Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28442 LG8 6339975 6344503 PREDICTED: uridylate kinase
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   vegetative to reproductive phase transition of meristem, negative regulation of cellular biosynthetic process, vegetative to reproductive phase transition of meristem, vegetative to reproductive phase transition of meristem, 'de novo' CTP biosynthetic process, UDP biosynthetic process, macromolecule modification, negative regulation of post-embryonic development, 'de novo' CTP biosynthetic process, UDP biosynthetic process, UDP biosynthetic process, 'de novo' CTP biosynthetic process, negative regulation of post-embryonic development, flower development, UDP biosynthetic process, vegetative to reproductive phase transition of meristem, negative regulation of cellular biosynthetic process, 'de novo' CTP biosynthetic process, negative regulation of cellular biosynthetic process
Cellular Component   is active in   cytosol
Cellular Component   located in   cytoplasm, cytoplasm, cytoplasm
Molecular Function   enables   UMP kinase activity, UMP kinase activity, UMP kinase activity, UMP kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 6339975 splice_region_variant
T/A 6340590 downstream_gene_variant
A/G 6340599 downstream_gene_variant
G/A 6340678 missense_variant p.Ala437Val
A/C 6341403 downstream_gene_variant
A/T 6341463 downstream_gene_variant
C/T 6341677 downstream_gene_variant
A/T 6341764 downstream_gene_variant
A/T 6341795 downstream_gene_variant
C/T 6341796 downstream_gene_variant
C/A 6341815 downstream_gene_variant
A/T 6342454 synonymous_variant p.Thr255Thr
A/C,* 6342610 downstream_gene_variant
A/C 6342996 downstream_gene_variant
G/T 6343000 downstream_gene_variant
A/G 6343169 downstream_gene_variant
G/A 6343174 downstream_gene_variant
T/G 6343692 synonymous_variant p.Ala197Ala
C/G 6343911 synonymous_variant p.Arg124Arg
G/A 6343966 missense_variant p.Thr106Met
C/A 6343970 missense_variant p.Asp105Tyr
C/A 6343974 missense_variant p.Trp103Cys
A/T 6343976 missense_variant p.Trp103Arg
T/A 6344077 missense_variant p.Glu69Val
