Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06827 LG1 99157478 99164760 PREDICTED: ABC transporter B family member 25
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   response to aluminum ion, transmembrane transport, transmembrane transport, transmembrane transport, transmembrane transport
Cellular Component   is active in   integral component of membrane
Cellular Component   located in   plant-type vacuole, plant-type vacuole, vacuole, vacuole, plant-type vacuole, plastid, vacuolar membrane, vacuole, vacuolar membrane
Molecular Function   enables   ATPase-coupled transmembrane transporter activity, transmembrane transporter activity, ATPase-coupled transmembrane transporter activity, ATP binding, ABC-type transporter activity, ATP binding
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 99157924 synonymous_variant p.Tyr510Tyr
C/T 99157930 synonymous_variant p.Glu508Glu
T/A 99158028 downstream_gene_variant
T/C 99158138 synonymous_variant p.Thr467Thr
C/T 99158211 downstream_gene_variant
C/A 99158287 downstream_gene_variant
C/G 99158390 downstream_gene_variant
G/A 99158512 downstream_gene_variant
A/T 99159010 downstream_gene_variant
G/A 99159015 downstream_gene_variant
A/G 99159608 downstream_gene_variant
A/G 99159647 downstream_gene_variant
G/A 99159787 downstream_gene_variant
G/A 99159900 downstream_gene_variant
G/A 99159962 downstream_gene_variant
A/C 99159970 downstream_gene_variant
A/G 99160338 intron_variant
A/G 99160599 intron_variant
G/T 99160718 intron_variant
A/T 99160738 intron_variant
T/C 99160742 intron_variant
G/C 99160978 intron_variant
C/T 99161017 intron_variant
G/A 99161181 intron_variant
A/T 99161217 intron_variant
T/A 99161644 intron_variant
G/C 99161868 intron_variant
G/C 99161998 stop_gained p.Ser258*
A/T 99162004 missense_variant p.Val256Glu
G/T 99162164 missense_variant p.Pro228His
A/T 99162228 splice_region_variant&intron_variant
T/A 99162754 intron_variant
T/C 99162758 intron_variant
A/T 99162871 synonymous_variant p.Thr180Thr
G/A 99162928 synonymous_variant p.Thr161Thr
G/A 99163344 intron_variant
C/A 99163422 missense_variant&splice_region_variant p.Gly119Val
A/T 99163594 intron_variant
C/T 99163852 intron_variant
T/C 99164051 missense_variant p.Ser25Gly
T/A 99164148 intron_variant
T/A 99164157 intron_variant
G/A 99164272 intron_variant
C/A 99164284 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06827.1
