Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_10380 LG2 44347880 44350280 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase Aurora-2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   histone phosphorylation, regulation of cytokinesis, regulation of cytokinesis, mitotic spindle organization, histone phosphorylation, mitotic spindle organization, histone phosphorylation, histone phosphorylation, mitotic spindle organization, histone phosphorylation, histone phosphorylation, histone phosphorylation, histone phosphorylation
Cellular Component   is active in   chromosome passenger complex, spindle microtubule, spindle pole centrosome, spindle midzone, spindle microtubule, spindle pole centrosome, spindle midzone
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleolus, microtubule, spindle, spindle, cell plate
Molecular Function   enables   histone serine kinase activity, histone serine kinase activity, histone kinase activity (H3-S10 specific), histone kinase activity (H3-S10 specific), protein serine/threonine kinase activity, histone kinase activity (H3-S10 specific), protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, histone serine kinase activity
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 44348243 downstream_gene_variant
T/C 44349082 downstream_gene_variant
A/G 44349145 downstream_gene_variant
A/T 44349257 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/T 44349319 missense_variant p.Asp155Tyr
T/A 44349501 missense_variant p.Met187Lys
T/G 44349505 missense_variant p.Cys188Trp
A/G 44349630 downstream_gene_variant
T/C 44349637 splice_region_variant&intron_variant
C/T 44349822 downstream_gene_variant
C/A 44349874 downstream_gene_variant
A/G 44349932 downstream_gene_variant
C/A 44349994 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_10380.1
MAIATETQPQQHKDSYELSGSAAERRWTLNDFEVGKPLGRGKFGHVYLAREKSSNHIVALKVLFKSQLQQSQVVHQLRREVEIQSHLRHPHILRLYGYFYDQKRVYLILEYAPKGELYKELQKCKYFSERRAATYVASLARALIYCHGKHVIHRDIKPENLLVGAQGELKIADFGWSVHTFNRRRTMCGTLDYLPPEMVESVEHDASVDIWSLGVLCYEFLYGVPPFEAKEHSDTYRRIVHVDLKFPPKPIVSSGAKDLISQMLVKDSSQRLPLHKLLDHPWIVQNAEPSGVYRG*


CDS Sequence:
>Vu_10380.1
