Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09096 LG2 15118234 15122263 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase WNK3 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, intracellular signal transduction, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Cellular Component   located in   nucleus, plasma membrane
Molecular Function   enables   protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, ATP binding, protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, ATP binding
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 15118265 3_prime_UTR_variant
G/T 15118421 3_prime_UTR_variant
A/T 15118677 missense_variant p.Leu594Gln
C/T 15119174 missense_variant p.Met428Ile
G/A 15119242 missense_variant p.Leu406Phe
G/T 15119767 synonymous_variant p.Pro283Pro
A/C 15120024 intron_variant
T/C 15120221 intron_variant
C/G 15120294 intron_variant
A/T 15120301 intron_variant
C/G 15120308 intron_variant
T/G 15120634 intron_variant
G/A 15120651 intron_variant
G/T 15120917 missense_variant p.Pro194Gln
G/T 15121314 intron_variant
C/T 15121316 intron_variant
C/A 15121604 intron_variant
G/A 15121987 5_prime_UTR_variant
G/A 15122044 5_prime_UTR_variant
C/G 15122108 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09096.1
MLPDSSEQDLDDPDMEFVEVDPSGRYGRYKEVLGKGAFKKVYRAFDELEGIEVAWNQIKLADVLRNSEDFERLYSEVHLLKTLKHKNIIKFYNSWIDSKSENINFITEIFTSGTLRQYRKKHKHVDLRAVKKWSKQILEGLHYLHSNNPPIIHRDLKCDNIFVNGNQGEVKIGDLGLAAILQQANSAHSVIGTPEFMAPELYEEEYNELVDIYAFGMCLLELVTVEYPYVECANAAQIYKKVTSGIKPASLAKVTDPEVKAFIEKCIAHVSERLSAKDLLMDPFLQSDYDNESVGRSSKAQTHHLANISHNQAIVVDTSAEASREFTVEGQRRDNNTIFLKLRIADSSGHIRNIHFPFDIEADTSTSVASEMVEELELTDQDVTTIARMIDSEIRFHIPSWNVSELPVDSYSQDSGYTSESRPEASPMKHDSITSPGSLALEILPSGRKFWSDSPKGVGGNSPYRAGSSNFCSAADANAADGSLAANGDISADDRVGDCSDEKVCDEIVDSPSSEKSIKSGATSEKSAVNVISGTVKDSEAEYINLIATKLENLLVKQREELDELKRKHKLAVSDLLKELSPEISQKVLNICNLQMPGGEVKGEARASFI*


CDS Sequence:
>Vu_09096.1
