Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_14600 LG3 49982714 49987488 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   trans-Golgi network, Golgi apparatus, Golgi apparatus, secretory vesicle, Golgi trans cisterna, extracellular region, Golgi trans cisterna, trans-Golgi network, endosome, extracellular region, Golgi apparatus, Golgi apparatus, secretory vesicle, Golgi apparatus
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 49982718 5_prime_UTR_variant
T/A 49982820 5_prime_UTR_variant
T/G 49985319 intron_variant
A/T 49985328 intron_variant
C/A 49987277 3_prime_UTR_variant
G/T 49987280 3_prime_UTR_variant
T/A 49987365 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_14600.1
MAPSPFTSLPFVFFTLLSILHLSHCKTLKRDVKALNEIKASLGWRVVYAWVGDDPCGDGDLPPWSGVTCSTVGDYRVVTELEVYAVSIVGPFPTAVTSLLDLTRLDLHNNKLTGPIPPQIGRLRRLKILNLRWNKLQDAIPPEIGQLKSLTHLYLSFNNFKGEIPKELANLPDLRYLHLHENRLTGRIPPELGTLQNLRHLDAGNNHLVGTLRELIRIEGCFPALRNLYLNNNYFTGGVPAQLANLTSLEILYLSYNKMSGVIPSSIAHIPKLTCLYLDHNQFSGRIPDPFYKHLFLKEMYLEGNAFRPGVNPIGFHKVLEVSDSDFLA*


CDS Sequence:
>Vu_14600.1
ATGGCGCCTTCACCCTTCACTTCATTACCCTTCGTCTTCTTTACCCTTCTGTCAATTCTCCACCTTTCGCACTGCAAGACCCTAAAGCGTGACGTTAAGGCTTTGAACGAGATCAAGGCTTCTCTTGGGTGGAGAGTGGTGTATGCGTGGGTCGGTGATGACCCTTGTGGTGATGGGGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACGTGTTCCACTGTCGGTGATTATCGTGTCGTGACCGAGCTTGAGGTGTATGCGGTGTCGATTGTCGGACCTTTTCCTACTGCTGTAACCAGCTTACTGGATCTTACACGGCTTGATCTTCACAATAACAAGTTGACAGGGCCTATTCCTCCTCAAATTGGACGGTTGAGGCGTCTTAAAATACTAAATTTGAGGTGGAACAAACTACAGGATGCAATTCCTCCAGAAATTGGTCAGCTCAAAAGTTTAACACATCTGTACCTAAGCTTCAACAATTTTAAGGGAGAAATTCCCAAGGAGCTAGCAAATCTGCCTGACCTTCGCTATCTTCATCTCCATGAAAACCGTTTAACCGGAAGAATACCACCAGAATTGGGCACTCTACAAAATCTTCGGCACTTGGATGCTGGTAACAATCATTTGGTGGGTACCTTAAGGGAACTCATTCGTATTGAAGGTTGCTTTCCAGCCCTACGCAATCTATATCTAAACAATAATTATTTTACTGGAGGAGTACCTGCACAACTTGCTAACTTAACCAGTCTTGAAATATTGTACCTATCCTACAACAAAATGTCAGGAGTTATACCATCGAGCATTGCTCATATTCCTAAATTGACATGCTTGTACTTGGATCACAATCAGTTTTCAGGGAGAATTCCCGATCCCTTTTATAAGCATCTATTTTTGAAAGAAATGTACCTCGAAGGAAATGCATTCCGGCCTGGTGTCAACCCCATTGGTTTTCATAAAGTGCTTGAAGTTTCTGATTCAGACTTCCTTGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_14600::LG3:49980714-49982714(+)
