Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06240 LG1 92494899 92499942 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase At4g35230
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   brassinosteroid mediated signaling pathway, brassinosteroid mediated signaling pathway, protein phosphorylation, protein phosphorylation, brassinosteroid mediated signaling pathway, brassinosteroid mediated signaling pathway, brassinosteroid mediated signaling pathway, brassinosteroid mediated signaling pathway, protein phosphorylation, brassinosteroid mediated signaling pathway, brassinosteroid mediated signaling pathway
Cellular Component   located in   plasma membrane, nucleus, plasma membrane
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 92495050 3_prime_UTR_variant
C/A 92495322 missense_variant p.Arg444Ser
G/T 92495364 synonymous_variant p.Ala430Ala
A/C 92495469 intron_variant
C/T 92495473 intron_variant
T/A 92495514 synonymous_variant p.Ser412Ser
G/A 92495616 synonymous_variant p.Phe378Phe
G/A 92495624 missense_variant&splice_region_variant p.Leu376Phe
C/T 92495758 intron_variant
A/T 92495828 intron_variant
A/T 92496006 synonymous_variant p.Ser343Ser
T/C 92496223 splice_region_variant&intron_variant
A/T 92496467 intron_variant
G/T 92497307 missense_variant p.Arg200Ser
C/A 92497638 missense_variant p.Arg190Met
A/G 92497679 synonymous_variant p.Ser176Ser
G/A 92497737 missense_variant p.Pro157Leu
C/T 92497917 intron_variant
A/T 92498037 intron_variant
G/C 92498249 intron_variant
A/T 92498396 intron_variant
G/C 92498887 intron_variant
G/T 92498920 intron_variant
A/T 92498925 intron_variant
T/A 92499088 splice_region_variant&intron_variant
G/A 92499239 synonymous_variant p.Ala56Ala
T/C 92499264 missense_variant p.Tyr48Cys
A/G 92499360 intron_variant
G/T 92499388 intron_variant
T/A 92499806 5_prime_UTR_variant
A/G 92499921 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06240.1
MGCLHSKTAHLHSPEDPPTALPDSKKPDPGNGGDDVDQEVQVPAFKEYGLSELRRATNEFNTDYIVSESGEKAPNVVYRGKLENNRLVAVKRFSKLSWPDAQQFMAEAAGVGKVRHKRLVNLIGCCAEGDERLLVAEYMPNDTLSKHLFHWDKQPLPWEMRVRVAYHVAQALDHCSMENRKIYHDLNAYRILFDEDGDPRLSSFGLMKNSRDGKSYSTNLAYTPPEFLRTGRIIPESVIYSYGTVLLDLLSGKHIPPSHALDLIRGKNVLLLMDSSLEGQYANDDATKLVELASKCLQFEARERPEIKFLLTSVTPLQKQKEVASHVLMGLTKNTAVLPTMLSPLGKACARMDLTAVHDILLKTGYKDEEGAENELSFQEWTQQVQDILNTKKFGDIAFRDKDFKNAIEYYSKLVVMMSVPSATVFARRAFSYLMNDQAELALRDAMQAQVCIPDWPTAFYLQALALSKLGMETDAHDMLNDGAAFEAKRSNSWRG*


