Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_09183 LG2 16451910 16454760 PREDICTED: squamosa promoter-binding-like protein 13A isoform X2
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 16452419 missense_variant p.Arg212Met
T/C 16453215 intron_variant
C/T 16453562 intron_variant
A/T 16453572 intron_variant
A/G 16453953 intron_variant
G/A 16454245 intron_variant
C/T 16454573 missense_variant p.Arg63Lys
G/T 16454738 missense_variant p.Pro8His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_09183.1
MDWNLKAPSWDLVDVDKASIPNIDSMEEHNRFGVYRMEGEFSVDLKLGHVGNSGTESALSKFRDVAAGAGVSKVASSPSGSSKRARAINSTTLTVSCLVDGCNSDLSNCRDYHRRHKVCELHSKSPEVTIGGLKQRFCQQCSRFHSLEQFDERKRSCRKRLDGHNRRRRKPQPEPHTRPGSFLSNYQGTQLLPFSNPHVYPSTAMMSTPWSGGLVTSSADARLHNQHHHQELFLGSSHKEGKQVAFLHGNHSNQSLPFPSPSVCHTLLRSSPLSESCGARSKMFCESLTTTNSVHDTPCALSLLSSSQTHTPGNGLNQMVQAPSMSLMQPLGLSLQDNTNLESVERVLVPNGSDHCSSMYSLGSDGSHCNEAPQLFPFQWE*


CDS Sequence:
>Vu_09183.1
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Promoter Sequence:
>Vu_09183::LG2:16454760-16456760(-)
ATTCAACGATTAGTCATATTCCATTATTTCCATCTACACTTGTTTTGTTAATTTCAATTGCAATCTTAATTGTCGCCAGAAAGCGACATCTTACACACTTGTTGAAATGATGTGAATGGTTTAAAGATTTAAGAAGGAAAAAGAAACGTTTGAATGATAATAAACGATTACTTTTGAGCAGAACGATATAAATAATTAAGTGCAGGAAACACAGCACAGAGAGATATGTGATGGATGCAGAAACGCAATCTGAGAGCAGTGATGTAACGTGACGAGAAGGTTATTAAAGAACAAAATAAAGATTTGGTTGGAAGGATATGTGTAGAGAAAAATGGGAGTTGTGTAAAATGAAAAGTTTGACTGAAAAATAAGGATGTGAATGTAGTGTATCTGGAAAGATGGATGGTGTGAGGATGGTAATAAATGCTACAGTCCCCACAGCAGAATTGACATGAAGATGGCAGAAAGGGTAAAAATGATCACATGCTGGAGGGGTTATGGCATATGAAGGTTTGATAGGGTGGCATGCTTGTTGTGGCCTAAATCAGCAAACTATCAAAACCTGGAGCCCTCAAAATTAAAAGTGGACGTCTACTACATGGACCCACCACACCACTCATCATTACCCTTCTCCCAACAAACTCCACTCCACCACTTTTACCACCATTCACAACCTTTCAAATTTTACTTCACTTTTCAATTAGATTGATTAGCTTCATCATCACAAATAATATAGTTAATCAGTTCCCTTTTGAGGTATTAGAGAAAGAAGAGATTTGAAGTGAATAATGAAGGATTAAGGTAATTAATGATGTTGAGATATTATTATTAGCTTAGAAGAGAGGAAAGAGAGGCGGGGGAAAGACATGCCATGAAATGTGAAACATAATGCCACATGCCTTGTCTTGAGCATCCATTCTTTGTACTTCTTTTTCCTGACTCATAAAAGTTGAAAGCAACCAACAGGCTGTCCTTATTATCCATCTTCCTTTCTTTCTCTCTCAACCTACTACACTCACTGGAGGAGCTGAGGAAGCCCCTATATTTGGAAAAAATAAATATTAAAATATTTGGTTCAACTTCTAAGACGGAGCATATCATCCAGACCTTTTTGCCTCTCTCTCTCCTCCTTCTTCAGTATCAACTTTCAATACATTATCCACTCCACTGTGTGCACAAATCCATGACTTCACATCCTTTAACTCTCTAACAGGTATGGTTTTTGGGATTCCCTCTCACCTAACTCACAAAAACCTCTCCCTCTTTCATCCATAAGATAATCAAAATAACCTTTTTTTTTTATTCACTCACTCCATTGGCTACTCATGGAATCCATGTCAGGCAACCACTGGTCGGTGAAGGAAGAACTCAGCATCCTATTGCTGCTCTTGTCTGCAACTGCAAGTACTCTCTCCCTTCCTTCTTTCAATCACTGTTTATTTATTATTTATATTTATTTCCTTTCTACTTTTATCTTTCTAGTTGCTTCACTGTGCCTTCTTTGGTAACCTTCTCAGTTTATGCTTCCATTTTCCTTGGAACTCTTCCTACTACTTCATTAACTCTAGGCGGTCATGTCTTTATTTACTTATTTAATTCTTCTTAAAATTTAACCCCTTCTTTCTTCCTAGTACGGACAAAAACTTGTCCAATGTGTTTGTCTTATAATTGCCTGTTTGTGTCTGTCTAGTTTTTCTTGATTTCCTCCTCCCCCTCTATCATCATCATCTATCACTTTCCATTCTTCTTCAATTGGACTTTTACCCATGCCCTTTTCACTTGGCTTCTTAATTTAAGTTTGCCTCTCCTTACTGTCTCACTATTTATGCAATACAACCTCATGCCTTTCTCACTGCATAATTTTCTGTTGCTCCTCATGCAATTCTGAACCTATGGTACATAGCACATATACAAGGTAACCATACAAAGGGGGACTTTGGAGAAGTACAAGGGTGGGGAGGGAGGGGGGTTAGAGTTTTATTTTTCTCTATTATTTTGTT


Gene Sequence:
>Vu_09183(-)
ATGGACTGGAATTTGAAAGCACCTTCTTGGGATTTGGTGGATGTGGATAAGGCTTCCATACCCAACATAGACTCAATGGAGGAGCATAACAGATTTGGAGTTTATAGAATGGAGGGGGAGTTTTCTGTGGACTTGAAGCTTGGTCATGTGGGGAATTCTGGCACTGAATCAGCATTATCCAAGTTCAGAGATGTTGCTGCTGGTGCTGGAGTCTCCAAAGTGGCTTCCTCACCTTCAGGGTCTTCTAAGAGAGCTAGAGCCATTAACAGCACAACCCTGACTGTGTCATGCCTTGTGGACGGGTGCAATTCTGATCTTAGCAATTGTAGAGATTATCATAGGCGACACAAGGTGTGTGAGCTCCATTCCAAGTCCCCAGAGGTCACAATCGGTGGCCTCAAGCAAAGGTTCTGCCAACAATGTAGCAGGTTTGTATCATATCATACCATATATACTTAAGCTTTTGTTCTTTTGCTTGCAATTGAGTTCTAGATTGCTTGTAAGCTGTGGTTTGTCCTCTTAATTATTGCTTTTTTGTGTTTTTGCCCCCCTTTTCTTTTCATTGTACCTCATCCACATTTAATTTGTGTCGTTTGCATTGCATCCGTATCCATTATTCATGTTAGCTTCACAAGTACTCATACGCCACCAAATTACTTTATTTTGCTTTCCCCTACCATTAGCATCTTCACTTAGCGTTCTTTAGAAGAAGCAGGTTTTTATACTCTTAGTATTTACTTCCTCACCATTCATTTTCTAAAGATAGAAAATTTTCTTTCTTTTTACTTTTAAAATAATTTAAAACCATATTAAATCTAGGAAAGAGAATGTACTGCGAGAGTATTAGAAAAAGATTCGCTCCATACTGATTTCTTAAACCAAATACTAGTTCTTAACCCTGGTGTTTGTCGTTATATGTTTATACTCTTTTTGTGTGGCACTTTTCAAAAACCAAATACCTCTGCTATATACATGGAGAATTAAGCTGAAAATATACCGGTGCACGGAACACAATTAATCACACAAGTTTACACATAATATGAGAGAATGACTTGCCTGATTTGTTCTGTTAATATACCCTGTGTATGGGTATGTTGCTTGTAGTAGTTGTGGTAAATCCGTGGTAAATATTTTTCACCGCTTAGTTTGTTGTCCATTTGATTTTATGTTCTTGATTCCATTTCCATGTCATATGGGCGTGTCTCAGTTTGCTGAAATTCTGAAACTTGTCTTTTTTTGGAAGGTTCCATTCGCTGGAGCAATTTGATGAGAGAAAAAGAAGCTGCAGAAAGCGTTTAGATGGACACAACAGACGGAGAAGAAAGCCTCAGCCAGAACCTCACACCCGACCTGGTAGTTTTTTATCGAATTACCAAGGTAAGCTTTGTGGTTGTAGTTGTTGTTCTAATACCACATTATCTGAATGGACCCATGTGCATATATGCGTGGATTTCATGCAGGTATTAGCTAGAGATACACATCCACATAGGTACACGAGTCTCAAAAGAGTAAGAAGTTTCATGTGGAAACAATGCACTTAGCTAAATGAGTGCGCTGCCCACATACCTGATATGGCTGATTTGGTCCATTTATGTCCACGCTCATGACAATCTAGTGGCCACTAGTTAAATATGTCACTACATACACACCATAAAAAAGGAAAAACATTTTCAGTAAACTCCCATGTGCTTCAGAGTCTATGCATCAATCATTCTGATCTTTGACTCCATATAACTCTTATTTTTCTTCTTGGTTTTATGAAAAATTACCCATTTTTATTCGTTTCTCTATCATTTTACTTCATAGGGGACTGAAATGACGTTTTGCAAGTCAAAACTTTATACAATAATACTTTATGCTTACCATTTTAAGAGCCTGTATTGGACTTTGTTTGGAAGTTGCTTCTTTCGAGAGATTGATCTAAACTGTCATCCACAAGAAATTATCGCTGAAACCATAAGACCATATCTCTGATGCTTATCTTGTGTCTTGCTTTGCAAAATTTGTGGTAGGTACAGGATTATACAAGAAAATAATTTGTCCTGGATAAAACTACAGTTGAAAAACCTTTTGTTTACCTTCTTCCTAATTTCGAATACCATACAAATTCTTACTCATGTACATCATACCAAACTTTAGATTACTGATAAATGTGGTTAACGAAGAAATATAATAATATATTATGATCGAGCATCTACATTTTTGTTGACATAGTACTTACTTTGTTGAGATAAAGTATAAGAGTTGTGAAATTCAAGATTTTTCAGGTACTCAGTTGCTACCATTCTCAAATCCACACGTGTATCCTTCCACTGCCATGATGAGCACCCCTTGGAGTGGAGGGCTTGTGACTTCCTCTGCAGATGCGAGGTTGCACAACCAGCACCACCATCAAGAGCTTTTTCTAGGATCTTCTCACAAAGAAGGGAAGCAAGTGGCATTCCTACACGGTAACCATAGCAACCAAAGCCTTCCCTTTCCGTCTCCTTCTGTGTGCCACACGCTTCTCAGGAGCAGCCCTTTATCAGAAAGTTGTGGAGCGAGAAGCAAAATGTTCTGTGAAAGCTTAACGACAACAAATTCGGTGCATGACACTCCTTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCATCATCACAGACGCACACACCTGGGAATGGTTTGAATCAAATGGTGCAGGCACCGTCGATGTCCCTGATGCAGCCCTTAGGCCTGAGTCTGCAGGATAACACCAACTTAGAGTCTGTGGAGCGAGTTTTGGTTCCCAATGGCAGTGACCACTGTTCCTCCATGTATAGCTTGGGTTCTGATGGATCCCACTGCAATGAAGCCCCTCAACTGTTTCCCTTTCAATGGGAATAG