Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19813 LG5 13354281 13358664 PREDICTED: myb-related protein 305-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 13354418 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ala46Ala
A/G 13354547 intron_variant
A/T 13354855 intron_variant
T/A 13355055 intron_variant
T/A 13355056 intron_variant
T/G 13355062 intron_variant
G/A 13355298 intron_variant
C/T 13355377 intron_variant
G/A 13355409 intron_variant
G/A 13355710 intron_variant
A/C 13355835 intron_variant
A/T 13356007 intron_variant
A/T,* 13356019 intron_variant
G/A,* 13356024 intron_variant
A/T 13356621 intron_variant
A/G 13356661 intron_variant
A/C 13356787 intron_variant
C/T 13356942 intron_variant
C/A 13357061 intron_variant
A/T 13357063 intron_variant
G/A 13357180 intron_variant
G/T 13357229 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19813.1
MDKKLSSVSHDPEVRKGPWTMEEDLILINYIANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEEQLLIMELHAKWGNRWSKIAKQLPGRTDNEIKNFWRTRIQKHMKQSESFQQQSNSETNDHQAFTSQVSTIAEPMETYSPSCYQGMLEPFSTQFHTNPDQSSCCTNDNNNYWSMEDILSMQLANY*


CDS Sequence:
>Vu_19813.1
ATGGATAAGAAACTATCTAGCGTGTCTCACGATCCTGAGGTGAGAAAGGGACCATGGACAATGGAAGAAGACTTAATCTTGATCAACTACATCGCAAATCATGGGGAAGGTGTTTGGAACTCTTTGGCCAAAGCTGCTGGTCTTAAACGTACTGGAAAAAGCTGCCGGCTCCGGTGGTTAAACTACCTCCGACCCGATGTTAGAAGAGGGAATATTACACCCGAGGAACAGCTCTTGATCATGGAGCTTCATGCAAAGTGGGGAAACAGGTGGTCCAAAATTGCCAAGCAGCTACCCGGAAGGACTGATAATGAGATCAAGAACTTCTGGAGGACAAGGATTCAGAAGCACATGAAGCAAAGTGAGAGCTTTCAGCAGCAGAGTAATTCTGAGACAAATGATCACCAAGCTTTCACTAGCCAAGTGTCCACCATTGCTGAGCCCATGGAGACCTATTCTCCATCCTGTTATCAAGGAATGCTAGAACCATTCTCAACTCAGTTCCACACAAATCCTGATCAATCCAGTTGTTGTACAAACGACAACAACAACTACTGGAGCATGGAGGATATCTTATCAATGCAGTTAGCCAATTACTAA


Promoter Sequence:
>Vu_19813::LG5:13352281-13354281(+)
