Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23987 LG5 70191191 70192264 NAC domain-containing protein 104
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 70191477 intron_variant
A/G 70191514 intron_variant
G/A 70191600 intron_variant
G/T 70191733 missense_variant p.Gly84Trp
A/T 70191763 stop_gained p.Lys94*
C/G 70191908 missense_variant p.Thr142Ser
T/C 70191969 intron_variant
A/T 70191970 intron_variant
T/A 70191996 intron_variant
T/G 70191997 intron_variant
C/A 70192004 intron_variant
T/A 70192105 intron_variant
T/A 70192117 intron_variant
C/T 70192171 synonymous_variant p.Asn158Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23987.1
MADTNVNLPPGFRFYPTDEELIVHFLHRKASLLPCHPDVIPDLELYQYDPWELHGRALAEGNQWYYYSRRTQNRVTGNGYWKPTGMEEPVVSSSNSKRVGMKKYFVFHVGEDATAIKTNWIMQEYRLSDSASSTRSSKRKPQPKSDYNKWVICRVYERNGEEDNGTELSCLDEVFLSLDDDLDEISLPN*


CDS Sequence:
>Vu_23987.1
ATGGCAGATACCAATGTCAACCTTCCACCAGGCTTTCGATTCTATCCCACAGATGAAGAGCTCATAGTCCATTTCCTTCACAGAAAAGCCTCACTTTTGCCTTGCCACCCGGATGTCATCCCTGATCTTGAGCTCTACCAATATGATCCATGGGAGCTTCATGGTAGAGCTTTGGCTGAGGGAAACCAATGGTACTACTACAGCAGAAGGACGCAGAATAGAGTCACTGGCAATGGGTATTGGAAACCAACGGGAATGGAAGAGCCAGTGGTTTCAAGCTCAAACAGCAAGAGAGTTGGTATGAAGAAATATTTTGTTTTTCATGTAGGAGAAGATGCTACTGCTATCAAAACCAATTGGATAATGCAAGAATATCGTCTATCAGATTCTGCTTCCTCTACCAGATCATCCAAAAGAAAACCTCAACCAAAATCAGATTACAATAAATGGGTGATATGTCGTGTTTATGAGCGTAACGGAGAGGAGGACAATGGAACAGAGCTCTCATGTTTGGATGAAGTATTCTTGTCATTGGATGATGATCTTGATGAAATAAGCTTACCAAATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_23987::LG5:70189191-70191191(+)
AGAGTGAATACCAAGGTTATGAGCATGAAAAAAAGAACTAGCTCATAGTTTTAGGAATGTTGCTCACTGGGCCTTATGTGGATGGAATTCACCTTTTCAGTGGAAAGATGTTCCTCAACTCTTGGTCCACAAAAGATGGAGTACGGTAGTGCTTCCACTTCCACACATGTGTGATATGTTATTATCCGTAGGGTTTATCTATTAGAAAGTGGGTTTAAGTCCAACTCAGTGATTCGAGAATGATCCGACAACGGATGAAACAAAATGTCCACATAGATCTATTTAGGATAGGCTTGTAAGGTGAGATTTGTACCTCACTTATATATTATAAAAATCGGCTTGTAAGGTGAGCACCCCACTTATATATTATAATTTGACCTTATCTCTAGTCGATGTGAAACTTTTAACATTATCAAGAATAAGGTTCACTGGAAAGATATAAATATATAAAGGATTGACATCATTCTCTAACTAAAACCTTAACAATAAGTTAACGGGTCTTTCATCTTTATACAGTGATCTATTTTCTTATTTTTATCCAACGTAGAACTTATACTCACACTTGTATTCTCATATCCTCAATATAATATAATTTTTTTTTGTTGACATAAACCTTATCCAAAATTGGTACAAGTATTATTAAGCTGATACCAAAACCTTCTGATTCAGATTAATGTTATCATGTTATGGTACGAGAATATGAAGCCATAAACGGTAAAGGAATTTGAATCCAGAACTAAACGTTTCGGTTGTTGATAACTAGTTTGGTTGAGTTCTGTTGGTACCAACCTCACATAGCCCATATGTCTACTTCATTGCCAGTCTCAACTGATGCCAGTGCAAGAAGAAATGTACTTAGGTACCCTTTCACGTTCCTATTTTATGAAGCACAATATAGCAGTTAACATATAAAACATATAACGACTTACAAGAAAGACACCGTCCAAAGTTGTACTGTAAATAGTAAATATCTCTAAGATTTAAGGTAATGATGTCTACTTCAAGTTAAATAAATATTACTGCCGAACTTCTAAATCAGAAAAGACATCAATCAACTGCAAAATTATAATTAATTAATGTTAGGATGAGTTATAAGCAAGGTGTAGTTCACGTACTTTATTTTTGTTTCCTTAATAATTGGTTAATCATATAAATAATGTTGTGTTGTAGTTTCCTTGGCTCCACCAAGTGAGGGGAGTAAAATAGTTATATATTGATACAATCTATTGTTGTAGAAATAGAATTTGTGAGTTAGTTAAAGTCCACCTTCCAAAGAAATAATTGATTGCTTTGCTTGATGTATGTGCAGTTCCCACTGTGCTACTCCTGCTTATTCATTCATTGCATAGCTAGGCAGAAGCATATGGGTTGAGAGTGAAACAAAAAGTCCCTCCCATATTTTATTCTCAAAACATACTATAATTGCTGATAATTATGAACCATATAAAGATACACTCCAAGAGGTGGGTCATCCCAGTTCAATTGGCCTAAAACCAAACCCATCTTAATGTCTGTGACACATACTACCGCAGGTGAATGATGTCAGCATGAAGTGTGATCATCATCGTATTATCGTTATCTTTAATCGACGTGAAACTTTCAACACATTTTTTAATCTCACAAAACTAAATTGTAAGATGAGATTTATACTCGTTTATACAGTATAAATTGATTTTATCTTTAGTCGAGGTAGAACTTCCACCAGATGCTGTAAATGTATACTGTAAATGTATATCATATATAATCTTGTGCCACGCAACGATCTGTCCCTACGTTTGTTAAGCAAATATATATCCATGAGGTTCCCTTATCTGGCGCATTGCTTGCTTGGACTTTGAGTGGTACCGTGCCAAAAAGAATTATCAATTATTTGATGAAATGTATCTGTTTTGTACGTGATAAACGCCATCTTCAATTTCACGTCAGGCCCTGCTATATATAGTCTATCCATTCGTTACTTCCTAGCTACCTTCATCTTCCCCTGCCTCTCCTTGCTTCAA


Gene Sequence:
>Vu_23987(+)
ATGGCAGATACCAATGTCAACCTTCCACCAGGCTTTCGATTCTATCCCACAGATGAAGAGCTCATAGTCCATTTCCTTCACAGAAAAGCCTCACTTTTGCCTTGCCACCCGGATGTCATCCCTGATCTTGAGCTCTACCAATATGATCCATGGGAGCTTCATGGTACTGTTACTTCCTTTGCTTCCAAACTTTCAATACATGCCATATTTCACACAAAAATATTTTATATTCTGGAGTCGTGTTGCATGTAAGAGTTAATAGAATTTGGTTCTTTGCTATACAAAGATCAGGTTGGACTTGGATCATGTATCTTATATCATTCAATAATAATTTCCTGTATTCAAATAGATGCCAAACTATATATAGTTATATAGTTAGTTAGCTAGGATGTTGGACTTTGGTTAATTAGGTATAAATATATTGTAGTATGCATATAATTATGCAAGTGTTCAGGTAGAGCTTTGGCTGAGGGAAACCAATGGTACTACTACAGCAGAAGGACGCAGAATAGAGTCACTGGCAATGGGTATTGGAAACCAACGGGAATGGAAGAGCCAGTGGTTTCAAGCTCAAACAGCAAGAGAGTTGGTATGAAGAAATATTTTGTTTTTCATGTAGGAGAAGATGCTACTGCTATCAAAACCAATTGGATAATGCAAGAATATCGTCTATCAGATTCTGCTTCCTCTACCAGATCATCCAAAAGAAAACCTCAACCAAAATCAGTCAGTACACATTCATATACACTCATCACATGAATATACGTATGCATAAATATACATCATGTATATTTAACTAGTTAAATTTTTTTTCAAAAGTGTTACTTCTCTAAGTAATCATGATTAATTTTCACTTGTGACAGTCTTGCATGGAAAACTGTTGTGCAACACTTTGATTTGATTGGTGATTTTGTTTTTCCTTGTGTTTGATTAATTCAGGATTACAATAAATGGGTGATATGTCGTGTTTATGAGCGTAACGGAGAGGAGGACAATGGAACAGAGCTCTCATGTTTGGATGAAGTATTCTTGTCATTGGATGATGATCTTGATGAAATAAGCTTACCAAATTAG