ATGCTGCCGGATTCCTCCGAGCAGGACCTCGACGATCCTGACATGGAATTCGTCGAGGTGGATCCCTCTGGTCGTTATGGTCGGTACAAGGAAGTTTTAGGGAAAGGGGCTTTCAAGAAAGTATATCGAGCGTTTGATGAATTGGAAGGTATTGAAGTGGCTTGGAATCAGATTAAGCTGGCGGATGTGTTACGTAACTCTGAAGATTTCGAGCGACTTTATTCGGAGGTTCATTTACTCAAGACTTTGAAGCATAAGAATATAATTAAGTTTTATAACTCATGGATTGACTCCAAGAGCGAGAACATCAACTTCATTACTGAAATTTTCACCTCAGGAACGTTGCGCCAATACCGGAAGAAACATAAGCATGTTGATTTGAGAGCTGTGAAGAAATGGTCTAAGCAGATTCTGGAAGGCCTTCACTATCTTCACAGTAATAATCCTCCGATCATTCATCGTGACCTGAAGTGTGATAACATTTTTGTCAATGGGAATCAAGGGGAGGTAAAAATTGGTGATTTAGGATTGGCGGCTATCCTCCAGCAGGCCAATTCAGCTCACAGTGTCATAGGAACTCCGGAGTTCATGGCCCCAGAACTTTACGAAGAGGAATACAACGAGCTTGTTGACATCTATGCTTTTGGTATGTGCTTGCTAGAGTTGGTAACAGTTGAGTACCCGTATGTTGAATGTGCCAATGCCGCTCAAATATACAAGAAAGTGACATCTGGAATAAAGCCAGCATCATTGGCAAAAGTGACAGATCCTGAAGTTAAAGCATTTATTGAAAAGTGTATTGCTCATGTATCTGAACGGTTGTCTGCGAAGGACCTCTTGATGGATCCCTTCCTTCAGTCAGATTATGATAATGAAAGTGTAGGCCGATCTTCAAAAGCTCAAACCCATCATTTAGCAAATATTTCTCATAATCAAGCTATTGTTGTGGATACTTCTGCTGAGGCAAGTAGGGAATTCACGGTGGAAGGTCAGAGGAGAGATAATAATACAATATTTTTAAAATTGAGAATTGCAGATTCCTCAGGTCATATTCGCAATATCCACTTTCCTTTTGATATCGAAGCAGACACTTCAACCTCTGTTGCCAGTGAAATGGTTGAGGAGTTGGAACTAACTGATCAAGATGTTACAACTATTGCTAGGATGATTGACTCTGAAATTCGGTTTCACATTCCTAGTTGGAACGTCAGTGAACTTCCTGTTGACAGTTATAGTCAAGATTCAGGCTATACCTCTGAAAGTAGGCCAGAGGCCTCTCCTATGAAACACGATTCCATTACTTCTCCTGGCAGTCTTGCATTAGAAATATTACCTTCAGGTCGAAAGTTCTGGTCTGACTCGCCAAAGGGAGTTGGTGGAAACTCTCCATATCGTGCTGGTTCTTCAAACTTTTGTTCTGCTGCAGATGCAAACGCTGCGGATGGTAGTCTGGCCGCGAATGGTGATATTTCAGCAGATGATCGTGTTGGTGATTGTAGTGATGAGAAGGTGTGTGATGAGATTGTTGATTCCCCTTCCAGTGAAAAAAGTATTAAATCAGGTGCAACCAGTGAAAAATCTGCTGTGAATGTAATATCTGGAACCGTGAAAGATTCAGAAGCAGAATACATCAATCTCATAGCAACAAAACTGGAGAATTTGTTGGTTAAACAAAGAGAGGAGTTAGATGAATTAAAGAGGAAGCACAAATTAGCTGTCTCAGATCTTTTGAAGGAACTTTCTCCAGAAATTAGCCAGAAGGTTCTAAATATATGCAACCTACAGATGCCTGGCGGTGAAGTGAAGGGAGAGGCTCGCGCTTCATTCATCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_09096::LG2:15122263-15124263(-)
