Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_15559 LG4 9368283 9370760 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 9368297 missense_variant p.His291Gln
G/C 9368391 missense_variant p.Pro260Arg
C/T,* 9368553 missense_variant p.Arg206Lys
T/A 9368603 synonymous_variant p.Pro189Pro
G/A 9368710 intron_variant
C/T 9368724 intron_variant
A/T 9368725 intron_variant
A/C 9369082 intron_variant
A/T 9369123 intron_variant
G/T 9369253 intron_variant
C/T 9369307 intron_variant
T/A 9369397 missense_variant p.Gln177His
T/C 9369408 missense_variant p.Lys174Glu
G/A 9369875 synonymous_variant p.Ile74Ile
C/G 9369880 missense_variant p.Glu73Gln
T/A 9370172 intron_variant
C/A 9370258 intron_variant
T/C 9370467 intron_variant
T/A 9370482 intron_variant
A/C 9370554 intron_variant
C/A 9370741 missense_variant p.Gly7Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_15559.1
MAEKDDGVGLSLSLSLGVNQQSFKVNHMHHPQQQQQQLQHQPRPVPINHNKTLFADLFQLPDRSSDVIRGIDVKSTVECEEDNGISSPNSAVSSVSGGKRSERDDDNAALVASGERTSCSRGSDDDDGGGGDCEGGRKKLRLTKEQSMVLEETFKEHNTLNPKRKQALAEELNLKPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCENLTEDNRRLQKEVQELRALKSSPQMYMHMNPPTTLTMCPSCERGHSSSTSSPAAVHPVVPPTSRKLFGANIRRPVAVNTWPFDGSFPRP*


CDS Sequence:
>Vu_15559.1
ATGGCTGAAAAAGATGATGGGGTTGGGTTGAGTTTGAGTTTGAGTTTGGGAGTGAATCAACAGTCTTTCAAGGTGAATCACATGCACCACCCTCAACAACAACAACAACAACTGCAGCATCAACCCCGACCTGTTCCCATAAATCACAACAAAACTCTCTTTGCTGATTTGTTTCAGTTACCAGATCGGAGCTCCGATGTGATACGAGGAATCGACGTGAAATCGACGGTGGAATGTGAGGAAGACAACGGCATTTCGTCACCGAACAGCGCCGTGTCAAGCGTCAGCGGCGGCAAGCGGAGCGAGAGGGACGACGATAATGCTGCGTTGGTGGCCTCTGGAGAGAGGACGTCGTGCTCGCGGGGGAGCGATGACGATGATGGTGGCGGCGGAGACTGCGAAGGCGGGAGGAAGAAACTGAGGCTCACGAAAGAACAGTCCATGGTGTTGGAAGAAACGTTCAAGGAGCATAACACACTGAATCCGAAACGAAAACAAGCCTTGGCAGAGGAGTTGAATCTGAAACCAAGACAAGTAGAAGTGTGGTTTCAGAACAGAAGGGCAAGAACCAAGTTGAAGCAAACCGAAGTGGATTGTGAATACTTGAAGAGATGTTGTGAGAATTTAACTGAAGACAATAGAAGGTTGCAGAAGGAGGTCCAAGAGCTTAGGGCATTGAAATCATCCCCACAAATGTACATGCACATGAACCCTCCCACCACTCTCACAATGTGCCCCTCTTGTGAGCGTGGCCACTCGTCTTCAACGTCTTCTCCTGCCGCCGTCCACCCGGTGGTGCCGCCGACTTCTCGCAAACTGTTTGGGGCAAACATCCGGCGGCCGGTGGCCGTCAACACTTGGCCGTTTGATGGCTCATTTCCTCGACCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_15559::LG4:9370760-9372760(-)