ATGGCCATCGCAACAGAGACTCAGCCTCAACAACACAAGGATTCTTACGAGTTGTCTGGTTCAGCTGCGGAGAGGAGGTGGACGCTGAACGATTTCGAGGTTGGAAAGCCTCTTGGAAGGGGGAAATTCGGCCACGTCTATTTGGCAAGAGAGAAGAGTAGTAATCACATTGTTGCTTTGAAAGTACTCTTTAAGAGCCAATTGCAGCAATCCCAAGTTGTGCATCAACTTCGGCGAGAAGTTGAGATTCAAAGTCATCTCCGACATCCCCACATCTTGCGACTCTATGGGTACTTTTATGACCAGAAAAGAGTGTATTTGATTTTAGAGTATGCACCCAAAGGTGAACTTTACAAGGAATTGCAAAAGTGCAAGTATTTCAGTGAAAGGCGTGCAGCTACTTATGTTGCGTCATTGGCTCGGGCCCTAATATATTGCCATGGAAAACATGTAATCCATAGGGATATTAAACCAGAAAACCTTCTTGTTGGTGCACAGGGTGAGTTAAAAATAGCGGACTTTGGGTGGTCAGTGCACACATTTAATCGCAGGCGGACAATGTGTGGCACACTGGATTACCTTCCTCCCGAGATGGTGGAGAGTGTAGAACATGATGCGAGTGTGGATATATGGAGCCTTGGTGTGCTGTGTTATGAGTTTCTTTATGGGGTCCCTCCCTTTGAGGCTAAAGAACACTCGGATACTTACAGGAGGATAGTACATGTGGATCTTAAGTTCCCTCCTAAACCAATTGTATCCTCTGGTGCAAAGGATCTTATCAGTCAGATGCTTGTCAAGGATTCATCGCAACGGTTACCACTGCACAAGCTCCTTGATCACCCTTGGATTGTTCAGAATGCAGAGCCCTCTGGTGTATATAGGGGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_10380::LG2:44345880-44347880(+)
AAAAATAGTTATTAAAAAATAAATTAAAATCTGTTTTATATACTTAATAATCTTACATTACTTATTATTATGCATTATAATAATTAATTTTTTCTAATAAAAATATATGTTTAATAGTAGGAAAGCATATCAATACACTTGTCTATCATAAGGAGTATATAGTCAATTTTCACATTCTCTCATTAACCATTATAAATATATTTTTTACAAATTCTTGATTTGTTTGCTTCTAATTATGTATTTGATATTGAGAGGGATATATAGGGAAATGAGGTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTAAATTATTGGTCGTCGTCCATCTTTCAAAGTAAGGTACAATTTGGTCCTCATTCTTATCGAAACGTTCGTTTTAGTCCTCGGAATTTTGGTTTTAGTCCTCATTTGTTGCTAAATGAGGACCAAATTTTTAAACATTTTAGTTTTCGAGGACTAAAATGAACGTTTTTGAAAAGAAGGAAGACCAAATTGTATCTTACTTTGAAACAGGGACGGACGAAAACCAAAAACGGCCAATAGTTTAGGGACTAAAAACATATTTAACCCTAATAATAATAATAATAATAATAATATTGTTGTTATCCTTAGAGGAAAGAATAATTTTCATAAATGCACTCAGTCCATTCAAATCTTCTCGTTATGAAACATTTTCTCCTTAAATAAATAGGAATAAACATATGGATCATTCCTTCCTCCATCCTTACCAAAATTATTTTCCGAAAGCAAACAGTTTTTCATCTGTGAAACAGTCTTATTTTTATTAGTTTTTCTTCGAAATTTAAAGTTTTTTCATTCAAAATTCAAACTTTTCTGATCAGTAGTCAACAACTCAACTCTTAAAAGTCTTATTTGTTTTAACCAAATTCATACAAAACAAGATTATATTTGAATTGATGAAAAAAAATTAATGTAAAATCAATTTAAAGTTGTTTTTCCCATTAAAAAAATAAAAATAAAAACAATATATTGTCAAATAATTTGTAACTATGGTACATATGTCATTATTTTTTTTATTGATATAATTTATTTTATTAGTTTACCTTTTAAATTTTATAATTATTTTTAAATTGAATTAATTATTTATAATAAAAAAATTTATTTTTTTAAGAAATTTACAAATATATTTTATTAAAATATAATAATATTGTTTATTTTAATAATTATGATAAAAATTAACTTTTCTATTTTTTATTATCATAATAAAAAAGTTGATACACATACATCTAAACACATATGTTTCACTATTACATATAACAAAATTATTTATCGTAACTTGAATATTTATCACATATCATTCTTTCATATCATCATCAATTTGTTTAAAATTATTATTTAACATATTTCTTAATAAATAAAATAACTTTTTTTCCTTAGTTTTCTTATTCTAAAAACAAGTAATTTTTTTATGCTTTAAGAAGAAAATTCCATATATTTCTTAAATGAGTGATTTTTTTAAAATGTTTTATTATTAAATGTTACACATTGGAACACATGTAAAGCAAAAAATAAAAAATAAAGGGTGAGTCGACTACTGATTTTAAAACAATCTTATAATTAAAAAAGTTATAACAAATTTCATAAAAACGTTATTTTGTTCAATTATTTAAAAGAACAGTAATCGTTTATTTATTTATTTACGAAAAATATTTGTTTATTTTTTTCTGGACATATAATATAACGTGCTAGAAAGGACGCTCCTCTTCCTGTAGAAAAAAAAAAGACAAAAAGGAAAGGAGGTATTTGAAAAGCTTAGAAAGCGGGATTGGAACACGTGGCTTGCTATCCGTTATTCGACCGTTGCAGGAAGAAAGCTGTCGTTGTGCTGTGTGTTAATGCAAACACAACCCAACACAACACAGCACAGCCTCTGTGTCCATTAAAATCACTCTCTCAAATTCTCTCTCTCTCCATCATTCTTGCAATTGCGCTTCCATAATCA


