Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_11907 LG3 7405974 7410906 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase D6PKL1-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane, nucleus, cytoplasm
Cellular Component   located in   cytoplasm, cytoplasm, nucleus, cytoplasm, cytoplasm, cytoplasm
Molecular Function   enables   protein kinase binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase binding, protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, protein kinase binding, protein kinase activity, protein kinase activity, protein kinase binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 7406209 missense_variant p.Arg846Met
C/T 7406356 missense_variant p.Arg797Gln
G/A 7406595 synonymous_variant p.Phe717Phe
A/G 7406973 synonymous_variant p.Asp591Asp
G/A 7407039 synonymous_variant p.Tyr569Tyr
C/T 7407225 intron_variant
A/T 7407260 intron_variant
T/C 7407416 intron_variant
T/C 7407436 intron_variant
C/A 7407573 intron_variant
T/C 7407587 intron_variant
C/T 7407700 synonymous_variant p.Ser544Ser
T/A 7408068 missense_variant p.Met422Leu
G/A 7408229 missense_variant p.Thr368Ile
G/T 7408325 missense_variant p.Ser336Tyr
T/A 7408516 synonymous_variant p.Gly272Gly
A/C 7409362 5_prime_UTR_variant
C/A 7409790 intron_variant
A/T 7409843 intron_variant
G/T 7410229 intron_variant
C/A 7410307 intron_variant
A/T 7410357 splice_donor_variant&intron_variant
A/G 7410447 5_prime_UTR_variant
A/T 7410512 5_prime_UTR_variant
T/C 7410755 5_prime_UTR_variant
T/C 7410756 5_prime_UTR_variant
C/T 7410779 5_prime_UTR_variant
A/C 7410807 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 7410840 5_prime_UTR_variant
T/A 7410841 5_prime_UTR_variant
T/C 7410865 5_prime_UTR_variant
T/C 7410867 5_prime_UTR_variant
A/G 7410874 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_11907.1
