Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22919 LG5 60433434 60434575 PREDICTED: putative B3 domain-containing protein At5g66980
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   is active in   cellular_component
Molecular Function   enables   protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 60433635 missense_variant p.Pro18Thr
A/G 60433932 synonymous_variant p.Glu89Glu
T/A 60434057 downstream_gene_variant
T/G 60434079 downstream_gene_variant
T/A 60434428 synonymous_variant p.Arg144Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22919.1
MENIGMLRKVAAPPKVVPIVDLEEDSDEHSHEIQNNGVRKRPLPSPKTNVKSEGACPFKEAQRKSKRMKEGKDKMNDEKPALTKLVPLENAHFQICFDTPYKLKRVEFPRKMFKMNMKLLRYITLRDENGKSWLVMINSSSNYDRSFLGSGWMAFKESKNIQVGSRCDFQFVVDKANVARELHVRVLSKIKKK*


CDS Sequence:
>Vu_22919.1
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Promoter Sequence:
>Vu_22919::LG5:60431434-60433434(+)
ATCGTACGAGGAATGATGACCAACACTAACTATTTCTTTTTACACATTAAATTGATAAAACCAATCGTTAAATTAATTCTTTTATTAATTGTATGAAATCTAGTTTTTTTTATAAATTTTAAAAACTATTTACTAATATATTAAATAAACAATGTTAGTTTTAGAAATGAAGTAAATGTCAATTATAAAGTTTATTTGATTTAACTACATTTTTTTTTGTGTTCATGGTTTACTTAAAATGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATGTTTATTAACTTATATAATTTTTTTTAATTGATACATGTTAGCAGAATATATCAAGTTTTAGTAGAAAAAAAATATTTTAAATATTAAGTTATTTTAAAAATTTTTATTTTTAATTTAAAAAAAAATCAGAAACATTCTCCTAATCTTAACTCACCATTTCACCTAATTTTAATCCATCTTTTTTATTTATCCAATTTTTTCTCTCTCATTTTCATCCTTTCACAATAATTTTTTATTTTAAATTAAAAATAAAAATTATTAAAATAATCTCATGTTTAAAATATATTGTTATTTTATGAATGAAGACTTTTTTGTCACCTAAAATTTAATACACTTTGCTAAATTATATCAATGAAAAAAAAGAGCTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGATAAACCTAATTTTATAATACTTTGATCCTATCATAATTTATTGTGTATTATAAGAGGAATTTTAACAGAATACCTGTAATATATATTTTTTAACTTATTTTCCTGTTATAAATTAAAAAACAATTGTTACAAGTTATAAAATAATTAAAATATCTATCGAATAAAACATAAAAGTTATAAAAAACTGCTTATATTAAATTTTAACCATTAAGATGGGGCTGGGCTTCAGCGTTTTTGAAGATATAATATTTTTCTATCGTATAACTGAAATCAAACATATAATACGAGGATTAACTAATTAATTAAGTTATTCTAAATATATATTTACTCATCATTTAAATTCTTCGTTTTTAATTTAACAATCTCAGTAAAAAAAATAATTTTTAACACACTAATTTTTTTATATTTATTTAATATTATCCTTCTCTATTTTTACTTTTTCATTTCTTAAAAAATAAAACATAATGTAAAAATATGTCACATACCTTTATACATCTCGAAATAAGTCACCTCTTTACAAATTTTTTATACCAATCCCAAAATATATACATATATCCATTTTAACAAATTTTAAAATTTTTTATATTTGAAGTAAGTAAAGATTTACCTAACATCTAAAACAAGAAAATATTTGAGGCACTGGCCATAAATATTGACGTTTCGTCTCAGCATTTTCTTGAAGAACAGCATGGAGAGTGCGAGTGCGGGGCTATCTTGTGGCCATAAAATTCCATGTGAGTTCTTCAAAGTTTTTCTTACAAACAGAGGTTCTACCCAGTTGGTACGTGTTTCTTTCTCTTGTTTTTAGTTCTTTTTAGTCTTTCTCTTTTTGTTATAGGAGGGTTAGCAGAGTTTATACGGGTCTAGGTTCAAACCCTCTCAGTGTCATGTATACGAAAAAAAGTGTTTTTTTTTAGTGTAAAAGGATCATGGAAAGTGATTTTTTTTTTGTATTCTTGCACTTTCTCTTAAGTAGGATTTAGTGCTTGCTTATTTTGTCTGGTCTTTTATGCTTTGAGAATGTTTGATAGTTCATTACTGATGGTGACATTCTCCTGAGATTTAATGTTTGCTTATTTTGTCTGGTCTTTTATGCTTTGAAAATGTTAATCGTTTGTTACTGACAATGACACCCTCCTGGGACTTGTTTTTTTTTTCCAGCAAATACCAAGATCTTTCACTAAGTTTTTCACTGGAATCCCACCATGTAAGGTCATTCTTGTAGAACACGA


Gene Sequence:
>Vu_22919(+)
ATGGAAAACATTGGGATGTTAAGGTGGAAAAAATCGAAGGTCGTTTGGTTTTTAAAAGTGGGTGGCAGGAATTTTCCAAGGAGAAAAATTTAGAAGATTGCGACTTTTTGGTTTTTGAGTATGATGGTAAAACTACTTTTAATGTGAAGATATTTGGGAAAACTGGGTGCAGGAAAGTGGCTGCACCTCCAAAAGTTGTTCCCATTGTGGATTTGGAAGAAGATTCTGATGAGCATAGTCATGAAATCCAGAACAATGGTGTACGGAAACGTCCACTCCCAAGTCCCAAAACAAATGTGAAATCAGAAGGTTAGTCTTTCAAGTATTCATTTTGCATAATTTCATGTCATTGTTATTCAACCCTTCATGCTTAATGTATAATGTTTATAGGTGCATGTCCATTCAAAGAAGCTCAGCGCAAATCAAAAAGAATGAAGGAAGGAAAAGATAAAATGAATGACGAGAAACCTGCGCTTACAAAGCTTGTTCCATTGGAGAATGCTCATTTTCAAATATGTTTTGATACTCCATATAAACTAAAAAGAGTGGTTGGTTATTTTATTCTTTTACCTATATTTACAATAAGTAGTTAGTCTTCTCTGAATTGAATGAATGAGTGTCTCTTTTAAGTAACTGAATTCTATTTTCAGAATAGTGCATTTTATGTGGAGTAGGTCTAAAATATCTAAGAATGTTACAACAATGAGTTTAAAATTGATGTAGTAGAACTGAAAGTATTCGATAAAATTAGTTGTTAAAGTAATAGATATACCTTGTGCTTGGGATAAAGTGGGATATATAATTGCTCAATTTAGTTTTTGTTATGAAATAGTTTGGCGACTTGATGAGATGATGTAATTGGTGTTGGTGGGTTGCAGGAATTTCCTAGAAAAATGTTTAAAATGAATATGAAGCTGCTTCGGTATATAACTCTGAGGGATGAGAATGGCAAGTCATGGCTGGTGATGATCAATTCCTCATCGAATTATGATCGTAGTTTTTTGGGAAGTGGATGGATGGCTTTCAAGGAGAGTAAAAACATTCAAGTAGGGTCTCGATGTGATTTTCAGTTTGTTGTTGACAAAGCAAATGTGGCCAGAGAACTGCATGTGCGCGTGCTTTCGAAGATAAAGAAGAAATAG