Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25768 LG6 27022276 27022662 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 27022381 synonymous_variant p.Leu94Leu
G/T 27022389 missense_variant p.Leu92Met
T/A 27022494 missense_variant p.Thr57Ser
A/G 27022495 synonymous_variant p.Asp56Asp
G/C 27022544 missense_variant p.Ser40Cys
C/T 27022554 missense_variant p.Gly37Ser
G/A 27022563 stop_gained p.Gln34*
T/A 27022564 missense_variant p.Glu33Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25768.1
MIIRWSAIAAQIPGRTDNEIKNYWHTNLKKRFEQDTGTESQVSNSCERSPSTTSADTFQSFNSTEDCSPFSQHSSSSTTSAECNTVTINENLDLQDEFSFWDADTDLSFAATQPEFFTFDAQLWSHDN*


CDS Sequence:
>Vu_25768.1
ATGATCATCAGATGGTCTGCTATTGCTGCACAGATTCCAGGAAGAACAGACAATGAAATAAAAAACTATTGGCACACGAACCTGAAGAAACGATTTGAACAAGACACAGGCACAGAATCTCAAGTTTCAAACTCATGTGAACGATCCCCATCAACAACAAGTGCAGATACTTTCCAAAGCTTTAACTCCACGGAAGATTGTTCCCCATTTTCCCAGCATTCATCATCCTCCACAACAAGCGCAGAATGTAACACTGTAACCATCAACGAAAATCTGGATCTGCAAGATGAATTTTCCTTTTGGGACGCTGACACAGATCTTTCATTCGCAGCTACTCAACCTGAGTTCTTCACTTTTGATGCACAACTTTGGAGCCATGATAACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25768::LG6:27022662-27024662(-)
TATGAAAACTAGAAACAAATGGAACAACATGTACGCTGTTTTCTCCGTAAAACATTTGCAAGGTTATGCGTATTGAAGTTCCTCTAATACACTCACCTCTTGTTTACGTATGTGTATAGTCTTGTATTATGTAAATCTAAATAGTTGATTACTCTTGACTATAACATAATTCATTATTGATTATGTACTCATGTTTAAAGAATTTAAGTTTAATTTCCAATTTCGGAAAGAGATAAATAATTGTTATTTATATTATAAAATATGTAATGAAAGAGTATTATTGTAAAAAAAATAACTTAAATACTACAATTTTCAATTTATTCTTGGAATAAAAGGTTTTAAGTTTTCTTTAAATTTTGTAATAAAAAACACAGTATAAGTCGATTCTCATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTATTTAACTTTTAATATTTTATGCCCAAATTAAAATTAGTGGGTTTAGAAATTTAGAATTTTAAAACATAAAAATTGCAACCAACTAAAAATGTGAAAATCAAGTAGATCAATTTATATATTCAAAAGAATATTTAAATTCAAGTTTAAACAATAAACCGATTTAATTAACTAATTAAACTAATTATATAAATTAAATGAAAATATCATTGAATTTAGTTTATATTTATGTATCAAATCAAGATTTAATTGAAGTTAATTTTAAAATAAAAAATACAAATTATAATATTCATTGGTACAAAAATCAATTTGATTTATTTTTTTTTTAATTCCGTGAACTGATTTTTAATTAAAATTAGTTATTTATGGATGAAGGGAAAAAAACAAATTTTAAAGAAAATGAGAGAAGAGAAAAAGTCAACTTGAAAATTGAAAGAAAAATAAATATATAAAGAGGCAATTCCTATATAAAAAATAGATTAGAGTAAGTTTAGAACACATTTAAGATATATAGGATATATTTAGACTTTCAAAATATGAAAGAAAGAAAGGTTTAAATGTGAACCTAATTAAGTTTATAAGTTTAATTAGAAAAATTTAAGTTAAAACCAAAATAAAAATGGATGTGCATGGATTTTTTTCACAAAGCAAATATGATCTACCTTCAAAAAACATAAATAGCAGAGTTTCATATTCAATACGTACATTTTGAAACCACGAAAATATAGAATCTTATATATTAAAATCAACTAAAAAATATTTAAAAAATAACCAAAATAATAGTGAATAAGTATTAGATAAAAAAAATATAAAATGAAAATGAATATATAGAATGAACACAATTTATTATTATTAAAATAAAACAAATTAAAAATTAAAAGTAAAAACATAAAAAAAATATTTTAATATATCTATAAATAAAAAATATGTGACGTCTTGTCATCTTAATTGCACTCTTTGATTGTGCTACATAATATTACTATACTTTTTTTAATTTGCTGATTCTCTTTCTTAAACTTTAAATAATATCAACAGATTTCACTTTCTATAATTTCTTTTCCTTTCTTTGTCGTTTTAATAATATAAAAGAATATCACTTTCTATCATTTCGTTTCCTCTCTTCCATCATCATCCACTCGTTCAAAGGCTTAATGAACATAAAGCTAACCATCGCGATACTTCTTTTTGAAAGATACCCATTAATAATTTTTTTCTCTTGTATAATATATCTTATAAATCTGTATCCTTTTTATTCTTTGTATTTGTAGCGCACATGAAACTTGCTGTCTTTACTTCTAACCCCTTTTTTAGTAGCATAGTAATTACATATTTATATTCTTTTTATATAATATAAAGATAAAATTGTCACCGTAAACTTTTATATTTAGAAAATAATAATAATAATAATATCAAATAATATAAAAAGTTATATTAATTAATGATTGCACATGTACTTATTACTTATCAGTATGATTGAGAACTAACATTAAGATCCTGAAGCATTAATTAAACATCGTGTTACTAACATTTAGTGATAATGTGAAATTAAACCTTTCAATTTTC


Gene Sequence:
>Vu_25768(-)
ATGATCATCAGATGGTCTGCTATTGCTGCACAGATTCCAGGAAGAACAGACAATGAAATAAAAAACTATTGGCACACGAACCTGAAGAAACGATTTGAACAAGACACAGGCACAGAATCTCAAGTTTCAAACTCATGTGAACGATCCCCATCAACAACAAGTGCAGATACTTTCCAAAGCTTTAACTCCACGGAAGATTGTTCCCCATTTTCCCAGCATTCATCATCCTCCACAACAAGCGCAGAATGTAACACTGTAACCATCAACGAAAATCTGGATCTGCAAGATGAATTTTCCTTTTGGGACGCTGACACAGATCTTTCATTCGCAGCTACTCAACCTGAGTTCTTCACTTTTGATGCACAACTTTGGAGCCATGATAACTGA