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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08944 LG2 12743958 12746933 PREDICTED: transcription factor bHLH79-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 12744355 downstream_gene_variant
G/T 12744720 missense_variant p.Arg93Met
T/A 12744852 downstream_gene_variant
A/T 12744856 downstream_gene_variant
T/C 12745422 downstream_gene_variant
A/G 12745686 downstream_gene_variant
A/T 12745844 downstream_gene_variant
T/C 12746024 downstream_gene_variant
C/A 12746080 downstream_gene_variant
A/G 12746435 downstream_gene_variant
A/T 12746443 downstream_gene_variant
A/T 12746583 downstream_gene_variant
C/A 12746624 downstream_gene_variant
A/G 12746629 downstream_gene_variant
G/A 12746787 synonymous_variant p.Val217Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08944.1
MDPPLITDSTFSSAYTLADIWLGTSPFPPSDHHFSENDSGSNKRMKVEGCSVKNDGFKDEAETSSVSGNKSSEQSTVPCEAPKQDYIHVRARRGQATDNHSLAERARREKISERMRILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRMNMSPNTDGFPLKDVGGTGMVFGSQAATGYAQGSHPGCLHMQIGGGLREQHDSEVSQGNETSFDRFVFPLL*


CDS Sequence:
>Vu_08944.1
ATGGATCCTCCTCTCATCACTGACTCCACATTCTCCTCTGCTTACACCCTCGCCGATATTTGGCTCGGAACCTCCCCTTTTCCCCCTTCCGACCACCATTTCTCCGAGAATGACTCTGGTAGCAATAAACGGATGAAGGTGGAAGGGTGCAGTGTTAAAAATGATGGTTTCAAAGATGAAGCAGAAACAAGTTCTGTGAGTGGTAACAAGTCAAGTGAACAAAGCACTGTACCTTGTGAGGCACCTAAGCAAGACTATATTCACGTGAGAGCAAGAAGGGGCCAAGCTACCGATAACCACAGTCTAGCAGAAAGAGCAAGAAGAGAAAAGATCAGTGAGAGAATGAGAATTCTTCAGGATTTGGTTCCAGGGTGTAACAAGGTAATTGGTAAAGCACTAGTCCTAGATGAGATAATCAATTACATACAGTCGCTGCAGCGTCAGGTTGAGTTCCTTTCTATGAAGCTTGAAGCAGTTAATTCAAGGATGAACATGAGCCCTAACACAGATGGGTTTCCTTTAAAAGATGTTGGTGGTACTGGAATGGTATTTGGATCACAAGCAGCAACAGGGTATGCTCAGGGATCACATCCTGGATGCCTGCATATGCAGATAGGTGGTGGTTTGAGAGAACAACATGATTCAGAGGTGTCTCAAGGGAATGAAACATCATTTGATAGGTTTGTATTTCCATTGTTATAG


Promoter Sequence:
>Vu_08944::LG2:12741958-12743958(+)
AAGCGTTCGGTCTAAGTATTGTTTCCTCTTTAAGCTTCCTAAACAGTTTAGTTAATGTATTCTATAGTACTTACAGTCGTAGAGGTTACCTTTATCCTTCATTGAAAATAAGTGTTGTGTAATTGTGTATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCCTTCATTTTGATTTAAGTTCAGTAGTGTTCGGTCGTTAACCAAGTGTTCGGTCTCAGTAGTGCTTGGTTTTGAACCAAACGCTCGGTCTTTATAGTGGTGGTCTTTAACCAAGCGCTTGGTATTTTATTATACCCCATTGTGTACTCTATTTGAACTAAGAGTGTTCGGTCCAAGTCAATAGTATTTGATTAAATATTGTAGGGTTCGGTTTAAGTTCCTAGGTTCCAGCAATAGTTATTATGATTTTTGGTTAAGTCTAAATTATATGTAATATTTAGTATTCGGTACATTCTTAGGAGTTCGGTCTAGTAAAATATTGTTCTGTAGTAACTGTTGAGTAGCAAATAAACGTTCAAATACTATCGCTAGTGTTCGATTTATGATGAGTCTTATCTAGAATGGACCGTTCGGTCTTATTCTATGTATAAGTGGAAGATCGCTCGGTCTTACATTAGGTGTCCAGTTGTGTTAGTCTAGAATGTATTCAAAACGTTCTCGGTCTTGTCTCTGGGGGAATGTTATTGTTCAGTTTTGATTTCAGATGGTATCTGTTTGTATTGGTTCGGTATGATTGTATTATTGAATATGAATGGAATAGAATGGAAATGAAAGAGTATTCTAGGGAGGAATATCTCATGAGTGGTTATTGAATGGTAGAGTATGAATGTGGTTATGCTTAGTTGGCGGTTATCCTAATATTCTGTGATTACTCATTCTCAAGTAGAGAGGAGTAAGTCATGTGTGAGAATGACAGGAGGTCCTAGTCCATAAGGTGAACTTGGACGGAACGGACTAACCTCGAGTGACAACTGTTGAGGGCATCCCAGCTATTACATCACCCGGGTGCAAAAACGTTGTAACTACACAGAATTCATACAGTCCAGACAGTCAGAGTAAAGTGGTCGGTCATTGCATGCTTTGACTTGAAATTTTGATTGGAAGTGCATGATTGGATGTTACATGATTGTATATTGAATTATGTTAGATTTATGTGAAGTATAGGTTTATCTGAATTAATTAAATTACATAAGTTTACCCTATTTTTCTGTCTTGTCTGTATTGTCCGTTCGGTTGTTTTTTCTTGTTGCAATGATCATCCTGTGAATGTGAGCAGAAGGAGAAGAGCTGCTGGAAGAAGCTTTGGAAGAAGTGGAAGTGAAAGCGAAACCTTAGAACCGTTCGGTCGTTAGGTTGGGTTTTATTTTGTAAAACTGTTCGGTGTAATCTTAGTTTTGAAACCGTTCCGTCTAGACTGTAGTTTTGTAAAGTTTGAATTCTGCAATATTTTCGTAAGGCCGTTCAACCATATCTGTACCTTTGCTTCTCAGAACTGAACTGTAATATTATTAGTTGCGAATATTCTATATATAGTTTTATGTTGTATTTTGGAATATTACAATAATAATCTAACAAAAAAATCCATTTTAACTTCTTGTAATAAATATTGAAAGAAAATACTAAAACTAAAAAGAGGTATTAACCTTTTATAAAATGAATATTGAGATTTGCAATGAGTTATATATTATAATTTGTTGATGGTATCTTTAATTCAGTGTGGAGTTAAAAAAAAAGTTTGATTAGAAGAGTGATGATGTGATATAACAATAATTTTGAAGCAACCCAGATTGAAGGAGGAAGTAAAATGGTGGTGGTAATTTTGATGTGAGAATAAAAAAAGGTGGAAAAGAAGGTATGAGTAAAAAAATGGAGTATAAGAGTAGAATATGATGGAGTTGCTGTTCTCTCTCAGTGTCACACTCATCCATTAACATACTTCATTACAGTCTCATGCTCTCACCTCCCAA


Gene Sequence:
>Vu_08944(+)
ATGGATCCTCCTCTCATCACTGACTCCACATTCTCCTCTGCTTACACCCTCGCCGATATTTGGCTCGGAACCTCCCCTTTTCCCCCTTCCGACCACCATTTCTCCGAGGTCCTTCACTTTTCATGTCTTCACTCTATGCTTCAATTACACTTCAATACTTTTTCTACAACACTTTACTTCCTCAATTAAAGTTCAATGCTTTCAGGTTTTTTGCAATTCCCAAATGTTTGGAATTTCGCAAACTGCATCTAAGTTATGTTGTGTTTCTGTGAAAGAGTCGGAATTCAAGTTGTATGAACTGTTTGAGTGAGGGTGTTGTAAACTGTAGGGTTTACTTTTTTGGTGAATTTGAATTGTTGCGGTGTTTTACTGTTTGCTTTGGAGGAAAGAAAACGGAGGTTGGAAATTTTGAAATTTCATACTAAGAAAATTTGAAGGAAAGAAAAGTTTGAAGCTTTACTTTTAAAATTTGATTTTTCTGTCTATTTTCCATTTTGTTATTGGAGTTACTTTCTCTTTTTCTCTATTTTTCTATTTTCTTTCCAAGTGAGGAGCTGGGTTCTGATTGATCCATTGCGTGGGAATTTGAACAGAATGACTCTGGTAGCAATAAACGGATGAAGGTGGAAGGGTGCAGTGTTAAAAATGATGGTTTCAAAGATGAAGCAGAAACAAGTTCTGTGAGTGGTAACAAGTCAAGTGAACAAAGCACTGTACCTTGTGAGGCACCTAAGCAAGACTATATTCACGTGAGAGCAAGAAGGGGCCAAGCTACCGATAACCACAGTCTAGCAGAAAGAGTAACTCTTCTGTTTTTTAACTTCTTGTCTCTTACAAGTTTTGCCTGCTATTGGGCATTTTTCCTTGATGTAGAAACAAATGGAATGTGTGAACTTTTAGACATTCTCTTTTTCTTTCTTGTGTTTATATTTGCTATTTTTCATAGGCATGCCACTAAACACCACCTGTTTTCCAGGCAAGAAGAGAAAAGATCAGTGAGAGAATGAGAATTCTTCAGGATTTGGTTCCAGGGTGTAACAAGGTACTCATAATATTCTGTTGGAATATCACAAGATTAATGCTTCTATATTTCCTTCATCGTTTGTTTGTTTTAATGTTCAGGTAATTGGTAAAGCACTAGTCCTAGATGAGATAATCAATTACATACAGTCGCTGCAGCGTCAGGTTGAGGTGGGTTTCTTCATCTTTCCATCACCTTTTAGTATTTTCACTAGATGATGTTTTCTTCTTAACTTCCAATCTAATTCTGTATGCCAAACAAATTGAGTTTTGTAGTTCCTTTCTATGAAGCTTGAAGCAGTTAATTCAAGGATGAACATGAGCCCTAACACAGATGGGTTTCCTTTAAAAGATGTGAGTCTATCAACTTTGATGTTGATCATACTGACTTCAAATATTCAATTAATTTCCACTTGCATAAGATTTAAACATCGTGCAAAATTGTATGTGTTGGCTGCTTAGAAGCTTTTGGAATCCTGCCGAAGAAATTTATCCTGATGCTTTGTCTGGGAAATTGTCTCAAATTATTCTTCTTGACTACTTTTATTTGAAAAGTCAAAAACTAATAGGATAAAGTGATTTCTAACTTGTAAGTTTATGGATCCGTTTGTGACATTGTTCTCACCGATCAGTTGGCAAAGCTTAATTGAAGTCAAGTTGGTATGGAAGAAACAGAGAGGGAGAAAAGAAAAGAAAGGAATTGATGGAAGAATGCAGAACCAGTTTTTGATCTGGGAAACGAATAGATCAGAATCGGAAAACCGATGATAATGTCGGTGCATAGTTATCCATAATTGGGATAAAAACAGCTTTGTTATCAATCAATCTAATGGCTGTAGTATCATCATATGACATCTTCCTCAATAACTGAAGGCCAATCAGCAGAAAGGAAGGATTGAATCAGCATATAATTACCCTGATCTTGTCTCCCATTTAACATCCAGTTTAGATGGAACAACATTTTGAAGTTCAACCTTCATGGAGATGATAAAAGGTTGAAGCTTTCACCTACATCGTCTTGAAGCGTTTGAGAATTTTGGCTCCAATACTGTTGATAATTGTTCTTCATTTGTGTAGAAATGCATTGGAATGTGCAAAAGTGCAAAAGTGCAATTGGGATTTCGGGACTCACAAATATAATGTATATGGCAAGATCTGTATCAAGCTACATTAGGCTAAATCCTCAGTAATTCACTCTAGCAAACTCCAAATTTAGCTCTATTATAAACTCGACTTGAACATCTTTAGGGAATGTGACCTTAATTTTCACCAGATTTAGAGTGCAATTCTACTTTTCATTGTGATTTCATAAATCATAATTGTAGTTATTAGTGTACCAGTCATGATCATGCATAAAAGCTAGTGGAAACTATAGATGTTTGATCTCACATAGTTTTGGTAGAACGGCCTGTGGCTTGATTTCAACTTCTTAAGAGGTGTAGTCACCTGAATCCACCATATAACCAAATTAGACAAGCACTAGCCCAAACCAATTCTCAATGAAAATGATTGGCAGTGTTTATCTCAAAGATGAATATTGTCAGTCAGAACTATATTTTCTTGTGTCTCTATTTGTATCTATACCAAATTAGTTAGGCCTAAAACATTTTTTGGTAAAGAATTAGTTATTGTGGAACTGTTTGTTCCCATAATATCATGATCTTGATCAGTTAATAAATTGTTTCAGGTTGGTGGTACTGGAATGGTATTTGGATCACAAGCAGCAACAGGGTATGCTCAGGGATCACATCCTGGATGCCTGCATATGCAGATAGGTGGTGGTTTGAGAGAACAACATGATTCAGAGGTGTCTCAAGGGAATGAAACATCATTTGATAGGTTTGATTTTCTTCTAAAAAACTAAAGGTAGTGAGTGGGTTGATTACACAGTGTGCTTTATTAACAACCTAGTTAACTGTTGCCGGATGTTGTAGGTTTGTATTTCCATTGTTATAG

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