C/A 6344272 missense_variant p.Cys4Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28442.1
MASCDDDDDFSLLRDDNHHLHQPYAPHHHFSPSAVAVAPVPPKSVADDADDYGNPFDDDGGSEKRKDREEIGEGATSYGFNKRSKAPQSSAGSAEYRKDREEWSDTAIVCLLEAYTEKFTQLNRGNLRGRDWEEVAFVVSERCENQSKSVEQCKNKVDNLKKRYKLERQRMSSGCISTSHWPWFKQLEQIVGNSLPAKFSDEDKAVVSAGTSPRQSKRYGVATPSTGQVNNIRSKALTNLRWRRVVFKISGAALTGSDTCNMDPKVAMLVSREVAIASRLGVEVAIVVGGCNFFSGDAWVNATGLERCTAYQVGMMATVMNSILLQSTLEKMGVQTRVQTSIAMQEFAELYNRQRAIRHLEKGRVIIFGGISFGAGNPLFSTDIAAALRASELNAEAVLKGTNVDGVYDCNSRDNNFTFEHISFRELGSRGITSMDASALTLCKENAIPVVVFNLLEPGNISKALCGEQVGTLIDQTGAVS*


CDS Sequence:
>Vu_28442.1
ATGGCCTCTTGCGACGACGACGACGACTTCTCTCTCCTCCGTGACGATAACCACCACCTCCACCAGCCTTACGCCCCGCACCACCACTTCTCCCCCTCCGCCGTCGCCGTCGCTCCTGTCCCACCCAAATCCGTTGCTGACGACGCCGACGACTATGGAAACCCCTTCGACGACGACGGTGGCAGCGAAAAGCGGAAGGACCGGGAGGAGATCGGCGAGGGAGCCACGTCGTACGGATTCAACAAGAGATCTAAGGCTCCGCAGTCGAGTGCAGGCAGTGCGGAGTACAGAAAGGACAGGGAGGAGTGGAGCGACACGGCCATCGTGTGCCTCCTCGAGGCTTACACGGAGAAGTTCACACAACTGAATCGGGGAAACCTGAGAGGAAGGGATTGGGAGGAGGTTGCGTTTGTGGTGAGCGAACGGTGCGAGAACCAATCGAAGAGCGTGGAACAGTGTAAGAACAAGGTAGATAACCTAAAAAAGAGGTACAAATTGGAGCGACAAAGAATGAGCAGTGGCTGCATTTCTACCAGTCACTGGCCTTGGTTCAAACAATTGGAGCAGATCGTCGGGAATTCTCTTCCGGCAAAATTCTCTGATGAGGATAAAGCGGTTGTTTCTGCCGGAACTTCGCCCAGACAATCGAAAAGATATGGAGTAGCAACACCCAGCACAGGTCAAGTGAATAACATTAGGTCAAAAGCACTGACAAACCTTAGATGGCGGAGGGTAGTCTTCAAAATTAGTGGAGCAGCTCTTACTGGATCTGATACCTGCAACATGGACCCTAAGGTGGCTATGTTAGTTTCAAGAGAAGTTGCCATAGCTTCCCGCCTTGGTGTTGAGGTGGCGATTGTTGTTGGAGGCTGTAATTTCTTCTCTGGAGATGCATGGGTAAATGCGACAGGTCTAGAAAGATGCACTGCATACCAAGTTGGCATGATGGCAACAGTGATGAATTCAATATTGCTCCAATCGACTCTAGAGAAGATGGGTGTTCAGACTCGTGTACAAACTTCAATTGCCATGCAGGAGTTTGCTGAACTATACAATAGGCAGCGGGCTATCAGACATCTTGAGAAAGGAAGAGTTATTATATTTGGTGGCATTAGTTTTGGTGCTGGCAATCCACTTTTCTCAACTGACATAGCTGCAGCTCTTCGTGCTTCAGAGCTTAATGCTGAAGCAGTCCTCAAGGGTACTAATGTAGACGGTGTGTATGACTGCAACTCACGGGATAACAATTTCACTTTTGAGCACATATCCTTCAGAGAGCTGGGCTCAAGAGGAATCACTTCTATGGATGCGTCAGCGCTGACTTTATGCAAGGAAAATGCCATTCCTGTGGTGGTTTTTAATCTACTGGAGCCTGGGAACATCTCTAAAGCCTTATGTGGAGAACAAGTTGGCACACTAATTGATCAAACTGGAGCAGTAAGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_28442::LG8:6344503-6346503(-)
