Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35845 LG11 6268496 6269914 PREDICTED: two-component response regulator ARR18-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 6268871 missense_variant p.Ala204Val
C/T 6268984 splice_region_variant&synonymous_variant p.Thr166Thr
A/G 6269027 downstream_gene_variant
T/C 6269078 downstream_gene_variant
T/A 6269079 downstream_gene_variant
T/A 6269266 downstream_gene_variant
A/G 6269324 splice_region_variant&intron_variant
G/T 6269580 downstream_gene_variant
G/T 6269715 missense_variant p.Pro67His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35845.1
MGESRVSQCSKTSPSNIDEEECESHANEDQRKQNNNGGSSSNSTVEESEKKIRPYVRSKLPRLRWTPDLHLRFVHAVQRLGGQERATPKLVLQLMNMKGLSIAHVKSHLQMFRSKKLDDRNQVFSDHTSLVEIGDKNIYNLSQLSMLQGYNPSQSSSYSYTNNIYPSYGFGDASFGSYEKLVHRPFDWFNGMSRAGSSISGEQSTSKTREPKNELFSFGAYENLCTRFKHSPSNIIQQTPQNLMPVNPTTELKTLKRKAEDSSLDLDLSLKLNTNMDSEGTKSEDHEVHSNLSLSLCSQSSSSNLSSRLKAAKDRCEEHGKRASTLDLTI*


CDS Sequence:
>Vu_35845.1
ATGGGAGAAAGCCGAGTCTCCCAATGTTCAAAGACAAGCCCTTCTAACATTGATGAGGAAGAGTGTGAAAGCCATGCGAATGAAGATCAAAGGAAGCAAAACAACAATGGAGGAAGCTCAAGCAACAGCACAGTGGAAGAGAGTGAGAAAAAGATTAGACCTTATGTTAGATCCAAGTTACCAAGGCTTCGATGGACACCTGATCTTCATCTTCGCTTTGTTCATGCTGTTCAACGACTTGGAGGACAAGAGAGAGCAACTCCTAAACTGGTTCTTCAACTGATGAACATGAAAGGTTTGAGTATTGCCCATGTCAAGAGTCATTTGCAGATGTTTCGGAGCAAAAAGCTGGATGACCGAAATCAAGTATTTTCCGATCATACCAGTCTTGTTGAAATTGGAGACAAAAATATTTATAACCTTAGCCAACTTTCCATGCTTCAAGGATACAATCCCAGTCAAAGTTCGTCCTACAGCTACACAAACAATATCTATCCAAGTTACGGATTCGGGGATGCTTCTTTTGGTAGCTACGAAAAACTTGTGCACAGACCTTTCGATTGGTTTAATGGAATGTCTCGGGCAGGTTCATCCATTTCTGGTGAACAATCAACAAGCAAAACCCGTGAACCAAAAAATGAGCTTTTCTCATTTGGTGCTTATGAAAATCTATGCACAAGATTTAAACACAGTCCATCAAATATTATTCAACAGACACCACAAAACCTCATGCCTGTAAATCCAACAACAGAATTGAAGACACTGAAAAGGAAGGCTGAAGATTCATCACTTGATTTGGATCTGTCACTGAAACTAAACACAAACATGGATTCCGAAGGAACAAAATCGGAGGACCATGAAGTTCATAGCAATCTGTCTCTGTCGTTGTGCTCTCAATCCTCCTCTTCCAATCTCAGCAGCAGGTTAAAGGCAGCAAAAGATCGATGTGAGGAACACGGAAAAAGGGCCAGTACTCTAGATCTGACTATATGA