TCACCGTAGCAGCACTTCACCAGCTCCACAAACGAGAGTTTCTCAAGCCAAACAAGAACACACAATTCTCAATGATTTCTGAGCTCTAGAGCATAAGGAAAGAGTTGATGTTGAAGGAAAATGAGAGCCTATTTATAGACTCAAGCAAATACTCTTTCGTTCTTCGTTTCCAGCCATTTAACGCTTTTAATTGATAATATTAGTGTTAATCGATTAAAATGAGCACTTTGGCTAGTTTTAACGGCAAGAAAACTCCAATGGTCAATTTTAATCGATTAAAAGGTATTTTAATCGATTAGCTAATAGATTAAAATGTATTTTAATCTATTAAATCGAAAAAGTTTGAGTTTTCAGCTTTTACTCGTTTTAATCGATTAATACTTGTTTTAATCGATTAATACTTGTTTTAATCGATTAAAACAGTGCCATTTTGACTCTGGACATCAACTATATAATATAAAAGTACATAGAATCAAAACCACTAAAAATCTAAGTCCTAGACACTGAACTACAATTATTACAAAAGTTTTCCATTGCAATACAAGTCTTCATAATATCTTCTTGAATCTTGATTTCTCTTGACTTGATTTGGACATCATCAAAACTTCATCTTCATCATTTTGCTAACACTAAGTGGGAAGTACCCCAAGGAGGTTATAAGTGACAGATGTGTGATGGGACTTTATCGTGTTGGTTGTCTTCTTCTTCATTAAGGTTTCCTGTTTACTGTTTTGTGTTGGCAGTAGCTTGTTTATGGGGGACCACAACGAAAGCAACCATAAACCCAACGAAAGCAATGGTGCACGCACCTTCGAATGGAACCTACTTTGCACTTCCAAATACCCCATGAATAATGCGAAAAGTGTTTCCAAATCACCAAATGTGATTCTGCTTTTGAAAGCCCCAACTGCGATTTTTCACTCTTCGTCAACTCAGGAACACTCTATCTCAAATGCCCTAATTTGATTTCATTCACAACAAAACCTGTAATTTTATTTCATTCACAAAACCCCTAAATCAATTATGATTTTCATTTCCCCAATTCCATAACCTAATTCCATGTCACCCTACATGTCATTCACATCTCATTATCAATATTGCCACGTTTTAATTGTTTACTGCGAAATCATCAATCAGTTAACACCGTTAGCCTGTATTTAACGGAAAGGGCTTAATTGAGGCAAATTTTTCTACGTTTGGATGCAATTGAAACTTTTAAATATAACATCACATTTTTAAGTCGATTTTCTTGTAAATAGACTTAAATTCACAAAATTAAAATTGTCTTTTTTTCGTTAGTGAGTGAACTTTAAATCTAATTAAAACCAACAAAATTGACTTGTGAGGTGAGATTTACACTTACTTATTTACTATGAAATTGTCTTATCTTTAGTTGATGTGGATATCTAACCTATCTAAATAATCTTTTGATTATCTTAATGTCCAATAGGATCTTTCTTAGGTTTTCTTTACCATTAATCCAATATTTCTAAATAATTAAAATGTGTTTTCATCACTAGTTGTATGAATATTCTTCCTCTTGGATCTAGGGGAGATCATATTTTGCTCTTGATATTTGCGTAGGATCAATGGAATTAAGCTCTCACTCCCCATAATTTAAAGCTTGTAATGTAACCTCTAAGGCTGGTAATATTTACACAACATCTTTTCTTCACTCTTCTTTTTAAGAAAATGTATACTGTACACACCTGATGTTTAAATATGGAGTGCATGTGCGCGTAACTTGAGAGTACGTAAAGACACTCGTCTCTTATAGTATGCCAGGGAAAACAAAAATCATAGTCATGCATGCATGTGTTGACATGAGAAACATAGTTAGGTACGTGAAAGCATGTCGTTATCCTTAATAGAAAATTTTCATTACAATTACCAAATGACATAGCCTTGCCTCTATTTAAACCTGCCAAACTCTTATTAACATTTCAATATCTCTTCACCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCCATTTCCTCGTACTAAATAATA


Gene Sequence:
>Vu_19813(+)
