Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32839 LG9 26932727 26937405 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 26933050 missense_variant p.Leu652Met
T/A 26933434 intron_variant
A/G 26933547 intron_variant
A/T 26933553 intron_variant
G/A 26933611 intron_variant
T/A 26933686 intron_variant
A/T 26935059 intron_variant
A/C 26935079 intron_variant
A/G 26935172 missense_variant p.Phe356Leu
A/G 26935279 intron_variant
C/A 26935347 missense_variant p.Ser341Ile
G/T 26935466 synonymous_variant p.Ser301Ser
C/T 26937309 splice_donor_variant&intron_variant
C/A 26937310 missense_variant&splice_region_variant p.Gln32His
G/A 26937314 missense_variant p.Ala31Val
G/T 26937326 missense_variant p.Thr27Asn
G/A 26937329 missense_variant p.Ser26Leu
T/A 26937360 stop_gained p.Lys16*
G/A 26937383 missense_variant p.Pro8Leu
T/A 26937402 missense_variant p.Ile2Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32839.1
MIPARNMPSMIARKNKNNLGEFGSSSTFTLAQPNLMEALEMGQNTSESEVPRIREDEFDSATKSGSENHEGASGEDQDPRPNKKKRYHRHTQHQIQEMEAFFKECPHPDDKQRKELSRELGLEPLQVKFWFQNKRTQMKTQHERHENTQLRTENEKLRADNMRYREALSNASCPNCGGPTAIGEMSFDEHHLRLENARLREEIDRISAIAAKYVGKPVVNYSNISPSLPPRPLELGVGAGFGGQPAIGVDMYGAGDLLRSISGPTEADKPIIIELAVAAMEELIGMAQMGDPLWLTTLDASSTILNEDEYIRSFPRGIGPKPSGFKCEASRETAVVIMNHVSLVEILMDVNQWSTVFSGIVSRAMTLEVLSTGVAGNYNGALQVMTAELQLPTPLVPTRESYFVRYCKQHSDGTWAVVDVSLDNLRPSPSARCRRRPSGCLIQEMPNGYSKISYIDFSHIPTKSRGSSMLKWMTEVFIIFTNSLLALDMHLVPNVGLQPWIDSVKDLPVLWQQIFPHVDVGVITNQEGRKSMMKLAERMVISFCAGVSASTAHTWTTLSGTGADDVRVMTRKSVDDPGRPPGIVLSAATSFWLPVPPKRVFDFLRDENSRNEWDILSNGGVVQEMAHIANGRDTGNCVSLLRVNSANSSQSNMLILQESCTDSTGSFVIYAPVDIVAMNVVLNGGDPDYVALLPSGFAILPDGTISHETGPGGSLLTVAFQILVDSVPTAKLSLGSVATVNNLIACTVERIKASLSGETA*


CDS Sequence:
>Vu_32839.1
ATGATTCCAGCGAGAAACATGCCGTCGATGATAGCTAGGAAGAACAAGAACAACCTTGGTGAGTTTGGATCATCTTCAACTTTCACTCTTGCGCAGCCGAACCTGATGGAAGCCTTGGAGATGGGTCAGAACACTTCGGAGAGTGAGGTTCCTCGAATCCGTGAAGATGAGTTCGACAGTGCCACCAAGTCTGGTAGTGAAAACCATGAAGGTGCCTCTGGTGAAGACCAAGACCCTCGTCCAAACAAGAAGAAGCGTTACCACCGCCACACCCAACACCAGATCCAGGAGATGGAAGCATTCTTCAAGGAGTGTCCACACCCAGATGATAAACAAAGGAAAGAACTGAGCAGGGAATTAGGGTTAGAACCATTGCAGGTTAAGTTTTGGTTTCAGAACAAACGTACCCAGATGAAGACACAACACGAGCGGCATGAGAATACACAACTTAGAACCGAGAACGAGAAGCTTCGAGCTGATAACATGAGGTATAGGGAAGCTCTCAGCAATGCTTCGTGTCCTAATTGTGGTGGACCAACAGCAATAGGAGAAATGTCATTTGATGAACATCACTTGAGGCTTGAGAATGCAAGGCTTAGAGAAGAGATTGATAGGATTTCAGCAATTGCTGCTAAGTATGTAGGGAAGCCTGTGGTGAATTATTCAAATATTTCTCCTTCCCTCCCTCCTCGTCCTCTAGAACTTGGGGTTGGTGCTGGTTTTGGAGGCCAACCAGCTATTGGTGTGGACATGTATGGAGCTGGAGATCTTCTGAGATCAATTAGTGGACCCACTGAAGCTGATAAACCCATCATAATAGAGCTAGCTGTTGCAGCTATGGAGGAGCTCATTGGAATGGCACAAATGGGTGATCCCCTTTGGTTAACTACTCTTGATGCCTCATCCACTATACTCAATGAGGACGAATACATCAGATCTTTCCCTCGAGGAATTGGCCCAAAACCATCTGGCTTCAAATGTGAAGCTTCTCGAGAAACTGCTGTTGTTATCATGAACCATGTCAGCCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTTAACCAATGGTCTACAGTGTTCTCTGGTATAGTCTCAAGAGCCATGACTCTGGAAGTGCTATCCACAGGAGTGGCTGGGAACTACAACGGTGCCTTACAAGTGATGACAGCAGAATTGCAACTACCTACCCCTCTTGTGCCAACTCGTGAGAGTTATTTTGTAAGGTATTGTAAGCAACATTCGGATGGAACTTGGGCAGTGGTGGATGTGTCTCTGGATAATTTGCGCCCTAGTCCTTCAGCCAGATGTAGGAGAAGACCTTCTGGTTGCTTAATTCAGGAAATGCCAAATGGCTATTCAAAGATCAGTTACATTGACTTTTCCCATATACCTACTAAGTCACGTGGGTCGAGCATGTTGAAGTGGATGACAGAGGTGTTCATAATCTTTACAAACAGCTTGTTAGCTCTGGACATGCATTTGGTGCCAAACGTTGGGTTGCAACCTTGGATAGACAGTGTGAAAGACTTGCCAGTGCTATGGCAACAAATATTCCCACATGTTGATGTTGGTGTGATAACAAACCAAGAGGGGAGAAAGAGTATGATGAAACTGGCTGAAAGGATGGTGATAAGCTTTTGTGCTGGAGTGAGTGCTTCCACTGCTCACACATGGACAACACTGTCTGGAACAGGTGCCGATGATGTAAGGGTGATGACCCGAAAGAGTGTGGATGATCCTGGAAGACCTCCTGGCATTGTTCTCAGTGCAGCCACTTCTTTTTGGCTTCCAGTTCCACCTAAACGAGTTTTTGACTTTCTCCGTGATGAGAACTCTAGGAATGAGTGGGACATTCTTTCCAATGGTGGAGTTGTGCAAGAAATGGCACACATTGCAAATGGACGAGATACTGGAAACTGCGTGTCTCTACTTCGAGTAAATAGTGCAAATTCAAGTCAGAGTAACATGTTGATACTGCAAGAGAGTTGCACCGATTCAACAGGGTCTTTTGTGATATATGCTCCAGTAGATATTGTTGCAATGAATGTAGTTCTAAACGGAGGAGATCCAGATTATGTGGCACTTCTTCCTTCAGGGTTTGCAATTCTCCCAGATGGAACTATATCTCACGAAACTGGACCTGGTGGATCTCTTTTAACTGTTGCGTTTCAAATACTGGTTGATTCGGTTCCAACTGCTAAGCTTTCTCTTGGATCTGTTGCCACTGTCAACAATCTCATTGCATGCACTGTTGAGAGAATCAAAGCATCTTTGTCTGGTGAAACTGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_32839::LG9:26937405-26939405(-)