CDS Sequence:
>Vu_06240.1
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Promoter Sequence:
>Vu_06240::LG1:92499942-92501942(-)
TTCTATAAAAGATTTTAACAGATTATCTTCCAAGTAAAATTACTTACGACTTTAACAAAAAAAATAAAAATAAATAAATATACAATTCAATTTAACATTCTTATACATTTGGTCTATTTTTCGCATACATAATTTGTACTGAATGCTAAATTGTCAATTTTATATGTAAAAAGTAATTTTTTGTTTGTCTGATGAAATTATATTCTCCCAACTGTCTTTATCAAATATTGTAAAAATTGAACAATAATAATAAAATGATGCATTGATTTATATTTTAATATATTTTAAAAAGAGTACATATATTATTATTTATGAAATTTAAAATATGCTTAATTAGTTTCAATTTATACAATTTATGTTGATAATTACAGAAATATTTTTTAGTTTAAATATTGCATTTTTTTTTTAAATATGGAGATTAAGAAATGTTATTCACACTCTTCATTCAGGATATTATAAAAACATGTTTTTGTAATCAGTGGATAAAAAGGCTAAAGGAGAAATGAAAAATAAGGGAACACCTTTTCTGTATTATTTCTAAAAATAATTCTGTACGATACAAATAAAACTTTTTTGCCTACTAAAAATGGGTTATTTTAGAGTCACACTGTATCTTCAATTGCTTTTTTGGGAGATGATAATAATTTACATAATATCTAAGATTTAAAAAATATTATAAAAGAGTAATTTTTCATGTCTTACATGATTGCTTTTCGACAACCCATGTATTATTTTATCTCATATCATGCCACTATTATTAAAGCATTTATACTTTTTCGATTGCATGATCTCATTATTAGTTAACAGAACGAGAGCTTTTATTTTGAAAGTAAGTTGTTATTAACCTTGCTAAATAATACTACGTCATTAAGTTGACTATTTATAATTATGTGAGTATTGGAATTAATTATGATCAAACTTGTCACCTAAATTTAGTTTTGTAGATCCTACAATCAATTTTGTTTGGAAATTTTGGTTATTAATTGTACTGTTTTAGTTTTAATTGTATTTGTACTTTCGTTTTGTTATTTAGTTAAATTCATCTTATCTGTACTTGTTTTTTGTCTATTTTTAATTTAATAAATATTCCTTTTACAAACAGTGGTAATATAATTTATTTTTACGCTTTTAGCAATATATGGAATAAATTTTAAAAATTAAAATACTAAATAATAGCGTGATTTTGTTACATATAAAAAAAAAAGAAAAAAATGACCCGTGAGTCAATCATGCTATGCCGAGTGCATTTATTTGAAGGTAAATGTTAATAAAGCCACCCCTGGATAAATTCATAGCCTGCAAAAATATTGATTAAAAATAATGTAAACATATTAATTAGCATTAAATATTTTAATTTTTAACTCTTTAGCCAAATGGTAAAGATTATAGTCGATGTCATTTAATCTTGTATTAAAAAAATTAAAAAAAATGTTATAAGTGGAATAAAAATGAATGGTGGTGAAATTGAGCTGGTTGTAGAATGTATGGAATTGGTGTTTTGTTCTCTACTCTGTAAGAAAACAGTAAGTTCTCTTCGAAACGGTGAAGGTATTTGGGCAATGTTGGTGGATTGAAATTGAAACTACGGAAGCTTCTGAAAAGTTTGCAGAGGATGATGCAAAGGGAAAGTAAGAACTTCGAAAGTTGAATCTGCTTGTGATCATTATTGTTGGCTGAAGTTGAAAACACATGAGAGAAAACAAAGGTGATTCACTTTTGATCACAACACTACCCTTAAAACATGGAGGAGAACAATCAACAACAAACAAACTGGTTCCACTTCCACACAATAACATGTCCACGTTGTAAATTGTAATTTTCCAACGCAAGAGTAAAAAAGAAAATAATATTAATTTATGAAGTGCCATTGGAAAATGGTTCTCACTTCTTACTTCTTATTACTTCCCAGTCCCACCTGGGGCAGCACGTGCTGCATCATAGACACTGTCATGTGACCTTCTCTGTTCCTTTTTCATCCTTCTTCCTCTCTCCTCTTTTTC


Gene Sequence:
>Vu_06240(-)