TCAGAAAAACATCTAAAATACACCATGGCAGTTACTGCAAATAAGGAGCCCAGATCTTACAATGAGGCAAAAGGCATGAATGAATGGGTAGAAGCCATGCAGAGAGAGATCAAGGCCCTGCAGGACAATGACACATGGGTTTTAACCAAACTTCCCCCAGGAAAAACTGCTATAGGATGTAAGTGGGTGTACAAAACAAAATACAAAGCTGATGGTAGCATTGAGAGATTCAAAGCCCGACTAGTGGCGAAGGGCTACACACAACAAGAGGGAATAGACTACCTCGACACTTTTTCTCCTGTGGCTAAACTGACCACAGTAAGGTTGCTCATTGCTCTAGCAGCTTCAAACAATTGGTTCCTACACCAACTGGATGTAGACAATGCGTTCCTACATGGAGATCTCAATGAAGAGGTGTATATGGAACCACCTCCAGGTCTGAACAACCACGATGAAGGACAAGTTTGCAGGTTGACAAAGTCACTATATGGCTTGAAACAAGCCAGTAGGGAATGGTTTGAAAAACTGTCTTCTTTCCTACTATCTGTCAACTATATTCAATCTAAATCTGATCACTCTTTGTTCACTAGAACAACCCCTACAAGTTTTACTGCTCTACTTGTGTATGTGGATGACATTGTGTTGACAGGAAATTCTATGATGGAAATCAACAGCATAAAGGAACTCCTACACAAGAGATTCCGAATAAAGAATCTTGGAGAACTCAAATACTTCCTAGGATTGGAAGTGGCCAGGTCAAAAGCAGGTATTCACCTATGTCAGAGAAAGTATGCTTTGGACATACTGGAGGAGACCGGAATGTTGGGATGCAAACCTTCCTCTACTCCCTTCTTAAGTGACACAACCTCATTGTACAAACTGGACAGCTACCTGGATGATCCAGGTCCATACAGAAAACTAATAGGGAAGCTTCTCTATCTTACCAATACAAGACCTGACCTATGTTTTTCTGTTAATCTACTTAGTCAATTCATGCAATCACCTACTGACCACCATTATCGTGCCATTCAGCACATTCTTAGGTACAATAAATCCAAGCCCTCTGAAGGGCTGTTTTTCCCTGCTGACTCACCTATGCACTTAAAGGCATTCAGTGACTCTGACTGGGCCACATGTCCTACCACCAGAAGATCCACAACAGGGTTCTGTGTGTTTCTCGGATCCTCTCTCATTTGCTGGAAATCTAAGAAGCAGAAAACTGTTTCCAGATCATCCACTGAGGCTGAGTACAGAGCACTTGCTGCCACTGTATGTGAGATACAGTGGCTTTGCTATCTCCTTCAGGATTTTCAGATTAAGGCGTCAGGGGTCCCCGCCTTGTACTGCGACAGCAAGTCTGCACGACACATAGCACATAACCAGAGCTTCCACGAACGCACCAAGCATATTGAGCTCGATTGCCACGTTGTTCGTGAAAAGGTTCAGGAACACCTCCTTAATCTCCTTCCAGTGCGATCCGACGAACAGCTTGCCGATATCTTCACAAAATTTCCGCACCGCGTCAAGTTCAAGTCTATTGTTCCCAAGCTTGGACTGGTGGCCATACACCGTCCAGCTTGAGGGGAGGCTATTGAGAATCGTATAGATTCTTTACTGTCTAACAGACAGTACTGGACTGTATTACTTAGGTTTTATTGTGCTTTTATGTCTAACCGTTTTCAGTTTACCGGAGCTCTATAAATAGAGTTCCCCTTTGTGTTTTCAGTGTAAGAAACAGTAATGAAACAACTAGAACAGATTTGCATGAAATAAGAAAAGGTTACTTTTTACTTACCTCCCTTGCCATCCTCTTCATCTTTGCCTTCTCCACCATTGCAGTCTGATGCTTCTACGACCATCAAACTGCCTTGCCCTCTTTGCTTCTCTTCCATCGCCAGAACACGAGAGTTCTCTGGAAGCTTCATTCTCTCTTTTCACATTCATAAGTCCGCGTGCCACGTCCGCTGCCTTCTTTCAGTAAAAGGGTAATACCCATGCCA


Gene Sequence:
>Vu_14600(+)
