Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28173 LG7 47193156 47199319 PREDICTED: protein NSP-INTERACTING KINASE 3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   anther development, protein phosphorylation, protein phosphorylation, anther development, anther development, homeostasis of number of meristem cells, anther development, homeostasis of number of meristem cells, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   chloroplast
Molecular Function   enables   protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, protein binding, coreceptor activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 47196202 intron_variant
A/T 47196356 intron_variant
A/G 47196983 intron_variant
G/T 47197033 intron_variant
A/T 47197039 intron_variant
A/C 47197146 intron_variant
T/C 47197147 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28173.1
MELSSLVFWLLGLLLLQLMEISSAALSPSGINYEVVALMAIKGDLTDPHNVLENWDSSSVDPCSWRMVTCSSDGSVSALGFPSQNLSGTLSPGIGNLTNLQSVLLQNNAISGRIPAAIGNLERLHTLDLSNNAFSGEIPSSLGGLKNLNYLRLNNNSLTGSCPQSLSNIEGLTLVDLSYNNLSGSLPRISARTLKIVGNPLICGPKANNCSSVLPEPLSFPPDALRGQSDSGKKSHHVALAFGASFGAAFVIVIIVGFLVWWRYRRNQQIFFDVNEHYDPEVRLGHLKRFSFKELRTATDHFNSKNILGRGGFGIVYKACLNDGSVVAVKRLKDYNAAGGEIQFQTEVETISLAVHRNLLRLSGFCSTQHERLLVYPYMSNGSVASRLKDHIHGHPALDWTRRKRIALGTARGLVYLHEQCDPKIIHRDVKAANILLDEDFEAVVGDFGLAKLLDHRDSHVTTAVRGTVGHIAPEYLSTGQSSEKTDVFGFGILLLELITGHKALDFGRAANQKGVMLDWVKKLHQDGRLSQMVDKDLKGNFDLIELEEMVQVALLCTQFNPSHRPKMSEVLKMLEGDGLAERWEASQRIETPRFRSCEPQRYSDLIEESSLIIEAMELSGPR*


CDS Sequence:
>Vu_28173.1
ATGGAACTTAGTAGTTTGGTTTTCTGGCTACTGGGGTTGCTGCTTTTGCAGTTGATGGAGATTTCTTCTGCTGCTCTTTCTCCATCTGGCATAAACTATGAAGTTGTAGCTCTGATGGCCATAAAGGGTGACTTGACTGATCCTCACAACGTTCTGGAAAATTGGGATTCTAGTTCTGTTGATCCATGTAGCTGGAGAATGGTTACGTGTTCCTCTGATGGCTCCGTTTCTGCATTGGGATTTCCGAGTCAGAACTTGTCTGGTACACTATCTCCCGGAATTGGAAACCTCACTAACTTGCAATCTGTGTTGCTTCAGAATAATGCCATTTCTGGTAGGATTCCTGCTGCAATAGGAAACTTGGAAAGGCTTCACACACTTGATCTTTCCAATAATGCATTTAGTGGTGAGATACCCAGTTCTTTGGGAGGCCTCAAGAACCTGAATTATTTGAGGTTAAACAATAACAGCCTTACGGGATCCTGTCCTCAGTCTCTTAGCAATATCGAAGGTCTAACCCTTGTGGACCTCTCCTACAACAATCTGAGTGGTTCCTTGCCTAGAATATCGGCAAGAACATTAAAGATTGTGGGTAACCCTTTAATTTGTGGTCCAAAAGCAAACAACTGTTCTTCTGTTTTACCGGAGCCACTTTCCTTCCCTCCAGATGCACTAAGAGGCCAATCTGATTCTGGTAAAAAAAGCCATCACGTGGCACTTGCTTTCGGTGCAAGCTTTGGTGCTGCATTTGTCATTGTGATTATAGTTGGGTTTCTTGTTTGGTGGCGATATAGACGCAACCAGCAGATATTCTTTGATGTTAACGAACATTATGATCCGGAGGTGCGTCTTGGTCATTTAAAAAGGTTTTCATTCAAAGAGCTTCGAACTGCAACAGACCATTTCAACTCAAAGAACATTCTTGGAAGAGGTGGCTTTGGAATAGTCTACAAGGCATGCCTAAATGATGGGTCTGTTGTGGCTGTTAAGAGGCTAAAGGACTACAATGCAGCCGGTGGTGAGATCCAATTTCAAACAGAAGTTGAGACAATCAGTTTGGCTGTCCACCGGAATCTTCTCAGGCTTTCGGGGTTTTGCAGCACTCAGCATGAAAGGCTCCTCGTTTATCCATATATGTCTAATGGAAGTGTAGCCTCTAGATTAAAAGATCATATCCATGGCCATCCGGCGTTAGATTGGACTAGGCGGAAGAGAATAGCTTTAGGTACAGCAAGAGGGTTGGTTTACTTGCATGAACAATGTGACCCTAAGATTATTCACCGTGATGTGAAAGCAGCTAACATATTGCTAGATGAAGACTTTGAAGCTGTTGTTGGCGATTTTGGTTTAGCCAAGCTTCTGGATCATAGAGACTCCCATGTGACCACTGCCGTGCGTGGCACTGTTGGTCACATTGCTCCAGAGTATCTATCCACTGGCCAATCATCAGAAAAGACTGATGTGTTTGGGTTTGGAATCTTGCTGCTTGAACTGATCACAGGTCACAAGGCTCTAGATTTTGGGCGAGCAGCGAACCAGAAAGGTGTAATGCTTGATTGGGTTAAGAAGCTCCACCAGGATGGAAGATTAAGTCAAATGGTGGACAAAGATCTAAAGGGAAACTTTGATCTGATTGAGTTAGAAGAAATGGTTCAGGTTGCACTCTTGTGCACACAGTTCAATCCTTCACACCGCCCCAAGATGTCAGAAGTATTAAAGATGTTGGAAGGGGATGGCTTGGCTGAGAGATGGGAGGCCTCACAGAGGATTGAAACACCAAGGTTTCGGTCTTGTGAGCCTCAAAGATATTCAGATTTAATAGAGGAATCTTCACTCATAATTGAAGCCATGGAGCTTTCTGGCCCTAGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_28173::LG7:47199319-47201319(-)
CACAGTATTGCCTACGCCGCGAGTAACTTCTATAACCTCCTACAAACTTCAACTCCAAAACAACAACTTGATCGGTGCAAAGTGAAGCCCTTGACACCAAGAGGACTCAGGTAAGAATTTGTAGAGAGAAGGAGGAGAATTTGTAGAGACAAGGAGACGAAGTTTAGAGAGAAAGAAGAAAACTGAAACTCAAAAACTTTTAGAGAAGAAGGTGCATGCAACAAAGTGACACGAAAATCTGAAAACTTGATTTATATATTACCGTTAAAAACCGATCGTCCACTCCACTGTTCACTCTTGTTTTTCACTTTTTGAATTTTAAATCCTTTGCACCTACCCTTGGCTTTCACTAATATAGAATTTAAGAGTTCTGACAGTGGGGGTATTTTTATTAAAAATCATATATAAACATGTTAAAAATTATAAAACCCAAAAAAGCATTTTAGTTTCTTATTTGTTTATCTATTTTTACCTTTTAACTTTAAGGAGCCAATGAGTATGTACTTGCTTACAAATTTGGCTTGGTTGATACATAATAAACTAATTTTAATGTATGCTTCTTATCACGAAAGACTCGTCACAAAACACAAAACTTTAAACTGGAACCAATGATGTTGAATTTCATAATTTGTTTAATCACTCAATTAAACAAAACAAATCTCATAAATTTTGTGAATGTGAGATGCTGTGTATTAATTCAAGATTTTTTTTAAATGTTTAAATATTTTTGAGATTGAGTCAATTACTTTGTGTTGATATGAGAAATTTTAATAATTCTAGAAAATTATGTGATGTTTGAATTATTTGTAATATTTTTTTAAAATATTTGGTTTAAATAAGTAATTAAAACATCTTCTATTTCCAAATTTTCAATAATAATTTAATTTATAATTTGTATTAAAGAAAACATATTTATCAATAATTAACTTTGGAAAATATTTAAAACTTTAAAAGTAAAAAATTAAACACATTTTGAATATTAGTCCATCATAGGAAGAACTAGCCAACTAGAAAAATTATTATCTGTCATCCATTTTTCTAAATTATTTTTCAGGATAAATATTCTTACTTTGATCGTATTATCACCTAAGAGAAAAAACATAATTGTGGGAAAATGATAAAAAAGCGAGAAGATACAGTCCTATTAACTCCAAACATTCTAGATCAGTTACTAAAATAATTGATATAATATTCAATTTACTATATTAATCATGAAAAAAAACTGATACATAAATATCTATGATATTACTTTTGTTTCTAGTTCAATACATGCAACATATTGTTTCTGCTAGTTGAGCATATGTAACATGTGATCTTTTTATTTACACATGTATTTGATAACTATTGTTTGAAAATTAATGTGGCAAGCAATTTTTGGAAAATATTTTTTTCTGCATTAGTTTTTTACATATAAAATTGAAAGGGAGCATTTATGAAATTGTAAATAAGTATTACAAAAATTAGAAATTTTTGTTCTTATTTTAAATTTATAATTTCTTAAAGATAAAAAAATATTTAAATTATTTTAACTCATGATTTCTAAAGTAAAACTATTATATAAGGTAAAATCGATTCGCAATTGCATCTTTCCATAAAACTTAAACCTAAAATTGTTTACAAAATTTAACAATATCTCGATTTATTGTACAAATTTAACATAAAATTTATGGTTAGTTATTAACAAGAAGTTAGACATATAGTAAACAGTATAAAGTTATCCTATTTGAATTAACTTAATCAGAGTTTAAATGAAAGGGTTCCTGCATTACTAAGCAAAGAAAGAGGCACAGTGTAGCACAATGGACCATTAGTTCATGAGCTGCAGATTGCAGAATGTGATTTGTTTCGTTGGTTGATGTTTGTTTTTCCCGAATTCTGAAAAAGTTACATTTTCAAGCCAAAAGCAAACAAAGGAGGAGACAATCCAACCACGTGACCTGTCCAAAAAAACTTACCTGCCTGCAACCATATTTTCTTTTTCATCACCACATCCCATTCCC


Gene Sequence:
>Vu_28173(-)
ATAATTCTCATGTCTCTCTCTCTCACTCATCAATCCCACACATCCCTTCACACCACAATCTCCTTTTTTTCAAAGTTAAAAAATGCACCAACCAGTTTTCCATCATTATAATAATTTTTGTTCATTTATTTACTTTTATTCCTGAGAAAAGTTTTTGGTCACTGGGTATAGTTGTGCATCTACATTTGTGTCCACCTTGGCCTTTTGTTTTGTCCTCTGTTTGGTTCTTTGTTTGGTTGGGTTGTGAGCGTGCTCCATGCTCACCTCCTTTTTATTTTCTGCAACTGCAAAAGAAAGAAGATAATGGTAGTGTTATCACCGGGAAACAACAACGACACACTCACATGGAATTATTTGTGGGGGCTGTCCACACCTCATAGAACCCAAACCCAACGCTCACAGATCTCAAGGATCTCACAACTTCAGCCTTGAACTTGGGTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCGCCATTAAAGTTTTGCTCTTTTTGGTGTTCTCAGTGCTCACTCCTCTTGGCTGATTCAAATTTTTAGTTGCCAAGTTGGTCTGTGGTGGCAAAAAAGGAAAAAAAAAACAATTTTGGCATCTGGGTTCTTTTTGGCTTGATGTTCATTGAATTTGGTCTAGTGGAAGTTGCTGTTTTGGTGAGGGTGGGGTTGCTTTGTGTGGGAATCTGATTCCAGAGACTGGCTTTTTCTGTTTGGATAAGGTGATATAGACTGGACCTTCTTTGTGGGAATGGGGAGAGTTGTTGTTAATTATGGTGGCTTGGAGCACTGGTCAGTGGTTGTGTGAGGGAGACACAGTTGAGGAACTAATTTTAGAGTATGGAACTTAGTAGTTTGGTTTTCTGGCTACTGGGGTTGCTGCTTTTGCAGTTGATGGAGATTTCTTCTGCTGCTCTTTCTCCATCTGGCATAAACTATGAAGGTTAATGTTCTTCTTGGGAATTTTTTTTGTTTGTTTTGTTCATTGAGATCTTTGGTAAAACTTGTGAAGTGAAGGTTTGTGAATTGATTATTTAAGGCACAAAAGTTTTGCATATTGACCAATTTAATTGTGCTGGAAACTAGTAGGCACGGTAGCTCGGTGGTTAAGGTTGATGTAATGTAATGATGCTATTTCTGTCTTGGTTTTTCAGTTTTCATTTTCCTTGAGAATTTAAGTGCTACCTAACTATCTATGACAAAATAGCAGCAGAGAGGTTCTTCTTCCTTTTTTTAATAGGGTTTTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCATACCTAGGGTGTTGGGGTGGGGTCTTCAGTTTCCTATTTTATTTTATTTTCTTGGCCGATCAATGTTCTTTTTATCTGTTTGCTGGAGGTACAGGAGGATTTTCGGATGAAACTTCTTATCCCCTCTTCTGTTTGTTCCTTCAACAGTTGTAGCTCTGATGGCCATAAAGGGTGACTTGACTGATCCTCACAACGTTCTGGAAAATTGGGATTCTAGTTCTGTTGATCCATGTAGCTGGAGAATGGTTACGTGTTCCTCTGATGGCTCCGTTTCTGCATTGTAAGTTGCTTGGCCTTTAAGTGGGTTCTAGAGTGATGAAGAAGTTTCAAGAGGCGTTGTTTAGAGAGTGAACCATCCAACTTTTGCTAGTTTGATTTTCAACTAAAGGATTTTCTTTTTCTCTTATCAGGGGATTTCCGAGTCAGAACTTGTCTGGTACACTATCTCCCGGAATTGGAAACCTCACTAACTTGCAATCTGTGTACGTCTGCTATTTTTGTTGAGATTCTTTATATCTTGCTTTCGCTTTGTATGGTGGTTGAGTTTGGCATCAGTGTCTTTTAGTTCTTATTGATCAGCTCTATCCTTTCACAAAATCATACTTCCCCCGAATTATAAGCTGAATAAGTGAAAAAATTACAACTATGCTTTATTAATTATACACATGCAGGTTGCTTCAGAATAATGCCATTTCTGGTAGGATTCCTGCTGCAATAGGAAACTTGGAAAGGCTTCACACACTTGATCTTTCCAATAATGCATTTAGTGGTGAGATACCCAGTTCTTTGGGAGGCCTCAAGAACCTGAATTATTTGTAAGTTACAAAAAGCACTTCTGAAGAACCTATTGATTGCAGTGATTATGAGTTATTCATTTGCTTTAGCAGTGACTAATGAAATTATGTTTCTTACTCAATGTAAATTATTTTACTTGCACGCCAGGAGGTTAAACAATAACAGCCTTACGGGATCCTGTCCTCAGTCTCTTAGCAATATCGAAGGTCTAACCCTTGTGTAAGTCTTTATCATCTTGTTGCACCATTATTTTTCTGTTTGCTTAATCATATTTCAGTTTTAGCTCAGAGAACAAGGGGCAGATTCAAAGCTTTGATTTCTATCTAAAAGACAGTTATGTTAACTCTTATGACTTGAATATGTACAGGGACCTCTCCTACAACAATCTGAGTGGTTCCTTGCCTAGAATATCGGCAAGAACATTAAAGTTAGTTCATTTCGAATTTGCTCGTCTTTTTTTCTTCTGTATTCAAGTTTAAAACAGGGCAGTGTAGTTTATCTCTTGCTCAATTATTTACTGCAGGATTGTGGGTAACCCTTTAATTTGTGGTCCAAAAGCAAACAACTGTTCTTCTGTTTTACCGGAGCCACTTTCCTTCCCTCCAGATGCACTAAGAGGTGTTAATCTATCATTGAACTCTGCTTTCACATTATTATTTCTTTGAATAAAAATATGGCGTGCTTAATGTGGTGATTTGGTTTTCTAGGCCAATCTGATTCTGGTAAAAAAAGCCATCACGTGGCACTTGCTTTCGGTGCAAGCTTTGGTGCTGCATTTGTCATTGTGATTATAGTTGGGTTTCTTGTTTGGTGGCGATATAGACGCAACCAGCAGATATTCTTTGATGTTAACGGTTAGAACTCTCATTTTTCTTTTTATAATTCTTTTTCTTTTTATCTCTTATGCTCTCTATCAGTAAACTTTATGGAAAATTTGCAAAAAATGGGTTGCTCATCGCACTGTTACAGCACACAATCGTTTAAGGATATTTTTTTCAAGGAATTCACATCTTAGATGCTCGCTTCAATTCATGTTTGTTACACTGGCAAAGTTAATTGACCCACCTTTACCTAACACTAAGCGACGTTGCTTCCAAAGAACTTTTGTCTGTTTCTGACCATTCAACATGTTGCACTGTTTCTAGATTGTTTATATTATTTTCCAACTACTCTAAGCTCATTAAATCAGCTGTAAGACTTATGCATATAATGAAATGGGACTAAACCTCGATGGTGACCTTTTGAAACATGACGAACAACAGCTGTCATTGTTCTAAACTTTGAAATTGTTGGAAATCTTAGTTGAAAATTTTATTTGGTGTTATGCAACTTCTGTAATGGTTATTCTAGAAGAGAAAAAATTGATGGTTAACAGTACCACTTGTGGTATATGTAATGTGTAATCATATATGGACCACCTTCTTTGAAAGGAAGTTAACATTGGCATATTATGTGCATTTTGTAGTTGAAAACAGTATCATTATAAATCCATTCCCTAATGTGATATAAGCATACGTTCTGCTCCTATACCAAAATACTGTGTATGAAAGAGCTTTTACTTCGTTCTCTTTCAATGATGTTCAATTGACACTTGTGTGTGTTTGTTATTTGGCAGAACATTATGATCCGGAGGTGCGTCTTGGTCATTTAAAAAGGTTTTCATTCAAAGAGCTTCGAACTGCAACAGACCATTTCAACTCAAAGAACATTCTTGGAAGAGGTGGCTTTGGAATAGTCTACAAGGCATGCCTAAATGATGGGTCTGTTGTGGCTGTTAAGAGGCTAAAGGACTACAATGCAGCCGGTGGTGAGATCCAATTTCAAACAGAAGTTGAGACAATCAGTTTGGCTGTCCACCGGAATCTTCTCAGGCTTTCGGGGTTTTGCAGCACTCAGCATGAAAGGCTCCTCGTTTATCCATATATGTCTAATGGAAGTGTAGCCTCTAGATTAAAAGGTTAGATCTGAGCTTTACAATCTGTTGTTTACCTAACCAGTATACTAATAACTGGCTGGACGTACTGTGTTCAGCCTGTTTTATGTCAACTGACAATAATCTGTCATATGATCATTTGAATCTTACAGTCAGATTACCGTATGTAGGTATTTAGATTGTGTTAACTGGCCACTTTAGTTAATACTAATACACTCTAGCCTTTTTGTGCCGAGTTCCTATTCAGTTACAGAAAACCTATTACCTTTTTCTGTTCTTAGCTCTTACTTATAGTTAGTTGGTTTGCTAAGATATTCATGAGCTGCTCATGATTAGGGGTAATAATTATAATTCAATTCCACAAGATCATTTTAAACTTATTTGTTTTTGGTTTTGGATTTATGTACCAGATCATATCCATGGCCATCCGGCGTTAGATTGGACTAGGCGGAAGAGAATAGCTTTAGGTACAGCAAGAGGGTTGGTTTACTTGCATGAACAATGTGACCCTAAGATTATTCACCGTGATGTGAAAGCAGCTAACATATTGCTAGATGAAGACTTTGAAGCTGTTGTTGGCGATTTTGGTTTAGCCAAGCTTCTGGATCATAGAGACTCCCATGTGACCACTGCCGTGCGTGGCACTGTTGGTCACATTGCTCCAGAGTATCTATCCACTGGCCAATCATCAGAAAAGACTGATGTGTTTGGGTTTGGAATCTTGCTGCTTGAACTGATCACAGGTCACAAGGCTCTAGATTTTGGGCGAGCAGCGAACCAGAAAGGTGTAATGCTTGATTGGGTACGTTTTCCACACACTTTCACTCTTTTCAACGTTTCTTTTCTTCTTCACTTAGCATATCACTCTTTTACAAGTTTTAGAATGTATTTATTCCCACAACTTACAATGAATGATTTGTTGGCACTTGGAGCAACTTTCTTCTTATATGCATAACTTGTCTTCCTAGAAATTTTAATGGAAAGAGTACTTGAATAACTTCTCTAAATAGGAGTT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