Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_20110 LG5 18335591 18340243 PREDICTED: adenylyl-sulfate kinase 3
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   hydrogen sulfide biosynthetic process, sulfate assimilation, hydrogen sulfide biosynthetic process, sulfate assimilation, sulfate assimilation, sulfate assimilation, male gamete generation, hydrogen sulfide biosynthetic process
Cellular Component   located in   cytosol, cytosol, chloroplast, chloroplast, chloroplast
Molecular Function   enables   adenylylsulfate kinase activity, adenylylsulfate kinase activity, adenylylsulfate kinase activity, adenylylsulfate kinase activity, adenylylsulfate kinase activity, adenylylsulfate kinase activity
Pathway   B 09102 Energy metabolism   C 00920 Sulfur metabolism [PATH:ko00920]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 18335977 intron_variant
A/T 18335994 intron_variant
A/T 18336018 intron_variant
T/A 18336099 intron_variant
C/T 18336270 intron_variant
A/T 18336272 intron_variant
T/C 18336684 intron_variant
A/G 18337359 intron_variant
T/C 18337415 intron_variant
T/G 18337462 intron_variant
T/C 18337480 splice_region_variant&intron_variant
G/T 18337483 missense_variant&splice_region_variant p.Gly42Val
G/A 18337641 intron_variant
T/A 18337643 intron_variant
T/A 18337885 intron_variant
A/G 18337987 intron_variant
T/A 18338064 intron_variant
T/G 18338066 intron_variant
G/A 18338069 intron_variant
C/G 18339747 intron_variant
A/G 18340087 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_20110.1
MATLSNSTNIFWQDCQIGRAERQKLLNQKGCVVWITGLSGSGKSTLACSLSRELYSRGKLSYVLDGDNLRHGLNKDLGFRAEERTENIRRTGEVAKLFADAGLICVASLISPYRRDRDTCRSMLPDANFIEVFMNMPLELCESRDPKGLYKLARAGKIRGFTGIDDPYEPPLNCEIEIKQDGGVCPTPTVMAGQVVTYLEKEGFLEH*


CDS Sequence:
>Vu_20110.1
ATGGCAACTCTGAGCAATTCAACAAATATCTTTTGGCAAGATTGTCAAATAGGCAGGGCTGAAAGGCAGAAGCTACTTAACCAAAAGGGATGTGTTGTATGGATTACTGGACTCAGCGGATCAGGAAAAAGCACATTGGCATGTTCCCTAAGCAGAGAACTGTATTCAAGGGGAAAGTTATCTTATGTCCTTGATGGAGATAACCTTCGGCATGGACTAAACAAAGATCTTGGTTTTAGAGCTGAAGAACGCACTGAAAACATTCGCAGGACTGGAGAAGTGGCAAAACTCTTTGCTGATGCTGGTTTGATATGTGTTGCCAGTCTGATATCTCCGTACAGAAGAGATCGAGACACTTGCCGATCCATGTTACCTGATGCGAATTTTATTGAGGTTTTCATGAATATGCCCCTAGAATTGTGCGAGTCACGAGATCCAAAAGGCCTCTATAAGCTTGCTCGCGCGGGCAAAATCAGAGGTTTTACCGGCATTGATGACCCGTATGAGCCACCGTTAAATTGCGAGATTGAGATAAAGCAGGATGGTGGCGTTTGTCCAACACCTACTGTGATGGCTGGACAAGTAGTTACTTACTTGGAGAAGGAAGGTTTTCTTGAACATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_20110::LG5:18333591-18335591(+)
