Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06700 LG1 97961451 97964461 PREDICTED: transcription factor bHLH79-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, DNA-binding transcription factor activity, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, protein dimerization activity, protein binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, DNA-binding transcription factor activity, DNA-binding transcription factor activity, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 97961451 splice_region_variant
T/A 97961462 3_prime_UTR_variant
C/G 97961592 3_prime_UTR_variant
C/G 97961735 3_prime_UTR_variant
T/C 97961753 3_prime_UTR_variant
C/A 97962187 downstream_gene_variant
G/T 97962452 downstream_gene_variant
T/A 97962482 downstream_gene_variant
T/A 97962633 downstream_gene_variant
T/A 97962699 downstream_gene_variant
C/T 97962934 downstream_gene_variant
C/T 97962942 downstream_gene_variant
C/T 97963484 downstream_gene_variant
T/G 97963899 missense_variant p.Asp125Ala
A/T 97963907 synonymous_variant p.Ile122Ile
A/T 97963908 missense_variant p.Ile122Asn
T/C 97963989 downstream_gene_variant
G/A 97964191 missense_variant p.Pro54Leu
A/G 97964198 missense_variant p.Ser52Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06700.1
MEPPLVNDATFSSANPSLSEIWPSQFPSSNKRPSSLLLHNHSPNSNKHVKLSPPSETHQNAALRPPQPDATSVAAANNNSPLQTPKPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCGKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRLSLSPSIECFPSKEVATQPFDLSGIIFGSQPARGFAQGSQAGWLHMQMAGGFEKVT*


CDS Sequence:
>Vu_06700.1
ATGGAACCTCCGCTCGTCAACGACGCCACATTCTCTTCGGCCAACCCTTCCTTGTCCGAGATTTGGCCCTCGCAATTCCCCTCTTCCAACAAGAGACCCTCTTCTCTTCTTCTTCACAATCACTCTCCCAACAGTAACAAACACGTTAAGCTATCACCACCCTCAGAGACACACCAAAACGCTGCGTTGCGCCCTCCTCAACCCGACGCCACTTCCGTAGCCGCCGCCAACAACAACTCACCCCTTCAAACTCCCAAACCCAAGCAGGACTACATACACGTGCGAGCAAGAAGAGGCCAGGCCACCGATAGCCACAGTCTCGCCGAAAGAGCTCGTAGGGAAAAGATAAGTGAGAGGATGAAAATTCTTCAAGATTTAGTCCCCGGCTGTGGCAAGGTAATTGGTAAAGCGCTTGTCCTGGATGAGATTATTAACTACATCCAGTCCCTGCAGCGTCAGGTTGAGTTTCTTTCAATGAAGCTTGAGGCGGTTAATTCGAGATTGAGTCTTAGCCCTTCTATCGAATGTTTTCCCTCAAAAGAAGTTGCCACTCAGCCATTTGACCTTTCAGGAATAATATTTGGATCACAACCGGCAAGGGGATTTGCTCAAGGATCACAAGCTGGATGGCTGCATATGCAGATGGCTGGTGGTTTTGAGAAAGTAACATAA


Promoter Sequence:
>Vu_06700::LG1:97964461-97966461(-)
