Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_22996 LG5 61197407 61199603 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At2g42960
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, phyllome development, phyllome development, phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   chloroplast, chloroplast, chloroplast, cytoplasm, cytosol, chloroplast
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 61197466 synonymous_variant p.Pro20Pro
A/G 61197697 synonymous_variant p.Pro97Pro
G/A 61197796 synonymous_variant p.Leu130Leu
G/T 61198034 upstream_gene_variant
G/A 61198064 missense_variant p.Ala188Thr
C/T 61198093 synonymous_variant p.Asn197Asn
A/T 61198194 missense_variant p.Gln231Leu
G/A 61198396 synonymous_variant p.Leu298Leu
G/A 61198539 upstream_gene_variant
C/T 61199016 synonymous_variant p.Tyr423Tyr
G/A 61199163 upstream_gene_variant
T/C 61199468 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_22996.1
MDECVEVKEYIYTWGEDGFPTSLCCRNALTVVSNALATHALSSGGQVFLSQDQWQRCLQSFHPQPGMSLDSCGFDNFYRGSSVCSNFILQDVRTLQPYQDALSRCSHFDQPFGQSCADCTSGISNVRDTLYSQVEKHNNDIDRAICGVAAIVGLAAGRPNDPLVDKFLLCLPSSASGSDKRGSLWKALLSVPVVVIVTLIVVIMVKCLSKKKGRKPVDLQDITAWSGLYWFSKTEIENAMNYGGRKISLGRGSAGHVYRGVLPSGQIVAIKHLTKSNTSESFTREIEGLSRLRHPNLVCLFGCCIEGDERYLVYEFCANGNLAQHLLRRDSHLTWETRVRILRDCSFALKYLHHHIEGCVVHRDIKLTNILLTEKYQAKLSDFGLSKVMGIKESKVFTDVRGTIGYMDPEYMSNAKLTCASDVYSFGIVALQILSGQKVIELDLDARDQLTRKARDVSMGKRPLSDFEDPRLKGKVDKADFEAILQIAVLCVAKSSKGRPTIEVVFDELDKVCMDTETKMKVKKDESSSSNSTPSSKSSKSSKSAPL*


CDS Sequence:
>Vu_22996.1
ATGGATGAGTGCGTCGAAGTGAAAGAGTATATTTACACGTGGGGTGAGGACGGGTTCCCGACCTCATTGTGCTGTCGAAATGCTCTCACGGTTGTGTCCAATGCGTTGGCCACACACGCACTGAGCTCGGGAGGACAAGTGTTCCTTTCCCAAGATCAATGGCAGCGTTGTTTGCAGTCATTTCACCCGCAACCAGGGATGTCACTTGATTCATGTGGCTTTGACAACTTTTACCGAGGAAGTTCCGTATGCTCTAACTTCATTTTGCAGGATGTTAGGACCCTGCAACCATACCAAGACGCATTGAGCCGGTGCTCCCACTTCGACCAACCTTTTGGTCAATCTTGTGCAGATTGTACCAGTGGAATATCGAACGTGAGAGATACTTTGTATTCTCAAGTTGAAAAACACAACAACGACATTGACAGAGCCATATGTGGGGTAGCAGCTATTGTTGGTCTTGCAGCTGGCAGACCAAATGATCCTCTCGTTGACAAATTTTTACTATGCTTGCCATCTTCAGCTTCAGGATCAGACAAGAGAGGATCTCTGTGGAAAGCCTTGCTGAGTGTGCCAGTAGTTGTGATTGTAACATTGATTGTGGTTATTATGGTGAAATGTTTGTCCAAGAAGAAGGGTCGTAAACCGGTTGACTTGCAAGACATCACTGCATGGTCTGGATTGTACTGGTTCAGCAAAACGGAAATTGAGAATGCCATGAATTATGGTGGTCGAAAGATAAGCCTTGGACGTGGAAGTGCAGGGCATGTATATAGAGGCGTTCTACCCAGTGGTCAAATAGTGGCCATCAAGCATTTAACAAAGAGTAATACCTCTGAGTCTTTCACTCGAGAAATTGAAGGCCTTTCAAGGCTTCGTCATCCAAACTTGGTTTGCCTCTTTGGCTGCTGCATTGAAGGGGATGAGAGATATTTAGTCTATGAATTTTGTGCAAACGGGAATCTTGCTCAACATCTCTTACGAAGAGACAGTCACTTGACCTGGGAAACAAGAGTGAGAATTTTGAGAGATTGTTCGTTTGCACTCAAGTACCTCCACCATCATATAGAAGGCTGTGTTGTCCATAGAGATATTAAGCTTACGAACATTCTTTTGACTGAGAAATACCAAGCGAAACTGTCAGATTTTGGACTGTCAAAGGTGATGGGAATCAAAGAGAGCAAGGTTTTTACCGATGTAAGAGGAACCATAGGCTACATGGATCCAGAATACATGAGTAATGCCAAGCTAACGTGTGCCAGTGATGTATACAGTTTTGGTATTGTTGCTTTGCAAATATTGTCTGGACAGAAAGTCATAGAGTTGGATCTTGATGCCAGAGACCAGCTCACAAGGAAGGCAAGAGATGTGAGTATGGGAAAGCGCCCATTGTCTGATTTTGAAGACCCACGACTAAAAGGAAAGGTTGATAAGGCAGACTTCGAAGCCATCCTACAAATTGCAGTGTTGTGTGTTGCCAAATCAAGCAAAGGTCGACCAACCATTGAGGTAGTTTTTGATGAATTGGACAAGGTCTGCATGGACACAGAAACCAAGATGAAGGTAAAGAAGGATGAGAGTTCATCATCAAACTCCACCCCCAGCTCCAAATCCTCCAAATCCTCCAAATCAGCTCCTCTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_22996::LG5:61195407-61197407(+)
GAGATGGTAAAACACGAAACGTGGTTGCTTACACACGACGAGGCAATGCATGTATGATCCTTGGCTTACAAACATTCTTTTGAATTATTTTAAATTAACTAAATTTATTAAAAAACATATATTTTTTTAACTTTTATATTTTTAATAAATTTTAATTAATATTAAACAATGTGGTAGAAGATATGTTATTAGTATTTTTGGTGGGTGCAAATCACAAGACAAGCAAGGTACAAGAAAAACATAATTAATCCTTGATTAGAAGATGTTTAATAAATAATGAAGGATAAATAGTTATTTTGTATAGTAATTTTGGTTATTGAAAATTGATAGTCGGCTAAGGGTAAGATTAAAATATGTTGTTGATGAAATCAAGACATGTAGTACAAGCTGTAATCTAAAGGCAATATGGCAGCGAGAATATCCAAATCCATAACGGTGTTAACGAAGAAAACTCACTCTATATCTTCTCTATTCTACTTTTAGCTTGATCTGCTATGAACGTTACGCTGCTTCACAATGGGTAACTTTTAGTTTCCATACAGAGCAAAAGAGGTTTGGTTGGACATGAAAACAAAAACACACTTACCTCTTCATCTTTTGTTTGCACTTATATTTCTTGCATTTCCTCACTCCTCCCCACTCCTATTCTCTGCTGCACTCACCGATCCGCAAGGTCAAATCCTTTTCCCTTCTCTTTTCATTTTTTCTTCTGCATTCACAGACTTATCTATGTATAAAACAGACAAACATCTATTTTCAATCCCTTCTCCTATTTAATTAAATAAGGAAATATCTTTTTAACAATCTTTTTACAACAACCTATGTGTTAGCATATAACCAGTCCGTTACCAGTAAGATAGTTACACATAGTCTATATTATCAAAAAGTTGATAAAAAAAATTATTAAAATATCACGGTCCAATTAAATAATATCTCTGCCTTTTAATAATGAAATATCAATTTCGGATATTTAAAATTCAGAAAAACAATTGTAGTGTGTTAGTGTAAACTTAAATGGAATAAAATAAATGAAGAAATATTTAGCGGAGTTTATTAGTGGTAATACAAGGGAGTATTTAACGGGTTTTATTAGTAATTATATAGGTAAACTCAAATGAGAAAATATTAATCATATTTTATTGGTAATATTTTGATGTTTTAAGAGAGAAATTATCAAGAGTTTAATAGATTGTGATTTGAGTTATATTTTATAATAATCAGAGATATTGTGACTCAAATGTAATATGGCTTATGGATTGTAATGTTTAGTTGACAAAAATACAAAGAAGTAAATAAGTTTTTTTACTGTTTTTTGCTAAATGATGATATAGAATAGTAAAATTGTTTAGATATCATTCAATCTTAAAATACTTATTTTATGTCATGTACTCATCGTAATTAGCAAGATGAATAGTTGATTCTGATCATACCACTTTTGTTAAATCCTTATAATAATATTTCCAATCTAAACTCATAAGAAAATAGGTTTATAGGTTTTTTTTTTTGTTTTTATATTGTCAATCTTAATCGTTTATTAAATAATGTCCGAGTTCCAACCCTAACAAAAGAAAAAGTTTTTATAAACCATTGATGATATGTATTTATTGATGATTAGATGTATTTTTGGTGTTATGTACGTCATACACTTATCCATGTTCTGTAAATATGTTATCACATGCAGCCAGATATAATAAACTAACACAAAATTAGATTAGACAATTCAAACCAATAGGGAGACTAAGCGCAGAAGTTAAAACATAGATTGGAAGTAGGTAGAGTTTACTAATATCTAGGTAACATGTATATGCATGTTATTAATCTCTGTCATAAGTAGAATAATACGTTTACCTTTGTCGTAGAAATTGGTTGCAGATCATATAATAATTTTCCAATCAAGTGATGGATAGAAAATTTGAGTAGCTTCACAAAGTTGTAGATTGAATGCTGTTTTGATACAGGTTCATGTGTGCTGAAGTTCAACACAAGCCAGTATGTGGCAA


