Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23838 LG5 69062662 69064000 PREDICTED: transcription factor MYB104
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 69062716 missense_variant p.Ser19Thr
T/C 69062818 intron_variant
A/C 69062825 intron_variant
G/T 69062864 intron_variant
T/A 69063055 intron_variant
C/G 69063122 intron_variant
G/T 69063190 stop_gained p.Glu49*
G/A 69063460 missense_variant p.Gly139Ser
T/A 69063550 missense_variant p.Cys169Ser
G/C 69063559 missense_variant p.Ala172Pro
G/C 69063577 missense_variant p.Val178Leu
C/T 69063858 synonymous_variant p.Phe271Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23838.1
MGRSPCCEKNGLKKGPWTSEEDQKLLDYIQKHGYGNWRTLPKNADNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHSPRLDLLDISSILNASFYGSSQMLLGMQPSMVNPELLRLASSLFSSSQQHKHLEICAPKGQQNQLCDPQVQNHVPHLAQFQDPVQEVPACSTPVFGTPCVSLPLSQPQLVEPHNVDPYPSSSFTDFTYQQHSHDDQIISDWHKDGVALSTLTDDYVPQLSSYNYYSCDAQDLVYPPLSEPSTFHSNNSHQNFSFASVLSTPSSSPTPLNSNSTIINGSNTEDERDQSYDSGSMLKFEIPDILDVNEFM*


CDS Sequence:
>Vu_23838.1
ATGGGGAGATCACCTTGTTGCGAAAAGAATGGCCTCAAGAAAGGACCATGGACCTCTGAGGAGGATCAGAAACTCCTTGATTACATTCAGAAACATGGATATGGCAACTGGAGGACACTCCCAAAGAATGCTGACAATGAAATCAAGAACTATTGGAACACACACATTAGAAAAAGGCTTCTGAGGATGGGAATCGACCCTGTCACACACAGTCCTCGACTTGATCTATTGGACATCTCTTCCATTCTAAACGCATCTTTCTACGGTTCATCACAAATGCTCCTTGGCATGCAGCCTTCTATGGTGAACCCCGAGCTTTTAAGGTTGGCTTCTTCACTCTTCTCCTCCTCACAGCAACACAAACACCTTGAAATCTGTGCTCCAAAGGGTCAACAGAACCAGCTTTGCGATCCACAGGTTCAGAATCATGTTCCACACTTGGCACAATTTCAAGATCCAGTTCAAGAGGTGCCTGCATGCAGCACCCCCGTGTTCGGCACCCCTTGTGTTTCATTGCCTCTCTCTCAACCACAGTTGGTTGAGCCCCATAATGTGGACCCGTATCCATCATCAAGTTTCACAGACTTCACTTACCAACAACATTCCCATGATGATCAGATAATAAGTGATTGGCACAAAGATGGGGTTGCTTTAAGCACTTTAACAGATGACTATGTCCCTCAATTATCAAGCTATAATTATTATAGTTGTGATGCTCAAGATCTCGTGTATCCTCCCTTGTCCGAACCTTCAACTTTCCATTCCAATAACAGCCATCAGAACTTCAGCTTCGCTTCAGTTCTATCCACGCCTTCGTCAAGCCCCACACCCTTAAATTCAAACTCCACGATCATCAACGGGAGCAACACAGAAGACGAGAGAGACCAGAGCTATGACAGTGGCAGCATGTTGAAATTTGAAATCCCAGATATTTTAGATGTGAATGAGTTCATGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23838::LG5:69060662-69062662(+)
TTTTATCACATATAGTACAAATTTTTTTAAGACATCTTTCCAACTTACCCTATAAAATAAATGCAATAATATGATATAGGAGATGCATATTAACGAATTGATACTTTTCTTGCGTTTTTTTAAATCATAATCAATAATTGAGCTATAATAGTTATAGTCTTGTTGGGATGAAAAATGCAGCTACTGTCAAAGATGACCTCTCTTATCATAAAAAAGTAAGCTTTGCATGTGACCTAAACAGCTTCAGCAGCTGAGAAACTGAAATGAATTGAAATTAGTAGTTTGGATTAGAAAGAGTGCCACTACCATAAACAGAAGTCAATAAACTTTTCAAAGTTCACTTTGACAACAAAGGAGAAAATAAGCAAATTAATAGTGTTCTTCACCCGATTTTCTTACAATTGATCACCAAATAAATAAATAAATAAAATCTTAAATATGATTTTCAGAGGGAACCGTATCAGAACGATGACGTATTACGGAGGGTGGGTGATAAGAGGTGTAATATATATATATAATAAAAACAGAAGAAAATAATAAAAGAAGTTGCTTTTCCAGAATAATTTAAAATAATAAAATAGCTCTTATCCCATATCATGCCTAATAAATGTTTGGGAGGAGTATATAGTATTTTAAATTAAGGCAACACCGAACTCTATTATTGCCACGGTGTCTATTAAATGCTCATCCTCAACCTTCTTTGCATTTATTATGTCCACACATTTAAGATGCTGATTATAACAGTACATGTTTCATCAAATTACTTTCATTTTTATTTCTCCTTTTTTTTTTAATTTTTAATAAGTTTTTTGAGATATTGTTGTCTGAGAATTATAACTATAAGACTATATATATGTCAAAACTTTTCAATCTATTTAATGAATAATTGTTTTAAATTCAAACATATGTTCATGAAAGGCACGATGCAATGAAAGCGAGTGAGATATATGCGTATTTCTCGTATTTGTAATAACTTCCACTTCACATAATAATATTTTACCAATTTTTTTAAAATTGCATAAACAAAAAAAATAAAATAAGCTTATTTTATCAAAACACGTTTTTTTTTTTAAATAAAGAGAAATAAACCGACCCATATTATGTGATAACAAAAAAAAAAGATGAATTTTATAGAGAGAAGAAGTTGCACAAAGAGCAAATAAGCACTTTAGCCAATGATATAGAAGTAAGTGATGCAGGTCATGGTTTGCAGCTAGAGGTGAAAATGGTGAATAGAAAACCAATTAATATGTATGTGTGTATGTGTTTTCCAGATAAGCTAAGCATAGCATTCAACATAAAAGGCTTGCTTCAGGGAAAAGGAAGAAAAGAAAAGGTATGTGTATGCATGGATAAAACAACAAAACCAACGCCGTCTACTCCTGAACTGTAATAATACAGACACAAAGAGAGAGAGAGAGACACGTGGCGTCTCCTTTTCATTACAGCTAATATCAATCCAGAAACTTTCGGGAGTCACACTCCCGGAAAATCATATGCCTTCACACTTCACTCAATCTTAATCTTAATCACTTTTTTAATACAATTTTACATTCACAAACACACAAATCTGTTTACTTTCTTCCTTGTCATTTCATGCTAATCCAGTTTAAATTATAGTATAAGTAAGAAGTTGACGTAATTAAACTCCAACTTCAACCTCAAACCTACGTAGAAATAGATTAACGTAGTGATATAATCGGAATGGTTTTTTCTGTAATAACATTAAGAATAGGGAAAAGAAATTCATAGATTAGATGAGACACGTAGCCAATGCCCAGAGGGATAACAGGAGGACGGCACCGAATCAATTTGACTTCCCTTGTTTCTTAATCTTCACTTTCTTTCTATTTATACCACAAAACTACTACTACGTCCCACTACGGACCCTACTATCATAACTCTGTTTTTTCCTCCCTCTCTCTTTCCCTATTCTCTCACGTCTCATATATTTCCTCCTCTGTCTCTCGTCGTCACCTTCAACCATTCACCTTCTAAAA


Gene Sequence:
>Vu_23838(+)
ATGGGGAGATCACCTTGTTGCGAAAAGAATGGCCTCAAGAAAGGACCATGGACCTCTGAGGAGGATCAGAAACTCCTTGATTACATTCAGAAACATGGATATGGCAACTGGAGGACACTCCCAAAGAATGCTGGTATCTCACCGAATTAAACAAAATAAAAAAACTGCATTTAAATAAATGTTTTTTTTTTAATTTAATTATGTGAGTTTCAACTGACGAGTTTGGTGTTATTTATTGAATAGGGTTGCAGAGATGTGGAAAGAGTTGCCGTCTTCGTTGGACAAACTATCTCCGACCAGACATAAAGCGAGGTCGGTTTTCGTTTGAGGAGGAAGAGACCATAATTCAGCTACATAGCATTCTTGGCAACAAGTCAGTTCTTGTCTCTTCTCTGAGTTTTTACTCAAAATTATTTAATAAGAGACAAACAACGCTTACTGTTCCTTAAATATTTTATAACGTTTCTTATTGTGTAGGTGGTCTGCAATTGCTTCTCGCTTACCCGGAAGAACAGACAATGAAATCAAGAACTATTGGAACACACACATTAGAAAAAGGCTTCTGAGGATGGGAATCGACCCTGTCACACACAGTCCTCGACTTGATCTATTGGACATCTCTTCCATTCTAAACGCATCTTTCTACGGTTCATCACAAATGCTCCTTGGCATGCAGCCTTCTATGGTGAACCCCGAGCTTTTAAGGTTGGCTTCTTCACTCTTCTCCTCCTCACAGCAACACAAACACCTTGAAATCTGTGCTCCAAAGGGTCAACAGAACCAGCTTTGCGATCCACAGGTTCAGAATCATGTTCCACACTTGGCACAATTTCAAGATCCAGTTCAAGAGGTGCCTGCATGCAGCACCCCCGTGTTCGGCACCCCTTGTGTTTCATTGCCTCTCTCTCAACCACAGTTGGTTGAGCCCCATAATGTGGACCCGTATCCATCATCAAGTTTCACAGACTTCACTTACCAACAACATTCCCATGATGATCAGATAATAAGTGATTGGCACAAAGATGGGGTTGCTTTAAGCACTTTAACAGATGACTATGTCCCTCAATTATCAAGCTATAATTATTATAGTTGTGATGCTCAAGATCTCGTGTATCCTCCCTTGTCCGAACCTTCAACTTTCCATTCCAATAACAGCCATCAGAACTTCAGCTTCGCTTCAGTTCTATCCACGCCTTCGTCAAGCCCCACACCCTTAAATTCAAACTCCACGATCATCAACGGGAGCAACACAGAAGACGAGAGAGACCAGAGCTATGACAGTGGCAGCATGTTGAAATTTGAAATCCCAGATATTTTAGATGTGAATGAGTTCATGTAA