AATTCCCCAATGCCGTTCATGATTTTTGTTATAAACAAATAGAACCCAATACCTCATTTGAAGTAGCAACATATAAGTAAAAAACTTATTGTTAAAAGTCTAAGCTTGCATGCAGAAAAAAGGAAAGGATATTGGTTTTAATCTTTGATTTTTGTTTGGCTAACCTTATAAAATGAAACGTGGAGTTTTTCTTTATGAATTTGAAAGATAGGTTTGAGAGATTAACTTAATCAAAGTGCAATTTGAGTGAAGGACTCTCACTTAAGAGATCCTTAAGGGAACTTAAGACAGACAAGGTTTCCCTTCTACAAGTTGCTTGACCTAAGGAGACACTTTGAGAATGTGTTATGTAAAAAATGTTCAACTCTAAGACTTTGTTCACTTGAATGAATTTGAGGGAGAGTGATTGAGGGGATTTGAAGATAAATTTTGTTGTTGCTTATTTGAGTGGATTTGGAGGTAATTGAGAGTGAATTTGGAAGTAAAGTTTGTGAGAATTAGTGTAGGATTTGATTGACGTGACAGATTAAAAAAAATTACTTCCAAATCCAGTCACTTACTTCCAAATCCACTCAAATAAACAACAAAAAATTTTATCTTCAAATCCTCTTAAATCCCCTCAATCACTCTCTCCCAAATCTATTCAAGTGAACAAAGCCTAAATGCTATAAATTTAGGGTTAGACACTCTTACAAAACCATCCAAGCTAGGTTTCTAATATGCACATATAAACATGTTTATGTACTCTAAGATCTTAGTCTTTAGTTTTTCCTTAAGCTTGTGTTAATTCACTAACTACTAAGTCACAGTTCATAATTTTATTTTGTTATTGGAATTGTTTTTATAAATTAGGGTTTAGAAAACAATTATAATTGAGAATGGTAGGAACTACCAAGCCAACTTTAAGTCATCAACCTTAATGTTGGTTGCTTGACAAAGTTTACCAAGGAATTAAGTTCTCCCTATGCATGAATGTTCCAATCAGAGGTGGCAAGGATGGGAAATGTACTGACTTAGTTTATGAACAACATAACATATATCCAGGTGAGAAATAGTTAAATACAATAACCTACTAATGAGGTGTCTATTAGGATGGCAAAAAAATCCGCGCCCGCGGATATCCGCGGATAAAATCCGTGACGGATAGTTGATACCCGCGGATATTTACTACCCGCAACCCGCGGGTAGCGGATATTTTAATATCCGCTTATAAACGGGTCGGATGCGGGTATTATACTATCCGTACTCGCGAATACCCGTCACCCGCAAAAAATAAAAATAAAAATTTAATTTATTTTTTATTAAGTTAACTTTAATTAAAATTAACATTATTTATATTTTACAAGATTAAATTTAATTAAAATTGAATTTAAATTTAAATTTAATTTAATTTATATTATATTTTATATATTTTTTGTAATTTCATTTTAATAATTTATTAAAATATATATTTTTTTAATATTTGCGGGTATCCACGAATTTTAAAATACTCGCGACGAGTATCCGTGTGAATAGCGAGTCAAGTAGCGGGTGAATTTTTTTTTCGAATCAAATTACGGATAAGCACTATCCGTGCTCGACCCGACCCGTTAGCATGCTAGTGCCTATAAACAACATAATCATTGATAATGTGCCAAAGATGCTATATAAATTCAAATTAGGAACCATAGGTACATAACAAGTTTACAAGAAAGCATGCACAATCTTCAAGAAGAGATAATATTCTTTAAAAATGACAAGTTTCTTGAAAGAATACATTTACTCACGTTTTTTTATTTTAAGGAAAAAAATAAAAATAATACTGTATTGAAATGTGTATCACTTTTATTTTCAAGAAAATAAACTTTTCGTAAACCCACCCTGAATTGATTTTTCCCATGTTTTCGTAAAAGTAAAACAGAGAACAATAATAATTAATGAATTAAAAATATTTATTTATTTTCGTACCAAACATATGAATTTGGCCCAAACAAATATTTGGGTTGGATAAGCATGGCCTG


Gene Sequence:
>Vu_28442(-)
