Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_12438 LG3 16842193 16843017 PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 16842195 splice_region_variant&synonymous_variant p.Asn173Asn
C/T 16842255 synonymous_variant p.Gln153Gln
A/G 16842290 synonymous_variant p.Leu142Leu
G/T 16842378 missense_variant p.Asn112Lys
C/T 16842491 missense_variant p.Ala75Thr
C/T 16842528 synonymous_variant p.Leu62Leu
A/C 16842699 upstream_gene_variant
T/C 16842722 upstream_gene_variant
T/G 16842810 upstream_gene_variant
C/T 16842868 upstream_gene_variant
G/A 16842875 upstream_gene_variant
G/A 16842925 synonymous_variant p.Arg31Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_12438.1
MSLFIIRGSSTLEKRVFGLWLSIAKSWSVTRSVTLREELRSWLGLSNFGNPYLSPCRRVSLTVPSRNQPGPTDNSSITFASAIVLVLIVLIVLFFYTQKWKPRSRVVGSTRKQVKVFTDIGVTLTFESVVQATRYFNVGKCIGSGGFGATYKAEITSGILVAVKRLAVGQCVQ*


CDS Sequence:
>Vu_12438.1
ATGTCTCTATTCATTATTCGTGGATCATCAACCTTGGAGAAGAGGGTTTTCGGTTTGTGGCTTAGTATTGCGAAATCCTGGTCGGTGACTCGCAGTGTGACGTTGAGAGAAGAGCTGCGATCCTGGTTAGGACTTTCAAATTTTGGGAATCCATACCTAAGTCCCTGCCGCAGAGTGTCTCTGACTGTGCCATCAAGGAATCAGCCAGGGCCAACTGATAACAGCTCTATAACTTTTGCTTCAGCCATTGTTTTGGTACTTATAGTCCTGATTGTTCTGTTCTTTTACACACAGAAGTGGAAGCCAAGATCCAGGGTTGTTGGCTCTACAAGAAAACAAGTTAAAGTGTTTACTGATATTGGGGTCACATTGACATTTGAAAGTGTTGTCCAAGCCACAAGATATTTCAATGTTGGCAAATGTATTGGGAGTGGAGGTTTTGGGGCAACATACAAGGCAGAGATAACATCAGGAATCCTGGTGGCAGTCAAACGACTCGCAGTTGGACAGTGTGTTCAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_12438::LG3:16843017-16845017(-)
TAAGTTTATTTTAAACAATTCACATTTCTAACTTGTTTGGTCAATATAAACACGATGTTGTGATTTATTATTTGTCACATAAGTGAAATTAAGAAAAACAAAATGTACTAAATTTCAAATTAGAATTTAAACTTAATAAATCTGTTACCATCACGCTTATAATTTACTTTCTACTCCTTTCATTCTATGATTTTATCAAAATTGGTATTAAGAAACTAAATGATTTGCAACTATTGTGGGTTGATGCTAATGTCTTTTCACGGGGGGTTTCTTGGTTTTTTAGTTTTAAAATTATTGTAGACATCAACATCATCAATTATTTTGTTATCAAAGTGAAAACAAATGAACGAACAGAACAAGATCAACAAATTGCAGTGTCGCGTGTTACTATGTGTGGTGAAAGAGAGAATGGAGATGAGAGAGAAACAAATTGGATAAGTTAGAAAGGTAGATTAAGGTTAAGTGAATGTTTCTTATTTTTTTTCAGTTGGGCTAGTGTAGGGATGACAAAGAGAATGTTAGAGTGAGAAATGAAAGATAAAAGGTTTTTTTTTAGTTTTGAGAATGAAAATTATTCAAACACCTTTGACCTTAAAACTTAGAATCTATAATATATGAAGGTATTTTTGCCTACTAAAATTTGGTACACATTACTAAAATGTACCAACTGAAACAAAGAACTTATACAAGTTATGAAACCCCTTAAAAAATATTTCATAATCTAAAATTATATTTTAAAATCTCCAATTCAAAATATAAAAATATTAAAATAAATATTTGAAAGATTTTTTCAATTAAAAATATATTTTGTCCGAAAAATCATCTCTATTACCAAATGCCTTTAAAGGGAATACTTGCGAATAATCAAATACTTACCAAACTTTTGTGTTAGACAATTTAAAAATAATTTAACAAGTAATAACTCTATCGAGATTAAAAAACCATTTAAATAGCAAATGCTTAAGAAAGAAATTAACTTATTTTGATTTATACAAAACCTCAATTTCCAATAGTGATTTTTGTTAAATATAATATTAAATGAAAGAATTGAAGTATTTCATTAAAGAAAAACACTATAATGGACTTTTTAAAGATTAAAAAGAATAAGAGTTAAAAAAAAAGTAAAATAGATATTTAAACAAATGGATAGAGATGGAGAAAAAATGTATTTATTTCAAACATATCATTTACTTATGCATGATTGTGACATATTCCAAACAAAATTCACAGGATTTAATGCAAGTTCATGTGTGAGTGAACTATATTATATATTATCGTATGGTTAACAACAATTAAAATGAAAAATGAATAAATAAAAAAGAAAAAAAATATAAATATATAGTCTTACCTTATTTAACTAAAATAAACTTTCTTAAATAGGCTCATCACTTATTTTCGTAACAAAAAATTAAAATAATAATCCGTAAATTTACATCCATAACGCCTGCTACTTATGTTATATTTTGAATAATTAAAATTCGTAACCTTAAATTAATATGGAACGTTTTCATCATAACGGCTGTATTATATGTTATATTTTGAATAATTAAATTTAGGTTTAATATCCAATTTTGTCCCCAGTTTGGTTGGCAAATCTCAATTTAGTCCGTCATAAAAAAATGTTTGAAACGGGTCTTTATTTGTAAATTTGTGAGTCAAATTAGTCCCTTCCGTTAAATGTAATCAAACAGAGTTAATGAGATGATGATGTGGCACTAGTTAGTGGTTACGTTTGAAAATATAATTGTGTGCTTGCTTACGTGTTGATTAAAATATTGTGTTTATCCGTATGTTTGTCTCGTGTGAGAGGTTGGCTAGGGAAGCACCTTTCTTCTTCTCCTTTCCCAGTAGTTCTGGTTTGGCCTTGAAAGAGGGGAAGCACCAATTTGTTTTTCTTATTGCTGGTTCCTCTCAACAAACCATATTCAGAGGTTCTCTTCCCACTTTCTTCTCTCTGTCATTTATCTCGAGCAAGCAAACCCCAATCAGTTTTGTTCCGA


Gene Sequence:
>Vu_12438(-)
ATGTCTCTATTCATTATTCGTGGATCATCAACCTTGGAGAAGAGGGTTTTCGGTTTGTGGCTTAGTATTGCGAAATCCTGGTCGGTGACTCGCAGTGTGACGTTGAGAGAAGAGCTGCGATCCTGGTTGTTTGGGAAGGCGACGACACGGCGAGGGTGTAGCCAGCGGAGTCGCAACGAAGGCACGACGGAGGTGCAGCGGAGGTTTATTCTCTCCATTTTGATTCACGACGCAAGGAGGGAGCTTCCTTTCGTTTCTCCTTTTCCGGTTCGTCTTGTAGAGGGTTCTTAACCTTATTTTTGATTTGGGAATGTGGGTTGTTGTCTCTTCCTTATAGGTTTTGGTCTTGTTTTGTTTTGAGCCAGGGTTTGAAATGGGGATTTCGAATTGGGATTGAATTTAGGGTTTTTTAAATTGGGAATTTGGAGGTTAGGACTTTCAAATTTTGGGAATCCATACCTAAGTCCCTGCCGCAGAGTGTCTCTGACTGTGCCATCAAGGAATCAGCCAGGGCCAACTGATAACAGCTCTATAACTTTTGCTTCAGCCATTGTTTTGGTACTTATAGTCCTGATTGTTCTGTTCTTTTACACACAGAAGTGGAAGCCAAGATCCAGGGTTGTTGGCTCTACAAGAAAACAAGTTAAAGTGTTTACTGATATTGGGGTCACATTGACATTTGAAAGTGTTGTCCAAGCCACAAGATATTTCAATGTTGGCAAATGTATTGGGAGTGGAGGTTTTGGGGCAACATACAAGGCAGAGATAACATCAGGAATCCTGGTGGCAGTCAAACGACTCGCAGTTGGACAGTGTGTTCAATAA