Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_36772 LG11 28981001 28981323 "unnamed protein product, partial "
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 28981003 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ser64Ser
C/T 28981015 synonymous_variant p.Pro60Pro
C/T 28981133 intron_variant
T/C 28981165 intron_variant
C/A 28981180 intron_variant
T/C 28981212 splice_region_variant&intron_variant
T/C 28981217 splice_region_variant&intron_variant
C/T 28981229 missense_variant p.Arg32His
G/C 28981231 synonymous_variant p.Gly31Gly
A/G 28981245 missense_variant p.Trp27Arg
C/T 28981304 missense_variant p.Gly7Asp
C/T 28981315 synonymous_variant p.Gln3Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_36772.1
MEQQGRGDCTRTLVSPLRGARREGSFWHLNGRSRGKGQDLGLNQVAYDESTMPSSVCSCTGVLK*


CDS Sequence:
>Vu_36772.1
ATGGAGCAGCAAGGTCGCGGCGACTGCACAAGGACGTTGGTCAGTCCGCTTCGTGGTGCAAGGAGGGAGGGTTCGTTTTGGCATCTCAATGGCCGTTCTCGTGGGAAAGGTCAGGACTTGGGATTGAACCAAGTGGCTTATGATGAGTCAACCATGCCATCGTCTGTATGTTCTTGTACCGGTGTCCTGAAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_36772::LG11:28981323-28983323(-)
AGAGGAAGATAGCTTAGTTGAAGTAGAAGTTAAGACCGAATAGTAGGACCGTTCGGTTAGTATATTAGTTAATTGTAAGATGATCGTTCGATCACATTTTCACTCTTCTTTTGTAGGACCGTTCGGTATAGCCTTTTGTAAACCGTTCGGTCAGGGCTTGCTTATGTTTCTCGATTTTTTTTAATTTTTCTTGTTTATCTGTAAGGTCGTTCAGCCACAAGCGTACTTCCTCTATTAATGTAAGACTGATCTATAATATTATTCAATGTGATTATTCTATTATATAGTTTTAGACTGTATTTTTGGGATGTTACAAATTTTATCTTCAAACATAAAGTTATAATTAATTTAATAATAATATATCAGTACTTAAAAAAATTAAACTCTTTTATTTCTTAATAATTTTTCTGAAAGTCTAAAACAAGTAATTTACTTGCTTCCTTAAGTTAGTACACACACACACACAATATATATATATAAAGTTTGTGTAAATTTAGTTGAATAAATTAAAGTAAAACCCAGGGCGAAATATTATTTTAAAATTTGAGCTCAATTTACGTCAAATTTATACAACAGGTTTATAGGTTTATTGATTAGGTCGTTGTGAGATAGCACATATATAAATGTATATAACATTTTTATAACTTCATTTGGAACTAGAGAGGTTCTCATTGAACTAGTAATTTTAAGGATAAAACTGTACTTCTTTTTCTCTCCCATATTTAAAATTGAATCATAGAAGAACACATAAGTCAACACCATTTTATTGTATTTAGATAAATTGTTTCATTAATAAAATTATGCAAGATTATCTCATATAGTTTATCTAAATTATTACTTAATTTATAAATAAGTTAATTTTATTTTACAAAAGAATATTTTTAAATTTTTTCTAAACATAATTTAAAAAAGTTATCCAAACAAAGCCTAAATTAAATTAAGATTCTTATCTAATTACACCTTTTATTTAACCAATGCAATTTAATAATAATATTTTTAAAAGTGGTGGTGAGAATAGAATGTGTGAAAGGTGTGAGTAGTTGAATTTTATGAAACATTATGTACCTAGCTATCTAACTAGATACTGCTCCTATGGTTGCCGTCCTAGTATGATTTTGGTAAAGATGATAATATTCATATATTAATAAATATATAATGATGGTCCAAAACTCTCTAATGTCAGATAATGGTGGTCCAACAGATGCGTATAATAATGTCATACCGAGATGTGACCCTATAAATAAATTATTGCACTCAACAATTTTCTTTCTTTAATTAAATTTGGCCCGCAACATGTATATCATCATTATTATTAATCACATATATTTCTACCACATATATCATACCTAAATTATATACCTAACTATCTCAAACATAACTTAATATTATTTAAAGACTTCTAATCACTCTCATCGTACAATATCATTTCACCCATCTATTAAAAAAATACAGCATTGTAAATCTTTTATCAACAATAGTCTAGATGATTCATAAAAATACCATAAATGATACAAACTCAAAACAATAATGAGTTAAACTAAGTCCAATAACATTATATCATATTCATAATTTTATATTAAATTTCTCAAACAATCATATCTAATAATAATATTAATGGTATATGTATAAATTATCTATATTTGATCACTGTGGGAATTAATATTTGCAATGTACTTCGATGAAATAGTGTAATTGTATCCAATTAATAATTTTATAATTATAAGTTTTAAGTTAGAAACGCGGTAAAATTTTTATGTGATTTGATTTAAGTTTTATTACGTACTGTCTTAGTGAATGCTTCTCGAAAAATCTATAAATAATTAATACTAAATTAATAATTGTTTTGTTGACCAGTTCAAATGAATGAAAAATTTAGATATATTCTTCCCTTTCTCCTTTGACGCAAACAGACTCAACGTTGGGGGAGAGAATATTCTGCGTTTTCGAGCACAGACAGAGACCTTGTAGAGGGGCAGCGGAGGCGCAACGATAACAAATCG


Gene Sequence:
>Vu_36772(-)
ATGGAGCAGCAAGGTCGCGGCGACTGCACAAGGACGTTGGTCAGTCCGCTTCGTGGTGCAAGGAGGGAGGGTTCGTTTTGGCATCTCAATGGCCGTTCTCGTGGGTAGTGCAGATCACGTTCTTGGTTGAGTTTCATATTAGGGTTTTTTTTTAAATTAAAATTAGGGATTTGATTCATCTGTTTTCTTTGCAGATTGATTCATTTGAGAATTAGGGATTTGATTAATCTAGGAAAGGTCAGGACTTGGGATTGAACCAAGTGGCTTATGATGAGTCAACCATGCCATCGTCTGTATGTTCTTGTACCGGTGTCCTGAAGTAG