Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06966 LG1 100682904 100692033 PREDICTED: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 24
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, response to salt stress, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, signal transduction, response to salt stress, intracellular signal transduction, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   plant-type vacuole membrane, cytoplasm, plant-type vacuole membrane
Molecular Function   enables   protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein kinase activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein kinase activity, protein kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 100683176 3_prime_UTR_variant
T/C 100683177 3_prime_UTR_variant
G/C 100683183 3_prime_UTR_variant
T/C 100683724 downstream_gene_variant
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A/T 100683822 downstream_gene_variant
A/G 100683945 downstream_gene_variant
T/A 100684372 downstream_gene_variant
A/G 100684391 downstream_gene_variant
T/A 100685132 3_prime_UTR_variant
C/A 100685136 3_prime_UTR_variant
G/A 100685398 3_prime_UTR_variant
C/T 100685507 3_prime_UTR_variant
G/T 100686015 3_prime_UTR_variant
G/T 100686168 3_prime_UTR_variant
C/G,* 100686307 missense_variant p.Val400Leu
A/C 100686312 missense_variant p.Phe398Cys
A/C 100686379 intron_variant
A/C 100686380 intron_variant
A/C 100686397 intron_variant
A/T 100686415 intron_variant
A/T 100686561 intron_variant
G/C 100686572 intron_variant
T/A 100686580 intron_variant
A/T 100686581 intron_variant
G/T 100686771 intron_variant
G/A 100686799 intron_variant
T/A 100687081 3_prime_UTR_variant
T/C 100687332 missense_variant p.Glu310Gly
T/A 100687340 missense_variant p.Glu307Asp
C/A 100687717 intron_variant
A/C 100687848 intron_variant
C/A 100687850 intron_variant
T/C 100687862 intron_variant
T/C 100688088 intron_variant
A/T 100688278 missense_variant p.Cys235Ser
T/C 100688577 intron_variant
G/A 100688581 intron_variant
T/C 100689553 intron_variant
C/T 100689576 intron_variant
T/G 100689722 intron_variant
A/G 100690016 intron_variant
C/T 100690424 intron_variant
A/G 100690650 synonymous_variant p.Ala85Ala
A/T 100690859 intron_variant
G/T 100690885 intron_variant
G/A 100690923 intron_variant
A/G 100691036 intron_variant
G/A 100691143 intron_variant
A/T 100691163 intron_variant
T/A 100691196 intron_variant
G/A 100691425 intron_variant
A/C 100691431 intron_variant
G/A 100691462 intron_variant
G/A 100691718 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06966.1