ATAGACAATAATGTATAGCAATAAAATATACGAAATTTAACAGTAAGGTTAATTTTATAGATTATTTATTTACTTTTCATCTATTTAAAACTATTAGTTTTAATTGTTTTAACTTTCTTAGTATTTATTAGAATTTCAAACTTTTAGGAAGATATTATAAATGTTTTCTTAATTAGAAATATTTGAATATTGCATTTCAAATGTGTTTATTTCAATTAATTAAAAATTGATAAATTTTATTTCAGTAAAAGACCATGTTATAAGTGCTCTCTTTAAACGAGAAGCAATTGAGGTTAAACAATTATATTCAAATTTACAATGAAAAAAAAATATAATAAATTTTATTTTTTAAATTAATAACTGTTGTGATTGAACTGATAGTTTCAAAGTTACGACTTTTAAAATTATAGTTATGACCATTTATTTATGATTATTTATTTTCAGCAAGTATAGAATGTTAATAATTTTAGTATATTTTAATTGCCTCAACGACTTTTTTTTGGAATAAGTTTCTTCACCGGCATGATTCATAGTTGTATAGTTTTTTTTTTCTATGATAATTTATAAATATATTCAAATCACTTCTCTATTTTTTTTAGTTTACATAAATTTATTCTTAAATATGCTTTAAGTGTAATTAAATATTATTTTGTTTTGTTTTAATATTTTATTTTTATATCTCTGACATATTTTGTGTTAGTTTTTATTATTAAATATTAATGAATATAATTAAGGTAATAAAAATTATTCTGAATTATTTTTGTTGTGAAAAAAATTGATATAATCAGTTATTTACAAATATATATGGACTCAAAAATAGTCTTAGAATTCAAAAAAATAATTTAAACGTTTTTTTTTTAAGTTTTATTGGCAGTTGAGAGTAAAAATGGGAAGACTACTATTTACAAACTAGAAACTAACGCAATAATAAATGTTTTTCAATAAATATTTAATGGAATGATACCAGTTTTGTAAAGTCATTCATTACTGAAGCAGAATTTTGTTTGATAACATTGGAACTTCCAAAGCATGGAAGTGGAAATTATCTTTATGCCCTTGAAAAAATGAGTTGAAGAGAATGAAGTTCACGCGCTGACGCGGCCTGGGGCTCAATCCCATCCCTCTGCTACTGTTATACATCGTGATTTGGGGCTACCATGCCATTGAACATCCATGTCAAACGGGCCCCACACACCTTTACAAAATCCACTACAAGGCCCATCATGCTACAACTCTCACCATCTCCGATACAGTATTTCTAAATTTTCATACCATAATGATAAAAAATAAATTTTCTAATTTTATCTCAACACTTTATTTTAATAATAATAAATAATATATTTATTTATTATAACATAAATAAATAGGTGAAACGTGAGTTCACTCATCATCTCCACGATGATGAGGCGATGATGATGATGATTCCAAGCACATCACGTGAAACAAATGCACTTGCTCTTTCTGGTCAACATTGGAGCGAAAAAGTAGCAGTTTTTCATTAACAGAACTAGTTAAAGCTAATTAAGCTCTGGCATAATCAGTTACTAATACATGTATAGTAATCCAAATCCTAGTCCTAATCTAATCCAATCCAATCCCCAACACTAACTAACCAGGGTTAAAAAGTAACCCGAGGTAGAGTTCAAGAATCCAAATCCTAAAACATATACAGCATAAGATAATTATATTAAAATGCCTAGGATAACCATTTAAGTGATGATTGAGGCAATTTGTCACTCTGACCCAGGTCATAATTAACTCTGTACCATCCATTCACTAAATTGCTCTCTATCTCTCTCTCTCTGCATATATATTTAGTTCCATCCATCAGTTTCCCTACACTGCAAAAAAGCCAAAGCCTGTTACACACACTGCCACCAAACACCACACTTTTTTCCTTCATTTTGCCTACCCTAAATTACATCCCTTTTTTCTCTTCCCTTTTCTCAAGTGGCCAACCAGAAATACATTGCTGCTTGGTTTTTCTCTTCTAAAGAGAA


Gene Sequence:
>Vu_15559(-)