Gene Sequence:
>Vu_22996(+)
ATGGATGAGTGCGTCGAAGTGAAAGAGTATATTTACACGTGGGGTGAGGACGGGTTCCCGACCTCATTGTGCTGTCGAAATGCTCTCACGGTTGTGTCCAATGCGTTGGCCACACACGCACTGAGCTCGGGAGGACAAGTGTTCCTTTCCCAAGATCAATGGCAGCGTTGTTTGCAGTCATTTCACCCGCAACCAGGGATGTCACTTGATTCATGTGGCTTTGACAACTTTTACCGAGGAAGTTCCGTATGCTCTAACTTCATTTTGCAGGATGTTAGGACCCTGCAACCATACCAAGACGCATTGAGCCGGTGCTCCCACTTCGACCAACCTTTTGGTCAATCTTGTGCAGATTGTACCAGTGGAATATCGAACGTGAGAGATACTTTGTATTCTCAAGTTGAAAAACACAACAACGACATTGACAGAGCCATATGTGGGGTAGCAGCTATTGTTGGTCTTGCAGCTGGCAGACCAAATGATCCTCTCGTTGACAAATTTTTACTATGCTTGCCATCTTCAGCTTCAGGATCAGACAAGAGTAGTCATCTCATCTCTACCATTTTATTTTTTGAACCTAACATTAATAGGACCATGTGAGAGAATACTGACAAAAAGTGTTTTTGGGTCCCCAGGAGGATCTCTGTGGAAAGCCTTGCTGAGTGTGCCAGTAGTTGTGATTGTAACATTGATTGTGGTTATTATGGTGAAATGTTTGTCCAAGAAGAAGGGTCGTAAACCGGTTGACTTGCAAGACATCACTGCATGGTCTGGATTGTACTGGTTCAGCAAAACGGAAATTGAGAATGCCATGAATTATGGTGGTCGAAAGATAAGCCTTGGACGTGGAAGTGCAGGGCATGTATATAGAGGCGTTCTACCCAGTGGTCAAATAGTGGCCATCAAGCATTTAACAAAGAGTAATACCTCTGAGTCTTTCACTCGAGAAATTGAAGGCCTTTCAAGGCTTCGTCATCCAAACTTGGTTTGCCTCTTTGGCTGCTGCATTGAAGGGGATGAGAGATATTTAGTCTATGAATTTTGTGCAAACGGGAATCTTGCTCAACATCTCTTACGTAATGTCCTCTCCCTTAAATGGAAGAACTAGACCAAATATTTTATCCATACAAATGCATCTAAATCTTTGATTATCCCTTAACTGTTTTATATATATATATATGTCTCTATTTTTCAGGAAGAGACAGTCACTTGACCTGGGAAACAAGAGTGAGAATTTTGAGAGATTGTTCGTTTGCACTCAAGTACCTCCACCATCATATAGAAGGCTGTGTTGTCCATAGAGATATTAAGGCAAGTAACATGCAATGAAAATTTGAATATGTTGTATATTGCACTTGAAAACAACAAGCAAATACATGTACAATTGTTTTGGGTTAGCTCTATGATAATGCCTCTCACTGGTTCTAATTTTATAGCTTACGAACATTCTTTTGACTGAGAAATACCAAGCGAAACTGTCAGATTTTGGACTGTCAAAGGTGATGGGAATCAAAGAGAGCAAGGTTTTTACCGATGTAAGAGGAACCATAGGCTACATGGATCCAGAATACATGAGTAATGCCAAGCTAACGTGTGCCAGTGATGTATACAGTTTTGGTATTGTTGCTTTGCAAATATTGTCTGGACAGAAAGTCATAGAGTTGGATCTTGATGCCAGAGACCAGCTCACAAGGAAGGTACTTAAAAATATATTCATTATCATATTTCCATGCCATTCAATGATTCAACTAAAAATGAGATAATTTGAAATTTGTTTTGTAGGCAAGAGATGTGAGTATGGGAAAGCGCCCATTGTCTGATTTTGAAGACCCACGACTAAAAGGAAAGGTTGATAAGGCAGACTTCGAAGCCATCCTACAAATTGCAGTGTTGTGTGTTGCCAAATCAAGCAAAGGTCGACCAACCATTGAGGTAGTTTTTGATGAATTGGACAAGGTCTGCATGGACACAGAAACCAAGATGGTAAATATATATTTGTCAAGTTACTCCTAATCTCATTCTAACTATGTTTACAAATTAATGTGTCAAGCCCTTTTGTGCTAGTCCTTGCCTTGTGTTTATCAAATTTACATTTTTTTTTTTGTTGATGCAGAAGGTAAAGAAGGATGAGAGTTCATCATCAAACTCCACCCCCAGCTCCAAATCCTCCAAATCCTCCAAATCAGCTCCTCTTTGA