Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34493 LG10 11663775 11667908 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g12460
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein-containing complex assembly, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein-containing complex assembly, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   chloroplast
Molecular Function   enables   kinase activity, protein binding, protein binding, protein kinase activity, ATP binding, ATP binding, protein kinase activity, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 11663795 3_prime_UTR_variant
C/A 11663810 3_prime_UTR_variant
C/A 11663820 3_prime_UTR_variant
T/G 11664055 3_prime_UTR_variant
G/A 11664064 3_prime_UTR_variant
G/C 11664132 3_prime_UTR_variant
T/G 11664237 3_prime_UTR_variant
A/T 11664512 missense_variant p.Leu797His
T/C 11664544 synonymous_variant p.Glu786Glu
A/C 11664823 synonymous_variant p.Thr693Thr
T/A 11664992 missense_variant p.Glu637Val
G/A 11665048 synonymous_variant p.Gly618Gly
A/G 11665098 synonymous_variant p.Leu602Leu
T/C 11665386 missense_variant p.Thr506Ala
T/G 11665478 missense_variant p.Glu475Ala
A/T 11665522 missense_variant p.Phe460Leu
T/C 11665526 missense_variant p.His459Arg
C/T 11665600 synonymous_variant p.Gln434Gln
G/A 11665614 synonymous_variant p.Leu430Leu
G/T 11665670 missense_variant p.Ser411Tyr
G/T 11665780 downstream_gene_variant
G/T 11665993 missense_variant p.Pro332Gln
T/C 11665997 missense_variant p.Ile331Val
C/G 11666248 missense_variant p.Gly247Ala
G/T 11666448 synonymous_variant p.Ala180Ala
C/T 11666547 synonymous_variant p.Leu147Leu
G/T 11666607 synonymous_variant p.Ser127Ser
C/T 11666912 missense_variant p.Ala26Thr
A/C 11666933 missense_variant p.Tyr19Asp
T/C 11667085 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 11667206 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 11667230 5_prime_UTR_variant
T/C 11667231 5_prime_UTR_variant
C/T 11667239 5_prime_UTR_variant
A/T 11667547 5_prime_UTR_variant