TCACCGACTGATCCAAATTCGCCCCACTCCAAGACTAGTAAAAGTGCGTGTAATGCACTCGCTCTTGGCACTTAACGGGACCGTCACCCGCGTGACGGCAGATACCAGACCCACTCACGGAAGGTACGCTCCGTCAAACCCTCCCACACACACCTTCTCTCAACTCTCCATTCTCTTTCCCTAACGTCCCCGACGACGCCGTAACGTCCTCCCTCACCGTTATGGCCTCTTGCGACGACGACGACGACTTCTCTCTCCTCCGTGACGATAACCACCACCTCCACCAGCCTTACGCCCCGCACCACCACTTCTCCCCCTCCGCCGTCGCCGTCGCTCCTGTCCCACCCAAATCCGTTGCTGACGACGCCGACGACTATGGAAACCCCTTCGACGACGACGGTGGCAGCGAAAAGCGGAAGGACCGGGAGGAGATCGGCGAGGGAGCCACGTCGTACGGATTCAACAAGAGATCTAAGGCTCCGCAGTCGAGTGCAGGCAGTGCGGAGTACAGAAAGGACAGGGAGGAGTGGAGCGACACGGCCATCGTGTGCCTCCTCGAGGCTTACACGGAGAAGTTCACACAACTGAATCGGGGAAACCTGAGAGGAAGGGATTGGGAGGAGGTTGCGTTTGTGGTGAGCGAACGGTGCGAGAACCAATCGAAGAGCGTGGAACAGTGTAAGAACAAGGTAGATAACCTAAAAAAGAGGTACAAATTGGAGCGACAAAGAATGAGCAGTGGCTGCATTTCTACCAGTCACTGGCCTTGGTTCAAACAATTGGAGCAGATCGTCGGGAATTCTCTTCCGGCAAAATTCTCTGATGAGGATAAAGCGGTTGTTTCTGCCGGAACTTCGCCCAGACAATCGAAAAGGTATTCTATTCAGCATTCAGCGCCGAAGTATTTAATTTTTTTGTCACTGCTTTTGCTAACGAGTATTAGTAGTTCATATTGATAGTTATTGCATTATTATATTCACCATAGGATTTGTTTTTTTTTTTTGGTTTTCTGATTTGGTTTGGTACTCTAGTGCCCGAATCTGTTTGTTGGCTGCATCATAAATACTTAGTTTAATCGAGATGCTTGAAGATTGGAACATTGTATAGCTTTATGATATTACTTTGCGGTACAACTATTCAGATGTTATAGTTAGTAGAATGTAGAATGTTTGCTTTTACATCATGTAGGTTTTTTCATGTTTTTCGTGGACTAGACTTTAGAATTGGTTCTTGTAATAAATAGGGGTGTGTTGTTTGAATAGAACCAGAACACTTGTTTAATATGGAGGTATTGCTGCATTTTAACAAGTGTCATGCTGTATTCACTGACACGCTTTTAGTTTAGAAATCACATGGAAACTTAGAATGGTCATGGCGTTACTTTAGTTACCTGTATTGTGTATTGTCTCGATGTAGTTTCCGATGGTAACTCAAGTATTGTATTGTTGTTATGCTATGTTTCACTGTGCTTTATGTCCTCTGAGGATTTGTCCATTTTTGTTTCTGATATGTACCTTCCATATCCTTGTGTTGTGCTTGATTTATACCGACGGTTACAACTTGGAATAATGAATAACTATTTTATCTTTTAGTACAGGAGTGCACATATTACAGTTCATAGAATCTTCGCATTTATTGATTTTTTGTTATGTTATTTTAGCATTAGTTTGGGCTTCAGAATATGATTTTGGAATTAATATGAGTCTATGGTTTGACTGATGCAAACATTTGAATAAGCTAATGCTATCTTCACTCACACACTTCTGAATCACAAATCATACGGGGATGACGTTTCCAAATTATAATGCAGGTGGTGTTACTACGATGGGGCTTTTTTATGTTGAATCTCATTCAAAATGAATTGTTTTACCCTTTTCTTTTACTTTTTTTTTTTATAATGACTAGTGACTGTTGAACTTTCCCCTGCTTTATGCATAGATATGGAGTAGCAACACCCAGCACAGGTCAAGTGAATAACATTAGGTCAAAAGCACTGACAAACCTTAGATGGCGGAGGGTAGTCTTCAAAATTAGTGGAGCAGCTCTTACTGGATCTGATACCTGCAACATGGACCCTAAGGTGGTTTGGTTACAATATGTGGGAAGTTTTGTAATATTATTTGACTCATGACCTAAGTTCTTTACTGTGTACTAATTGTTTCTAGATCTTGTGACAATACTTATGCATTATTTTGTTCAAATTTAAACTAATTATCAGGTGGCTATGTTAGTTTCAAGAGAAGTTGCCATAGCTTCCCGCCTTGGTGTTGAGGTATCAGTTCTCTTGATTGTTTTCTGGAGTCTCTTATTCTGCTACCCTTTCTGTTTAGCTGAAGCAGCTTTTGATATTTCAGGTGGCGATTGTTGTTGGAGGCTGTAATTTCTTCTCTGGAGATGCATGGGTAAATGCGACAGGTCTAGAAAGATGCACTGCATACCAAGTTGGGTAAGGTTAATCACCAAATTTTAAAGCAAGTTCTCTCTGCACCATTGTAATTTTACTAGAGTTCAATACCAAAGAAAATAAATTGAATAGATTTAGTATCTGTGCAACCATCCATATCCTGATAAAAAATAGACGACCCTAACTGAAGAAGATATGTTTGTGAAGTTGAATGGAAAGTACCTTGGTGGTAGTGCTGGAGGAGAAGGCCACATCTGTGAACTGAACTTTGACTAACTAGTATGGGGTATTGTTTGTATCAATGTAGAGCACATCCCTTACCCAGGTCACAAGGCTACAAAGGTTAGAGGACAAAGATTTTGTCATTTTAGAAATCTAAATTGGAGATCTGATATTTGAATATCTGAATGGGGCTAGGTTAGGCTCACCATGAGGAATTTTTTGTCCAGTTTCTTCTGTGATGATACTTATCATTTTTAACTGTATCTGTCGACTGTATAATCCCATTTTGCCCCGTAGAGTTACTCTTCCGACCTTTCATTTAGTCCCATATTCAAATATGGTGAAATTTTGATCTGCGATGAATGAATTTATATTGTAACAGTTTAAGCTGCCAAGTTATGTTTTTCTTATCTTTGATTTCTCTGTTTCTTTTTATTGAAAAACATGTCTTATGATGCTTTAACTTTGAGACATTCTATTACGCTCTGGCAAGTATCTTCTTGATGCCTTGCACATGGGTTGTGCTTATCACTTTGTTGCTTTTAGGTACATATGCTGCCATGTGACATTTTTAATCTTTCTGGTTAATACATTAGCTTTAGAAGTGATTTACTTTTGTTTCTACTATTTTAAAAATATTGATCTGAATAAGTGCGGTTTTCTTGAACTTCAATTTGCCAGCATGATGGCAACAGTGATGAATTCAATATTGCTCCAATCGACTCTAGAGAAGATGGGTGTTCAGACTCGTGTACAAACTTCAATTGCCATGCAGGAGTTTGCTGAACTATACAATAGGCAGCGGGCTATCAGACATCTTGAGAAAGGAAGAGTTATTATATTTGGTGGCATTAGTTTTGGTGCTGGCAATCCACTTTTCTCAACTGACATAGCTGCAGCTCTTCGTGCTTCAGAGCGTATGCTATTGTCCTTTGTTTTTAAATTAAATGTCTAATTACCTATTTTTCCATGTTATCTGTAGTTTATGCAAAGGGGCAACGCATGCATATTTTTTTTTCGGTTTTTGATTTTGCTAGCATCAGCATATATCTCCTTCAACCTTGCAGTTAATGCTGAAGCAGTCCTCAAGGGTACTAATGTAGACGGTGTGTATGACTGCAACTCACGGGATAACAATTTCACTTTTGAGCACATATCCTTCAGAGAGCTGGGCTCAAGAGGAATCACTTCTATGGATGCGTCAGCGCTGACTTTATGCAAGGAAAATGCCATTCCTGGTTAGTAAGTTGTTGCATTTGATCTTTCTATAAGCACGTTTCAGGTTTTAGGCCTTTGGTTCTTGCACACAGACAATGGGTTCCAAAATTGTATGTGTTTAATATTTTTGCTTTTTATGTTCAGGTTTATAAAAATCCATTGAAGTTAAGTGGTCATTTTATTATATATTTTAATTGACAAATTTCTTTGGCCATTTTCTTATACAGTGGTGGTTTTTAATCTACTGGAGCCTGGGAACATCTCTAAAGCCTTATGTGGAGAACAAGTTGGCACACTAATTGATCAAACTGGAGCAGTAAGCTAACAGTTAATTCAGCCTATTCAATTATTGTTACTCACACTGGAGCCATCAAGTTGAGTGGGATCTTTGCTATGACTAAGATTCTTTAAGAAGAAAATATCAAATCCAGACAGATTCTGTGTGGCCAAGATTGTAGAAATCGTACTTTGGAACTGTAATCACAAAATCCCTTTCACTAATTTTAGGTGGTGGTTGTAATTTTAATAAGCTTCTGTAAAAAGAAAAAAAAAGAAGAGAATGTTTTTGTATATTATTCCTAGGTGAATTGTAGCATAGTAATGAAGTAGCAGTAGTCCTCCCCCTTTGTAGCTAATGTAAACAGATGCAGAGTAATTCAACCTTATTTATTATTGCAACAGTACT