CGATCTCCATCAACCAATAACTCATATTGATAAGAGTAATCAATAGCATCTGTACTAGAGCATGAGCCTTTTTTGCTCACATGATGTCATGTTGATGCTTCAATGGGTAATTACATATTCTTTTGGATCATGGACTAAAGTTTTTCTTCAAGTGCTCTTTGCATTTGTTATTGTTGTAATTATTCCATGAATTGTTGCTCCATAACTACCATGCTTTGGTTGATTCTTTCTTCCATTTGGAGCTCCATCTTTCACAACACCTTTTGACTCATGAATTCACTACTTGAAGATGTCCAAAACACAGTCCCTACACAAAAGCAATTGGTGAAAATGAAAGAAAACAATACCAAAGCATCCAAACAACATGCATTTGAGATAAATGAAAGAAAATTTATCTTTGGTGGTGGTCGCACGGGTCATCGCAGCTACTAGGAGGTTGAGAAGAGAGAGTAGAAAGGAATTGTGAAAAGGAAATGCTCTCACACTATTTTTTTTTTAAGTTCTTTATACAGTACATGATTATGGATTCTATGGGAGATCAACATCATATATCTTTAGAGATAAGATATTATGGAGACCGACATCTAATAGCTACATAAAAATAACTTTGTGTTGTATTAGTTTATTATTTTAAACATCATTAGACATCAACCACTCTACAATCTATAGTGTAATTAGATATCACATCACCTTTCCTATAATACAACATCTAAAGGATATAGGAAATGTCATTCTTAACTCGATTTTTTTAATGTTTAAAATCATTAGATATAGATTCTAGTAGAATCTGATGTCTAAAAATATATGACATCGACTATTATAAAATCCGACATCAAATTTTTTTATAATAGTACTTTTCAACTAATTTTTTAAATATTAAAAACAATATGATGTTTTCCAATTAACTGTTTTAGATGTTAAAAAATCATATAATATTAATCTCTCTCCTAAATGGGAGATCTTATAAACCCAGTATAATGTTGCAAATGTAATACAATCATTTTATACTTTATCTTTGGTTCTATTAGTTTTCGTCCAACAGCTTCAAAATTTTTCTATTTAGTTTGTATAATTTAAGAAACATTTGTTTTTGTCTCTAACTCAGTTACATTAAATGTTTTACTTATTTAATTAATAATTACAAGTTATTTATATTGCAATTTTAATAGTTAACATTCTATTATAACACGAGTTTTTAAAGTATCCACTTTAATAATGTTTAGACAGATACTTTAAGAAAAAAAAAAAATTCTAACCTAAACTAAAGATTAATTTTGCGTTTGAAGGACGGGTACAAATTTAGCTCAAACTGAACATATTTTCTATTTTTAAATTGAGTTTGATGAAGAAAATGTCAAAACCTTAAAATAAATCATGTACTTGGCTAAATTTTCTCAACTAAAGACAAAAAACAATCTTGTATTTTTTTTAAGAAATAAATAAGAGTATAATTATTAATTAGCATTAATTATTTTAATTTTTCTAATAAGAACTATAAAATAACTTAATTACAGCATTGAATGTTTTTAATTAAACTTTTATTATTTTTTTTACAAGAACTCTGTTTATATTTTTCAATTTTGAAATTGTATATTTCTTTGTATCTATGGTTTTGAAATTAGTATAAAACAATATTGGAATAATAAAAATCATGTTTTGTGTTATATTAATAAAAAATCTCATATTTTTAAAGGCAAAGTAATAAGATCATGAAAATATATAATTATCATATCACCTAATCAATTAAAAATATTAAATAATAAAAACTCAATTAGAATATATAAATTTTTAGATATCCAATCTAAAAAAAATCATTAATAAAAAACTAAACTAAAAATATTCATAAATTTACAACTTAATTAATTCTTAGAAAATTTAAATTTAATATTGTATTACTTGTTTATGAAGTAAACGAGCAATAAAAAAACAAAAATAAGAGAGTAGTAGCCGATGAACTTGCCTTGAACGCTATAAATGAGAGTATTTGACTTGGCCAGCAT


Gene Sequence:
>Vu_09096(-)