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>Vu_06966.2
MNERRKNMNVRRKIGKYEVGRTIGEGTFAKVKFARNSETGESVAIKTMAKTTILQHRMVEQIKREISIMKIVRHPNIVRLHEVLASQTKIYIILEFVMGGELYDKIVQQGRLSENESRRYFQQLIDAIDHCHKKGVYHRDLKPENLLLDAFGNLKVSDFGLSALTEKGVGLLHTTCGTPNYVAPEVIGNRGYNGAAADVWSCGVILYVLLAGYLPFEEPDLPTLYRRINAAEYVCPFWFSAETKSFIHKILDPNPETRVKIEEIRKVPWFQKNYFPVKLKECEQVNLDDVRAVFDDIEVCCFFLFYSIYTNKIYFCNCMSNPCISIAANTL*


CDS Sequence:
>Vu_06966.1
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>Vu_06966.2
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Promoter Sequence:
>Vu_06966::LG1:100692033-100694033(-)
TTGAAGAACGAGCGGTAAATTCCTCTCGCTTAATGTCTAAGGACGAGCGGTAAATCCCGCTCGGTTAAAGTCGAAGGCCGAGAGGTAAATCCCTCTCGGTTCATGTTGAAGGACGAGCGGTAAATCCCGCTCGGTTAAAGTCGAAGGCCGAGAGGTAAATCCCTCTCGGTTCATGTTGAAGGACGAGCGGTAAATCCCGCTCGGTTAATGTCGAAGGCCGAGAGGTAAATCCCTCTCGGTTCATGTTGAAAGACGAGCGGTAAATCCCGCTCGGTTAATGTTGAAGGTCGAGAGGTAAAACCCTCTCGATTAATGTTGAAGACCGAGAGGTAAATTCCTCTCGGTTCATGTTGAAGGACGAGCGGTAAATCCCGCTCGGTTAATGTCGAAGGCCGAGAGGTAAATCCCTCTCGGTTCATGTTGAAGGACGAGCGGTAAATCCCGCTCGGTTAATGTTGAAGGTCGAGAGGTAAAACCCTCTCGATTAATGTTGAAGACCGAGAGGTAAATTCCTCTCGGTTCATGTTGAAGGACGAGCGGTAAATCCCGCTCGGTTAAAGTCGAAGGCCGAGAGGTAAATTCCTCTCGGTTCATGTTGAAGGACGAGCGGTAAATCCCCCTCGGTTAAAGTCGAAGGCCGAGAGGTAAATCCCTCTCGGTTCATGTTGAAGGACGAGCGGTAAATCCTGCTCGGTTAAAGTCGAAGGCCGAGAGGTAAACCCCTCTCGGTTAAAGTCGAAGGTCGAGAGGTAAATCCCTCTCGGTTAAAGTCGAAGGTCGAGAGGTAAACCCCTCTCGATTAAAGTCGAAGGTCGAGAGGTAAATCCCTCTCGGTTAAAGTAGAAGGTCGAGAGGTAAAGCCCTCTCGGTTAATTTCGAAGACCAAGAGGTAAACTCCTCTCGGTTCCTGTTGAAGGACGAGCTGTAAATCCAGCTCGGTTAGTGTCGATCGTCAAGCGTCGATCGTCGAGCGGTAAAACGCCATCGGTCTGTCTTTACATGGAAAAAGTTCTAAAAAGAACTCTCTTCAACCACCGACAAGAGCGGCAGAAGCTCACCAATACAACAAACACACCCTCCCTCAAACTCATAAGTCCTATAGTTAACCACGGCTAAAGCCAAACGCTTAACTCGGACTTGGGGGGCATAATGTATAGTATGAAATATTAACCGAGCGGTTACAAACAACCAACCGGATATTTAGGTAATCTGTTTATATCTTATTCTGTTTATATTTTATTGGGCTTATATTAGCTCAAGATCCATGAGGAAAAGAATAAATACAAAGCTAGGGCCAAGAGCCAGGTACGTTCAACTTACTCTACATGACTCTCAAATACTCAATAGTGATAACCATTCACTAAATATTCAACCAAGAGCCGAGGCTCTTCAAATCACACGCCTAACTTGGGCGTCGGAGTACCTTTTGCAGGTACATCCCCTCGTCAAGAAGGAGACCGATCGGTTTGCGCCAACACCGATCGGCCAACCGGAGGAGTTTGGAAGCGAGCGAGCGGCCCAGACGCGTCAGCAGGTTAGTCTCTCGGTCCCTAAAAGTATCTACCGAAACACGCTTGTTTATCTTTCTTAGGTAGTTTTCGGTGTTTAGCTAGGCTTTAATGATTCAACTGGGACACGAAGTATCTCAAAAATAATTTCAAGTTGGGATCAATAAGAGTTTAAGAGTAAGAACCTTCCCTAGAATAAAGCTCTTAACTTTATGATCATAGGTTCGAATTGGGAAATTGACTTTTTAATTAGTAAAAAATAAACTTTTTTTCTTTTTCTTATTTTTTTTTTCATTCATCCAAACAAAACAGTAGATAAATTATTTCACTTCTATTGATTTAAACAACATATCTGTATTTATCCTATGTAATTTTTATTTTATTTATTTTCTACTTTTCTCGCCATTATTCATATTTAACTATCTGTAAAAGGTTTACGCTACAAAGGTCTATTTTCTTTTATATACGCATGCTAAAACTGAGGATTAAGAC