CAAGTTCGTCTACCTTTTTAAAAAAGTTGCAATTTCGTCCACATATGGTTTAAAAGTATCAATTGCATCCAAACATATAAAAATTTGCCTCAATCAAGTCCCTTCTGTTAAATAGACAGAAACGGTGTTAACTTTTTCTTTCTCTCTTTTGCTTTTCTGAATACAACAGTTTTTTGTGAGAACACAAAAAATTGGTAGGTGTATCAGCCACATAGTCATAAGCAATAAATTTTAAATAATTTATTAAAAAATAATATATTATAATATTCATGGATAACATTAAGCAATAAATTTTAAATAATTTATTAAAAAATAATATATTATAATATTCATGGATAACATTTTTTGTGTATTTCAAGAATTGGAGAGAAGGTTTAATCATTCAATTACTGAAAATTGCTAGTTCCTCTCTCTTACTCTATTCAACATTAAACAATTATTAAAGATTGCTAATTCTACCATCATAACAATTTCTTTTTATATTTATTTTGTTTGTTTGAAAAAAACACTATGGTCAGATAGTTATCTCGTTACACTATATACATATCTTTTCCTAAAAAATAAATATTAAATCTATTTATCTTACAAACAAATAAATTAACAGGAGTTCTTTTAACTTATATTAGAAATATAAGTTTTAAGTTTCGTAAATTAAAAAATCTAAAAGAAACATTTACAGAAACATAAAGTAAACTTCAATTAACAGAATTCAAAAACAAACATTTTTATGTTTAAACTAGAAAAGAAAATAGAGAAATTTTAAATCGACTTTGAATTGAAACTTTCTGACAATTGGTACATGTAAATTGTAAGTATTTTGTTTAATTTTACTTTGCTTTGATATACAGATTTTTTAAAGAATATATTTAAATATATTGAATTTAAATTGATATTAGTCTAAATTATTTTATTTTTTATTATTTATTTGATAAGTAAATTCAAATTTGAATATTTTTATTCGGATGAAATATTTCAATTACTAATACATACAATTATTTAAAAGTAAAACAATAATAATTAATGTTGTTGAAATTTTTTTCCGTCAACATTTACAAAAATTAAAACAAGTTATTAATAAATAATAATATTTTGTGTTGACAGTAAAAAAAACACGATATTAAAAAAAAACTGCCAACTAACAATTCATAAAAAATTAACTTTTTTTTCATAATCTCTCGTTTTCTCTCTTTTCTTCTATATTTTATTTTTATTTATTAAATTTATTTAAATACTACTGAGTTTTTACAAATTCTATTTGTATTTAACTTTATTATAATATTTTTATTAATTTAATATTTTTTTGAAACTGGGTGTCAAACAAAAACCATATATTTTGATTAGATATATTTACACAATAATATACATATATTGTTTTTGTCTTTTTATATTATTAAAAAACATTGTTTTTTATTAAAAAAAAAGTATATATGTGCACGTAATAATAATAATAGTTAGAATTGATAAAAAGTGGAGTGGAACATAATATTATTTTTTTTATATAGAGATTTAATTGTTTCTCTTTCGTTGAAATAAACAGGGTTTAATTGTTTTATTTGGAAAGTAATCATTTTATGTTGGAAAGAGATTGTATTATAAAAAAAGCAGATGAGAGAAGAAAAAGTTAATGTCATATAGATTTGATTAAGACAAATTTTTTTACGTTTGACACTTTTAAATCATATATAAACAAAATTGTAACTTTTAAAAAGGCTGACAAACGAAACTTGGACAAAGAACCAATCAAACCTAAGAATAAAAAAGAAGAAGATTAGTTATATGTATTTAATTTGTTGGTGAGAGACTTAAAAAGAGAGGGGTAGAAGGTGGCACGTAAATGATCCTTTTTAAAAGGTAAGAAGGGAAGAGATAAAAACTAAGAAGAAATGGATAAGAAGCGCAGTGGGCGCAGTATGCACCTTTGGTGCTTGTTGTTCCCAGTTGGAGACTGAGACCACTCCAGGTCGAACCAGAAAAGATCAGAAACTAACCTTTCAGACCTC


Gene Sequence:
>Vu_06700(-)
AATTCTAGCATTATTTAAACAAACAAAATCACCAACCTCAACACCTTCAACTATTCTTTCTCACTCACTCCCTGAACCGATTCTAACAGAATTCAATTGAATGAATCTGAATGGAACCTCCGCTCGTCAACGACGCCACATTCTCTTCGGCCAACCCTTCCTTGTCCGAGATTTGGCCCTCGCAATTCCCCTCTTCCAACAAGAGACCCTCTTCTCTTCTTCTTCACAATCACTCTCCCAACAGTAACAAACACGTTAAGCTATCACCACCCTCAGAGACACACCAAAACGCTGCGTTGCGCCCTCCTCAACCCGACGCCACTTCCGTAGCCGCCGCCAACAACAACTCACCCCTTCAAACTCCCAAACCCAAGCAGGACTACATACACGTGCGAGCAAGAAGAGGCCAGGCCACCGATAGCCACAGTCTCGCCGAAAGAGTAATTCATGTTATTTATTTATTTTTAATTTCACACTTCAAATCTTCAACAACATTTACAACCGTGCTCTTCACAACAGGCTCGTAGGGAAAAGATAAGTGAGAGGATGAAAATTCTTCAAGATTTAGTCCCCGGCTGTGGCAAGGTAATTAATTATCTCTCTTTTTTTATTAACTTTATTTGCGTTTTTGTGTTATGTTTTGGTATAATTATTTTGGGTTCAGGTAATTGGTAAAGCGCTTGTCCTGGATGAGATTATTAACTACATCCAGTCCCTGCAGCGTCAGGTTGAGGTGGTTATCTTCATCCCTCTTTTTTCTTCTGTATGTTTTTATTTTAAAACTTAATAACAAAACTCAATATTAAATATTAGAAAAATGATTTTATTTTATAACGCCCGTCCCTTTTTTTCTGTCAAAATTGTGTTTATAATTTTTTTATTTAAATTTAATCTTTGAAACTTTAATATTTTTTTGTATAATATTCCTGCAATTTATTTTCACACTATATAGAATTAAATTCCTTAAAATAGTTTTAGCCCAAAATGGATCTTTGAATAGATTCAACGTATTTATCTATTATTTAATATGCTTACATGATGTTGGATGATTTGATTTATTAATTCTATGCATAATTCTATGATTTTGCAGTTTCTTTCAATGAAGCTTGAGGCGGTTAATTCGAGATTGAGTCTTAGCCCTTCTATCGAATGTTTTCCCTCAAAAGAAGTAAGTTTACCGACTTAATATTTTAATCTAACGCCAAAACCATTCACTCTGTTTAGAAAATGTTAGGCAAAATGTTAAGCGGTGGTATGTTATTTGGCTTTGTGAAACACCCGACAAGTGCCCAGTGTTTGTTTAGGCTGGAGACTTTCATAAATAATTTGGTTTACATGGATGCAAACTAACATTCTGGAAGTTTGGTGCGTGTATGAGAAGAGAATGGTAGTGGGAAAACGGAAAATAAGGAAATTGTGATTTTGAATGTCTGATTTCAGGAAGGGTGGCTGTTATTGTAAATTATTGTGACATTGCAAACCTTTTTGGCGACTAAAATCCAGAGTAGCATAGTCTTAAGAAAATTAGTTGAAACATTTTTGTGAATTCTGTCAACCCGTAATTCTTTGACCTGGTTGATTGCCATCCGATTGGTTTTATATAAATGTAAATTATCACTATCGGTTGTAAAATAATCTACACGTATCATTAGTGATGAATGAATCCTCAGCTCAAGCGAATCCTGTGGTCAGATATATATTTTTCGAGTAATTGTTAATTTCATTGGGATTCATGTTTATCTGGTTCTGCTTCTGATGAGTTATATCATAGGAGTTCTACTGTAACATTGAGATTTTCTCTTCTCATTATTAATATTTATTATCTCACACAAAAGAGTATAGACATTCTTGTACACGGTTACTTATCTTGGTCTTTTGACATGTGTTACTTGAAAGATTAAGAGATTTTTTTTTACTGTATTAACTACAAAATGAAAATGAATTACTGTCAAAAAACTACAAAAATGAATTGTGCCAAAAAAAGTCAACTGGTGTTTGCGCTTATTGAGCTTTCCAAATAATTAACTTTGCTATGCAAGTATTGTGATCACTAATGAATTTACTACTTTTGGCATCAAATTAATTCTACAGTGGAAATTTTTGTTTTCTGTTTGTGCAAATATAGCTCTTGGCCCAAATACAAAATGAGTTTTTGGAGTCATTTTAAAATTTTTGGAGTGTTTAATCATAGAAACAATCTCAATTAGAACAAGAAGAGTGCTATTTACACACCCAGAGTCACTCTTCTAAACACATTCTATATGATTTGTTCCAGCCATGTAAAATAAGTTGAACTAAATGAGGACTAAAACCCGCATGGATTTCACTGTATGGCAGAGTGTGATTTTCTTGGGACTATATGTTAGTTAGTCAAAGTATTGTTGTTATCTAGACATATTACATGTATTTAAACACGGTATTGTTTATTTAGGATTGTTTATTTTTTTACTGAGATTTTGATCAGCTGTTATGGTGGTACAGGTTGCCACTCAGCCATTTGACCTTTCAGGAATAATATTTGGATCACAACCGGCAAGGGGATTTGCTCAAGGATCACAAGCTGGATGGCTGCATATGCAGATGGCTGGTGGTTTTGAGAAAGTAACATAATATGAACGAGATTCATTGGGAATGACAGATCAATCAGTGTGGTTGGTTTTCCATTAAAAAGGAAAAAGTCACAGCAGATGATGGCTGGTTAGCACTCTAATAACAACTTAGTGTTTGATGCAAAATGTTGTTAGATCATTTGCTTTTTTTCTCTCATAGTGAGATATCCATTGAAAGAAATACATCTAATCTCCTCGGGCATTTGGAATAATTTTATTGTGGTTTTAGTTAAAAAACTCTGCTGTGGTGGGATTCTTCTGTCCTGATTTGTTGTATCACAGTTCATATATATTAGGAAGATATTATTAGCTTTAGAGACAATATGAAAATTACCCGACTTAGTAATCGAGTCACTGGCAGAACGATTGGATATGACCAAATAAAATGTAATAAATTTCTGT