AAGATATTAACAGCATGTTAGTTGCGTCTCCTTGAACTTACTCTGCACCTGCACGCACCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCGAGTCTATAACGGAAACGGAGCGTTTCAATCGAAAGCATCGTACCATTATATGTGCTGTTTTCACTCTGCCAATAACGAGAACCAGAACCAGAACCAGAGCTAGCATTGTTTCCTCGCGTTCTCCGAAATTCCAATAACAACACCCATAATTCCCGTTCCTCTTCCCTTCCCCCATTTTCTTCCCAATTCAGCACTTCCTTCTACGTAGCTAGGGTTTCTGCCAATGCTGCCGGATTCCTCCGAGCAGGACCTCGACGATCCTGACATGGAATTCGTCGAGGTGGATCCCTCTGGTCGTTATGGTCGGGTCAGTTTCACATCTTCCTCAATGCGGATCCTTAATGCCTTCCGTTATACCCCTTCGTTTACCTTGTTAATTCTATTAATAATCGATTGATTACTTTTGCGACTTATTTTTAAAACGCTTCGCTTGATCTGATTTGGTTTGCTGGATTATTCTGCAGTACAAGGAAGTTTTAGGGAAAGGGGCTTTCAAGAAAGTGTATCCTTTTTCGGTTTTTTGTATTTTTCCACGCTTGATTAAAATAACCAGTAACCAGTCTGCATGGATTCGTTTTGGGGGTGGGAGGATTTTTGTTTGGCCTTAACAGTGAAATGGAAATGTAGATATCGAGCGTTTGATGAATTGGAAGGTATTGAAGTGGCTTGGAATCAGATTAAGCTGGCGGATGTGTTACGTAACTCTGAAGATTTCGAGCGACTTTATTCGGAGGTTCATTTACTCAAGACTTTGAAGCATAAGAATATAATTAAGTTTTATAACTCATGGATTGACTCCAAGAGCGAGAACATCAACTTCATTACTGAAATTTTCACCTCAGGAACGTTGCGCCAGTGAGTCTCTTTCGGCTTCTGTTGTGCTTTTATTTTGTAACGTTGGTGAGCTTTTTGTGTTTATGTTTTACTTTCTTAATTTAGATACCGGAAGAAACATAAGCATGTTGATTTGAGAGCTGTGAAGAAATGGTCTAAGCAGATTCTGGAAGGCCTTCACTATCTTCACAGTAATAATCCTCCGATCATTCATCGTGACCTGAAGTGTGATAACATTTTTGTCAATGGGAATCAAGGGGAGGTAAAAATTGGTGATTTAGGATTGGCGGCTATCCTCCAGCAGGCCAATTCAGCTCACAGTGTCATAGGTAACATTTCCTGTGAAATTGTTATACTCCTTATTTTTTTTCTTTTGTGGACTGCTGCGGGAAACTGAAAGCGTCTGTAATTCTCATTGTGAGCCTAGGAACTCCGGAGTTCATGGCCCCAGAACTTTACGAAGAGGAATACAACGAGCTTGTTGACATCTATGCTTTTGGTATGTGCTTGCTAGAGTTGGTAACAGTTGAGTACCCGTATGTTGAATGTGCCAATGCCGCTCAAATATACAAGAAAGTGACATCTGTAAGTTAAGCTCTTTTATCAAAATGTTGCCAACTATTTTACCTTACGTGTGATGCAACGCTGATATTAGAATTGCTCATTTCATCTCAATGGAGATGGATATAGTATTTCATTCCTCAATGAAAGCTTTTAAAAAATCCTAGAATATTTGATATGGTATTTTTTCTTCTTCTCCAGTTTTTGAACCTGAATTTTAATTGGCTTCTAAAGAATGAGAAATGATATTAGCACATTCTTTCGAACACACTCTATGCTATTAACTGGAATTTATTACAAATGACATAATTCCATGGGTCTCACTTTTTACTTAATGATTCTTTCTCATAATTTTATAATCTCCTATACAATTTAACCAATAGCAGAGTGTGGGTGCTAATACTCCTCTTTTGGGAATAATGGTTAACACCTCTTCGATAAGAATCATCTAAGGTTTTAGCTTATGTAGGAAATTGCTAAAGATCTAATTTAGATGTTTGAAGAGGACCACAGATGTGGTTGGACATGCTTTTAAGGTTTAAAATGGTCATGGAAATTTTTTAACTCAACTTGAAATATATTTTTCTGCTCCATAGTCTTATTCATATACTCTGCAAAGAATCAAATAACTGTCCAGTAGTCAACAGTTGACGGGTACTCATGATATTTTAGGGGCTTGTTTGCTTCAAGGTAACATTTTTCATTGCTATTTTCCGTTAAGAACTATAAAAATGTTAAATAGTTTCACCTTATCTTGCCAAAATCTTTGAAAACAGGAAACAAACCAGAAAAAAAAAATGTTTTTCAATTATTGGTGAAAACGGTAACGGAAACCATTTTCTTAAACCGGCCCTTATTCTCACTTATCATCTTTATGTTTATTATTGTTGTTTCCATTCCCGGTAGGGAATAAAGCCAGCATCATTGGCAAAAGTGACAGATCCTGAAGTTAAAGCATTTATTGAAAAGTGTATTGCTCATGTATCTGAACGGTTGTCTGCGAAGGACCTCTTGATGGATCCCTTCCTTCAGTCAGATTATGATAATGAAAGTGTAGGCCGATCTTCAAAAGCTCAAACCCATCATTTAGGTAATTATATCCCTTGCGTCTAATTTCCCAATTAACTATATTATTTTGTTTACCATCTGATGCATCGCAAATGCAGCAAATATTTCTCATAATCAAGCTATTGTTGTGGATACTTCTGCTGAGGCAAGTAGGGAATTCACGGTGGAAGGTCAGAGGAGAGATAATAATACAATATTTTTAAAATTGAGAATTGCAGATTCCTCAGGTCTTCTCTTAATTTCTTATCTTATATTTATCCAAAGTTTCTATTTTCTTTTTCATTGGTTCTGATGTTCATTTCCATGTAGGTCATATTCGCAATATCCACTTTCCTTTTGATATCGAAGCAGACACTTCAACCTCTGTTGCCAGTGAAATGGTTGAGGAGTTGGAACTAACTGATCAAGATGTTACAACTATTGCTAGGATGATTGACTCTGAAATTCGGTTTCACATTCCTAGTTGGAACGTCAGTGAACTTCCTGTTGACAGTTATAGTCAAGATTCAGGCTATACCTCTGAAAGTAGGCCAGAGGCCTCTCCTATGAAACACGATTCCATTACTTCTCCTGGCAGTCTTGCATTAGAAATATTACCTTCAGGTCGAAAGTTCTGGTCTGACTCGCCAAAGGGAGTTGGTGGAAACTCTCCATATCGTGCTGGTTCTTCAAACTTTTGTTCTGCTGCAGATGCAAACGCTGCGGATGGTAGTCTGGCCGCGAATGGTGATATTTCAGCAGATGATCGTGTTGGTGATTGTAGTGATGAGAAGGTGTGTGATGAGATTGTTGATTCCCCTTCCAGTGAAAAAAGTATTAAATCAGGTGCAACCAGTGAAAAATCTGCTGTGAATGTAATATCTGGAACCGTGAAAGATTCAGAAGCAGAATACATCAATCTCATAGCAACAAAACTGGAGAATTTGTTGGTTAAACAAAGAGAGGAGTTAGATGAATTAAAGAGGAAGCACAAATTAGCTGTCTCAGATCTTTTGAAGGAACTTTCTCCAGAAATTAGCCAGAAGGTTCTAAATATATGCAACCTACAGATGCCTGGCGGTGAAGTGAAGGGAGAGGCTCGCGCTTCATTCATCTAAATACCCCGTTTGTAAAGTTTATGGTAGTCGCGGGTTCAGAATCTAGAAAAAGCCAAAGCTCAATTTAGGATTGAAATTAAGTAGCGATCATGTTTGTTGCTTAGAACCTGCATACTGTTAATATTTTGGTTTTCATAATTGATAGAGGATAATTTTTTAATGCTTTTAGTGTCCTTGGTATACAATGTGAAGAGGAAATGCAGCTGGAGTTGGTTTATAACTAGGGAGTGATCTGTGCAGTCCTTGGGGAATGGCTCAACGTGGTCTCCAACTTGGAGGACTCAATGCTATTGCTGCATTTACCCAACAAACATGGGTTAAAGTAAGAAATTAGTTTCTATAGGTCATGAAACAGGATTATATCAATTTAATATCTCATCTGTAAATAGTC