Gene Sequence:
>Vu_10380(+)
ATGGCCATCGCAACAGAGACTCAGCCTCAACAACACAAGGTCTCTGTTCTCTTCTCTTCTCTCTCTCACGCTCACAAATCTAGGGTTTTCGTTCCTCCAAATCTAACCATTTTTTTAATTATTTTGCTTTGCGGAATTAATCGGCAACAAGGTTTCGTCGCAGTTCTGTTCTGATTCTGTGGTGTTTCGTTTTGCCAGGATTCTTACGAGTTGTCTGGTTCAGCTGCGGAGAGGAGGTGGACGCTGAACGATTTCGAGGTTGGAAAGCCTCTTGGAAGGGGGAAATTCGGCCACGTCTATTTGGCAAGAGAGAAGAGTGTGAGTTTTATTTTGTTAGGGTTTCTGCTGTTGATATTGTATTCTTCTGATCAGGGATGATGACTCGTGATTATGCTAATTTCTATGGATTATTTCATTGGTTTTTCGATTTATTTGGGGATAATTGTGCGCCACTGCTTTGTCACGAGTTCTACGGTGTTTTCGTTTTTTCTTTTGTTCTCTTAATTTCGAATTGAGGGTTTGAACGATTAGCTGTGTAGAAGTGTAGCTACTCAAGTTTTTACAGTTGTTGGATTGTGACTACTTGTTGTTATAGTCTTTTGATGAGATGGGATGCAATATAAAGCATCTAAAATGTTTCACGTAACACTGTTAACAGGTTTTTGGAATTGTTGGTTTAAGATCAGAGCTGTTATTGACCATTGTATTTGTATGAGGACTGTGATTTATTGTGCTCTAATGTGTACAGAATGTTTCTCTTTACTTTTTTGTTTTCGGAAGTTAATTGTAGTGTGGGACTGATATGTGGTTTTGGTACAGAGTAATCACATTGTTGCTTTGAAAGTACTCTTTAAGAGCCAATTGCAGCAATCCCAAGTTGTGCATCAACTTCGGCGAGAAGTTGAGATTCAAAGTCATCTCCGACATCCCCACATCTTGCGACTCTATGGGTACTTTTATGACCAGGTACGTTTGTTTTTTACTTTTTATGCTGATATTGTCGAAGAAGTTTAAAATGCTCTGCTATTAACATTTTATGTGGAATAACATTACTGCAGAAAAGAGTGTATTTGATTTTAGAGTATGCACCCAAAGGTGAACTTTACAAGGAATTGCAAAAGTGCAAGTATTTCAGTGAAAGGCGTGCAGCTACTGTAAGTATAGCAGCTATTGTTTTTTCCTCTCCCCTCGTGTACTGTTGTTTGTGTGATGCAAAAGATTGACTCAAGTGTTTTCTTCCACATTACTGTCTTAATGTATTAAGAAGCAAGTAAATACTGGAACATTTGACATAATATTTCACTTGGAGTGCGGTTGCTTAGATACGTGGTTGGCATTCTTCTGATATGGACGAAATGTTTATTTGTGTTTGAGAGCAGTATGTTGCGTCATTGGCTCGGGCCCTAATATATTGCCATGGAAAACATGTAATCCATAGGGATATTAAACCAGAAAACCTTCTTGTTGGTGCACAGGTGATCGTCTAAACTCAGGCTGCTGTTTCTTATGTGGCTCTTTTTGTTGTCCTCGTTATTTAAGTTAACATTTTTTTAATCTCAGGGTGAGTTAAAAATAGCGGACTTTGGGTGGTCAGTGCACACATTTAATCGCAGGCGGACAATGTGTGGCACACTGGATTACCTTCCTCCCGAGATGGGTATGCTTATGCCACATGAACACTGGACAAATATTTTTTCTGTTACTCTTTTCATAAATGGTGCTGCACTATATTTATTGTTTAATACTTTATATTTCAATAGTGGAGAGTGTAGAACATGATGCGAGTGTGGATATATGGAGCCTTGGTGTGCTGTGTTATGAGTTTCTTTATGGGGTCCCTCCCTTTGAGGCTAAAGAACACTCGGATACTTACAGGAGGTAAAGCACCAATCAGTTGAATATAATTTAGCATCAGCATGATAGACTGTTTTTTCTATTGTCCCAACTACTTTTTTATCATTATTCCCGCTGAGGGGACTAAGATTTAACCAACTCGGGTGATTTTGCTACTGAATCTACCGAGTTTCATGCTGCTGTCCACTTTGGTCTCTTATTAGAAACTGCTTTGTAAACATTAAATCAATTTAAATTGCAGTGCAAGTGGATCTTATGTTCCCTTTTGAAAACCTTATTTACAGGATAGTACATGTGGATCTTAAGTTCCCTCCTAAACCAATTGTATCCTCTGGTGCAAAGGATCTTATCAGTCAGGTTTGTTATCAACTCTCAATGTTTATTATATATTTGTTCAAACGTTTTTGCCTTAGTAACTCTTTCCTCTATTTTTTTTTATTGACAGATGCTTGTCAAGGATTCATCGCAACGGTTACCACTGCACAAGCTCCTTGATCACCCTTGGATTGTTCAGAATGCAGAGCCCTCTGGTGTATATAGGGGCTAG