ATACTGATTCATTTTACTTACTTACCTTTTGGGTTTTGGCCTTTTCATCTCTCTCTTTTTCTCTTTCTCTCTCTTGGCTGTGTTTCCGCCGCTGCAACAAGAAAGAGTAGCAGCGACTCAGTCACTTGCTGCATTTACGCTTATCATATCAAACCCACACCATAGAACCATCACTCTTTCTGCTTCTGCTCCCCTATGCCAATCTAGCGTTGTTGTAATTTTTTTACAACCTTTTTTCTATGTTGACACCCCACTTATTATTCCATTGCGATATTAGTTAATCATTTCCCAATCATAGCCATGGGTTGCCTACACTCCAAAACCGCTCATCTTCACTCTCCTGAAGACCCTCCCACTGCCTTGCCAGACTCAAAAAAACCCGATCCAGGTCTCCCCTTAGTTCTTTTCACCTTGTCTCTGCGTTTTGCTCTTGGGACTTTTACACCCTTTTGGTTTTTACGGTGTGGAAATGTTTGTTTACTTTTTTTATTGATGTGGGGTTTGTCAAAATCTTGCTTTGATGGGTTTCGAAGCTCAATGGAGATGGTTCTTGTCGTTTTTTTTGGTGTTTGTTTGAGAAAGTTTGGGTTTTTAGTTTGGTTTTGTTTTGTTTTGATTTTGAAGGGAATGGTGGGGATGATGTTGATCAAGAGGTTCAGGTTCCAGCATTCAAAGAGTACGGTCTGAGTGAACTTCGAAGGGCCACAAATGAGTTCAACACAGATTACATTGTTTCTGAGAGTGGGGAGAAAGCCCCCAATGTGGTCTACAGAGGGAAGCTAGAGAACAATCGTTTAGTTGCTGTGAAGCGGTTCTCAAAACTGTCTTGGCCTGATGCTCAACAGTTTATGGTGAGTGAAATGGACAACTTTTAATAGCCCTCGGTATGGTTGCCGATTGAGGAAGAAAGGACAATATTTAGTTGTTTTTTTGAAACGCACTGCTAATTTTTGTGGATTCTCTTGTGCATTTCTGACTGGGAGATAAAATTTTAGATTCTCTAAATTTTAAACATTTTCCCTCATGCATTTTTTTACCCCGTGATATTTAATCTGCCAATGCAAGCTATTGTTGTTAATGGTTTTGATTGGTCAGGCAGAGGCAGCTGGAGTTGGGAAAGTGAGGCACAAGAGACTGGTGAATCTAATTGGCTGTTGTGCTGAAGGAGATGAAAGGCTCTTGGTAGCTGAGTACATGCCAAATGACACTTTGTCCAAACATCTCTTTCATTGTACTTCTCTTTTATCTTTACATTTAACTTCGTTAGCAGTCATTTAAAGCTCTTTATTAATTATAGTACTTTTTCCCTCTCTTGTCATTCTCCTTGTTGACTGACTGTCTTTAGATCTGGTAGCGAGTCCTTGCTTTCATTTCTTGAAAGACAGGGCTGCCTGTCTTAAATTTTTACCCCATTTGTGTAGTTTGCTGGATCCGTAAATCGCATATTCTAAGAGCTAATATGCTTTTACAGAGACAGAAATGATACATTTATTTAGCTGTTGGCCAATATAAGTTATACAATTCTCATGCTTTTAAGGCCATGTTGTTTTGTTGGAGTGAAATGGACACTTGAAAGATAAGATTGCATAAAGGTACTGCATTTTAACACAATAAAATCTTGATATTGTCAGTTTCCACCTTTCATATTCACCCAAACCTAACATAACTCAACTGACGAAGTCCTTTTTTTGTACCTGAACTTGGGTAGCTTTAATCTTATCTGATCTAGTAATTACATACCGAAGAGATTTTGGCCCGTGGAATTAATTTTTATTTGATTAGTCAAGCAAATTTAACCAACATCTCTGCATATCCAACTAAGAAACCCCTCTGAAAGGGATATTGCTACATTAGCTGAACACCATTAAGAAGCAAAGAACTTCACCCCAAAGTAGAAGTAGAATATAATGTAATTCCTTTTAGTTCTGTCATTCTTCTCCACTATTGGCACTAAATAACTGCATACATTGCAAATCGTAACATAATCTTAACAAAAAATGTATAGCGAAACTTTTCAAGCTTTCTGGACAATCCAATGTTAATTCCTTTATCTTTGTAGAAAGCGTGACATATTTTTATTGCCTTTTTTATTAGTCCTGTTCTATCATAATATCTGTTTCACTTGACAACGGTAGTTTGATTTTTAGTTTCTTAATTTTTTGTTGATGAATTCTTTGTTTCTGTCAGGGGACAAGCAACCATTACCATGGGAAATGCGTGTAAGAGTTGCGTACCATGTTGCGCAGGCACTAGATCATTGCAGTATGGAAAACCGGAAAATATATCATGATCTGAATGCATATAGGATTCTTTTTGATGAGGTGTGATTATGAACCTAACGTAATGAACTCATTGTTTTGTAAACGTTGTCACCATATTATAAGCATTGTGAAACATTTTCTGTTTGATGCAGTTTTCTGCTTTGGTATATCTATCCCATATGCTTGTTGTGTGACTTTGATACTTCTTTGTTGTCTTCTCCACATCATAGGTGGTGCCTAGTTGCCATTATATTCATATGCTTGCACACAAAGAATGTTAAATGCCATGAACTTCATTCGTTCGTTAGTATATGTCTAAATTAGCTATTGAAATTTGTTGCTAATTTATTCACTTATGTCAGGATGGTGATCCCCGCTTGTCTAGTTTTGGGCTTATGAAAAATAGTCGAGACGGGAAAAGCTACAGTACCAATTTAGCTTACACTCCACCTGAATTTTTGAGAACAGGTATATTTGCTGGCATGTATTTTTGCGGATAATTGATGGTGGTTGAACGTTTTACTTTTGCTTATACGCATTTGATGGAATGGGATTATTATATACATACACGATGAATTATAGAGCAGAATTTTTGTTTTGTCAACGTGTTCTTTAGAGTCTAAAAGGAATAAAAATGTTTGCTGGATTCATTGATTCTTTCAGAACTGTCTTATCAGAAGTCTTGCTGCTAAGTATAATTAATGACAATATGGTAATCCGATGACACCTGCAGGCAGGATAATCCCGGAGAGTGTGATCTACAGTTATGGAACTGTTCTTCTGGATCTTTTAAGTGGCAAGCATATTCCCCCTAGCCATGTATGTTAATTTGAACTCTCTGCATTCCTTTAAGAATTTTTTTTATTCTGCTTTGTTAGATATGCTAAGCATTCTATATTATCCTACATCTGGACTCCATTGATGTTTGATATGTGAATTATACGATCTATCCAATTCACGTGAGTATTGTCTGGTTATGACATACTGGATTGATGAAATATTTTTGGTGCATACGTTGGTAAAGAGTTATTGTCCCTCTACATGGGACTGGATTTTATGATTACTTTCTGGTTGCTGAGTTTATGCTCGCATAGAATTGGAAATGAGTGATTTGCATAATTAGTATTTGAATTCCTTTTATGTTTTGACTTGATACATATATGTCTATTCTTGCTGCTTAGTTAAATCATATGAAGTTGAATAGTATGGTGTATTCAACGCAAGGGTATGGAATTTTTTAATAGGAATGATTTCGTTCTATAGGCTTTGGACCTGATTAGAGGGAAGAATGTTTTGTTGTTGATGGACTCTTCCCTCGAAGGGCAATATGCGAATGATGATGCTACAAAGTTGGTTGAGCTTGCTTCAAAATGTCTTCAGTTTGAGGCCAGAGAACGACCTGAAATTAAGTTTCTTCTTACTTCCGTTACACCTCTTCAGAAGCAAAAAGAGGTTTTCAGTTTTCGTTTTAGCTTTCAATGTTGAGCTTCCGCTTTCATTTCTTGTCCTTTTATCTCCATTTCAATTGTGTTCAACTTCATTTTCTAGGTTTCTCTTCTCTTCCATGTAAAGTATTTGTTCTTCATGTTGAATCACCCTCCTCCTTTTTACAGGTAGCATCTCATGTGTTGATGGGCCTAACTAAAAACACAGCAGTGCTACCAACGATGCTTTCTCCCCTTGGAAAGGCTTGTGCAAGAATGGATCTCACTGCTGTGCATGATATATTGTTAAAAACAGGTTATAAAGATGAAGAAGGAGCAGAAAATGAGGTATGTCAAAAATCATATAGTTACTACTGAGTGGGATGTGTGGATATGTAGCTGATGTATTATACCTGTTAGCATGGCTAATATTCCTGTTATCTGATTCATAAAATAAACAGTTAATGCACTCTAGTTGCATTGCATTGATGGATAAGGTGCTGTCTCTGCAGCACAAAGCTGTTTGTTTTACTTGGAGAGACTAAAATTGTAAATCTAACTTGTTAATCTCTGGATTTCTGACTAATGTTTTTGGTTCTTGCTTTTGTATATTAATTAAAGATGTGATTGCAGCTTTCATTCCAAGAATGGACACAGCAAGTGCAAGATATATTGAACACTAAAAAGTTTGGGGATATTGCATTCAGGGACAAGGATTTCAAAAATGCTATTGAGTACTATTCAAAGGTAGGTTCAGTGTTTCACATTTTTTTACAGGTTTCTGGCTGTGTCTCTCTATACACTCCTATTCTGATTGTCCTTTATTTATTTGCATTTAAACAGTTGGTGGTTATGATGTCTGTTCCCTCTGCTACTGTGTTTGCAAGAAGAGCCTTCTCCTACTTGATGAATGATCAAGCAGAACTTGCATTAAGGGATGCCATGCAGGCACAGGTATGCATACCTGATTGGCCAACTGCATTCTATCTGCAGGCTCTGGCTCTCTCGAAGCTGGGAATGGAAACTGATGCACATGACATGCTCAATGATGGGGCTGCTTTTGAAGCAAAGAGGTCTAACAGCTGGCGTGGTTAATTTTCTTATTTGCAGTTCTTTGCTCTCTAAACTAGCAGAGTGGCATAAAAGAATATGCTATTTTGCCATAATTTGTACTTGCTAGAGTAGGAATATGTAGGGTGCTAGTTTAAGGGGCAAGCAAAAGAACTCTGCTTTAAGATGTTCTCAAGGAATATTACAGTATAGATTTTCCCATACATGTGAACTCTGTAGCATTAATTTTCTCCATATGAAAATAACAATGTGTTTGGATGGGGAGTTTTGAGGGAGGAATTCAGTTTT