TTTCAATAAAATTTCTCAAACAAAGCTTATGAATAAATGCCTATAAAGAAAAGTTTTACTTGTTTCCTTATTTTTTTTAATTCCTTATTTTCTTTCAATAATAATTAAAAATAAAACTCCCAGTTTTCCTTTTAAGGATTGCTATGAATATTTCACCAAAAAGGTTCTCAATGCTAATCACTTCTTGTTGACAAGCGTCTGTGAAAAAAAATACAAATGAAAAATCATTAAAAATGACATTTAAATTTAAAATCACATTAAAAGCATTTAAAAATCCGAGTAAAGAGAATTAATAATATTTTTAATAAAACTATTCTAATTATTTAATCAACTACTCTTCACTGAATGAAATTATTCCACACTTATTTCAGTTGCTTAATTTCTATAACTTAACACAATTATCAACAAAAAAAGGACAACTTCAGGTAAACTAATATAGAATTAATTCAATTAATTAATATTAACCTACATTAACAGAGGAAAAACTTTATACCACCCTCAATAATCTTACTTACTTCCAATCAAGAATGTGTAAGAAAAAAAAAATCCCTATTTCCTTATCATAATCCTTACTTTGAATATTTCATTAACAAAACCTAAATCACGAAGGAAACACCAGAGTCTTTCTGAGCAGGTGAAAAACTTTCATTAAAAAGCATATTAAGAATGGCATTAAAACATATTAAAAACGTCATTAAAGCACATTAATAATATTTTGAAGAAAAAGCTCTTGTAATTCTTGAGCCATTACTCTTATATTAATGAGAAATATATACACTTATGATCGGAATGGTTGTAACATAAGAGAAAGAAAGAAGATGATGTTAATGGAGTTACAGGCAGAAAATTAATTTGAAGATAGCAGCATAACACTTAGCATTTGTTTGGTAGCCGTCATTCGTTGCATTGTTTTGCATTGCATTGCACCGTCAACTCTCAAAATTTTATACACCAAAAATATGCTGCGTCTCTTTCTCTCTCCCCTCTCTAGCAATTACACCTCTTTTGCCCTCCATTAAATGCAATTGCACCCTCTCTATACGCTCTGCAATTACTCTTCGCTGCCACATTTTCCTCCATCTGTTCCCCACTTCCCTCTCTCTCCCTCCTTCCTTCAATGCCCTTGTCCCTATCTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTTCTTTCTCTCCCTAACAAACCATCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTCTTCAAATGGCTCCTCACTTTTCTACTGCTTTTTAGTCCCTAAACAGATCTACTACTACACCTTCTTCATCTTCCACCACCCCTCACTGGTAAGTTAAAGAGTTTGTCAGTCAAACTGTCGTGGCATCCACTGTTACGATGGCTTGTTACAGTTCTGTGAGGTCACTGGTTTTTTGAGTAATGGGGTGTTCGGTACATGTTTTTTGAGTTCTAACAGGTTTTTAGAAAGTGGCTAGAAACTAGGGCTGGGTTAGAGTGAAAGGGAACGCTAGGTTTGTAAGAAAGAGAAATATCCTGAAATACATGAAGCGTGTAGGATTCTCTGAGATCTTCGTGGGAGTTGGATTTTCTTGAAAAAAGTTTTGATCTTGCTCTTTGACAAGGCAAGATCAGAAAAGGGTATCGGTGTTTCTCCGCTTTTTGATTCATATGTGCATTGATGTGTATATCATTCTATAGGGTATGTTTGTTTTTGAGCATTTGATTTTTGTTTTTTAATCTTTTTCTCCCTTGCAGGTCACGTTTGCGGATGCTTGAGTTTTGTAGTAACACACTGACTCGCTTTGACATTGCCATCTGACAGAATCCGAGGACTCGTCGTTTTTAGCTTCTTCTTCTGTATCCAAGGACCTCTGAAAACCCAACCAACCCTTGTGGTAAGAGAGAGAAAGTGATAGGAATATAGAGAGAGAGAAAAAGAGAAAAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCAATTCAGAATATAAATGTTGGTGGTGGTGGTTTCTGAGGTGTGTGAAAAACACAAGGCGGTATT


Gene Sequence:
>Vu_32839(-)
ATGATTCCAGCGAGAAACATGCCGTCGATGATAGCTAGGAAGAACAAGAACAACCTTGGTGAGTTTGGATCATCTTCAACTTTCACTCTTGCGCAGGTGGGTGTTTTAACTTTTCACCTTCTCTTTCAACGCATTTGACTCGCTTTTTTTATTCTTCACCACTTCAATTCCCCAAACTCGGTTTTAATTAAAATTTTCAAACAAATTTGACTCCTTTCATATTTTCACTTTTTAACTTTGCATCACAGCAACAAAATAAACAAACCCCTTTTTTTGTACCACCAACCAGGCCAAATATCCTTCTCGATATTAGAAAGCCGCGTTTTCCCCAAAACTGCGTTATATTTTCTCAAAAAAAAAAAGTCAAAAGGAAAAGTTTACAAATAGTTAAAAAAAAAAGAAAGAGAAATTATCTTACAAAGAAATAAAATGTTGATGTCTGTGTCTTTTTCTCTATGAGTGTACCGTACTATACTACATGTTTCTGTGCTGTGTTTTGTTAGATTGAGAAAGCATAAGCCTCTGGAACCTTGAAGATCTGTAACAATGTTCCAGCCGAACCTGATGGAAGCCTTGGAGATGGGTCAGAACACTTCGGAGAGTGAGGTTCCTCGAATCCGTGAAGATGAGTTCGACAGTGCCACCAAGTCTGGTAGTGAAAACCATGAAGGTGCCTCTGGTGAAGACCAAGACCCTCGTCCAAACAAGAAGAAGCGTTACCACCGCCACACCCAACACCAGATCCAGGAGATGGAAGCGTAAGTTACTCCAAATATACTCCATCTTCTTGATTTTTCTTTGGGTAAAATACTACATGTATGCTTCACCAAACACAGGTAATCCCTGTGCAAACCAGATATAACTATGAACAACAAAAGTGACATTTTTTCACAGAAATATTGTACCGGTTAGATATACTAGCTATTTCAAGTCTTGAACACCCAAACTTTTAATTAGTTTTATAAAGAAGCATCTAACATATTCTTTAAAGGAACTGATCAAATTATGTCTGTGCAGATTCTTCAAGGAGTGTCCACACCCAGATGATAAACAAAGGAAAGAACTGAGCAGGGAATTAGGGTTAGAACCATTGCAGGTTAAGTTTTGGTTTCAGAACAAACGTACCCAGATGAAGGTATATATCTGTATAACTGTGGTGCATGTGTTAGGTTTTGCCTTAACTTTTTTGTGAGATGTTCGTTAAAGGGGGTGTTTTGTTTTTGCAGACACAACACGAGCGGCATGAGAATACACAACTTAGAACCGAGAACGAGAAGCTTCGAGCTGATAACATGAGGTATAGGGAAGCTCTCAGCAATGCTTCGTGTCCTAATTGTGGTGGACCAACAGCAATAGGAGAAATGTCATTTGATGAACATCACTTGAGGCTTGAGAATGCAAGGCTTAGAGAAGAGGTACATCAGTTAAATAGCCAACATTTTATGTGACTTTATTAGTTGGTTACTCTAACTACTCCTTGGACCAATTAAGAAGGACCTTAATAAAGTCTCGAGTTATGTGTTACAGTTAGAAAATTAAAATGAATATTAAAAGGGAATTTTTAAGCAATGGACTAACAGTTACAAACCCCAGAGGGGTAGTTGATTATTATAACATTTTGTTTTTGGCTTTTTTGACAGATTGATAGGATTTCAGCAATTGCTGCTAAGTATGTAGGGAAGCCTGTGGTGAATTATTCAAATATTTCTCCTTCCCTCCCTCCTCGTCCTCTAGAACTTGGGGTTGGTGCTGGTTTTGGAGGCCAACCAGCTATTGGTGTGGACATGTATGGAGCTGGAGATCTTCTGAGATCAATTAGTGGACCCACTGAAGCTGATAAACCCATCATAATAGAGCTAGCTGTTGCAGCTATGGAGGAGCTCATTGGAATGGCACAAATGGGTGATCCCCTTTGGTTAACTACTCTTGATGCCTCATCCACTATACTCAATGAGGACGAATACATCAGATCTTTCCCTCGAGGAATTGGCCCAAAACCATCTGGCTTCAAATGTGAAGCTTCTCGAGAAACTGCTGTTGTTATCATGAACCATGTCAGCCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTTGTATGTTTCACTTCCTTTACTCGATTTCAATAATGTTTATTCTATGTTATTCACTGAAGAGAACTAAACAAAGTTATTTCAAGTCTAACTATTTCTCTGGGCTTTGCCATTGATTTCTTGATTGTTTTCAGAACCAATGGTCTACAGTGTTCTCTGGTATAGTCTCAAGAGCCATGACTCTGGAAGTGCTATCCACAGGAGTGGCTGGGAACTACAACGGTGCCTTACAAGTGGTACACATATAGAAATTATCTCTTTTATTTGTTAAAGTACTTTAGTCTTAACAAATCAAACAATACAAAATGAAACTGATGTTTGTTTCTGCAGATGACAGCAGAATTGCAACTACCTACCCCTCTTGTGCCAACTCGTGAGAGTTATTTTGTAAGGTATTGTAAGCAACATTCGGATGGAACTTGGGCAGTGGTGGATGTGTCTCTGGATAATTTGCGCCCTAGTCCTTCAGCCAGATGTAGGAGAAGACCTTCTGGTTGCTTAATTCAGGAAATGCCAAATGGCTATTCAAAGGTATAGTCGAGACACTTATAGGGTAATTTTGTACATGTTGGATTCTTACTTGTATTTACAATATTGTTGAAATTGTAAAGATCAGTTACATTGACTTTTCCCATATACCTACTAAGTAGGAGGCTTTGATTTTTAGACCTAGGCCATACCCTTTATTTCATTTTTTCTCCTCAATGACTTAATCTATAATATCTATGAATTAGGTCACGTGGGTCGAGCATGTTGAAGTGGATGACAGAGGTGTTCATAATCTTTACAAACAGCTTGTTAGCTCTGGACATGCATTTGGTGCCAAACGTTGGGTTGCAACCTTGGATAGACAGTGTGAAAGACTTGCCAGTGCTATGGCAACAAATATTCCCACATGTTGATGTTGGTGGTAATAATAGATTCTCATTTCCTGTTCTTTCACCATAACCATATCCAAAGTAATTAACTTTTTATTCTGAATATGTTTATCAGTGATAACAAACCAAGAGGGGAGAAAGAGTATGATGAAACTGGCTGAAAGGATGGTGATAAGCTTTTGTGCTGGAGTGAGTGCTTCCACTGCTCACACATGGACAACACTGTCTGGAACAGGTGCCGATGATGTAAGGGTGATGACCCGAAAGAGTGTGGATGATCCTGGAAGACCTCCTGGCATTGTTCTCAGTGCAGCCACTTCTTTTTGGCTTCCAGTTCCACCTAAACGAGTTTTTGACTTTCTCCGTGATGAGAACTCTAGGAATGAGGTATGCCAACCATTCAAAAAGGCTAATTAAGTTAATTAATAACGTTTTAGGCTGCATTATTGTGTTCTCTTAGGTCCCTTATTAATGGATAATTAACCTTCCTTTGGTAATCTTGCTTACTTGGTGGATTTATTGTTATGAATTGCTCCTTCTCTTTCTTTCTCAAGATTTGACTGCCTAGATTTTACACCAATTACCTTCTATCAAGTGCTTTGGATTACATATCCTTTTCAGGTTGCCAAACACGGTATGATAGATGCTTTTCAATAAAAGCATAATAAGTTAGATGAAAAATGTTAGGTAGAATAACTATAGATATCTACTTTTACACCCACGTACACTATTTTACAGTTAGCTGATATGTTCATTATCTAATTGGTCCTCATTTCGTTTTCTGAACACCTATTTTCGGATTCTACTGATGTAAAATGACGTTTTCAAATGTATACCAGACATTGTTACATTAGATAAGAACCTTTACTTCATGTCATCCGAATAAAAGTAACTTTATTTTCTCTTATCCATGAATTTTAACAAAATAATTTCGACAATATAAAAAGTATAAGTATTTTATATGGGTAATTATTCTTAATTTATCATGTAAGTTAAAATTATAATTTAAAAAAAAATTCGAAGTCCTTTTTAATTTGTTAACCGTGCTTGAAATTAAAAATTGTTCTTATATTAAAGCATATAATAAAGAATGTGGTTAGTCCTAATAATATATATATTGATTTTGATTTCTTTTACATGTGTATATTATCTGTATTTCATTTTAATATTTTTAATTGAATTTCCAAACAACAGTGGGACATTCTTTCCAATGGTGGAGTTGTGCAAGAAATGGCACACATTGCAAATGGACGAGATACTGGAAACTGCGTGTCTCTACTTCGAGTAAATGTATGTTTATATCTTAAATTCATTTTTTACTCATTTTGAATTATTTAATTAGCTAAATCTAACCTATGTCAAATTGTAGAGTGCAAATTCAAGTCAGAGTAACATGTTGATACTGCAAGAGAGTTGCACCGATTCAACAGGGTCTTTTGTGATATATGCTCCAGTAGATATTGTTGCAATGAATGTAGTTCTAAACGGAGGAGATCCAGATTATGTGGCACTTCTTCCTTCAGGGTTTGCAATTCTCCCAGATGGAACTATATCTCACGAAACTGGACCTGGTGGATCTCTTTTAACTGTTGCGTTTCAAATACTGGTTGATTCGGTTCCAACTGCTAAGCTTTCTCTTGGATCTGTTGCCACTGTCAACAATCTCATTGCATGCACTGTTGAGAGAATCAAAGCATCTTTGTCTGGTGAAACTGCTTGA