Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18590 LG4 60397422 60399648 PREDICTED: transcription factor bHLH3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, negative regulation of gene expression, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity, DNA-binding transcription factor activity, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, protein binding, DNA-binding transcription factor activity, protein dimerization activity, transcription cis-regulatory region binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18590.1
MMGEKFCLNEEDKGVLESVLGAEAVAFFISALSNNVFSSVVAPSVGADSTLRQRLCQLVDGSKWNYAVFWQVAGLKSGGSALIWGDGHCSDPKGKRSSMGKDDEQEVRKMVLQKLDACFGGSVSKEANYARLDRLSDLLMFYLSSMCYIFGFDSPCGPGSSFKSGKWIWTSDAAACLNQLESRSFLGKVAGLQTVVFVPLKSGVVELGSNEVVSEEQGFVEMVKTAFGESSPGQTKVFPKIFGHELSLGDTKSQSITISFSPKVEDDPGFTSDSFEVQALGLNHAYGNSSNGTLGDSSEGKMFPQLNQMMGGNFNAQARVPCLDLGNEDTSSIHADERKPRKRGRKPANGREEPLNHVEAERQRREKLNQRFYALRAVVPNISKMDKASLLGDAITFITDLQMKIKVLEAEKNMINNKDQKLSLPDMDFQEREDDTVVTVRCPLDTHPVSDVVKTFREHQIVAQDTNVSTTDDKIIHTFSIRTEGGEAAAIQLKEKLEAALSKN*


CDS Sequence:
>Vu_18590.1
ATGATGGGGGAGAAGTTTTGTCTGAACGAAGAAGACAAGGGTGTGTTGGAGTCTGTATTGGGTGCAGAGGCTGTTGCGTTTTTCATTTCAGCACTTTCCAATAATGTCTTTTCCAGCGTTGTTGCTCCTTCTGTCGGTGCTGACTCGACCCTCCGTCAGAGGTTGTGCCAGCTTGTTGATGGTTCCAAGTGGAACTATGCAGTGTTCTGGCAAGTTGCTGGCTTGAAATCTGGTGGTTCTGCCTTGATTTGGGGTGACGGGCATTGCAGTGATCCCAAAGGGAAGAGGAGTTCAATGGGGAAGGACGATGAGCAGGAGGTGAGAAAGATGGTGCTGCAGAAGCTTGATGCCTGTTTTGGTGGGTCTGTGTCGAAAGAGGCTAATTATGCAAGACTGGATAGGTTGTCTGATTTGCTCATGTTTTACTTATCCTCAATGTGTTACATATTCGGTTTTGATTCGCCATGTGGTCCTGGGAGTTCATTCAAATCTGGTAAATGGATTTGGACATCTGATGCTGCCGCTTGTTTGAATCAATTAGAATCTAGATCATTTCTAGGGAAAGTGGCTGGTCTTCAAACTGTTGTTTTTGTTCCTCTGAAATCTGGGGTGGTGGAGCTTGGTTCGAATGAAGTGGTGTCCGAAGAACAGGGTTTTGTGGAGATGGTGAAGACAGCATTTGGGGAATCCAGTCCCGGGCAGACTAAGGTGTTTCCGAAGATTTTTGGGCACGAGTTAAGCCTGGGGGATACAAAATCTCAGTCTATAACCATTAGTTTCTCCCCAAAGGTGGAAGATGATCCTGGTTTTACTTCAGACTCTTTTGAAGTTCAAGCACTGGGGTTGAACCATGCGTATGGAAATTCATCCAATGGAACTTTGGGGGACAGTAGTGAAGGGAAGATGTTCCCTCAATTGAATCAAATGATGGGTGGGAATTTTAATGCCCAAGCAAGGGTTCCTTGTCTAGATCTTGGTAATGAAGACACGTCCTCAATTCATGCAGATGAGCGGAAGCCCAGAAAAAGAGGTAGAAAACCTGCCAATGGGAGAGAGGAACCACTGAATCATGTTGAAGCAGAGAGACAGAGACGTGAGAAGCTTAACCAGAGGTTTTATGCCTTAAGAGCTGTTGTCCCCAATATATCTAAAATGGACAAGGCATCTTTGCTTGGTGATGCCATTACCTTCATCACTGATCTCCAGATGAAGATCAAAGTGTTGGAAGCTGAGAAGAACATGATTAACAACAAGGACCAGAAGCTATCCTTGCCAGATATGGATTTTCAGGAAAGAGAGGATGACACAGTTGTGACAGTGAGATGCCCTTTGGATACTCACCCTGTTTCTGATGTAGTTAAAACTTTCAGGGAGCATCAAATTGTGGCTCAAGACACCAATGTTTCTACTACTGATGATAAAATCATTCATACATTCTCCATAAGAACTGAGGGAGGGGAGGCTGCTGCCATACAGTTGAAAGAAAAGCTTGAAGCGGCCCTATCCAAAAATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_18590::LG4:60399648-60401648(-)
TTATTAGTAAAAAAAATCATTTTAATTTTAAAAAAATAGTTCCTAAAAAGTAAAATTGAGAATATAAAAATATTAAGCTTTAAAAATTATCAAATCGAAAAAAATTAAATTTTAAAACATAGTCACTTAAAGAATAAAATAATTATTTAAATTTAAAAATATTTACATCAAATATATAATTAAAAATAAATATAAAAGCAAATAACATATTATATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGGTTTGCTAACGCGCCTATGCCTGTTTTTCAGTTGATACATTTTAGCAATATGTACCGGATTTTAGTAGACAAAAATACCCTTATATATATTATTGATTCCAAGTTTTAAGGTTAAGGGTATTTTAATAATTTTCATTCTCAAAACTTAAAAAAAAAAAAGAAACCCCCCAAACCCTTACTCACCTCTCTCATTCCTCTTAATCCTTTCTCTTTCATCTCTCTCACTCCAACCTTTTCTCTGTCATTCCTACTGTAGCCCCAATTGAAAAAAATCAGAAACACATACCAATTCTTTCGGATGTCATTATGCTTGTGAAAATTAGATAAAATTATATACGACAAAAATTATAAAATGAAAACTCATTATAAAGTCATTTTTTTGTAAGAAATTGTTTAACAACTGAGTGTTTCTGTGCCAATTACCAACTCCTCTTATGTCATTATGCTTGTGAAAATTACATAAAATTAGATAAGACAAAAATTATAAAATAAAAACTCATTATAAAATCATTTTTTGTAAGAAATTGTTTAATAGCGAGTATTTCTGATTTTTTTCCAAGTCAATTACCAATACTTTATGCTTGTGAAAATTGGATAAAATTAGATAAGACAAAAATTATAAGATGAAAACTCATTATAAAATCATTTTTTTGTAAGATTGTTTAACAACAAGTGTTTCTAGTTTTTTCAATTGGGGCTACAAAAAATTGGAGTGAGAAAGAGGAAAGAGAAAGGGTTGAGAGGAATGAGAGAGGTGAATAAGGGTTTAGGGGATTCTTTTTTTTTTTAGTTTTGAGAATGAAAATTATTAAAATACCCTTAATCTTAAAACTTGAATCCATGATATATAAGGATATTTTTGTCTATTAAAACCCGGTACACATTGCTAAAATGTACCAACGCCTTAGCAAACCCCTATATATATAATATGTTATAGTTGAGTAAGGAGCATTGGATGAGAGAACTCTATATATAATATGACATCATTTTAATAATGATACATTAACAATATTTTAACATCATCTATGTGTCATTTTGTGATTGGTCATGGTTAGTGTTTATAATTATTATTATTATTGATTGTGGAGTAATTTTGAACCAATCACAAAATGACACGTATTGTCAAAATATCATTTTCCATCTAATATAATATATAGATACCTTAATTATTGAAATCTCTATCACACAACATCTCATAATTTTTATTTTGGGGTACACACTTTATCTAGTACACATGATTTCCAATCAAATTTTTAACAACAATAATTGTTCTTTTTGTCTATTATGATTAGTGTCCCAGAAATTAATAATTTAAATTTATATGATAGAAAATGACTTTTCTTAATCATAAGGAGTTAATTTGCGGCACATTTAAATTTAGCAAGATTAAGAAAACCTTTTCAAGGATTAATATAAGTTTTTATATTATTAAAAAAACTAATTCAAACAAATTAACATCTGAAACAATTTTACATCCTTAGTTAATTAAAAAATATTTTTTAAGAATAAATTGTTAAGTTTGAAATTAACTGCTTCATAAAGATACACAATGCAAATTTTATTAAAATTCTTTAGATTAATAAGTATTAAAATAATTAAGTCTTATTATTAAAATTTTATAAGATATTGTGTATAAGAATATTTGTGGTTCAATGTTTTCTAATCAGACTTTAGAGGACATATTAGTGCCACCGTATAGTGAACCAATGCAATAATAAACGTTAATAGG


Gene Sequence:
>Vu_18590(-)
CAAAGTAAAAGAAAAAAAAAACTAAAGGAAAGAAGAACAAATAGCTTAATTCCAGATCTCAGACGGAACTTCTTTCTCTGGTTTTCCAAATCTTATATCTGTTCAAAGTTTTCTCTATCTACCTATTCGTCATACACCACGCCAAATCAATATCGTTCAGGTAATTCTGTTTTTTCTTTTGTTTTTATGCTGAATTTGTTTGTTCCTGGTAAACATTTTTCATTGGGTTTGCGACTTACTAAGCTGGAGCTCAAGACTAAGTTAGACTGGTGGTGATAATCATCCTTTATATGTAATTGGAAAGACACATGTCATGAATTTCAGAAGTTTGTGGGGTTTGGTTGGATATTCTCAAGGTTTTAATTTTAGGGTTTTTTTATGTAAATTTTGGGGTTTTGGAAATTTAAGCTTGGGTGAGATGCCAGTGAAACGTTTTTGAGAATTGTTTTTTTGATCTTGATATATATGAAGTAGGAGGGAGGAAGAAAGATGATGGGGGAGAAGTTTTGTCTGAACGAAGAAGACAAGGGTGTGTTGGAGTCTGTATTGGGTGCAGAGGCTGTTGCGTTTTTCATTTCAGCACTTTCCAATAATGTCTTTTCCAGCGTTGTTGCTCCTTCTGTCGGTGCTGACTCGACCCTCCGTCAGAGGTTGTGCCAGCTTGTTGATGGTTCCAAGTGGAACTATGCAGTGTTCTGGCAAGTTGCTGGCTTGAAATCTGGTGGTTCTGCCTTGATTTGGGGTGACGGGCATTGCAGTGATCCCAAAGGGAAGAGGAGTTCAATGGGGAAGGACGATGAGCAGGAGGTGAGAAAGATGGTGCTGCAGAAGCTTGATGCCTGTTTTGGTGGGTCTGTGTCGAAAGAGGCTAATTATGCAAGACTGGATAGGTTGTCTGATTTGCTCATGTTTTACTTATCCTCAATGTGTTACATATTCGGTTTTGATTCGCCATGTGGTCCTGGGAGTTCATTCAAATCTGGTAAATGGATTTGGACATCTGATGCTGCCGCTTGTTTGAATCAATTAGAATCTAGATCATTTCTAGGGAAAGTGGCTGGTCTTCAAACTGTTGTTTTTGTTCCTCTGAAATCTGGGGTGGTGGAGCTTGGTTCGAATGAAGTGGTGTCCGAAGAACAGGGTTTTGTGGAGATGGTGAAGACAGCATTTGGGGAATCCAGTCCCGGGCAGACTAAGGTGTTTCCGAAGATTTTTGGGCACGAGTTAAGCCTGGGGGATACAAAATCTCAGTCTATAACCATTAGTTTCTCCCCAAAGGTGGAAGATGATCCTGGTTTTACTTCAGACTCTTTTGAAGTTCAAGCACTGGGGTTGAACCATGCGTATGGAAATTCATCCAATGGAACTTTGGGGGACAGTAGTGAAGGGAAGATGTTCCCTCAATTGAATCAAATGATGGGTGGGAATTTTAATGCCCAAGCAAGGGTTCCTTGTCTAGATCTTGGTAATGAAGACACGTCCTCAATTCATGCAGATGAGCGGAAGCCCAGAAAAAGAGGTAGAAAACCTGCCAATGGGAGAGAGGAACCACTGAATCATGTTGAAGCAGAGAGACAGAGACGTGAGAAGCTTAACCAGAGGTTTTATGCCTTAAGAGCTGTTGTCCCCAATATATCTAAAATGGACAAGGCATCTTTGCTTGGTGATGCCATTACCTTCATCACTGATCTCCAGATGAAGATCAAAGTGTTGGAAGCTGAGAAGAACATGATTAACAACAAGGACCAGAAGCTATCCTTGCCAGATATGGATTTTCAGGAAAGAGAGGATGACACAGTTGTGACAGTGAGATGCCCTTTGGATACTCACCCTGTTTCTGATGTAGTTAAAACTTTCAGGGAGCATCAAATTGTGGCTCAAGACACCAATGTTTCTACTACTGATGATAAAATCATTCATACATTCTCCATAAGAACTGAGGGAGGGGAGGCTGCTGCCATACAGTTGAAAGAAAAGCTTGAAGCGGCCCTATCCAAAAATTGACCATGAGATCATATTTATGTAGCATCTCAATGATGCTTTAAGTCTTCTTAGAATTACCCTCAGTTTGTCTGATAGGCTGACATGATTATTCTTAGTGTTATTTGTTACTTGTAATCTGTTTTAAAATGTATTCAGATCATCATCAATAACCTTAATTATGTACCTAAGTAAATTAGTGGTTGAATTTCAGGAGATGGATAATACAAGTTGAACTATATTTTCT