ACGCACAGTGTTGGATTGGGCCGACCCCTCTTCTTACACGCTATTGGGCCTCGTCTTAATAGAAAGAAAAGAAAACCATCAAAACCTCAGTGCCGACGCCAAGGAGTGTGTTGTTGGATGTTCAGATTCCAACATGATACCGCGTTCGCTGACTCTCAACTTCAATTGATCAATCACCAAAATCAAATTCCTACACCACACCTTCTCTCTCCTTTGCAAAATCTGAATCAACAACACGCAGCAAAACATCTCACTCAACCACACCAACAACACTTCAGATCTACGATTCCAATCCCACAACACAAAAAATAAACAAAAACCGATTTCTCCAAGCGGCCTCAAAATGGCGCCTTCACCCTTCACTTCATTACCCTTCGTCTTCTTTACCCTTCTGTCAATTCTCCACCTTTCGCACTGCAAGACCCTAAAGCGTGACGGTAACGTTAGCTACTTAACTCAGTCCCTTTACCCATGTCGTTTTCTCTCAACTTTTCTCCAATTCGGTTAATTGGGTTGTCGAGTTTTGCTTTTTCCCGTCATGGGTCGGAGTCGTTTATGTCTTCCTCGAATTTTTTGCAGTTAAGGCTTTGAACGAGATCAAGGCTTCTCTTGGGTGGAGAGTGGTGTATGCGTGGGTCGGTGATGACCCTTGTGGTGATGGGGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACGTGTTCCACTGTCGGTGATTATCGTGTCGTGACCGAGCTGTGAGCATCATTTATCAATTTTCAATTGATTTAGAAAAATGCAAAAAATGTCCCTTTTTTTTGGAATTGTTAAGATAAAGGTTTTTTATTTTTAAGTTCAGTTGTTGCTGACGAGATTTGAGGTTGTAAAGTTGGTGTAATTGGGATTTGGTATTTTTCAGTGAGGTGTATGCGGTGTCGATTGTCGGACCTTTTCCTACTGCTGTAACCAGCTTACTGGATCTTACACGGCTGTAAGTTTTTATTTTTTTCATTAATCTATGTTTCCTTTAATTTTGATCCTTTAACGGGTTGAGAAACATGTGGTGTTGATTAACGCCTATGGTTGTGTTGGAGTTGAATGTTTGAAAGCCAAATATTGTGTTCTGTTTGTATGTTTTTCATATTTGTTTGCAGGATAGCGAGGAGTTTATTTGGTTGGTGTTTTTTATAATTTGATGCAAAATAATAAAGAAATTAATTATAAATGGTTGATTGAGATTTATGGGTTGAGATAATGCATTTGCAGTTCATCTGCATTTTGTTTTGCTTTGTTGCTTTTAATTACAATTACTATATGTGTATCATTGAAATGCTTCCATTTTGATTCTCCCTTTGAAATTCTTATGAGTTGATGCACTGTGTACTTATGGCAGTGATCTTCACAATAACAAGTTGACAGGGCCTATTCCTCCTCAAATTGGACGGTTGAGGCGTCTTAAAATACTGTATGAATTTTCTGATCCCTGTTCACTTTTTCTTTCTCTCTGCATTTTTTGTTCTGATACTTATGTTTGACGCAGTACAATTATTTATACTAGATTTTTATGTTAACAACTAATGTTTATTTAGGAAGATTTTTCTTTTTACTGGGTTTTTATTTAAGCAGTGGTTGATCATCTATAACCATTATTCTAAGATGTTATATTGATTCATTTTTTACCTCTCTTTCCTTCCAGAAATTTGAGGTGGAACAAACTACAGGATGCAATTCCTCCAGAAATTGGTCAGCTCAAAAGTTTAACACATCTGTGAGTAACTCTTACCTTCCTAATGTCTTTGGGCTTGCTTGTCCCTTTTTCATCGTTGCTTTTATTTTATTTAGAATTGTAACTGTAATGTCATATCTTTTTGCAGGTACCTAAGCTTCAACAATTTTAAGGGAGAAATTCCCAAGGAGCTAGCAAATCTGCCTGACCTTCGCTATCTTCATCTCCATGAAAACCGTTTAACCGGAAGAATACCACCAGAATTGGGCACTCTACAAAATCTTCGGCACTTGTAATAATCAAAGCATTTTAATTTAATAATATTCTAGTGCAGAGTACACTATTTATCGTACTTAATGTTTCCTAATACTGTTATACTTTATAGGGATGCTGGTAACAATCATTTGGTGGGTACCTTAAGGGAACTCATTCGTATTGAAGGTTGCTTTCCAGCCCTACGCAATCTGTAAGTTAATGCTGGTGAATTAGTTTCCTCAATATATTATCATTTGGTTTTAAATAATATTGTCTAAATTTTAACGTTTTTTTTGTGGAACCAGATATCTAAACAATAATTATTTTACTGGAGGAGTACCTGCACAACTTGCTAACTTAACCAGTCTTGAAATATTGTGAGTGCTGCTTTTCCTTTTATCCTTTAATACCACTTTTCATTCTTCCTCCTCCTTTGAGCATGTGTGAGAGAGAGAGAGACAGTATTGCTTTACAATAATTCTACCCTTTTTGCAATATCTGTCTCTTATTTATGGAATTTCCATAACATGATTATTCTATGTTGGAGGCAGGTACCTATCCTACAACAAAATGTCAGGAGTTATACCATCGAGCATTGCTCATATTCCTAAATTGACATGCTTGTAAGTTTGTCTTTCTCTTGTTGATTGGAATCTTCATTAGAAGTGTTGTGCATTGAATAAGGTCTAAGTTGTTTTTGATTTTTCATGAAACTCTTGATTTCGTATTTTGTTGCTACTTATATATCTTTTAATTTTATTTTATAATATACTTATTCTTTAATGAGGAAGATTCCTCACCTTTTTTGGACAGATGTTAATGGAGAAGCTAGTCTTGGAATACCTTATTAGATTTAGTAGTTGAAATTTTGTTATTTTGATTGGTGACTTTTAGGAGGTAGTGGATGATATGATTCAGAGAAAGATTAACACTATGCGTATTCAAGAAACTAAATGGGTTGGAGAAAAAGGTATAGATCCAGACACTGCACGAGTTAAACTTTGGTGTACACTAGAAAGTTGGAGGTGATGACAAAATTGCTACTACTGGTGGAAAGTGGTGGAAGTAAAAAGAATCGGGACTAAATTTTACCTTAAAATTTACATTGGAGACTGATAATATTATTAATTTTTGCTTATGCGCCACAAGTAGGATCATAACCACTTTTAAAAGAGAAATTTTGTAAATGTTTTGGATCAAAGTTTTCCTCAAGAGGAAAAGATTCTCGTAGGCAGGGATTTAAATAGATATGTTGTTAATTGGGCAAGATATGTTGATGAATTAAAAGGTTTTGGACCAAGTGATAAGAAATCTTGGTGGTGGAACATAAGTGTTCGAGGAAAGAAATAAAAGAGTGTTTTAAGGATTTACACGAGTCCAATAATACTAAAAATTGGGCAAGATTTTGGAAACATAGAAATGAGGTAGTTAAAGTTGTGAATGAGGCACTATTCAAAGCGGTTGCAGAGTTTTAGCTTGATATTGGGACAAAGAATAAATAAAGAGCATATATATAATAAGCTTGCCAGAAGTAGGTAAAAGAAATCAAGAATTTTGGACCAAGATTTATTAAAGATCAAGAGAATTTCTAAGTTACTGCTACAGATCACGATATCAAAGAAATATGGGATAGCTATGTCCAAAGTTTTTCAATGCTAGATAAGGATTTATATTTAGCATGGAAGAATTAGAAAATTAACTGTTCGAACAAATTTGACTTATTGTGTAGAATTTTAGTTATTGAAGTAAAAGAAGCCTGTAAGAAGATGGATAATAGTAAAGTTTATTAGTTTATATAATTTGGTTGTTCACTGAGTTCAAGAGCATCATGTGATCTACATAGCTAACTTCACCTGCTGGGATAAAGTTATTGTTGCTGTTCTATTGGTTTACCGACAAAAAGAGTTTTTTGTATTGTAACCGGATATATCACAAAATTCAATGGATGGGCTATTTTTAAACATACGAGTATATAAGTCATATAGAAATTGATGTGAGTGTATGTTTACCCTTTTTGATTTTGAGACTTATAAACCTTGTCCTTTAGGCATTGAGTTCTCTAAATGCAATTTAAGAACTAGAAACACATGCTTTACTTGCTTTCATTTATTTATTCTCGCTGGAAAACTATGGTCTTTAATATGCTGCTGTGAGCTTCAATACTACAAACACTTGGCTCAGAATTCTAATTTTCTGTAGAAAATGGAAATTTGAACTTTCCTTTCCTTTCCATTTTGTTAGTAAGATTGATAAATATGTTCTCAGATACTTCCATGAAACTCAATTGTCATCTCTGTGAAGTTTTTAACAATTTCAAGATTTTTTTCTCTATTGCAGGTACTTGGATCACAATCAGTTTTCAGGGAGAATTCCCGATCCCTTTTATAAGCATCTATTTTTGAAAGAAATGTGAGTTTCCAATGAAGTTGTGCAGATCACATTATATTGTTCTAAGAACTGAGAAATTTTATATGCTCTTGGCAGGTACCTCGAAGGAAATGCATTCCGGCCTGGTGTCAACCCCATTGGTTTTCATAAAGTGCTTGAAGTTTCTGATTCAGACTTCCTTGCTTAATAAAAGCTCTAAATATTTATAATTTTTCAGGAACTGTACTTGTATAATTATTGAAAATATCTTGTTCCTCTAATTACCTCAATGAAATACCCACATAGGTAATTCAATTTTGTCTAATATGTCTTGTGGTAATAAACAGTCTTTTTTTAGTTTTAAGAGCTTTCCACGTTTCCAACAAGTTGTAATATATAGTCATGAACTCTTGTTATCAGCTTCAAAATTGAAGAATGATATTGCATATTTTGATATT