AATTAATTATTTATCGTAAACAAAAAGTCGCATAATCTATCTCATTATTCATATTTTAATACATAAAACAATTTATTAATTTAATAAAATAGATATCTATTAATTTAATAAAATAGATTGCTTCACCACTCTTATGCCTAAAGTAGTAGAAAAAATTGTAGATTTCATGCACCAATTGCTTTTATTTTTATTGTTTTTTAAATTAAAAAGTTGACATTCAAAATATATTTTAAGAAGGATATAAGTAATATTGTTAGTAACTTGTTAATGTTGAAAGTTTTTAACGTTTAAATTAGAGAGGATATGATAGTTTCAATTTATTGATGTAATACAAGTTTTATATATTTATTAGTTTCAAAAAAATATTAATAATATAGTTAGAAGTTATTCTGATTTAGCAAAAATATTTTTATAGAAATGCAAATAAATATGTAAATAATTTTAAGTTTTTTTTAAGAGAATACAAAAAATTCAAAAAAAATTATGTTTTTGTGAAAAAAATATTATGTGTGAATAAATTAGTTAATTTGATTTTTATTCACAAAAAATAATATAAGGATTCAATGTTATATTTATTTATATTATTTTCTTAATAAGTATAGTTCAGTTAACTTTTATTATGATTTCATATAATCTTCCATATTTTGTAATTATTTTTTTATTTTAATAAATTTTTATATAAAACAAATGCAGGTGATTAATTTTAAAATGTCAACATAACTAAAATGTTAAAATTCATAAAAGTACCCAACTATATTTAAAAAATAATTATATAACTTCTGTACCTAAAAATAACTATAACACATGTTTCTTTTTAAACCGTTTTCACATAAAAAAGTTTAATTATCTATTAAAAATATATTAAAATTAATATAAACATTAATATATAAAATAACATAAATCATAACAAGGGTCAAATTTAACTTAATAAAATTAATAACACAGTTTCTCTAATTATATGTTCACATATTTTCAGACTATTTTATCCTTTAACCAATCTTAAAATCTTCCCAACCACTATTTACATTAAAAAAGATCTCATGAAATTATTTTAATACTTCTTATCTCCTGTAAGACATGAAATGTCATTTTTTAATAGTAATAATAACAATAATTAATAATAATGTAATATTTTTATAGTTTGTTTAATAAAATTTTGAAAGTATTTCCTTATAAAAAGATTTAAAATGATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAATAAAATAGAAATATAATTTATGATTAGATATATTTTTAATTTCTAAATGAAATTGAAATTTGTTATATTATAAGAAACATTTTGACTTCAAACTTAAAAAATAATATTTTTTTAATTTAATGATGTTAATTTTTTTACTGCTTAAATAATGTTTCTAATTAACATTAAAATAAGAATGAGTTAAATAATATAAACAATTCAAATAAAGTTTAAAACATTATTAATACATTAAAAAATTTAACATAATTAAATTGAAACGATTATACTTATTTATTTTGAAGTTTAAAAACAAAAAGTTATCAAAATTTAAAATGAAAATAAATTTTAATTCTGTATTAAAGATAAGGATGTAAAAAATACTTAATTCTATAATTTATATAAAATAAATTTTAATTTTAATAACACTAACTTGTTCGAAATTATTTAAGTCTAAGACTTTTACACATAAATTAATAATATAATTAATTAATTAATTAATTAAAAACAGTTTTGTTCTCTTAATAAATGAATTGCTTTTACTCTCCTCATTTGTTAATGGGTGCGATAATGCATGTGAAGGTCCATTATAAAAGATAATTAATAATAAAATTAATTTGGTGGAAGGAGATGATGATTATGTGGGACAAGTAATTAATATAAGTGGAATAATAATTTAGACTGAAGATAATAATAAATGAAGAATAATATATGAGATTAAAAAGAAAGGAAAGATTGGTAGAAAATAGAGAAAAATAATAATAATAATTGAATGTAATTTAATTTGGGTA


Gene Sequence:
>Vu_20110(+)