MDTCGSTCEIVESREEIISEIKMVDKPESSYGHKSGKRYSIENDINQLFQAIDIKSSSRSHSSSRLQKNALKRPIKVTSSQASGIGISEPVSLKQALRGLCISQASEMAALKRLSKPCSSSRASEAGTIKRLYTAVVDEGKGNLVEISLVPEISTAPCNKLPSVTTSSSIDHCTSPLVDATKPKEMMIGFSSQDQIVPLPLEVEGYKPVMDIGTPILANLSPVASASEVVPEVLRDPASLSKASLISSMPGKGQEANLLPASCPPSSSAGNGGDKSTSSSTCLSKPIFNNLNFLKKKVKQDFSSSSSCSTPCTSNLDKEVGNSDLKHGVKENEKLSPSCSNHSIEVNSISVGTDSSKSGFSLNCNKRTKFLVTKVDEKSRSKEKGEFSQSSKSSIGEYSSSTSISEESSLSGSSRGGHRPHMSKHMRWEAIRVVQQQHGNLNLKHFKLLKRLGSGDIGTVYLAELIGTSCLFALKVMDNEFLSSRKKMFRAQTEREILQMLDHPFLPTLYSHIATDKLSCLVMEYCPGGDLHVLRQRQSYKSFSEQATRFYVAEVLLALEYLHMLGVVYRDLKPENILVREDGHIMLTDFDLSLRCSVNPMLVKSSSPDTDATKKTCSEASCIDPFCLQPDWQVSCFTPILLSAGAKSRKMKSDIASHVGPLPQLVVEPTSARSNSFVGTYEYLAPEIIKGEGHGSAVDWWTFGILLFELLYGKTPFKGQSNEDTLANVVSQCLKFPGAPIVSFHARDLIKGLLIKDPENRLGSVKGAAEIKQHPFFEGLNWALIRCAAPPELPKFRDFGTSAPSMAANKENANDLEDIEDCEEFELF*LLGPFQPQFPFSFLFMRGRKLN*


CDS Sequence:
>Vu_11907.1
ATGGATACCTGTGGTAGTACATGTGAGATAGTGGAATCAAGGGAAGAAATAATATCTGAGATTAAAATGGTTGACAAACCTGAGAGTAGTTATGGTCACAAATCAGGAAAAAGGTATTCGATTGAGAATGATATTAATCAGCTTTTCCAGGCTATTGATATTAAAAGTTCATCAAGAAGTCACAGTTCATCACGTTTACAAAAGAATGCTCTTAAAAGGCCAATAAAAGTCACTTCATCTCAGGCATCAGGAATTGGCATCTCAGAGCCTGTAAGTTTGAAGCAGGCACTTAGAGGGTTGTGCATCTCTCAGGCCTCAGAAATGGCTGCTTTGAAAAGATTGTCTAAGCCATGCAGTTCATCTAGAGCATCAGAGGCTGGCACCATCAAAAGGTTGTACACAGCGGTGGTAGATGAGGGGAAAGGGAACTTGGTAGAAATTTCTCTAGTGCCAGAGATATCTACTGCACCTTGTAATAAATTGCCCAGTGTAACTACATCAAGTTCAATTGATCATTGTACTAGTCCTTTGGTTGATGCTACAAAACCAAAAGAAATGATGATTGGATTTTCATCCCAAGATCAGATTGTTCCTCTGCCTTTAGAGGTTGAGGGTTACAAACCAGTCATGGACATTGGAACACCAATACTTGCAAATTTGTCACCAGTTGCCTCTGCTAGTGAAGTGGTGCCAGAGGTTCTAAGGGATCCTGCTTCCTTAAGCAAAGCTTCTCTTATTTCTTCAATGCCAGGTAAGGGGCAGGAAGCAAATTTACTTCCTGCATCTTGTCCACCTAGCTCTAGCGCTGGCAATGGAGGGGATAAATCTACAAGCAGTAGTACATGTTTGTCAAAGCCAATATTCAATAACTTGAATTTCCTTAAGAAAAAGGTAAAGCAGGATTTTAGTTCTTCCTCAAGTTGCTCCACTCCATGTACAAGTAATTTGGACAAGGAGGTTGGAAATTCTGATTTGAAGCACGGAGTGAAAGAAAATGAGAAATTGTCTCCAAGCTGTTCAAATCATAGCATTGAAGTTAACTCAATTAGTGTTGGTACGGATTCAAGCAAATCTGGTTTCAGCTTGAACTGCAACAAGAGAACTAAGTTTCTGGTGACCAAAGTTGATGAGAAATCAAGATCAAAGGAAAAGGGTGAGTTCTCTCAAAGTTCAAAAAGTAGCATTGGAGAGTATAGTAGTAGCACAAGCATCAGTGAGGAAAGCAGTCTAAGTGGTTCCAGCCGTGGTGGCCACAGACCTCACATGTCAAAACATATGAGATGGGAAGCTATCCGAGTTGTTCAGCAGCAACATGGTAATTTAAATTTGAAGCACTTTAAGCTGCTAAAGAGGCTTGGTAGTGGGGACATTGGAACTGTTTACCTTGCGGAATTAATTGGTACAAGCTGCCTTTTTGCACTCAAAGTGATGGACAATGAATTTTTGTCAAGTCGGAAGAAGATGTTCAGGGCCCAAACTGAGAGAGAGATCCTTCAGATGCTAGATCATCCATTTCTTCCTACACTGTACTCCCATATTGCAACAGATAAGCTCTCTTGCTTGGTTATGGAGTATTGTCCAGGAGGAGATCTGCATGTGCTGCGACAGAGGCAGTCATACAAGAGTTTCTCGGAACAAGCAACTAGGTTTTATGTTGCTGAGGTTCTTCTTGCCCTGGAGTATTTGCATATGCTGGGAGTTGTGTACCGAGACCTAAAGCCGGAAAATATCCTAGTGCGAGAAGATGGTCATATTATGCTGACAGATTTTGATTTGTCACTCAGATGTTCTGTCAATCCAATGTTAGTCAAGTCATCTTCACCTGACACAGATGCCACGAAGAAGACCTGTTCTGAAGCTAGCTGCATAGACCCTTTCTGTCTCCAGCCAGATTGGCAAGTTTCGTGCTTTACTCCCATTCTATTATCTGCTGGAGCAAAATCCCGAAAGATGAAGTCTGACATAGCTTCTCATGTTGGTCCACTGCCACAGCTTGTAGTGGAGCCTACCAGTGCACGGTCTAACTCCTTTGTTGGAACCTATGAATATCTTGCTCCGGAGATCATCAAGGGTGAGGGTCATGGGAGTGCAGTAGACTGGTGGACTTTTGGTATTCTTTTGTTTGAGCTTTTATATGGTAAGACTCCATTCAAGGGCCAATCAAATGAGGACACATTAGCCAATGTTGTGTCACAATGCCTAAAGTTCCCTGGTGCTCCAATAGTCAGTTTTCATGCCAGAGATTTGATCAAAGGGTTGTTGATAAAGGATCCTGAAAATCGATTAGGTTCTGTAAAAGGTGCTGCTGAAATAAAGCAGCACCCGTTTTTTGAAGGTCTCAATTGGGCTCTAATACGGTGTGCGGCACCACCAGAGCTCCCCAAGTTTCGGGATTTTGGAACAAGTGCTCCATCTATGGCTGCAAATAAGGAGAATGCAAATGATTTAGAGGATATAGAAGATTGTGAAGAGTTTGAGCTGTTTTAGTTACTCGGTCCCTTCCAACCCCAGTTTCCTTTTTCGTTTCTCTTTATGAGGGGTAGGAAGTTGAATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_11907::LG3:7410906-7412906(-)
TTATTTAGATACTTAAGTTAAAGGAGTCTTTTTTCACATAACTAGTGTTCTAAGACTGTATTATTAGCTTGGTTTATCAATCTTATTTGTTTAATGATTCTATGATAAATTATTTGTACATTAGTTTATCATTTCTTTTGCTTGTATTTTTTTTAATGATCATCTTTATAATATGAACAAATGAGAAAATCGGAGTCGAGCTACCTCTATAAAGAACTGATAGTGCAGTTATGTAATGTAGATATAAAGAACTCTTTTAAAAAACTCACTTTATGTTTTATTTAAAATTTTCTTAGTTTTTTTTTTAAAAAATGTTTGAAATAATTGTAACAATATTCTCGAGTTTCTAAATTATCTATCCTTACTTTATTAATTACGTATTTCACTTAATAATTTATACTATTAATTAAAATGTTACACGTCCTACTAAACACATTTAATAGTTTATTCTTAGTTAAATAAGCAAAACATCTAACTTACTAGCCCAAATCCAATCCAAAAATCAGAGACAAGATTTGACCTAATTATTTTATGATTTGTTTGTTTGTCAGTGGAAAAAGATGAAGCATTTATGCTATGATTACACTTCACAAATTTAGGAAAAAATATTAAACAGTGGTGCCCTAACATTAATTCATGGGTCCCATTCAAACAACAATCCCAACCTTTATGCCCTACAACTTCTACACTATGTCCATAAATATCCGTAGAATTCATTTTTCACTCAAATTATTACAATAAATTTAACTAATATACTGCCAAATTTTCTTCAAAATATATGTTTTTTAAAACTCTACACAATTATCTATAGAAGAATTAAATTAAATTTGTTAATCTTTTTAATACTAAATTATCACTAAGAACACATTTGATAACCAAATTAGTCACTTATCCTAAATTAAGTATTAATGAGTTTCTTTTTATGGATTGAGATTTATCCTCGTAATTAGAAAGAAATATTGTTAAAATAAGTTAGTCAATATTTTAAAGAGAAATTAATCATCACTAAGCCTAGTTTTACACCAATAACACAATTGTAAAAATAAAAATAAAAATTGTTAGTCTAAAAAGTGTAGTTTAACACTATCGCATCTAAGAAATATAGCAAAAAATTATTACAAAAATCTTAGAAGTATAATTTATTTATTGTTTTTGACACCAATCGCGCATGTAAAAAATATAGAAAAAAAATAATAATACAAAAATCTTAGAAGTATAATATTGTTATACTTATGTCATTAAACTACACTATCAATTGATAATGATGCATGATTGATTATTGTGATAGCAATCATATAGCTTCTGTAATACTTTTTTACAAAATTATGAATACAGTATAAAATAACTGATAATTATTTTATAAAATAATACTTGGTCAATTATTTTACAATTCATGTAGCTTCTATAATAGTATATTCACTATAACAAATATCGTTATATTATAATTTATTTTTAGTATGATAAAAAATCATAATCTTACTTATTATAATTTCTTAATTAAAGTAACCAACCAAACACGTTTCTGAGCATGTAATAATTATTATAAAAAAATAACATTAATATATAATTAATCATCAAAAGATATTTATTATCTTTTACTTTTTGTTTTATAAAATAAAAAATTAATAATATTTTTTAATAAATTGACTATTGCTAAAAACTAAATACACACTTAATTGTATTATTTATAGAATTATATAATTCAAATAAGACCACTCAAATAATTAAAATTGTAATAAAACTATAACTTTTTTATTATACTAAAAATAAAATATAATAACACTTATTTAATGAACTAATTATCCTTAAATTTAACTTGTTTCTAAAATCGTACACATATTAGTCATTAAATGTATCAATAATACATCAATTATTTATTGTTGTTAAGTTTTATGAATTATTTAACTATGATGTTAAGAACTAATTTATTATGGCAAAAAATATAATTATGTTAATCTAAAAAATGTAATTAACACGAAAACACGTATGTTTTTTTTCCT


Gene Sequence:
>Vu_11907(-)
ACAATAATCTGGGAGAATGAAAATAGCAGATATACATAAACAGAGAATAAACATTACGCGTTTGGAATGCTCTCATTCACCGTCGTGTGTATAATGTATTTGTCTCTGCAACACAACACCATGTGTTGTTGTTGTGTACACCACACACACAACATAACATAAATCATAGTAAATGTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTGCAGCATTAGATTGCAGAGAAAAGGGAGGGAGTAGTAGCAGTAGGTGGTAGGAGGTGTAGTTAATAGCAATAGGAACAGCAATTGTTGCCACTGTCACACTGCTCTTTCTGCCCTCTCACCCTTCTCGTGATTACCCTTTCAACCTTTTCTGTTTTCTCTTTCCTCTTTCACCATATTCACCCTTTTGCCTTTTCCTTCCTTCTCTCTCTCTTTCAACTTCAAACTTCAAACCCTAGCCATACCATTGGCATGCTCTTTCTCTTTCGGTTGCTTTTCATGTATTACGCTTTTGGGTCTTACAATTCCCTTCATACCGCTTTTTTTGGGATTTTGGAGCTGTTTCAGGTGATGTTTTTCACTTTTTTGTTGTTTGTTTCGTTAATTCATGTTGGCATGGTTTTTTTGTTCCAGATTTTGTTTTGGTTTTCTGGTTGGTTGGACTATGTTTGCTTGATTTTGCAGTAGACTCTTTTTCTTCCCATGAATGATGGTTTTTCAATTTGATTGTGTTTTTTTTTGTAATGCTTTAACTTCTGTTTTAGTGTTTTAGCTCCTCTTTTAATTTTGATCCACGGGGAGTATAATTGGTAAATGTATTTATTTGTTTCATGGATTATACTTTTATTTTTGTTTTTGAATTCTCTCTTTGATTGAGCTTCCTTCTTGTCCACCTGGCTTTGAATCCAAGGATTTTTCTAGCTCTAATTGTGGTACTAATTCCATGTACTGGGTTGCGAGTCTTGATCTTTCCTTTTTCCCTTGATATCAATTCTAACGTGTTTACCGTTCTTATAAAATCAAGAAAAGTATAGCACTTCCACATTCACATATTCAAACACAAAATCTGAACAAAAAGGTGCTCCATGCTTGCTCTCCTCCATTATGGATGTAAATGCTTATGGTGGCCCAAGATGGGAGTGGAGGAAGAAATTAATTGTCTCCTTTTAAAGTTCAGTAATAAAAATGTATTGGACTTTCAAATTGCAAGGATGGCTTAGGAGAGTGAAATGTGGGGTGAAAATCCACTTCTGTTTTTCTGACAATTTGGTGTTCAAATGAATTATGCATGTGTCTATTATCTTTCCCTGCCTTTGTAGCTAAATACATTGTTTCCCAAACTTGTGATGGAATTCATAGATAAATAATGGCCTTAGTGTAAATCTCTTCATTTGTTCCGTTGTTATTGTCTTGACCTATCTGCAATATCAATGTTAAAATTTCAGGTTTGGATGCCGAGAGTTATGACTGAAGAGAAATTTGGAGGTGCCCTTTGCGGTTTTGTACTTCTGTGCCATCATCTGTGACTTATCTTTGAAATTGGGCTAAAGCTGAGTTCTCCTATTTTTATCTGTCAACTTGTCATCTATCAAATATGGATACCTGTGGTAGTACATGTGAGATAGTGGAATCAAGGGAAGAAATAATATCTGAGATTAAAATGGTTGACAAACCTGAGAGTAGTTATGGTCACAAATCAGGAAAAAGGTATTCGATTGAGAATGATATTAATCAGCTTTTCCAGGCTATTGATATTAAAAGTTCATCAAGAAGTCACAGTTCATCACGTTTACAAAAGAATGCTCTTAAAAGGCCAATAAAAGTCACTTCATCTCAGGCATCAGGAATTGGCATCTCAGAGCCTGTAAGTTTGAAGCAGGCACTTAGAGGGTTGTGCATCTCTCAGGCCTCAGAAATGGCTGCTTTGAAAAGATTGTCTAAGCCATGCAGTTCATCTAGAGCATCAGAGGCTGGCACCATCAAAAGGTTGTACACAGCGGTGGTAGATGAGGGGAAAGGGAACTTGGTAGAAATTTCTCTAGTGCCAGAGATATCTACTGCACCTTGTAATAAATTGCCCAGTGTAACTACATCAAGTTCAATTGATCATTGTACTAGTCCTTTGGTTGATGCTACAAAACCAAAAGAAATGATGATTGGATTTTCATCCCAAGATCAGATTGTTCCTCTGCCTTTAGAGGTTGAGGGTTACAAACCAGTCATGGACATTGGAACACCAATACTTGCAAATTTGTCACCAGTTGCCTCTGCTAGTGAAGTGGTGCCAGAGGTTCTAAGGGATCCTGCTTCCTTAAGCAAAGCTTCTCTTATTTCTTCAATGCCAGGTAAGGGGCAGGAAGCAAATTTACTTCCTGCATCTTGTCCACCTAGCTCTAGCGCTGGCAATGGAGGGGATAAATCTACAAGCAGTAGTACATGTTTGTCAAAGCCAATATTCAATAACTTGAATTTCCTTAAGAAAAAGGTAAAGCAGGATTTTAGTTCTTCCTCAAGTTGCTCCACTCCATGTACAAGTAATTTGGACAAGGAGGTTGGAAATTCTGATTTGAAGCACGGAGTGAAAGAAAATGAGAAATTGTCTCCAAGCTGTTCAAATCATAGCATTGAAGTTAACTCAATTAGTGTTGGTACGGATTCAAGCAAATCTGGTTTCAGCTTGAACTGCAACAAGAGAACTAAGTTTCTGGTGACCAAAGTTGATGAGAAATCAAGATCAAAGGAAAAGGGTGAGTTCTCTCAAAGTTCAAAAAGTAGCATTGGAGAGTATAGTAGTAGCACAAGCATCAGTGAGGAAAGCAGTCTAAGTGGTTCCAGCCGTGGTGGCCACAGACCTCACATGTCAAAACATATGAGATGGGAAGCTATCCGAGTTGTTCAGCAGCAACATGGTAATTTAAATTTGAAGCACTTTAAGCTGCTAAAGAGGCTTGGTAGTGGGGACATTGGAACTGTTTACCTTGCGGAATTAATTGGTACAAGCTGCCTTTTTGCACTCAAAGTGATGGACAATGAATTTTTGTCAAGTCGGAAGAAGATGTTCAGGGCCCAAACTGAGAGAGAGATCCTTCAGATGCTAGATCATCCATTTCTTCCTACACTGTACTCCCATATTGCAACAGATAAGCTCTCTTGCTTGGTTATGGAGTATTGTCCAGGAGGAGATCTGCATGTGCTGCGACAGAGGCAGTCATACAAGAGTTTCTCGGAACAAGCAACTAGGTAGGAGTTGTGAACTTTTCCATTCCTTCGTGACTAGAAAATATATTTTGAAATTCAATCGTGCCTGGATTTGTATATTATTGTTTTTAAATTCAATCAGTGTCTGGGTAGAGCAAGTTCATATTTTGTTAACCCAAGGTAATTTTTATGTTCGAGTCCAGTAGACCTTTATGGTAATTTGTTCATTGCAGCATTTATTTCTTAGTCCGGCTAGCATTTTATGTTTGATGCTATGCACTGAACTAGAAAATCTAGTTTAAATTTTTGGAAAATGGAAGTGAGGTAACCTTGATGAATGAAATTTAAAGAGAACAGATGCATGTGCGCACAAATTGGTTGGGTGGTTTAGTTGACAACTATAGAATTCCCCAAGAGAACTGAATCAAAGAGAAGTGTTTAAAATTAACTTGATTGATGTACCAAAATATGTTTTGTTTAGGCTGCAACTCAATAAGACGCAGATTAAGTGTAAATGTGTATTGTCTCATTTTCACTTTACCAGAAACAGATTCCTGTGTTTCAATGCATGGCAAGTTGACAAATTTTTCATCCGTTCTTCAATATAGTCATGGCATCACATTTGCAGGTTTTATGTTGCTGAGGTTCTTCTTGCCCTGGAGTATTTGCATATGCTGGGAGTTGTGTACCGAGACCTAAAGCCGGAAAATATCCTAGTGCGAGAAGATGGTCATATTATGCTGACAGATTTTGATTTGTCACTCAGATGTTCTGTCAATCCAATGTTAGTCAAGTCATCTTCACCTGACACAGATGCCACGAAGAAGACCTGTTCTGAAGCTAGCTGCATAGACCCTTTCTGTCTCCAGCCAGATTGGCAAGTTTCGTGCTTTACTCCCATTCTATTATCTGCTGGAGCAAAATCCCGAAAGATGAAGTCTGACATAGCTTCTCATGTTGGTCCACTGCCACAGCTTGTAGTGGAGCCTACCAGTGCACGGTCTAACTCCTTTGTTGGAACCTATGAATATCTTGCTCCGGAGATCATCAAGGGTGAGGGTCATGGGAGTGCAGTAGACTGGTGGACTTTTGGTATTCTTTTGTTTGAGCTTTTATATGGTAAGACTCCATTCAAGGGCCAATCAAATGAGGACACATTAGCCAATGTTGTGTCACAATGCCTAAAGTTCCCTGGTGCTCCAATAGTCAGTTTTCATGCCAGAGATTTGATCAAAGGGTTGTTGATAAAGGATCCTGAAAATCGATTAGGTTCTGTAAAAGGTGCTGCTGAAATAAAGCAGCACCCGTTTTTTGAAGGTCTCAATTGGGCTCTAATACGGTGTGCGGCACCACCAGAGCTCCCCAAGTTTCGGGATTTTGGAACAAGTGCTCCATCTATGGCTGCAAATAAGGAGAATGCAAATGATTTAGAGGATATAGAAGATTGTGAAGAGTTTGAGCTGTTTTAGTTACTCGGTCCCTTCCAACCCCAGTTTCCTTTTTCGTTTCTCTTTATGAGGGGTAGGAAGTTGAATTGAACTTGACTTGGTTTCAAAACCCAATCTCATCCATATAACATTTAGTATAGCTTATAGCAGAAATGTAATCCAAACCATGTAACAAATAGATAGATTAGTATATGTTTATACTGTACTAGAAGTTTCAAATCGGTAAAGGAAAAAAAGGATTTCTTTGGTTTGTCTGCCTCTATATGATATTATCAATGGATATTTCATTCCCTTTTTGCATTTTCC