Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_21316 LG5 31932685 31935019 PREDICTED: pto-interacting protein 1-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   cytoplasm, cytoplasm, mitochondrion
Molecular Function   enables   protein kinase activity, ATP binding, ATP binding, protein kinase activity, protein kinase activity
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 31932726 missense_variant p.Lys14Asn
G/A 31932783 intron_variant
G/A 31932784 intron_variant
A/C 31932854 intron_variant
T/C 31932992 synonymous_variant p.Thr61Thr
T/A 31933501 intron_variant
A/T 31933563 splice_acceptor_variant&intron_variant
G/T 31934251 missense_variant p.Gly254Val
A/G 31934300 intron_variant
T/A 31934487 intron_variant
T/G 31934491 upstream_gene_variant
C/A 31934494 upstream_gene_variant
G/T 31934598 upstream_gene_variant
A/T 31934620 upstream_gene_variant
C/A 31934675 upstream_gene_variant
C/A 31934806 upstream_gene_variant
G/T 31934807 upstream_gene_variant
T/G 31934911 synonymous_variant p.Leu297Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_21316.1
MSCFSCCEEDDFQKHAESGGQHLVKNSTGNDGNGRASETAKQGIQAVKIQPIEVPELQVDELKEITDGFGESSLIGEGSYGRVYYGVLKSGQAAAIKKLDASKQPDDEFLAQVSMVSRLKHDNFVQLLGRKGVKGAQPGPVLTWIQRVKIAVGAAKGLEYLHERADPHIIHRDIKSSNVLIFDDDVAKIADFDLSNQAPDMAARLHSTRVLGTFGYHAPEYAMTGQLNAKSDVYSFGVVLLELLTGRKPVDHTLPRGQQSLVTWATPRLSEDKVRQCVDARLGGDYPPKAVAKMAAVAALCVQYEADFRPNMSIVVKALQPLLNARHGPAGEASN*


CDS Sequence:
>Vu_21316.1
ATGAGTTGTTTCAGCTGTTGCGAAGAAGATGACTTCCAGAAGCATGCTGAAAGTGGAGGACAACATCTTGTAAAAAACTCAACAGGAAATGATGGAAATGGTCGGGCATCTGAAACTGCAAAGCAGGGCATTCAAGCTGTTAAAATTCAGCCCATTGAAGTTCCCGAATTACAAGTGGATGAACTCAAAGAAATTACTGACGGCTTTGGAGAAAGTTCTTTGATTGGAGAGGGATCCTATGGAAGAGTGTATTACGGTGTTCTGAAAAGTGGGCAGGCTGCAGCAATCAAGAAATTAGATGCCAGTAAACAGCCAGATGATGAGTTTTTAGCCCAGGTTTCGATGGTTTCACGGCTGAAACATGACAATTTTGTTCAATTGCTTGGAAGAAAAGGTGTTAAAGGAGCACAGCCTGGTCCCGTACTAACTTGGATACAAAGAGTTAAAATTGCTGTAGGGGCAGCCAAAGGGCTTGAGTACTTGCATGAGAGGGCTGATCCTCACATTATCCATCGGGACATCAAGTCAAGTAATGTACTCATCTTTGACGATGATGTTGCTAAAATTGCAGATTTTGATTTGTCAAATCAGGCTCCTGACATGGCAGCACGACTCCATTCCACTCGGGTCCTTGGAACCTTTGGATATCATGCACCAGAATATGCAATGACTGGTCAATTGAATGCAAAAAGTGATGTATACAGTTTTGGTGTCGTCCTCCTGGAACTCTTGACGGGAAGGAAGCCTGTTGATCATACATTACCACGGGGGCAACAGAGCTTGGTTACTTGGGCTACTCCAAGACTCAGTGAGGATAAAGTTAGACAGTGTGTAGATGCAAGACTAGGAGGAGATTACCCTCCCAAAGCTGTTGCTAAGATGGCTGCTGTTGCTGCCCTTTGTGTGCAATATGAAGCTGATTTCAGACCAAACATGAGTATTGTTGTCAAAGCTCTTCAACCTTTGTTGAACGCAAGACATGGGCCTGCTGGTGAAGCTTCAAACTAA


