Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22021 LG5 42104676 42110436 PREDICTED: transcription factor PIF4-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of auxin mediated signaling pathway, regulation of auxin mediated signaling pathway, regulation of auxin mediated signaling pathway, red, far-red light phototransduction, regulation of auxin mediated signaling pathway, red, far-red light phototransduction, ethylene biosynthetic process, regulation of auxin biosynthetic process, red, far-red light phototransduction, ethylene biosynthetic process, response to low fluence blue light stimulus by blue low-fluence system, regulation of auxin biosynthetic process, ethylene biosynthetic process, regulation of auxin biosynthetic process, red, far-red light phototransduction, red, far-red light phototransduction, regulation of auxin mediated signaling pathway
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity, protein binding, protein binding, DNA-binding transcription factor activity, promoter-specific chromatin binding, protein binding, protein binding, protein dimerization activity, DNA-binding transcription factor activity
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 42104900 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/A 42104950 5_prime_UTR_variant
G/A 42104960 splice_region_variant
G/A 42108886 3_prime_UTR_variant
T/C 42108889 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22021.3
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CDS Sequence:
>Vu_22021.3
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