Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17059 LG4 31742257 31743307 PREDICTED: trihelix transcription factor ASIL2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   protein binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, DNA-binding transcription factor activity, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 31742376 synonymous_variant p.Pro40Pro
A/G 31742444 missense_variant p.Asn63Ser
C/T 31742469 synonymous_variant p.Asn71Asn
A/C 31742703 missense_variant p.His115Pro
G/A 31742764 synonymous_variant p.Arg135Arg
G/T 31743260 missense_variant p.Gly301Trp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17059.1
MDDMEDDARYPPKSFSLNRQNPSHRHKHPARAAPYHRPMPTRYDQPMVEVDDEDDENEHEDFNDDNDEGENGYDENDVVGYPRIPKKRKVVVASRVWGDKFLQLGRNSLRSEEWHEVAEKVSEELKTERSVTQCRSVLDKLKRKYKKEKTKMDEMGMGSCKWPFFKKMDMLMASSARQEYGLACGVDSGEYVFMNTRVYLNRSNGFDEMRDSPGESESDDDEEEEEFGGGGAADEEDETSFRVLADSIQKFGKIYEKIENSKRQQMMELEKMRLDFNRELELQKKQILERAQAEIAKIQDGDEEETDTSTENLSE*


CDS Sequence:
>Vu_17059.1
ATGGACGACATGGAAGACGACGCAAGGTACCCCCCTAAGTCATTCTCCCTCAACCGTCAGAATCCCTCCCACCGACATAAACACCCCGCACGCGCCGCCCCTTACCACCGCCCAATGCCCACGCGCTACGACCAGCCCATGGTGGAAGTCGACGATGAAGATGATGAAAACGAACACGAAGATTTCAACGACGACAACGACGAAGGCGAAAACGGGTACGACGAAAACGACGTCGTGGGGTATCCCCGGATCCCGAAGAAGCGCAAGGTGGTAGTCGCATCCAGGGTGTGGGGGGACAAGTTCCTCCAGCTCGGGAGGAACAGTTTAAGGTCCGAGGAATGGCACGAGGTTGCCGAAAAGGTTTCGGAGGAATTGAAGACAGAGAGAAGCGTGACGCAGTGTAGGAGCGTGCTGGACAAGCTGAAGAGAAAGTACAAGAAGGAGAAAACCAAAATGGATGAAATGGGGATGGGCTCTTGCAAATGGCCCTTCTTCAAGAAGATGGACATGTTGATGGCATCCTCTGCAAGGCAAGAGTATGGCCTTGCGTGTGGGGTGGATTCTGGGGAGTATGTGTTTATGAACACTAGGGTTTACTTGAACAGGTCCAATGGATTTGATGAGATGAGGGATAGTCCAGGGGAGTCTGAGAGTGATGATGATGAGGAAGAAGAGGAGTTTGGTGGTGGCGGTGCTGCTGATGAGGAGGATGAGACATCGTTCCGTGTGTTGGCGGATTCGATTCAGAAGTTTGGGAAGATTTATGAGAAGATTGAGAACAGCAAGAGGCAGCAGATGATGGAGTTGGAGAAGATGAGGCTGGATTTTAACAGGGAGTTGGAGCTGCAGAAGAAGCAGATTCTCGAGAGGGCGCAGGCTGAGATTGCCAAAATTCAGGACGGGGATGAGGAGGAAACCGACACTTCCACGGAGAATCTCAGTGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_17059::LG4:31740257-31742257(+)
AAAACATGTGTTAGAGTGACACAATAATTTTAATTTTAAAAAAAATTAATAACATGTGACATGTCATTTACCATGTAGGATAAATTTTAATGTCATGGAAAAAATAAGAACCAAAACTAATGTTTTTAAAAATAAAGTTATCAAAGTTTCTACGAAAAACTAATTTCAATTTTACGTAATTATGAACAAAATCATATTTTTTCTTTTTAGATAATACTTTTTGGAATGTGTGGAAATCTAAACATTTTAAAAATCTAAGGCTTTGTTCTTTTGGGTGTATTTGGGGGAGATGATTTGAATGGATTTGAGTGGATTTGAGGATAATTTTGTAGTTGTTTTTTTGAGTGGATTTGAGGGTAATTTTGTAGTTGTTTTTTTGAGTGGATTTGTGGGTAATTGATAGTGGATTTAGAAGTAAAGTTTTTTGAGAATTAGTGTAGGATTTGATTGATGTGATAGATTTAAAAAATTAGTTTAATTGGTAGAAATTAAAGATTATCAAAATGTCCCTATTTATTAAAGTAATATAAAATGTTATTTATTAATGTTATATTTAATTGTAAAAATGTTTATAAAGAGACAAAAATTATAAATAATTTTTAAAATTAATTTTTAAAAATTATAAAAATTATAATGTAGTAAAATAAATTTATTTTTAAACTTAGTATTTGTTTGTAATATAATTTACTACCAAGTAGTATCAATTTATTTGTAATATATCAATCAGGGAGGGTTACTCCCTACACTACCCCACTTTGCTCCCTGCACCACCATATTTTTTTTTTAAATTTCAAAACTATCCTTTATATTTTAAAATATCCTACACTCCCACCTCTTTTCTTCAACGGATGTCTAATCTATTGAAAAAAAATATTGTTCAACGGATGTGCCACATCTGTTGAGTTTTTTTTTTTAGTTTTTTTAATTTATTGTATTTTAAATTAATATATAAATATTATTTAATTTTTTAAAATTATTACTTAATTATTTATAAATTAATTTTTTTATTTAATAAAATAATAATTATTAATTTAATTTATGTATTATTATTTAAATAATAATTAAAATATTTTTTATAAATATATTAAAACGGATGTGGCGATATTTGTTGAATTTTTTTTTTAGTTTTTAGTTTTTTAATTTTTTGTATTTTAAATTAATATATAAATATTATTTAATTATTTTAAAATTATTACTTAATTATTTATAAATTTATTTTATTTTATTTAATAAAATAATTATTATTAATTTTAATTTATGTATTACTATTTAAATAATAATTAAAATTTTTGTTATAAATCTACTAAACGGATGTGGCGAGATCCATTGAATTAGTTTTTTTTTTTAGTTTTTAGTTTTTTAATATTTTATATTTTAAATTAATATGTAAATATTATTTAGTTTTTTTAAAATTATTACTTAATTATTTATAAATTAATTTTATCTTATTTAATAAAATAATTGCTATTAATTTAATTTATATATTATTATTTAAATAATAAATAAAATACTTTTTAAAAATCTATTAAACGGATGTGACACATCGATGTGGCCACATCCGTTAAAGTTTTTTTTTTTTAAATAAAAACTATAAACTAAAATATAAAATATGTAAACGGATGTCAACAGATGTGAACATCCATTAAAGTTAAACGGATATTAACATCTATTTTATAGAAAGGTAAATTAGATATGATGGTGCAGAAAGTGGTTGATGGTGGTGAAGGAAGCAACTCTCTCAATCAGGCCGCTTAAATTTCTGATCCATACCCAAAGGCCACTATTTTCAGCCCAAACACTATTCCTTCGCAAACACAAAATAAGGAAAGAGAAAAAGTGTCTGAAGATCGAAACATTCCCCAAATTTGACACCACACAAAAACCCTAACCCAATTTCACCCTTCACCGATTAAATTCTCCTATCATTCCTTAATTTCTTCACTTAAAATCGCGATTTTTATTCGTGGAATCTGTGCGATCCCAATAATCACACACTCCCA


Gene Sequence:
>Vu_17059(+)
ATGGACGACATGGAAGACGACGCAAGGTACCCCCCTAAGTCATTCTCCCTCAACCGTCAGAATCCCTCCCACCGACATAAACACCCCGCACGCGCCGCCCCTTACCACCGCCCAATGCCCACGCGCTACGACCAGCCCATGGTGGAAGTCGACGATGAAGATGATGAAAACGAACACGAAGATTTCAACGACGACAACGACGAAGGCGAAAACGGGTACGACGAAAACGACGTCGTGGGGTATCCCCGGATCCCGAAGAAGCGCAAGGTGGTAGTCGCATCCAGGGTCCTACGAATTCGCGCCACGTTTCAAATTGTCGTACGGTTCGCGTGGTTCGGGTTCTTCCGGTGAAGAGTGGAGCGAGCACGAGACTTTCGTGCTACTGGAGGTGTGGGGGGACAAGTTCCTCCAGCTCGGGAGGAACAGTTTAAGGTCCGAGGAATGGCACGAGGTTGCCGAAAAGGTTTCGGAGGAATTGAAGACAGAGAGAAGCGTGACGCAGTGTAGGAGCGTGCTGGACAAGCTGAAGAGAAAGTACAAGAAGGAGAAAACCAAAATGGATGAAATGGGGATGGGCTCTTGCAAATGGCCCTTCTTCAAGAAGATGGACATGTTGATGGCATCCTCTGCAAGGCAAGAGTATGGCCTTGCGTGTGGGGTGGATTCTGGGGAGTATGTGTTTATGAACACTAGGGTTTACTTGAACAGGTCCAATGGATTTGATGAGATGAGGGATAGTCCAGGGGAGTCTGAGAGTGATGATGATGAGGAAGAAGAGGAGTTTGGTGGTGGCGGTGCTGCTGATGAGGAGGATGAGACATCGTTCCGTGTGTTGGCGGATTCGATTCAGAAGTTTGGGAAGATTTATGAGAAGATTGAGAACAGCAAGAGGCAGCAGATGATGGAGTTGGAGAAGATGAGGCTGGATTTTAACAGGGAGTTGGAGCTGCAGAAGAAGCAGATTCTCGAGAGGGCGCAGGCTGAGATTGCCAAAATTCAGGACGGGGATGAGGAGGAAACCGACACTTCCACGGAGAATCTCAGTGAATGA