ATGGATAAGAAACTATCTAGCGTGTCTCACGATCCTGAGGTGAGAAAGGGACCATGGACAATGGAAGAAGACTTAATCTTGATCAACTACATCGCAAATCATGGGGAAGGTGTTTGGAACTCTTTGGCCAAAGCTGCTGGTAAACATACTTTTCATTCTTCAACTTTTATTATTATTATTTTTATTATTATTCTACTATTTTCTTCTTTTTTTCTCTCTCTTTTTAGTTCTAACTAAGCCCTATGGTTGCGAGAGAATGATGGATCATCATGCTTTTGCAGGTCTTAAACGTACTGGAAAAAGCTGCCGGCTCCGGTGGTTAAACTACCTCCGACCCGATGTTAGAAGAGGGAATATTACACCCGAGGAACAGCTCTTGATCATGGAGCTTCATGCAAAGTGGGGAAACAGGTGAACTCATGATGCAATTTATATATCAATAATAAGAAGAAACTTGTTAAAAAATTAACATAGTGCATGAGTCCACCACCAAGATCTTATATTTCAAATAAGTGATATTCTTACACGGAAAAATATTTTAAAGGGTAAATGGTAATTTTTGGTTTATGATCTCAAATAGACCATTTTTGTTCTTATTTTATTATTGTTTTTGTAATCTTGGTTCTTCATTTTTCAAAATTTTCTTTTTTATTCGACCTTCAAGTTTATGTACGTTTTATTTCTTTTACATTTTACTTAACTAATTTTTCTTGTACCTGAACTAAATATGTTGAATTTAAGGTTTAATTAGTCAAAAAATATTAAAAAAAAAACTTGAAAATTTGACCATACCGTTTTTCAAAATGTGGATACTAAAATTTATAACAAAAATGAAAGGGAAACCTTCTTCGTTTTCAAATGGTGAAAGGAAAACTTTATTGGTCTCTTTAATATTTTGGAGGTATCACATTAGATGACAAGTTAGTACATTCTTAGAAAACTATTTCTGATAGAAGGATATAACTGTAGCAAGAGCAAGATTCCACAATAGGGTTTTGTTGAACTTATAGACATTTCGTGTTTATATACGAAATTTTAGAGCTTCCAAAATGATTTCGATTTCCATCTTTATGTACATATTGTGCATCTATGCTCACTGTGGCATTCAATCTTCCGCTTTCACATCATGGTTATGATATAAAAAACATAAGACATAGGTAGTTAATTTTTCCTGCGCATAAAAAAAAAGGTGGTTAATTTTTCTATGGATTATTTTAAATCTTCTTTTTTTTCTCTTTGATTTTGAATTATGTGTAGCTCTAATATTGGTTCGGGTGAATTTTGGTTTTTACTTCATACCAACTTTTCATGTTTTGTTTTAAAAAAGTAAATTTTAATAATAAATAAAATTCGAGATGTTGCTGATCAGGGAAGAGAAATACGATTTGTAAACAACGACAGTAGAGTTATCTTCCAAAAGAAGAAGAAAGTACACTTCAAGTTTTTAGTCAGCATCTATTATTTTTTAAAGAAAAGTGTTTCCTATTATATTTTATGTTCTTACATCGCTCCCTAATAAGTAATGGTAAAAGTTTGAACATGTAGAAGAAAAAAAAAGAAGATATATACCTCTGAAATGAAAATAGACGTTTTAAAAGGAAAAATTAGAGAAAAATGATAGATGCATATAATGATAGAAAGAAATCACAAATTGAACATTTTATATTTCATAGAAGTTTTAAGTAGTTTTCTTTTTAAATATTGCAACTAATGAAATTTATTTATAAATTTACGATTTAAAAAGAAAACTTTTAGAAAGGAATTTCATGTATACTTTTGTATGAACTTTAAAGTTTCATGAAACATGTGTAAAAAATAGTTCTATAAAATAGAAATGTTAATAAAGAATTAGAACGATATAAAAATTAAATATATATTTCTAATATAAATTAAGAGTGTGTGGAAAGTGTAATAAGAAAAGGAAATAAAAAATGAAAAGAAGAGGAAGATAAAACTGAATTATAAACTTTTAGTAAGCACCATCTAACATATATATAAAATGTACCAATCATAACACCCTATTTCTTATGTATATTATCTATTTCATATGTTACTGGAAAGCAAAATATAAGGCTCAATTAATAAATAATATTAATATATTTTATTTTGATCTACTATATTTATATATATATTTAAAATTATTTATTTAAGATATTATTATTTAAAGTAAGTTTAGTAAACAATAAGGAATATGTATCATGAAAAACCCAGAGAAAGAGGTGTAGGGTTATTATTAAACCATACTGAAATGAAAAGAAAAGTTATATAAACATTTCTAATCAAAGAGACAAAGGATAATATACGAGAAGGCAAACTTGAATATAAATTGAATGAGAAAATAAAGAGGTATAGGTAGTTGTAAAGCTTTTAGTGGGGGAAAATCATGAGTAATATGTGGAGAAGGTAAAGAAAAAAGACCAATTATGAAGTTATTTATCAACATTTAGTAATATCTATATAAATATAAGAATAAAAGTTTATCTACTAAAGGAATTTAATTTTACAAAATGGCTATTATAAGCAACCTAGTGAAGGAGAAGGAAGTGAACTAGAGGAGGGGACCTTCCATTAATGGAAGTGGGCACACTTTTACATCTTTCGTGTTCCAATGAAAGGAAACTTTTGTTAGGGTTTAGGTAGTGAAAACGGACCCAAACCATACCGTGTTGGCTTTTCTTGACTAGGGCAGATGTCCTTGTAAATTAACATTCTCCCCTTGAGGTTAAGCTCAGATGGTGCATCCTTAACCTAACTATAGCTCCATCGTCGTACCGTTCTCACTATCCATTTTTTCTCTCAGCCTACAGACAAACCAAAACCTCTAACATCTCACATTCATATTACATCCTTAAACATAACATTACTCTCAGGAATCATACACACGGTCCTTTTCAACATAGTCAAACCTGTTTTAAGAAGGCAATTCCAAGAAAAGATGAGTGGGGAGCGGGGTGTTCAAATTTCGAAGAAAATAAGTAATTGCTTACACGAAAAGCTTTTGTAGATAATGGAATGAAAAGAGGTACAAGAAAAGATAAGAGAGATTTGAAGCATATACTCTCTACCCGAGGCATGCATTGAGAAATCTGATTTTCTTATCTTGTAGCCCTGCTATACATCAAAGGAAACTCAGAAATTCAGCATCTTTGCGTACCTCGATAATGATCGTTTTATAATGGTCACATTGATTCTCAGCCATTGAACATGGCCTCCTTTCAGACTGATCCTATTTATTATAGGAGCTGCCACTTTTTTACTAATCAAAATGAAATGCTTCAACAACCTCAGGTAGCTTTTAATTTTATTTCAACTAATTAATACCTTCTTGTGTCAGCACAATCACACAAAGTTGGTGTCTGCACATTAAATAGTTGTCTGCTTATAAAATTCTACAACAGTATTTTTCTAGCTTGCAATTTAGCTTCGAACTATTCATTCATTCATTTCCGACTTTTATAAATTAAAAATATCGAACAAAAAGTCTGTAAATTTTATCTGTATCTTAATGAAGCTTATATAATGGATTTTAGCATAAGTATAAATTGCTTTTGTTTGTTTACAATTAAAAACTAGTTTAAAAAGTACACTCATAAGCTATTCAAAATAGTTTTTAGTTTTAATAATATTTCTAACTTTTAATTATTTTTAAAAGCTGAAACAAATGCCCAATTGTTTTTAAAAGATAATACTTTTACGGGGAAAAAGTTGCAACAAACGGGTTTTTGAGATTAAAGGACTATGCACTCCTATTAAAATCAAAGCATTTTACTTTTCCTTTATAGTTATTTAAAAATAAAAATTAGATAAAAAAACAACTTTGAGAGTTATTACAAACTATTCTACCTAATATTCTCCTAGTCAATTAGCTTTCATACAAAAAGAGCTGAATATATAAAATGTGGCAAATATTTCTTTATTAATATTTGTTAGGTAGGTATCTGAGATTTACTCATTTCAGAATTTTGACTTTAAATTCTTACATTATGACAAAACCAGTACATTAATAGTCAGATATTTTACTGTCTTTCACAAATCACTCATTTTCCAACGCAGGTGGTCCAAAATTGCCAAGCAGCTACCCGGAAGGACTGATAATGAGATCAAGAACTTCTGGAGGACAAGGATTCAGAAGCACATGAAGCAAAGTGAGAGCTTTCAGCAGCAGAGTAATTCTGAGACAAATGATCACCAAGCTTTCACTAGCCAAGTGTCCACCATTGCTGAGCCCATGGAGACCTATTCTCCATCCTGTTATCAAGGAATGCTAGAACCATTCTCAACTCAGTTCCACACAAATCCTGATCAATCCAGTTGTTGTACAAACGACAACAACAACTACTGGAGCATGGAGGATATCTTATCAATGCAGTTAGCCAATTACTAA