C/T 11667707 5_prime_UTR_variant
T/A 11667811 5_prime_UTR_variant
A/G 11667833 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34493.1
MRRHRAIHLSHALLCTFFYCLVTASAVTEKEILLEFKGNITDDPRASLSSWVSSGNPCNDYRGVSCNSEGFVERIVLWNTSLGGVLSSSLSGLKRLRILTLFGNRLSGGIPEGYGDLHSLWKINLSSNALSGSIPEFIGDLPSIRFLDLSKNGFTGEIPSVLFRYCYKTRFVSLSHNNLAGSIPASLVNCFNLEGFDFSFNNLSGVVPSGLCGIPRLSYVSLRNNALSGSVQELISSCQSLEHLDFGSNRFTDLAPFSVLEMQNLTYLNLSYNGFGGHIPEISSCSGRLQILDASGNLLDGEIPTSITKCKSLKLLALELNRLEGNIPMDIPELRGLIVIKLGNNSIGGMIPKGFGSVELLELLDLHNLNLVGQIPDDISNCKFLLGLDLSGNKLEGEIPQTLYNLTNLESLNLHHNELNGSIPPSLGNLSRIQYLDLSHNSLSGPIPTSLGNLNNLTHFDLSFNNLSGFIPEIENIQRFGASAFSNNPFLCGRPLDTPCLVNGATSPSSPGKAKVLSTSAIVAIVAAAVILTGVCLVTIMNMAARGRKKQDDQIMIVESTPLGSTESNLIIGKLVLFSKSLPSKYEDWEAGTKALLDKESLIGGGSIGTVYRTDFEGGISIAVKKLETMGRIRNQEEFEHEIGRLGNLQHPNLVAFQGYYWSSSMHLILSEFVPNGNLYDNLHGLGYAGTSTSRGNRELYWSRRFQIAVGTARALAYLHHDCRPPILHLNIKSSNILLDDKYEAKLSDYGLGKLLPILDNYGLTKFHNAVGYVAPELAQGLRQSEKCDVYSFGVILLELVTGRKPVESPTTNEVVVLCEYVRGLLETSSASDCFDRNLLGFTENELIQVMRLGLICTSEDPLRRPSMAEVVQVLESIRNGLDSH*


CDS Sequence:
>Vu_34493.1
ATGAGAAGACACCGTGCTATTCATCTCTCTCATGCTCTACTGTGCACCTTTTTTTATTGTCTTGTGACAGCTTCTGCAGTGACCGAGAAGGAAATTTTGCTTGAATTCAAAGGTAACATCACGGACGATCCACGCGCCAGCTTGAGTTCGTGGGTTTCAAGTGGGAACCCGTGCAACGATTACAGAGGCGTTTCGTGTAACTCTGAAGGGTTTGTGGAGAGAATCGTGCTGTGGAACACTAGCTTGGGAGGGGTGTTATCCTCGTCACTTTCGGGGTTGAAGAGGTTGAGGATATTGACGTTGTTCGGAAACCGTCTCTCGGGTGGTATTCCAGAAGGGTATGGTGATCTTCACTCACTGTGGAAGATCAATTTGAGTTCCAATGCTTTATCTGGTTCTATCCCCGAGTTCATTGGTGATTTGCCTAGCATTCGGTTTCTGGATTTATCCAAGAATGGCTTCACTGGGGAGATACCTTCGGTTTTGTTTCGGTACTGCTACAAAACAAGGTTCGTTTCTCTTTCTCATAACAACCTCGCCGGTTCAATTCCTGCCTCCTTGGTGAACTGCTTTAACCTTGAAGGGTTTGATTTCTCCTTCAACAACCTTAGTGGGGTTGTCCCTTCCGGGCTTTGTGGCATTCCAAGGTTGTCTTATGTGTCGCTGAGAAACAATGCCTTGTCAGGGAGCGTGCAGGAGCTCATTTCCTCATGCCAAAGTCTGGAACATTTGGATTTTGGAAGTAATAGGTTCACTGATTTGGCACCGTTCAGTGTCCTTGAAATGCAAAATCTTACCTATCTCAATTTATCGTATAATGGGTTTGGAGGACATATTCCTGAGATCAGTTCCTGTAGTGGGAGATTGCAAATCTTGGATGCTTCGGGGAATCTTTTAGATGGGGAGATTCCCACCAGCATAACAAAATGCAAGAGCCTAAAGCTCTTGGCGTTGGAATTGAATAGACTGGAGGGGAATATCCCAATGGATATTCCGGAACTGCGGGGACTAATTGTTATCAAATTGGGTAATAATTCCATTGGTGGAATGATCCCCAAGGGCTTTGGCAGCGTCGAGCTTCTTGAATTGCTGGATTTGCACAATCTGAACCTCGTTGGCCAAATTCCTGATGATATAAGCAATTGCAAGTTTCTTCTTGGGCTGGACCTTTCTGGTAATAAATTAGAAGGTGAGATTCCTCAGACTCTTTACAACTTGACAAACCTGGAATCCCTTAACCTACATCATAACGAGCTTAATGGAAGCATCCCCCCAAGCCTAGGAAACCTATCAAGGATTCAGTACCTAGATCTTTCACATAATTCACTTTCTGGCCCAATCCCTACTTCCCTTGGAAATTTAAATAACTTGACACATTTTGATCTCTCATTCAATAATCTGTCTGGTTTCATTCCTGAGATTGAAAACATACAGCGTTTTGGTGCATCTGCATTTTCCAATAATCCTTTTCTCTGTGGTCGTCCTTTGGACACCCCTTGCTTGGTAAACGGAGCTACATCGCCTTCATCTCCTGGGAAGGCTAAAGTTCTAAGCACCTCAGCAATCGTTGCAATTGTTGCTGCAGCTGTAATTCTCACTGGGGTTTGTTTGGTGACCATCATGAATATGGCGGCACGTGGTAGAAAAAAACAGGATGATCAGATTATGATTGTTGAGAGCACCCCTCTTGGGTCAACAGAATCAAATCTTATAATTGGAAAGCTGGTTCTCTTCAGCAAAAGTTTACCATCAAAATATGAAGATTGGGAGGCAGGTACCAAAGCATTGCTTGATAAAGAGTCTTTGATAGGTGGTGGATCAATTGGTACAGTCTACCGAACTGATTTTGAAGGCGGGATCTCAATTGCAGTGAAGAAGCTCGAGACTATGGGAAGGATTAGAAACCAGGAGGAATTTGAGCATGAAATTGGGCGACTAGGCAATCTTCAACACCCTAATTTAGTTGCTTTTCAAGGTTATTATTGGTCCTCTTCAATGCATTTGATTCTATCAGAGTTTGTCCCAAATGGGAATCTCTATGATAATCTACATGGGTTGGGCTATGCTGGAACCAGTACTAGTAGAGGAAATAGGGAATTATATTGGTCTAGAAGGTTTCAAATTGCAGTGGGAACCGCAAGAGCCCTTGCTTATCTCCACCATGACTGTAGACCTCCAATTCTTCATCTCAACATTAAATCCTCTAACATACTCCTAGATGACAAGTATGAAGCTAAGTTGTCTGATTATGGATTAGGAAAGTTACTTCCCATTTTGGATAATTATGGTTTGACCAAATTCCACAATGCTGTGGGATATGTTGCACCAGAGTTGGCTCAAGGGCTGAGGCAGAGTGAAAAATGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTCATTCTTTTGGAGCTGGTTACAGGGAGGAAGCCTGTGGAAAGTCCAACCACAAATGAGGTGGTGGTCTTGTGTGAATATGTAAGAGGTTTGTTAGAGACTAGCTCAGCTTCAGATTGCTTTGACAGAAATTTACTGGGCTTTACTGAGAACGAATTAATTCAGGTTATGAGATTGGGACTAATTTGTACTTCGGAGGATCCTTTAAGGAGACCAAGCATGGCTGAGGTTGTCCAGGTCCTTGAGTCCATTAGAAATGGATTAGATTCCCATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_34493::LG10:11667908-11669908(-)
