTAAAATAAATCTTGTTCTTACTGTACATGGGCAAAACATAACTGATAAAAATTTGATCATAATTAAAACAAAAGACACAGAAACTAACCTAAAATCCATAACCAACTGGCGAAAGAAAATCATAAACTTTTACTAGCTCGAATTAGACCTTATCGATTATTCAAGACTCATTAATTTCAACTAATTATTTAAGTTATGGTTCACTTTCTAACATAGCCTAAACTACTACATTTAGTCTTCCAAAGCTTCATCAAGTAGACCATACTGTCCAAACGGTATCTGTGACTACGAATTTTAGCTACTAGGTTTGCCATGGTCTTTTAGATCTAATAGGCGTACAAGCTCTTTTCACTGGACCTGGACCTGGACCAACAAGAATTACCAATGCATCACTTGTATTTGGCTTTAACTAGCCTCCTTCATCTCCATCAAATAATATGGCCAGTGTATAACTAAGCCAATTTAATATCAACCTGTATTTTATCAACCAAGATAATTGAATTAGTAAATCCAGAGGAATCTGTATACATTCATTTTCACTTAATTTGATCGATATGCTAAAGTATATTTTGTGGATATTGTTTTGCAGAGGAATGGCCTATCTTCATAACGAACCAAATGTTATAATTCATCGGGACCTAAAGCCAAGGTATGTTGGTTATATGCAACTTATATGTGAAAATATTATGGACAACATGCTATGACAGCATGTCAAGATGCATTGTGATAAAGACTTGGTTATTATAAGGTGCCTAAATCCTGCATCAAGTAATATAGGATACTTATTGGAGTATTTAAATGTTTGGATCTTCCTTCCTTAGTATATAACTTTTGGGAGTAAATTTCCAAGTTCTTGAGTGTTTATGTATTGGTATCAGAGTTGGTTGTAGATACCAAGACGGGAGCAAAGTGTTGTAGAGTGAAAGCTGCCTAGCTTTTGAGGGTGTTGTAGGGTGAAACCCGCTAAGATGTTGACTCTTTGGGATGGTGCTAAGATAAGGACTTAGATATTATCAAAAGCCTAATCCCACATTGAGTAGAATGAGATGCTCAATAGATATCTAAGTGTTTAGTTTTCTCTCCTTAATGTCGAATTTTTTATGGTGAGTTTCCCAATGTTTGGGTCCTTATCATATATGGCTTATAAACAAATTGAAGAAACTAGGTTGACTAAATTTTGTCTAAAAATCATCCAGCTGGAATTAAAAAGCCACTGTATTA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