ATGGCTGAAAAAGATGATGGGGTTGGGTTGAGTTTGAGTTTGAGTTTGGGAGTGAATCAACAGTCTTTCAAGGTGAATCACATGCACCACCCTCAACAACAACAACAACAACTGCAGCATCAACCCCGACCTGTTCCCATAAATCACAACAAAACTCTCTTTGCTGATTTGTTTCAGTTACCAGGTACGAGGTTCTTCTTCTTTCATTGTTTTCTGATATTTTGTTTCTATATTCTCCTTGCTTTTTCACCCAAAAATAGTATTTTTTCACTTCACAAATTTTTTGTTCGTTTATCTCTTCACACATACAAACTCTCTTTCTTTTTCTGAAAAAAAAAAAATCTTTTCTTCCTCTGACTTTTTAAAGTTGAAGCCTGGTTGCTGATAGTTATATCTAACTCATTCATTCAAAAAAAAAAAAAACTTAGTTCAGATCCAGGTTTTCTTTGCACAAGGTTTGTAGAAACGTTTTTGCAACCCCGATTTTGGCGGTAACGTTTTTGGTGCCTTTGACTGAGATTATCTTTGCGTACTGAATATATTTTTAATCAGTTGTATTATTACAAAGCTTTTAATAAGGTTTGAAAAAATTATTGTATTTGATTTATTATTTATAAGAAGAATAAAATATAAAAAAATGAAACATTCGTGTAATGTTTATAATTTTTCTTTTTTTTTTCAGCAACATTTTATTTTCATTTCTACTTTCTATTTCTATTCTATTTATTTCTGATGTTTCCAAACAAATACAGATACTGTTATTTACAGAAATACCCTCTGCCGTGTCCTTTAATTACAAAAACTGCCATTCCTTAATAAACCTATTTGAAACTCTTGCATGTACAGATCGGAGCTCCGATGTGATACGAGGAATCGACGTGAAATCGACGGTGGAATGTGAGGAAGACAACGGCATTTCGTCACCGAACAGCGCCGTGTCAAGCGTCAGCGGCGGCAAGCGGAGCGAGAGGGACGACGATAATGCTGCGTTGGTGGCCTCTGGAGAGAGGACGTCGTGCTCGCGGGGGAGCGATGACGATGATGGTGGCGGCGGAGACTGCGAAGGCGGGAGGAAGAAACTGAGGCTCACGAAAGAACAGTCCATGGTGTTGGAAGAAACGTTCAAGGAGCATAACACACTGAATCCGGTTAGTTAGTGGCATTTGTGTAAATTCCTTGTGAATACAGATATTTTTTGAAATTTATTCTATTTATTATTATTAGAATTTATCTCAAAAGTTGTTATTACTAAATGAAATTTATTATTCATATTATTAGAATAATGATAATGATAATTATTTTGTTTTGAATTTTAGAAACGAAAACAAGCCTTGGCAGAGGAGTTGAATCTGAAACCAAGACAAGTAGAAGTGTGGTTTCAGAACAGAAGGGCAAGGTAAGATGTCTACAATAATTAATTAATATCTAAATTTAATTATTTTTTTTACTTTATGTAGCCTTTTATTTTTCTTATTTTTTAATTTTTATTTTGGGTTGTTTGATATAACGTTCAAAGCGGTGCCTGAGTCGCCACATGTTTTATGATATGTTGAAGCCTAACTGAAGTGCATATTAAACATAAAATAAGAAAATTATAATGTGGGTGCTATTTTCAATAAATATTAAAAAACTGTCGTTTTATTGAATGGTTTAAAATGACATTACGCATGTCATCTAATTGTTGTTAGCTTGGTTATAATTTTTTATAAGTATTTTATTTATTGAAGGGACAAATATAGATAGTATTAATTCTTGAAAGAGATGTTCATGTGGGATGGTTTCGTTGTTCCTCGTCCATGTTAATTATTAATCTAACTGTTTAAAATGCATTCAAAGCAACTTTAGCATAACGTCAAAACAAATAATGGGTTTGACTACCCTCCTTTGACAATGATCAACGACACAATTATGTTGACACAGATCCAAAATTATAATAATTAAAACAATTGTGTCAAATATCAAAGACATGGATAATAAATACAAAGGGCCACTCAAATATAGTATGTAGTTGTGAATTTGAATATCCATGTTTGGTTGGTTGGTTGTTTTGCTTTTGTGGTGTGATCATGTTCTTCTATGTTTGGTGTGGGATATCGTTTGTTTCAAAAGAACATGTGAACTATAATGTAACGATCTTAGTTGAATTGAAACAGAACCAAGTTGAAGCAAACCGAAGTGGATTGTGAATACTTGAAGAGATGTTGTGAGAATTTAACTGAAGACAATAGAAGGTTGCAGAAGGAGGTCCAAGAGCTTAGGGCATTGAAATCATCCCCACAAATGTACATGCACATGAACCCTCCCACCACTCTCACAATGTGCCCCTCTTGTGAGCGTGGCCACTCGTCTTCAACGTCTTCTCCTGCCGCCGTCCACCCGGTGGTGCCGCCGACTTCTCGCAAACTGTTTGGGGCAAACATCCGGCGGCCGGTGGCCGTCAACACTTGGCCGTTTGATGGCTCATTTCCTCGACCATAA