Promoter Sequence:
>Vu_35845::LG11:6269914-6271914(-)
TTTCTTTTCTTTTTTATTAAAAACAATCTTCACTACCTTAATAATAATTTAATTTAATTTATTTTAAAATTTAAATATTATTAAAAATAATTTTGTATTTTAATAATTATTAAAATATAATTTATATTATAATAATAATTATATTAAAAACATAAAAATAAAATAATAAAAATAATAATAAAAATAGTAATAATAATAATAAAAATAAATTTGAGTTAATATATTCAAATATATTAAATTATAATAAAATATTAAAAATAAATTAAATAATCATTGAATTTTAAATAAAAATAAAAATTTTAAAAAGCTTATTTATATATTAAAATCTATAAAATATGTTAATACTTTGATTTTTATTTAAAATTTAATAAATATTAAACTTAAATAAAAATTATAATATTATTTATTATATTTTTATATTTTAATAATTAATAAAATATAATTTATATTTTTAAAATAGTTCTATTAAAAAAATTAAAAAATAATAACTAAAATAAGAATAAAAATAAAAATAAAAACAATACTTAAAATCATATTTAATATATTTAAATATATTAAATAATATTAAAATATTAAATTAAATTTAATAATTATTAAAATTTTAAACAAACAAAATTTTGAAAAATTTGTTAATCGGATATAGATATCCGATAAGTTATAAATCGGATATCCATATCCGATAAAGAATGTTTTTAAAATTTTATTTTATATATAAATTTTAATAATTATTTAATTTAATTTAATATTTTAATATAATTTAGTATATTTAAATATTTTATTTAATATAATTTTATTTATTATTTGATAAATAACTGTTTTAAAATTTTGTTTATTATTTAAATTTTAATAATTATTTAATTTAATTTAATATTTTAATATAATTTAATATATTTAAATATATTAAATATTTTATTTAATATAATTTACATTTTTGTTATTATTTTTATTTTTAATTATTTTATTTTTATATTTTTAATATAATTATTATTATAACATAAATCATATTTTAATAATTATTAAAATATAAAATTATATTAAATAATATTTGAATTTTAAATTTAGTTATTATTAAGGTGATATAGAATCTTTTTAATAAGAAAAAGAAAAAAATAAGAATATATTTATTAAAATTAAAAATAAAATTTTCTATAAAGTTAAAGGTGTAGGATAATGATGAAATGTCAGAAGGTTAAAAGTGGAATTTTTGGAGGTGCAGGATGAGATCTTGGAGGTGTAGGATGAAACACTCTAAACCAAATAATATAAAATGGGCTTGGCAGAGTTAATAAGAAAACATGACCCAAGAATCAAACCCATGTTTCTAATTTCCTGAAAACAAAATATTTATGTATGTCAGAGATGGTCCACTGCTACACATAATCCAAAAATACCACCAGTTAATTTTTATTGCAATTATACTTTATTAATTGTCACAGGAAAAAAATACATATATCTTTATTCAAGTGGGAACAAAAAATGATTGTATTCACATTGAAATGTAAAGATATTCCTTTCATTGATGTCCATGCATATTTAAAAACACATATACATCAACATGGTAAGATATGAAACTATATTATGGTTTACTCTTCTCACACAGGCATTGACTAAAGAAAGAGAAGGGAAGAGAGAGAAACCTAGCTCAACAAGGAGCTCTAAATTCCATTGAAGATCACTGCAGGGTTTTTAACCTTATCATCACATATCCAGAGGTGTACGAATTGTCATCATCGATTATGCAACTATGTATATATAAATGTTTGTAGCTAGCTGAGTTCATGTTTCTAGGATCAATATTTTAACCGTTTTTGTATGGGGAAGAAGAGAAACAGGAAAAGAAATGCATATGAAAAAAATTTCTCACCTCCAATTATTATTCCTTTGTTGTTGTGATTTCTCCAATTGACCTGTTATCCAGAGAACAGTGTATGTTTCTTTTGTGTTATGATCTTGAAGGAAAGAGTATCATATAAAGTTGGAAAATCAAGGTGTATAAGAAG


Gene Sequence:
>Vu_35845(-)
ATGGGAGAAAGCCGAGTCTCCCAATGTTCAAAGACAAGCCCTTCTAACATTGATGAGGAAGAGTGTGAAAGCCATGCGAATGAAGATCAAAGGAAGCAAAACAACAATGGAGGAAGCTCAAGCAACAGCACAGTGGAAGAGAGTGAGAAAAAGATTAGACCTTATGTTAGATCCAAGTTACCAAGGCTTCGATGGACACCTGATCTTCATCTTCGCTTTGTTCATGCTGTTCAACGACTTGGAGGACAAGAGAGTCAGTTCCTTCATTATTTTTCTTTCAGTTTTCAGTATTTGTCTTCAATTCCAGTTAAGTTATATGCAGTAAAAAGAAAAACAACTTTTCACTGCTTCATCTGATACTGATTTTTGCATTTTTTGGTGTGCAGGAGCAACTCCTAAACTGGTTCTTCAACTGATGAACATGAAAGGTTTGAGTATTGCCCATGTCAAGAGTCATTTGCAGGTAATTATTAGACGATTCTGGCAAATAAATTATTAAAACTGTTCTAGCTTGGTTTATTTCTTTCCTTTCAATTTGTTTTTGCTAGATGTTTCGGAGCAAAAAGCTGGATGACCGAAATCAAGGTACATGGTGTTCTTCTTTATAACCATTTCAATGTTAATTAGTTCTGATTAGGGTTTCTGATTATACGTATCCCTAATGAATACAACTTGGTTGCATATATATGACAGTATTTTCCGATCATACCAGTCTTGTTGAAATTGGAGACAAAAATATTTATAACCTTAGCCAACTTTCCATGCTTCAAGGATACAATCCCAGTCAAAGTTCGTCCTACAGCTACACAAACAATATCTATCCAAGGTTTTCTTCAATTTTCTCAGAAACGAATAAAACATCATTAAAATAAACTAAACCGAACATGTTTTGATTCATTCAAATCTTCTTTCTTGTTCTTTTTCAGTTACGGATTCGGGGATGCTTCTTTTGGTAGCTACGAAAAACTTGTGCACAGACCTTTCGATTGGTTTAATGGAATGTCTCGGGCAGGTTCATCCATTTCTGGTGAACAATCAACAAGCAAAACCCGTGAACCAAAAAATGAGCTTTTCTCATTTGGTGCTTATGAAAATCTATGCACAAGATTTAAACACAGTCCATCAAATATTATTCAACAGACACCACAAAACCTCATGCCTGTAAATCCAACAACAGAATTGAAGACACTGAAAAGGAAGGCTGAAGATTCATCACTTGATTTGGATCTGTCACTGAAACTAAACACAAACATGGATTCCGAAGGAACAAAATCGGAGGACCATGAAGTTCATAGCAATCTGTCTCTGTCGTTGTGCTCTCAATCCTCCTCTTCCAATCTCAGCAGCAGGTTAAAGGCAGCAAAAGATCGATGTGAGGAACACGGAAAAAGGGCCAGTACTCTAGATCTGACTATATGA