AGGGTGGTCCGAATGACAGAGGACCTTGAATGGCGCGTCCTGAGTGAGAGTGAGAAAGAGAGGGAAAGGAAAGGAAGGAGGAAGTCTCTCTTATTATGTGTGTCCACATTCATTCATTGCCATTGCTTTCTTCCAACCCCTTCAACCCAGCAACACACTATAAAACCCCTTTCACCATCACATGCCATAATCCACACCACACCCCAAATTCCCCTCAGATTCAGATATCCAATCTCTCTTCTTTTCTGGTACTCATTCACTCTCATTCTCCTCTTTCATTTTTATTTTTTTTACAACACAATTTTCTTGCTAAATTCTTTCCATCATTTCTCTCCTTGATTCATGAGAGAATAGGAATTTTCGGTGTTTCTGAGGAAAGGGTCGGTAGGTTAGATAAGCATGCAATTCAAAATGTTTTTTTTGGACAAGGGATTGGAGTGTGTGCCCATGCCAACAATGCCTTCAATCTTTTCTTAAGAAAGGGACTGATGGGTGTTGTGCTGGGTCCTCCATATTCGTTGCCTCTCTCATCAAATCAATCATCAAGTTTGTTGCTTGCAGAATTGGCATGCACGAATCGTGTGATTATAAAATAAAGTAGAGGGGCTACATCTAGTTAATTTTATGAATCTTTTCTGGGACACTCTTTTTCCTTTCCTGATTTTTATGTTATTCGATTCCAGTATTCGCCAGTTTTATCAATTATTAATTTCTGTCAACAAGCCTGATTATTTTTCATAAGATTTTCTCTTTCAATCGTTTATTTTTTTCATTCTATTGTAATTTGAATTTGAAAGTCTAATTTCATTTTAAAAAAACTGACTTGTAAGCCGAAGAGGGAAAATTGTTCTCTTCCAGCAACAATCGCATGGATAAGTTGTGATATTATGAAGAGATTTGAACATATTTCTCCGTTTTGAAACATAAGAGTGGGTTTTGGATCATATTTTGAGGATTTGGATAGAGTGATAAAATACTACCTTTTGTATCATATAAGGACCCACCATGATTGGCTATACCAGATCAAGGGGTCACTTGTATTTAAATTTAAAATAGTGTCTTCCCCTTTTCAATAGAATCGTGCGTGCCCTGATACTCAAGAATAGGAGAGGATCCAAATCCATATTAGAAGGTCTCGTGACTCATCCTAGACTTTATGGAACCTTTCCTATGTACAATGTATGTAGACGCTATTTATGTCAAACAGGTCATACTTCTTTACTGACAATAACAAGTGGAAGTGAGTGATGAGATCACCATTCCACTGTCTGAAATTGATGCATGCTGTCGTGCTTTCAGTCCTGTGGCATGTACTGTACTGCTGTTGTAATGCTTGTCCTGATGAAGCACTTACCAAGTTTCTTGATTAGTTGTATTACTATCATGCATTTCTATTCTAAGGCCCTCTCTACTTATGTTATGATCCTTCAGTAATCTGTGAAATGAAACTGATAGCTTAATATTGATCTGTGGATAAGACTAGGGAACTTGTTTGCAATGGCAACTCTGAGCAATTCAACAAATATCTTTTGGCAAGATTGTCAAATAGGCAGGGCTGAAAGGCAGAAGCTACTTAACCAAAAGGGATGTGTTGTATGGATTACTGGACTCAGCGGATCAGGTTTATGCTATTAATTTTATTGGTTTGGTGCTGGCATTTTTAAACATCTGTTCCAGATATTCAGTTCTTTTTTGGCATGAAAAAATCATATTATTTCTCTTTGTGATGCTTTTGCTTTTCATTATGTTTTTATTGCTCCTTGAATTTAGCTTTTCACTTTAACTTGTCCTTATCAGCAGGCAAGTATTATCTGTCACATTGTATGGTAATTACCAAATAAGCTTTCATGTCTACATTCTTTTTTTCATTTTTAATGCATGTATCTGTTTAGGAAAAAGCACATTGGCATGTTCCCTAAGCAGAGAACTGTATTCAAGGGGAAAGTTATCTTATGTCCTTGATGGAGATAACCTTCGGCATGGACTAAACAAAGATCTTGGTTTTAGAGCTGAAGAACGCACTGAAAACATTCGCAGGACTGGTAAGCTTGCTCCTGTAAACTAATGCTTTAAGTGGGAACTTGATAGTCAGTTTAATATTTTAATTATTTGGTTATGTACCAAAGGTAGATCTTAGAGTGATATTGGTAGTCTATACCAGCATGATAAATATTACATTTTTGTTATCCCTTTGAGCAACTGATTAGTAATTGTCCATGCCCTTTTTCTATGAAAAAATGTATAGTTGAACGATTGAATCGAAAGGATGGAGGGTCTTATATGCTGTTGTGCTTTATCATGGCTTTTCGGTACCCTGTTTTTCTGAAGTTGAAATATGGTAACAGATATCTGTTAACTAGATGTTTGAGTAATGTAGGTGGTGTTTGCAACCAGAAATACAGGTAAATTGTTCATATAAAGTGGAAGCCTATTACCAGACATATTACCATGACATGCCCAGAACTAGTGTGTGTGTGTGTATGATGTTTACATATTACATATCTGATTTAATGATCTTCATATGTCATTTGCTTAGTCAACGGTACTTTGATTGTAGCAGTTATGTGAAGTCTAGATGCTTTATTTGAATCTCTGATCCGTATTTCTTTGCCAACTTTGTTTTACTAATCTGAAAATTATTTAATTCAGGAGAAGTGGCAAAACTCTTTGCTGATGCTGGTTTGATATGTGTTGCCAGTCTGATATCTCCGTACAGAAGAGATCGAGACACTTGCCGATCCATGTTACCTGATGCGAATTTTATTGAGGCAAGCCACCATGAAGCAATTCTTATCATTTTTATTAGTTGGTCTACATGATATTTGATAGGGGAATGTATTGGCAGGTTTTCATGAATATGCCCCTAGAATTGTGCGAGTCACGAGATCCAAAAGGCCTCTATAAGCTTGCTCGCGCGGGCAAAATCAGAGGTGTGTGTTTCTCTCGCAAAGGCTTTGTCCTACCTGTCTAACGTGAGTAAACTGAAGTGAGACATAGCAAGAAAGAAAATAAAATAAAAGAAGCCCAGAATTAAGCCTGTTCTGCATTTTTAACTTGGTTATATTCAATTCAATAATTATTTCAAGGAAGCACTGAACCCCACGCTTTTTTCCTTTACCTGTAGAAGATGCTAGAGTAATCACTAGTTTGGCTAATAGATCTATGTGGTTGAGTGTTTTAGGTTTAGCATATTCAGCTGTCCGCCAAGGTTATATAGTTAGTTCATTAAGGGTAGTTTGTCTGGGTAGCTTTCAGATTTCTCACATTAAGATTGAAAAAATATTGCAAACAATTGAACTTTAGTTAGTTTAATACTACAACAGGATTTCATATTTAATTATTCTGACTACGACATATGGAGTCATTCATTGAATTCGGATGAATACTAGTGATTTTTTCTAAAACTTTTCGTAATGCAATGAACTTATTTTCCTGGAGAGTGGAAATCATTGTCTTTATGATAAAAGTTATTTAAGAAAATTAAATTAGGGAGTGGTTAAAATGGTTTTGCTAGGGTGCCTTCTGAAACATCAGTGGTAAGATGATGACTGGTGTGAAAGTACCTGTTGATATGAGCTGGTGTTTCATTAGTGACTATGACAGTTGGAAAATGGGTGGATTCTGAAAATATTGTGTTATGTTGATAATAAGGCTGTTTGTCAGAGATCAAAGTTGTGGCATGGTATTGTACCGTACACAGTTTATTTGGACCCATTCACAGAGACCACGGATACTATTAACAAGTGGTTGTGATTCCTGTGTAGTTTAACAAAAAGGGTGGGAAAAAAAAACACTCCTTGGTTAAACTTATTCCAACAACCGATGCTTGTTAATCCTTGAGTCTAACCTCAGATGGCAATGTTTTTGGACAAATCCTTGGATTCAGATCTGTAAGTCAAGTTATTGAATTAACAACTTAATTAAATTGGAATTTGGTTGCTAATGAAGAAAGTGATTAAATGAAAGCATCTACTGTCTTGTATACGGTGTGAGGAATAACTAAACTAATACCTAATTTACTATGTCTCTTAACAGGCTAAGAGCTGACTTTCATAAACTCTCAAATTATCCCTGGCTTCAGTTTACCGGGGCTGACGTCCATCTGAATATCATAGTTAAACGGCTGAATTATAATATTAAATGTGATTGCAAAGTTCAAGGCCTGATAAATAATGTTGCAAGAATTCAGCATTGTATCTGAATTATCCTAACATTTGCTTGAATTCTACTATACGGTATTTATGAACTAACTACAATTGCACAGGTTTTACCGGCATTGATGACCCGTATGAGCCACCGTTAAATTGCGAGGTACATGTTCCTGAAGCTTCTAAAGCTGTTTACATGCTGTGCAGTGTTTAACATGCTTTAGCTTACGCTATTATCCTTTTCCAGATTGAGATAAAGCAGGATGGTGGCGTTTGTCCAACACCTACTGTGATGGCTGGACAAGTAGTTACTTACTTGGAGAAGGAAGGTTTTCTTGAACATTAGGGATTTGAAATATGTGATTATCTCTAATGATGATGTTTCTTCTGTAATGAAGTTGGTGAGAAATCCTAGGATGTGCATGTAGGAGACCAGTGAGAGGAAAAATGAACATGTAAAGTTCATCAGTTATAAAGGAATAAATAAATAGCGAATAATTGTTGC