ATCCACTGTTTCACAAGTCTAAAAACACAGGTGCAAATTCGAATTCGATTGCAAAACGAAATGGGTTGTATGACGTGGATTCCATAAATGACATTGAAGTGTTTATGTCAGTTGGCTCTCTCGTTTGTTTTCTTTTGGGGGACATGGCTCAATACTGGTGTGTACTCTTTCTCAGATGGAGGCCATGTCTCATAGATTATCTGCAACATTTTTTCTCTTTTAATTCATAAATATTAATGGTTAGCATTATGTTAACGAAATAATTGAATCCACTTTTTAGACTAATTTCTCTCTTCTAAGTTTAAGCATTTAATTTATGGAATGCTGAATTCAACAAGAAATTAGAGGTTCTTTATAATTTTTCAAAAGAGGTAGAAGGATCCAAAGATTAGGAGGACCCAGGACCACGATTTTATTTATTATTATTATTATTATTGTTATTTAATGCATTTTCAAACAAAGGCACGATGGAAACCTACCTTTTGGAGATGTTGATTTATGCTTAGATGGTATGTCATTTGCAAAAGTTGGTCTTTTTAACCGTTGATTAAGTAAGAAAAACAAAACCCTTTACATATAAAAGGAAAAGAAGAACAGAAGTGAAGAGATTCTTGTCCCTCTCTACGCTCAAATGCTAAAAGACAAATTTGAACAAAAGGGAATAACGTTTTAAGAGAAGGACTTTTCACACCCTTGAAATACGTAATAAAGAAAAAAATAAATAAAACGTTTAGAACACTTAATGGAGAGGACCATCCTTTTTCCATTTCAATCGGACGGCCACAATCACCTATCATGACAAATAAATGCCACGTGTCAAGAATCGGTTCGCCTGTGTATTTTTGATAGAATATTGTGTAATAATTTTGAAAACGTCCAGTAAAACAAAAAGACCAATAATAATATTCATTAAAAATATAAAATGTAACTATCCAGTTATAATATTCATTAAAATATATATTTTTTTTTCATAACTGTAAGCGGTTTGGTCCAGCTTCTTTTAGATACATTGATTGTATGTTTTGATTAGTGAAAATTAAATGGAATTGTGAGAATGGAGAGCACAGGGGGGAAAGAGTTATATATATATATATATATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATATATGTATATGTATGTATATATATGTATATGTATGTATATGTATATATATGTATATATATGTATGTATATGTATATATATGTATGTATATGTATATATATGTATGTATATGTATATATATGTATGTATGTAATAAATAAAATTACTTAAAAATATTTTTTTTAAATTTTAATTTAATTAAAAAGTTAATTTTTAAATATAATTTAAATTATTCAATGAATATTAATAAATTATTAATGTAAATAAATTTGAACTTTTAAAAGTTTAATTTAAATAATTTATATCAAAAAATAAATTTTAAAAATTAAAAAAATGATTTCAATATTATAAATCTAAATAAAAAATAAAAATACATAAAATCAAATTCTAAATATTTTTATAATCAATATCTTTTTACTAATAATCTTATTTTAATAAATAATTTGCATAGTATAACTATCCGATGAACCGTATATCGGATAGTCGCAACGACCAGCAATAAAACAATATATCAAAATATTAACTACATTAATTGTTAATAATATTTAGATTAACCTTAAAACAAGTTACGTAGGTTATAATTAAACAAGTTTTAATAAAAAATTCATTACAAAAATTTATAAATGCATATTTAATATTTAGATAATTTATTGTTTTTATTACACATTTATTACGTAACTATATAATTGTAAAATATTATATAAAAAAATGGTGTCTATAAAACATAATTGATTATATATATATAAGTGTAAGTAAATGGAGTTAGAAAATGGTTTGGAAGTGAGTAAATTTTCTTGAGTTGGGAGCTGGTAATTGGGAGGAATTGGTATGAAAAGTGTGGCGAAGGAAACGGATAGATAGAATAAAGCAAGGAGGGCCAGGAAACGGTACT


Gene Sequence:
>Vu_34493(-)