MNGLRSERAPLLESQRGGRGKRDGSSEDQVSDLEHGDAVPAANVGFCRVFSLAKPEAGKLVIGTVALLIAATSSILVQKFGGKIIDIVSGDLRTPEERDEALDAVKSTILEIFLIVVFGSICTALRAWLFYTASERVVARLRKNLFSHLVNQEIAFFDVTRTGELLSRLSEDTQIIKNAATTNLSEALRNFSTAFIGLSFMFATSWKLTLLALAVVPVLSVAVRKFGRYLRELSHKTQAAAALASSIAEESFGAIRTVRSFAQEDFEITRYSEKVNETLNLGLKQAKVVGLFSGGLNAASTLSVIVVVIYGANLTIRGYMSSGDLTSFILYSLSVGSSISGLSGLYTVVMKAAGASRRVFQLLDRTSSMPEPGSKCPLGDQDGEVELDDVWFAYPSRPNHPVLKGITLKLHPGSKVALVGPSGGGKSTIANLIERFYDPTKGKILLNGVPLVEISHKHLHRKISIVSQEPTLFNCSIEENIAYGFDGKVDPVDLENASKMANAHEFISKFPEKYQTFVGERGVRLSGGQKQRIAIARALLMNPKILLLDEATSALDAESEYLVQDAMESLMKGRTVLVIAHRLSTVKTANTVAVISDGQIVESGTHDELLSKDGVYTALVKRQLQTTTKVEI*


CDS Sequence:
>Vu_06827.1
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Promoter Sequence:
>Vu_06827::LG1:99164760-99166760(-)
TTTACATTATTTTCTTTTAGTTAAAGCCACTTTTGAAGGTTACGTGTTTTCCACGTACAATGACACATAAAATAACAACAACTTAATGCGCATGGTGTGTGATATAAACTTTTTGAAAGCATTTTTTATATGCTTTCACACATAAAATTTTTCACATCTATTTAGTATTATCATTTTTTATTTTTATTTTTTATTTGAAAAAATACAATTTTTTTATATTTATAACTATTTTATTTTTATATTATATGTTAAATAAATATAAAAAGGTGTCACCGTCTCATTTATATATAATCTTAAAATTTTGAAAATAAGTTAAAAATATCATTTGTTATTATTATTATTATACATACATAGCTTTATCAGGCAGGATTCATAATTTTTAGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATTTTATCTTTTAAATATTTTCTTTTAAATTAAAATTTTAAACTTTATACAAATTTTTAATTAAAAAATTACCTACAAAATAAATAAAAACCATTTATAAAAAAATTATTTATTAATTTTGTAATTATATTTTTTGTATTTTTCTAAATTTATCCTTTATTAAGTAACTATTTACCAATTTTATCATTTAAGTGACATTTCTTTAAGATTTAACCATTTTTTTAATTTAATCTTCTTTTAAACTAAAATAACCATCTCTAATAAAATATTACCTACAAAATAAATAAAAAACTATTTGCAATAAAATTAAAAAAAATTATTTATTTTTATTTTTATAATCATCATTTTATTATTATTTTTATCACAAGAAAAAAAAACACATATGTGTAATATATGTGTTTTCATTATATAAATATATTTTGATATTTTTGAATAATTACTAAAAAAAAATATTAATGTGTTAAAGAAAATTAAAATAACTTGAAGGATAACTACACAAGCAATGAGATTACCCCTATTGTCCTAAAAAAATTAAATAAACTCCAATTTTTTTGATTTTGTCAAATAATTCTTTTAGTCTGAATAATATTTAAAGAATTTTTTCTGCTTTATCCACGTCAAAACACGTGCGTTGAGTAAGCAAAACAGAACCACGTATTTTCTTCCTGGAGTGTGGGGGCCACATTCACGGAATGAACCTATCGTTCTCCTCACTCCGTTTTTATTTCTTTAAGAAAAATTGTAATGAATTAGAAAAAAACAACACACGAAACAAACAAAAAGGACCTATATTATCGCCATGTACATCACTAGGTACGTCATCACAGAAAAAGACTAATACTTTTTATACCTATATAAAATATAAAAAGACAAATATTTTTTTTCTCATTGGAATAGGCTAATATAACATATATTTTTCTTATTCTTTTAAATTAAAATAATTTCATTCTTTTAAATGACTATTAATTTAAATTTAATATTCTTTAAATTAAATCATTATTTTTAATTATTGTATCTTTAAATTTAGTTATTTGAACTTTCTCATATCAAAGTCGTCTACTGGTATTGGTAAATTGTATAATTATTTAACAAATTTTTTTATTAAACAGATTATGAAAATAAGACTTTAATTTAAATTAGAAAATGACACAAACAATGTTTACACAACTACATAATTTTTTTATTTGAGCATCTCTGACTAATTTTCATAATGTGAATTTATTGATTTGTTCTTTTTTAAAATGTTAAATTGGGGGAATAATATTTATAGAATTTTTAAATAATATTTAATAAGTTGAAATAAATGGACACAGACGCACACTCTTTGCATGCCTAACCCTAGCCAATGTCCTTGGGCAATGAGGGAAAATAGTCTCGGAAAAGAAAATATGTGAAAAATTATTTTGGAAGGATAGAGAGTGCATGTTGACTAACTCCCAACTAACACAATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTTATGGTGAGAAAGAACAGAGGTAACCTTTGGGTGTCGTTGTATCAGTATCTATATAGAAGAGTGGAAGTGAGAGAAGAAGCATTAATTGAGAGATTGAAA


Gene Sequence:
>Vu_06827(-)
ATGAACGGATTAAGAAGTGAACGAGCTCCTCTCTTGGAATCCCAGCGTGGCGTAAGTCAATTTCTCTTCCTCTCCACAATTTTTCTTCGCTTTTCTTCGATTGCTCCTTCTTCTCTACTACAACACTGTCATTCGTTGCTATTTCTGTCATCAATTCAGAAACACACGCTTATTCAATGTAATTCACTGCCTCCTGATGATGATGATAATAAATCCTATTGTACTCTTTTAATTGAATTAAAACTTTTTTTAAATTTTTTTTGTTGGTGTTTAAACTCGTTCTTCTTTGTACATATCACTTTCTGTTAAGTTGTGTTGTGGAAACTGTGTTCAGTGAAGACAGAGTTCAAGTCTTTACTGTTTTTTGTCATTTTTCGGATTTTATTTTGTTTTTTCTTTCATTTTGAGGCATGAATGAGATTAAAGTTTACACGAGAGGTCATGGATTTGTAACGATTCCACACTGTGAGGAACTCGTGCATGCTATACTGGCTTAGGTTTTACCCAGTCACTATTGCTCCCTGAAACTATTAATTACGTTCCCAATTCTTGGTATGGTCATGCATTTTTCTTTCGTGAGTTGTATGGTTATGGATTGGGTACAGTCAATGTAAAAATTTGCGAAAGTGGACATATTTCTGCGACTGCATTTATCGATGTGGTTCCATTAATTTTTGAAATGATATAGGGACGAGGAAAGAGGGATGGTAGCTCGGAAGATCAAGTCTCAGACCTTGAACACGGTGACGCAGTGCCGGTAATTACTGTCCACGCATAATTTAATTCTCTCTGTGACATCTCATAGCATTAGCATCATGTTAACATTTGCATTTGCTAACTTAATGCGTGTACATTACAGGCGGCGAATGTGGGATTCTGTCGAGTGTTTTCACTCGTAAGTGGCCAATGTTTCTTTGAATGAATTGCTGTCATGTTATTTTGATTATTAAAGCTTCTTCTTTTGTTCGTTTGAAATTGATTGCAGGCAAAACCTGAGGCTGGAAAGCTGGTGATCGGTACTGTGGCTCTTCTGATTGCAGCCACATCAAGTATCTTAGTTGTATGCTTCTTTTAATACCTCCCTTTTCCGTTCCATCTCACATACAGAGATACTAAATATTCTGTCAGCGTGTATTTATGTTATTTGCTGTCACCATTGCTGAATATAAGTTTCTACCTGCTTTCTAATGAACATGGAAATATTCTTGCCGCAGCAAAAATTTGGTGGGAAGATAATTGACATTGTCTCTGGGGATCTCCGGACTCCGGAGGAGAGAGATGAAGCTTTGGATGCTGTTAAGAGCACCATACTAGAAATCTTTCTGATCGTTGTCTTTGGGTATGATCCTCGCTTGAGTACTATTGAATATAGTGAAAAATTTGTATGGGATTAATCTCCCTTGTATAGAAAATATGCATAACATTGTTTTTATAATAAAAAAAATATGAATTAAACCCAAAACACAAACAAAGACCAATGATAAAGTAACTGAAGATAAAAGAGAAAATAAAATATTTATGTAAGATTTCTAATAATCTAATATATTTAATAAGTACTTTTTAATTTATCATAGACATAATTTTTAACTTATCACTGTGTTTTGATGGTTTTCCAGATCAATTTGCACTGCACTTCGAGCCTGGCTTTTTTATACTGCCAGTGAAAGGGTTGTTGCACGGCTGAGAAAGAATTTGTTCAGTCACCTTGTAAACCAGGTAAAACAGTAATGACTCTTGCGTTGCATCTCTTTACTTTCTCTGAGCACTGAGCAGGCTTGTTTATTATGTACTATGAGTTCTCAGGAGATAGCTTTCTTTGATGTTACTCGAACCGGGGAACTTTTAAGTAGGCTATCTGAAGATACACAGATCATAAAGAATGCTGCGACTACCAATCTTTCTGAGGCCCTGAGAAACTTTTCAACTGCATTTATTGGTTTGAGCTTCATGTTTGCAACGTCATGGAAGTTAACGTGTGAGTTATTCAACATTGAAGAAATGCAAACACGCAATTATATATATCCTAATCAATGTTTACAAAAAAAACCGGTCATTGAATTGGTGGCAGCTTGGTTCATTCATGATTTAACTATAGTCAAACCAGTGATAGTTAATTAAATATTTCAATGTCGTACAATTTATTAAGCAATGAATTAACATAAAATGAAAAGAAATAAAATCAGAGAAAATATAACATTAGCATAAAAGGACCATATTGTTAATCCTGCGTAGACAGAAAAATAATAAATAATAGTTAACCACATTTAGCGAGAGTGGACCTTATTTCATTTATTATTATTTGTCTCAAAAACATATCGTTGGTTGAATAAAGGATAAAAGAAGTAAATAAATAATAAATAAAAAAACTTGTCCAAACTGGTTTTTTGCCACTGGTTTTAGTGGTTCTCTAAATGTCTGATCTTTCAATTTTTCTAGATTGAAAACTGAGCCACTTCACTGGTTTTGTGGCCAAACTGGTTCACCCGGGTTTTCTTATCCATTATCCTAACTTCTCTCTTTTTCATCAACTCTTGCAGTGTTGGCTTTGGCTGTTGTACCTGTTCTTTCCGTTGCTGTTCGCAAGTTTGGCCGTTACCTGCGTGAACTTTCTCATAAAACTCAAGCTGCTGCTGCATTAGCTTCATCAATTGCGGAGGTACGCCTTTTTCACCAAAAAGATATCATAGGAAAAGATAGTTTAACTTATATTAATTTCATCTGTGTTGCACAGGAATCCTTTGGTGCAATAAGAACAGTAAGATCATTTGCCCAAGAAGATTTTGAAATAACGCGCTACTCAGAGAAAGTTAATGAAACACTTAATCTTGGACTTAAACAAGCTGTGAGTTAGCCAATTATATTTTGATACATCGTGTAACTTCTTTTGTTTACCTTTACAACATTTAATCTTATATGTATCTCTTTGGCAATGCAGAAAGTTGTTGGACTCTTTTCTGGAGGCCTTAATGCTGCATCTACACTTTCAGTTATTGTAGTTGTTATATATGGAGCTAATTTGACAATCAGGGGTTACATGTCCTCTGGTGATCTTACATCTTTCATTCTTTATAGTCTCTCAGGTAAGTTCTTTTTTCTATTTCTCCCATTTACATTACAATGAAACCTGGAAAACATTCACATTGAAAGTATGCATGATCCATGGATATTTTCTATTAGTTGGTTAAGATTCTTCTTGTTTATTCTCTTGATCTATTTCAGTGATATTTTAACTGTTGTATTTGAACTACCTCTGTTGTATTGATATTGACTCAGCTCCTTTGCCTTATTGCAGTGGGTTCTTCTATATCTGGTCTGTCAGGATTGTATACAGTAGTTATGAAAGCTGCAGGTGCTAGCAGAAGGGTATTTCAACTTTTGGATCGTACCTCATCCATGCCCGAGCCAGGAAGTAAATGTCCACTGGGGTCAGTTTCATATAATTCCTAAAATATAACTTTGAGAAATTCTAGCAACACAAGACAACACACTTTGTACAGTAGGGTGAAATTAATGTGGTACCCACTAAATAGGAGGCAGGACCCTTGTCATTGAGTGGGGTCACTCATGAATTTCACCAAACAGTATAGAGTGTGTATAGTTGTAAATCTATTATGCTATTCATTGAGAATTTGTCAATCATTTCACCAATTATGTATTTTACAATCCTTGAACTTGGTCTAGGATGTACAGATGAAGGAGCTTACTTTTTTTAATCTTTTACTACATGATTTTACAGCTCCCTCGTTATACATTCAACTCCTGTATTCCCTATAAAAAAAGTGCTTAAACTCATTAAAACTCCTGTATTCCCTATAAAAAAGTGGTTAAACTCTAGAATCATATGATTGGCCTTCACATATTCAATGTTTTTCTCTTTGAACTTTAGAGTATTTTCGGAAACCACCATCAAATCTATCTGCATACTAGATCCTTTTTCAGTATTTCGCAAGTCTTCTACTCGGTGCAAAACATTACTCATTTCTTGAAAAACACCATCATCAACAATCTTGACAAATCCAATGTCTTTAATGTCAATCAAACTCATCTCGTACAAGCCATTCTCCCACAATCTAGCCACCCTCCTTTTTCTATATGTTTTTTGTAATGAAATACTACTAGGGGTCTCAATCTTGGTGGTGTAAACCGAAACCGAATGACTAATAGCTCTTCTCCCACCAGCAGAAACTGCAGCATCAACCCCAATTGGATTTAGAATTTCATCCAATGCATCAACTTGATGGAGAGCAATGAGTGGTCAGTCGTGTCCACATATGTGATGTTGGTGGGAATCTCTTTTTTCTTGCATAGGACCCTCAACTTTGCAAAGAAATACTCCTTCAACTGATCTTTTGGAGTTGGATTTACTTGTGACACCAATATCTTGAAATCTTGGATGAAAATTTTCCCACTCCCAGTCTGTGTTAGTGCTGCCAAACTCTCAAATAAAATTTTCACACTCCCTGTCTGGGTCACTGCTGCCAAACTCTCAAATAACATGCTTCTCCTAGTGCCTCCAACTATCCTTAGTTGAGTTGTTGCAAGATCTTCCCAAGATTTTGTTGCCAGATTTTAGCCCACTAGCCTGCATTTCCTTCCATCCTAATGATGGCTGGACGCAACTTCTCTTTTGGAGCAATTTCCTGAATTTCGAAAACATTTTCAGCCCTTGCTGTCTACCCCATTGGATCGTTCCCTTCAAAGGTGGGTAATTCCATCCTTATCATCCAATGCTTATGTACTTCTTCCTCTTCTTTGTCAAAATTCTCACCGAGCACCGTTTCTTTCTCCTCTCCTTCCCCGTTAATGGAGTTCTCGCTTCTTTGAGAACTTCTTTCTCTCTTCTTGAATGACACAGTAATTCTTTAATTTCTTGGAAGTTATCTTGCATCTCCAAAATCACCCTTCCATGTTCGCTGGCCAATTTCTCCAAAGCAGCTATTCTCTTTTCCATGATTTCCCCTTCTCGAATGCGGCAGGCTGGACCAAATTGTTAGGAACCC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