Promoter Sequence:
>Vu_21316::LG5:31930685-31932685(+)
GGTTTAGGGGTTTCTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTGAGAATGAAAATTATTAAAATACCCTTAACCTTAGAACTTAGAATCCATGGTATATAAGGATATTTTTGTCTACTAAAACCCAGTACACATTGCTAAAATGTACCAACTGAAAAAAACAGGCGTACGCGCGTTAACAAACCCCTATATATATATATATTATAATAATTTATATGGCAAATAGAATCAATATTTTGTAACAATGGTTTACTAATATTTGTATCAATTACTTATGGCATTAATAGTTTGCAATATTTTGTTTGATAAGGAAATGTAATAAATATAATAGTTATTCAATATTTTATCATGAATAAAGTTGGAAAAGAAATCCTTTTTTCTTTATTTTTGTTATGTAGTAAGATATTTTAGATATTTTAGAAATCCTGCTAAGAAAAATCAATTTTAAATTTAAAGGTATTTTAATAATTTTAAAATTTAATTTAAAATAAAAAATAAAAGATAATTTTTTATCATCTGATTGATCCAGGAGAAGTTATTAGTTTTTATTATATATTTTTTTAAAAGATAGTTGTTTTTTTAAAATAAAAAATAAAATAAAAGATAATAACTACTCATACAGATGGACCAATCAGAATAATAAACAACTACCTTTTATTCTTTTTATTTTAAATTAAAATTTAAAATTATTAAAATACCCTTAAATTTAAAATTATATTTTTTTAATAAAAACTTTCTTGTAAGTTAAAACTTAGTACACTTTACCAAAACCTATCAACTAAAAAATCCGTAAATTAGAAAACCTCGTGTTAGTTTCTTACTCCAAAACACAGAAAAAATTTATTAAAATACTATTTATAAGTACCAATAAAAATGTATCTGTTATGTGCATGTGTTATTTATTTATAACAAAAATAATAAAATTATAATTATAAAAAAATATAAATAATTTTTACAATTTAACTATATATAATTTTTATTTATTTAGATTTTATTATTATTAAATTTTAAAAAATAGTTAAAGTCAAAAAGTAATTAAATTTAAATAAAAAATAAATGAAAAAAATAACACGAAAAGGGAAAACTTATATATATATATATATATATATATATATATATTAATAACAGAGGTCAAAGGAGTGAATTTTTAACACATCAGCAAATCAAATTGCATTTTGTGTGTGTAGGTGTAAAGAAGATTAGTAAAATGTTGGTGTATGTTATATAATAATAAATAATAAATAATGAATAATAAATATCATTACATTCTTACTCTTACCTAATTATAATGATTTCAATTCCAATCTAGTCAAAAGCTTGGACTGCTTTATCCTACGCCCTTCTCCTTGATTATCCTGCGCATATTTAGCTTCTATCTCGCGGAGATCCTCCTCCTCCTCCTCCGCGCCTCTCTCACTCTCTCAAAGACACGATATCCTGTTAGATTCCAGGTATTTCTCGATCTATATTATACTCTCTTCAATGTCTCTTATTTTTTTTTATTTAATTTCACCATTTATTTTTATTTTCTTGAGTTTTTTTCAGTGAATGAGTATTTTCTTTCAAAGCTTGTGATGAACATGTGATAATTGGTTTATTTAAGACCGATCCCTGCTGGCTTCCAAGTCAGTTGTAATTTTATTCTGATTGATGGAAAATTCGTTCATAAGTGATTTGCCAATTAGGAGAAACACTGGATTTTTGTCTTAATATTTACATGCATGAGTTGTATGAATGAAATGAGAGTTCAATTTCCGGTTCAAGATCCAACTGTGGTGAATTGATGACATTAATAGTTGTAACTGGACAAAAAAAAAAAGTTTCCTTATTGCTTTCATTCTTTTTATTTCTTTCGAATATTTTAATTTTGCTATTGTTGTCATGGTCTGTCTACAGGGGAGTAGCATTGTTTTTTTTTAGATTTGAATTTAAGCTTATATTCAGTCTTGATATGGCTATTAACTAGTGTGAATTGATGGAGTGGTGAATTATTATCAGCAGAAGGAATCA


Gene Sequence:
>Vu_21316(+)