ACAGACAAAGAAACACACTCCTTAACTCTTTTCTTTTCCACTCTCATCTTCTTCCTTCAACTTTTCTTTTATTTCTCCCCAATGATTCTACTACATTACCCATCTCCTCTTGCATATTAAATGGGATGGTGTTGGAGATAGCGATGTGGGAGGTGGTGGCTTGGTTGGTAGGGAAGAATAAATGCCGGTTAAGAGAAGCAGGCCCTACACAACAATGCAAGACATGGTGGAGAGATTAGTAGCAGTAACTCCTCAAGCTCACAGACACAGATTGGATTTTCATTGTTCAAGGGCATCATTGCCTTACAAAGTCTAGAGAGAGAAACACCCTCTCTCTCTCTCTCATGCACGTGCTTCATCCTTCATTTGGTGGCAATCTCTGAATTTATACATCACACCCTATTAAAAGAACTTTATTTAATTCCCTCCCACTGTCTCACCTGCTTCCTTTCCAGCAAAGGTACAGCCACCATTTCCACCTTCTTCATTTCATCACATTTACTCTTCTCTTCCCCCCCCACTCCTCCCTGCCCTCCATTCCTTCTCTCTCTTTCTCTCCAAAAGCTCCCATTTTTATGTCACCCCACAATCAATCAACCATTAAAAAACACGGAACACGACGTGGGCATTATTGAATCTTTCTTCTTCATGCTTATACGGAGAACCATGGAGGAAAAAACAGTGAGAGATTAAACGGGTACTATTTTTATTCTTTTTTTTTGGGTTTGTTTCTCTCTCCTGCAATTCCAGTCTTCTGAATGAGAATGCTCCCCGTCGGTGATGATCGTGATGTTTTGTTTCTTATTGGACCGACTTTACGATTACCTGAAACTTTGTAGCTGAGGAAGCAACACCTCAGAATCGACTCTGGTTCGGTTGTGACAGCTATGATGTCAAAGGGGTGATCACATTGTTTCGAGCATGAGAAGACACCGTGCTATTCATCTCTCTCATGCTCTACTGTGCACCTTTTTTTATTGTCTTGTGACAGCTTCTGCAGTGACCGAGAAGGAAATTTTGCTTGAATTCAAAGGTAACATCACGGACGATCCACGCGCCAGCTTGAGTTCGTGGGTTTCAAGTGGGAACCCGTGCAACGATTACAGAGGCGTTTCGTGTAACTCTGAAGGGTTTGTGGAGAGAATCGTGCTGTGGAACACTAGCTTGGGAGGGGTGTTATCCTCGTCACTTTCGGGGTTGAAGAGGTTGAGGATATTGACGTTGTTCGGAAACCGTCTCTCGGGTGGTATTCCAGAAGGGTATGGTGATCTTCACTCACTGTGGAAGATCAATTTGAGTTCCAATGCTTTATCTGGTTCTATCCCCGAGTTCATTGGTGATTTGCCTAGCATTCGGTTTCTGGATTTATCCAAGAATGGCTTCACTGGGGAGATACCTTCGGTTTTGTTTCGGTACTGCTACAAAACAAGGTTCGTTTCTCTTTCTCATAACAACCTCGCCGGTTCAATTCCTGCCTCCTTGGTGAACTGCTTTAACCTTGAAGGGTTTGATTTCTCCTTCAACAACCTTAGTGGGGTTGTCCCTTCCGGGCTTTGTGGCATTCCAAGGTTGTCTTATGTGTCGCTGAGAAACAATGCCTTGTCAGGGAGCGTGCAGGAGCTCATTTCCTCATGCCAAAGTCTGGAACATTTGGATTTTGGAAGTAATAGGTTCACTGATTTGGCACCGTTCAGTGTCCTTGAAATGCAAAATCTTACCTATCTCAATTTATCGTATAATGGGTTTGGAGGACATATTCCTGAGATCAGTTCCTGTAGTGGGAGATTGCAAATCTTGGATGCTTCGGGGAATCTTTTAGATGGGGAGATTCCCACCAGCATAACAAAATGCAAGAGCCTAAAGCTCTTGGCGTTGGAATTGAATAGACTGGAGGGGAATATCCCAATGGATATTCCGGAACTGCGGGGACTAATTGTTATCAAATTGGGTAATAATTCCATTGGTGGAATGATCCCCAAGGGCTTTGGCAGCGTCGAGCTTCTTGAATTGCTGGATTTGCACAATCTGAACCTCGTTGGCCAAATTCCTGATGATATAAGCAATTGCAAGTTTCTTCTTGGGCTGTGAGTTTTTTATCTTTCTCTAATTGCTCTGTATTATGTTAAACCCTCTGAATAAAATCTTAGTTCATTCTTTTTTGTCGCTGCAGGGACCTTTCTGGTAATAAATTAGAAGGTGAGATTCCTCAGACTCTTTACAACTTGACAAACCTGGAATCCCTTAACCTACATCATAACGAGCTTAATGGAAGCATCCCCCCAAGCCTAGGAAACCTATCAAGGATTCAGTACCTAGATCTTTCACATAATTCACTTTCTGGCCCAATCCCTACTTCCCTTGGAAATTTAAATAACTTGACACATTTTGATCTCTCATTCAATAATCTGTCTGGTTTCATTCCTGAGATTGAAAACATACAGCGTTTTGGTGCATCTGCATTTTCCAATAATCCTTTTCTCTGTGGTCGTCCTTTGGACACCCCTTGCTTGGTAAACGGAGCTACATCGCCTTCATCTCCTGGGAAGGCTAAAGTTCTAAGCACCTCAGCAATCGTTGCAATTGTTGCTGCAGCTGTAATTCTCACTGGGGTTTGTTTGGTGACCATCATGAATATGGCGGCACGTGGTAGAAAAAAACAGGATGATCAGATTATGATTGTTGAGAGCACCCCTCTTGGGTCAACAGAATCAAATCTTATAATTGGAAAGCTGGTTCTCTTCAGCAAAAGTTTACCATCAAAATATGAAGATTGGGAGGCAGGTACCAAAGCATTGCTTGATAAAGAGTCTTTGATAGGTGGTGGATCAATTGGTACAGTCTACCGAACTGATTTTGAAGGCGGGATCTCAATTGCAGTGAAGAAGCTCGAGACTATGGGAAGGATTAGAAACCAGGAGGAATTTGAGCATGAAATTGGGCGACTAGGCAATCTTCAACACCCTAATTTAGTTGCTTTTCAAGGTTATTATTGGTCCTCTTCAATGCATTTGATTCTATCAGAGTTTGTCCCAAATGGGAATCTCTATGATAATCTACATGGGTTGGGCTATGCTGGAACCAGTACTAGTAGAGGAAATAGGGAATTATATTGGTCTAGAAGGTTTCAAATTGCAGTGGGAACCGCAAGAGCCCTTGCTTATCTCCACCATGACTGTAGACCTCCAATTCTTCATCTCAACATTAAATCCTCTAACATACTCCTAGATGACAAGTATGAAGCTAAGTTGTCTGATTATGGATTAGGAAAGTTACTTCCCATTTTGGATAATTATGGTTTGACCAAATTCCACAATGCTGTGGGATATGTTGCACCAGAGTTGGCTCAAGGGCTGAGGCAGAGTGAAAAATGTGATGTTTACAGTTTTGGAGTCATTCTTTTGGAGCTGGTTACAGGGAGGAAGCCTGTGGAAAGTCCAACCACAAATGAGGTGGTGGTCTTGTGTGAATATGTAAGAGGTTTGTTAGAGACTAGCTCAGCTTCAGATTGCTTTGACAGAAATTTACTGGGCTTTACTGAGAACGAATTAATTCAGGTTATGAGATTGGGACTAATTTGTACTTCGGAGGATCCTTTAAGGAGACCAAGCATGGCTGAGGTTGTCCAGGTCCTTGAGTCCATTAGAAATGGATTAGATTCCCATTAATCAGTTATAGCTTTTCCATGCTGTGCAGCTCAGAATTGAAGTGATTGCTTAATTTGTTAAATTCTTCATGGACAGGAGGTATCAGATTTAGGCATTTAGGCATACATGGAACGAGATTTGGATCAGGATGGAATGTGTGTGCAGGAGGTATCAGATTTGTTACTCGGCCATTCAAAACGCAGAAAAGAAAAGGATAAAAATTCTTTTGTATTCTTTTTTATATTGCCATTATTTTTTTCATAAATTTGTAACTTCTGCAAATAAGGGCATTTGTTTATTCCATTACTTCTCGTGCTTTCAAGGGGGAAACAAAAAGTCTTGTTATTCATTTCCTACTAATTCTGTTTCGGCTTCGGTAACATGTCATGAGGGATAAACCACTGTATGTGAAAATGTGGGAGATCACATATCTTTTAATTGTATGACTAAAATAGAGTATATATCCTAGAGCAAATTTCATCTTACAGTT