Gene Sequence:
>Vu_06966(-)
GATGGAGACATTGGCAACTTGCCACGCCTTTTTTTTTTCTCTTTCTCGTTTCTCATTTCTCACGTGTCTCCTTTTTGAGCTAACTCCATTCTTATATGAACTGCTACTTCCTTCGCTTCTTTATTTCTTTCCAATTCCAGAATATTCCAACTCTCTGCGATCTTTTCTTTTCTCCTCGAACGTCCTATGCTACGCGAGGATCAGGTTCCAGAATAATACTGGTGGTCTCCTACAACTGAATAGCGTTCTGTTCTCTGAAATTCATTGGGAGCCAATTCCGTCTCTAGGTCATCTTCTCTGAATCGGAATTCGCCACGAGGAGCTGAAATTGTGGATGAATGAACGTCGAAAAAACATGAATGTCAGGAGAAAGATCGGGAAGTATGAGGTGGGGCGAACTATTGGCGAAGGCACGTTCGCCAAGGTCAAGTTCGCCAGAAATTCTGAAACAGGGGAGAGCGTGGCCATTAAAACTATGGCTAAGACCACCATTCTCCAGCACAGAATGGTTGAGCAGGTTGACCTTGTTACTTTCAACTTCTCCATAGGGAACTTATGTGTTCAATTTCCACTATATTGATTTATAACCTTTATGTTTTGGGTTTTAACTTTTGAGTCCTGTTTGGTTTGCCGTTCCTTCGAATTCATGTTGTTAATAACGAGAGTGAGGTCAAGCCTTTCTTTACATTCTTCAATTGGTATCCAAAAAACGAAATAACAAAATTAAAATAAACTAGAGGTGAAAATATTATGGGCTAGATTGTATTTGGTTCGTGAGAAGGAGAATCAGAGGGAATGTCAATTGCTGGAGACGGAAATGGTCAGGTTGCTTGCGGGAGAGGCTGATTTTGAGGCATATGACATTGTCTATCCCTCGGGCCTTGATCAAACCTATTTCCAAAATTAGTTAAGTGAAGATTTTATTAGAAAAACCTGTTTGGTAAAAAAGTTAAAGCTCTGCACCGTTCAAAATGACTTTTAGACCCCGAATATTGACTTGTTTAAATAAATACAAGTAATATAATGATAATAATATTATTGTTATCATTAGTCTGATATTATTTTTACATTCATATTTTAAATTTGCAGTCAAAGTTGTGCATCTAAATCCATATGCTTGCCTGTGCATTTATGCCAGAATATTGATGCAGTTCGTTGTACTGAATGCTTGTTGTAATTCTTTTCATCCTTTGGTATTAGCTTTTCTAACTTGAAACATGTTATCATAGATTAAAAGAGAGATATCGATTATGAAGATTGTCAGGCATCCTAATATAGTTAGATTGCACGAGGTATGTCTAGAGATATCTTAATACATCAGGATTTACACCATCTTTCTCCCTCTTGTATTTCTCACATTGTTCTCAAATTTTAGGTTTTGGCTAGCCAGACCAAGATCTACATAATCCTTGAATTTGTGATGGGAGGGGAACTATATGACAAAATTGTAAGTTTTTATGTTTATATATTATGATTCTTCTAAACTTTGACAATTCTCAAGTCTGACCTTAAAATTTATAATCACTGTTGAGATGCTAACAGATTAATGTTAATGATTTGATTAGGCTTTTTATTAGATTTTGTTTGTTATATATGTTACAATTACACTGCTTTTGGATCTGTAGGTTCAGCAGGGAAGGCTTTCTGAAAATGAATCTAGACGCTATTTTCAACAACTTATAGACGCTATTGATCATTGTCATAAAAAGGGTGTGTACCATAGAGACCTGAAGGTGAAAGGCAGTATATAGTATATGTATATGTGTGTGTGTCCGTGTTTATGTTCTTGCTGAGGTAAATGTTTTAACCTTCTTTTGTTTTTGTCTTGATCAATTTGTTTCTCTTCTCTTTTGATAGCCTGAAAACCTCCTTCTTGATGCTTTTGGAAATTTGAAAGTTTCTGACTTTGGATTGAGTGCATTGACTGAAAAGGTAATAAACTGGCATCTTATTTTTCCTAGTCTCAGAATAAAGATTTTTGGAAATAGCAGAAGCTGCAGAACTGACGGCTCCATCCTATCCTTTTCTGTGTCTTTCTTGTAGGGTGTTGGCCTTCTTCACACCACTTGTGGGACCCCAAATTATGTTGCCCCTGAGGTAAAATTAATTATACACAACTCCAATGTCATTCCTAATTATTGCCTTTATCTTTTAATCCTTTTCCTATGGGCTCAGATTGATGTTTTGATATAATTCTCTTTATCAAGTTTATTTACGGTCTTATGGACAAATCACCAGTGATGAAAATAGTAGCCAGTTGAGGTGTTCTCTTCTCTGCATTACGACCTTTTTATTTTTCTCTAAATTCAGCATAAATATTAATATATATAGATTATAAGAGATATTCAAGACTGATACGAGGATAATATATATATTAAAAAAGAGGAATTAAGGATGACATGAGAAATAAGAAATTAGTCCACTTGAAAGTTAAAGAAGTCTGATTCAATACATAGGGTAAATATTAGACCTTACTCTCAAACCCTTATCTTGGAACAAGAGGTGTCTTCACGGTTAATTATTTATACATTTAATGATTGGATTTGTAACTATTGCATTTTTTTTTATCTCATGACATTGATATATTCAATTTATATGTCTAAGGTGAGATAGTTAATTTAGGTTGCAATTTGACTGTTTCTTCTAAGTGATTTAATTATGAGTTCGTATAAATTTGATTCTTTTCCCCTTATTGCAATAAATTTCATTTATCATTATGTGCTTTGGTTTCTCACTGAAATGATCTTTTGTAGGTGATCGGAAATCGAGGATATAATGGTGCTGCAGCTGACGTTTGGTCATGTGGGGTCATCCTATATGTTCTACTAGCCGGATATCTTCCTTTTGAGGAGCCTGACCTTCCAACTTTGTACAGAAGGGTATTCTACCTTTCCATTATAACCTGGAAGTATACTTGAAAGAGCTAGAGAGAAGAGTGAAAAATATTGGTTGTGAATGTAATAGAAAAGATCAGTGGAGCATCACTTTTAACTACTTTGGAACTTTATTTATATTTTAAATCCTGAACTATTCTCACTGAAGAGAAAATAGTCTTTTAAAATAATAAGAAACAATTATATAACATTCTTGTAATTGAAGTGTTAATAACAAGATCCTAATCAAACAACCTTAATAATTGATATGGACAAAAATAAAATAAGCTACTAAATTCACGCATAGTTTTAGAGGTGACAGTAAAATTGCCAAGGTTGAAAATATTTCTGCTGCCAGCATTTATCTTTAATGGGTTATTCAAGCTTTAGTAGTTGTTTACATGCTGTATTATGTAATGTGAAAAGGTGAGATGCATTGTTCTTATGTTCATGCTTATTATGTAGTAGAGCTTCATTTGTTGAAAACTTGTTTTGAACCTGATTATTAAGAAGGTAAATGTGAGAAAGTAATTAGGTGGACAGATTGGTGTTAATAAGGGAGACATTGATATGCTTAGGCAACAGTAGTGTGTGTAGATTTTTGGAGGGAGTGGGTGGGTGCGGGAAGGGATTCTATTTTGTATGGTTGAGGATTAAGCTGAGTCTTGGCTGAAGAATAGTAATCCCTCTGGCTTTTACTATTTACTTTTATGAAAAATTGACTGTCTTGTCTTTCTTATTAGATACCATGAGGAATCTTTTGTGAGTGTGTTTAATGTTCATTTTAGGAGTATTGGCAGATGTAAATTGTTAACCAGCTGTTAACTTGTTATTGAATTTTCTTTTTATTTGAACTTGTAGATCAATGCTGCAGAGTATGTCTGCCCATTCTGGTTTTCTGCTGAGACAAAGTCATTCATACATAAAATTCTAGATCCTAATCCAGAAACAGTGAGTACAGTTTTTCATTTCTTCAAGATGTAATTTGTTATAGCCCCTAATACAGGCATACACGCATTATGCTTTGTTATGAAGTGTGTGCGCTTCTAACTGATTATCCTGATACATTTTCATAGTTACATTACAAGTGTGTTTATTCCTACGACAATGCAACTATGTAGTGAGTTCTGTGAAACAAGTATAATACTTTTTTCTTTTAATTTTTTGGTTTTTCTTTTTTCCTTATTTCAGAAACATAAAAATTGAAAATAGTAAAAATTGAGACAATAAATGATTTTCTTCTCATTAAAGGATGTTACTATCAGTTATGGTCCACTTTTCAGTTTTGTGGCATTTTTATGCTTCTGTAAGGTTTCATAATTTTTGCTGACACTAAAATAAATATATTTTTGTATGTATAGACATTTTTTACTACTTGTATAAGGATTACCCTATCTGGGAAATTTTACACCTGATTATTGCAAATTAGTTGTGAATTAAATAGATTATTCTTATTAATTCCAATTCAATTATGGAAGTGCAGAGGGTGAAAATTGAAGAAATAAGGAAAGTTCCATGGTTCCAGAAAAACTATTTTCCTGTCAAACTCAAGGAATGTGAGCAAGTAAATTTGGATGATGTTCGGGCTGTTTTTGATGATATTGAGGTTTGCTGTTTTTTTTTGTTCTATTCAATTTATACAAACAAAATTTATTTTTGCAACTGTATGTCTAACCCTTGCATATCCATAGCTGCAAATACATTGTAAGTCTACAATATGTTTTGCTAGTTATCCAACAGCGTAAGTGCTTTGATTCACTGATCTGGGTAGTTGGCACTTTTACATTTTTATAGGACCAATATGTTGCTGAAAAGTCAGAAATTACCGAGGGAGGTCCTTTCATAATGAATGCATTTGAGATGATTTCCTTATCACAAGGATTGAATCTTTCACCATTGTTTGATAGGCACCAGGTATTGTTTTAGTTTCATCTTCCTGCCCTACAATCTCCTGGTTCCTCTATGTCTCTGGCTGCCATGTAACATTTTATACTTCCACCTGCCTAGGTGGGCATTAGAGGGCATCTGATTTCAGGTTTGAATCAAAGGGGGGCAAGTTGGCTGAGAGTAATTTTTTCAAGGTTGTCTGATGTTTGCCCCAATTGATATGCTTTTGCTGTTCTAACA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