ATGAGTTGTTTCAGCTGTTGCGAAGAAGATGACTTCCAGAAGCATGCTGAAAGTGGAGGACAACATCTTGTAAAAAACTCAACAGGTAATTGGGATCGGGTCTGGGGGTTAGTTGTCTAGGTGTAATGTTATATTTTGCTTTGTTAATTGATGTTAGATCACCTGAATTATATTTGATGTAATTAATGTGATAAATTGTGTTATGCAGGAAATGATGGAAATGGTCGGGCATCTGAAACTGCAAAGCAGGGCATTCAAGCTGTTAAAATTCAGCCCATTGAAGTTCCCGAATTACAAGTGGATGAACTCAAAGAAATTACTGACGGCTTTGGAGAAAGTTCTTTGATTGGAGAGGGATCCTATGGAAGAGTGTATTACGGTGTTCTGAAAAGTGGGCAGGCTGCAGCAATCAAGAAATTAGATGCCAGTAAACAGCCAGATGATGAGTTTTTAGCCCAGGTTGGTGTCAAACTAGGCTTACTATTTAATCATTGAGGTTATTGTGATCAATATAATCATTTGGTTTTGGAATTTTCAGGTTTCGATGGTTTCACGGCTGAAACATGACAATTTTGTTCAATTGCTTGGTTATTGCATTGATGGAAACTCCCGAATTCTTGCTTATGAGTTTGCATCTAATGGGTCTCTTCATGATATTCTGCATGGTATGCGGTTTTCTCTTCATGATATTTTAAATGGGACATGTGTTGATTGCATCTTATGAACATTTTTATTTATTGGTCCTTGACAAGTAATGATAACCACATGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATATTATTTCTTTCTTCTTGTACATTGTTGTGTTCTTATAATTTTCATCACATGCAGGAAGAAAAGGTGTTAAAGGAGCACAGCCTGGTCCCGTACTAACTTGGATACAAAGAGTTAAAATTGCTGTAGGGGCAGCCAAAGGGCTTGAGTACTTGCATGAGAGGGCTGATCCTCACATTATCCATCGGGACATCAAGTCAAGTAATGTACTCATCTTTGACGATGATGTTGCTAAAATTGCAGATTTTGATTTGTCAAATCAGGCTCCTGACATGGCAGCACGACTCCATTCCACTCGGGTCCTTGGAACCTTTGGATATCATGCACCAGAGTAAGATGTGCATACCAGATTTTCAAGAGATATTGTATGACATGCTTTATTATTTTTCTGTTGGTTAACTTATCATAGACTTCTTGTAACTGATAAGCATAATAGGTGAAGGCTACTTATTGAAAAAGTAATAGAAAGTTTTCCCACCTCCCTAATTGACAAGAAGACATTGTCAATTTCCATACACTCTTTTGAGTGTTTCTCTGTATCTTGTCCGATGATCAATTTAGAAAACAAAACTATTCTTATATATTTAGTCAGTGTGCTGGCAAATACCTTGACAATCTGTCTAATCTTGTTGACGCAGATATGCAATGACTGGTCAATTGAATGCAAAAAGTGATGTATACAGTTTTGGTGTCGTCCTCCTGGAACTCTTGACGGGAAGGAAGCCTGTTGATCATACATTACCACGGGGGCAACAGAGCTTGGTTACTTGGGTAAATGCAAACTTCACTTGTAATATATTTTTCTGTTTTCAAAAAGCAGAGAATTCAAAGTGTTGGTCAACTAACTGATCCTAGTAACTGATGTGATTCAGGCTACTCCAAGACTCAGTGAGGATAAAGTTAGACAGTGTGTAGATGCAAGACTAGGAGGAGATTACCCTCCCAAAGCTGTTGCTAAGGTATTAGCTGTCTTTTAGTGTATTTTTTTTCTTTATTTTTTCTGTTATGTCATTTTCCTTGGTGAGGTTGTGGGTGGACTGGTTTGAAACACATGTCTATGAAATAGCAAACTAATCAAAAGTACTTCACATAAGATACCTGAGGACTTTTGAATCATAGATTTTGTTACAGTTGATTTAGTTAGTTGAACAATGGGAAGGTAATGTTTTCCTCTACAGTTTTGTTTTCAGTTTTTTAACTTGAGAGCTAGAAACAGGTATCATTCCTCTGAGAGCCAAAAAATACTTGCATATAAAAATAGTATTCACTTTTTAGTTGGACCCTGGTAGAAATTGACAATCCGATAACTGTTCTAGGAAATATTGACTAGTTACTTAACTAAGACAAATATTAATGTATAACATCAAGATACTTTCTTAATTATAGATGGCTGCTGTTGCTGCCCTTTGTGTGCAATATGAAGCTGATTTCAGACCAAACATGAGTATTGTTGTCAAAGCTCTTCAACCTTTGTTGAACGCAAGACATGGGCCTGCTGGTGAAGCTTCAAACTAA